CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7b : CodonNum = 5

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7b5S5LnonsyntCatTa11323113080.99867527768-27770
ORF7b5S5LnonsyntCAtTG11323120.0010597927768-27770
ORF7b5S5LnonsynTCaCTa1132320.00017663227768-27770
ORF7b5S5LnonsynTCACTG1132310.000088315827768-27770
ORF7b5S5SsyntcAtcG7125050.7092727768-27770
ORF7b5S5SsyntcAtcT7121860.26123627768-27770
ORF7b5S5SsyntcAtcC712210.029494427768-27770
ORF7b5S5deldelTCA---639639127768-27770
ORF7b5S5del1delTca-ca5605430.96964327768-27770
ORF7b5S5del1deltcAtc-56070.012527768-27770
ORF7b5S5del1delTCa-Ta56040.0071428627768-27770
ORF7b5S5del1delTCA-NN56030.0053571427768-27770
ORF7b5S5del1deltCat-a56030.0053571427768-27770
ORF7b5S5AnonsynTcaGca272272127768-27770
ORF7b5S5PnonsynTcaCca5353127768-27770
ORF7b5S5XnonsyntCatGa39260.66666727768-27770
ORF7b5S5XnonsyntCatAa39130.33333327768-27770
ORF7b5S5TnonsynTcaAca36350.97222227768-27770
ORF7b5S5TnonsynTcAAcT3610.027777827768-27770
ORF7b5S5del2delTCa--a25210.8427768-27770
ORF7b5S5del2deltCAt--2540.1627768-27770
ORF7b5S5InonsynTCaATa740.57142927768-27770
ORF7b5S5InonsynTCAATT730.42857127768-27770
ORF7b5S5RnonsynTCaAGa11127768-27770
ORF7b5S5FnonsyntCAtTC11127768-27770
ORF7b5S5DnonsynTCAGAC11127768-27770

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7b5S5LtCatTa1130811323All0.002163
ORF7b5S5LtCAtTG1211323All0.000002
ORF7b5S5LTCaCTa211323All0
ORF7b5S5LTCACTG111323All0
ORF7b5S5LtCatTa54945494B.1.1770.072343
ORF7b5S5LtCatTa26372639B.1.6280.929175
ORF7b5S5LTCaCTa22639B.1.6280.000705
ORF7b5S5StcAtcG505712All0.000097
ORF7b5S5StcAtcT186712All0.000036
ORF7b5S5StcAtcC21712All0.000004
ORF7b5S5delTCA---639639All0.000122
ORF7b5S5del1Tca-ca543560All0.000104
ORF7b5S5del1tcAtc-7560All0.000001
ORF7b5S5del1TCa-Ta4560All0.000001
ORF7b5S5del1TCA-NN3560All0.000001
ORF7b5S5del1tCat-a3560All0.000001
ORF7b5S5LtCatTa537537B.1.1.70.000481
ORF7b5S5del1Tca-ca503507B.1.1.70.00045
ORF7b5S5del1TCA-NN2507B.1.1.70.000002
ORF7b5S5del1tcAtc-2507B.1.1.70.000002
ORF7b5S5LtCatTa296297AY.40.000461
ORF7b5S5LTCACTG1297AY.40.000002
ORF7b5S5LtCatTa283283B.1.6310.952862
ORF7b5S5ATcaGca272272All0.000052
ORF7b5S5ATcaGca196196B.1.1.70.000175
ORF7b5S5StcAtcG158159AY.30.001572
ORF7b5S5StcAtcT1159AY.30.00001
ORF7b5S5delTCA---152152B.1.1.70.000136
ORF7b5S5LtCatTa151151AY.430.000669
ORF7b5S5LtCatTa149151B.10.001365
ORF7b5S5LtCAtTG2151B.10.000018
ORF7b5S5LtCatTa127127B.1.20.001118
ORF7b5S5LtCatTa113113AY.250.00068
ORF7b5S5LtCatTa9696B.1.617.20.000361
ORF7b5S5delTCA---8484AY.40.000131
ORF7b5S5LtCatTa8181P.10.001276
ORF7b5S5StcAtcG7474B.1.160.150.366337
ORF7b5S5LtCatTa7373B.1.466.20.02856
ORF7b5S5LtCatTa6969AY.470.002146
ORF7b5S5StcAtcT5559AY.1020.001458
ORF7b5S5StcAtcG459AY.1020.000106
ORF7b5S5LtCatTa5757AY.1030.000354
ORF7b5S5StcAtcG3057B.1.617.20.000113
ORF7b5S5StcAtcT2657B.1.617.20.000098
ORF7b5S5StcAtcC157B.1.617.20.000004
ORF7b5S5LtCatTa5656B.1.351.20.016944
ORF7b5S5PTcaCca5353All0.00001
ORF7b5S5LtCatTa4949AY.480.022791
ORF7b5S5StcAtcG2947B.1.1.70.000026
ORF7b5S5StcAtcT1647B.1.1.70.000014
ORF7b5S5StcAtcC247B.1.1.70.000002
ORF7b5S5delTCA---4747B.1.20.000414
ORF7b5S5StcAtcG4646B.1.5990.167883
ORF7b5S5LtCatTa4243B.1.10.000762
ORF7b5S5LtCAtTG143B.1.10.000018
ORF7b5S5LtCatTa4242AY.440.000256
ORF7b5S5LtCatTa4040AY.330.002671
ORF7b5S5XtCatGa2639All0.000005
ORF7b5S5XtCatAa1339All0.000002
ORF7b5S5LtCatTa3838AY.50.000785
ORF7b5S5TTcaAca3536All0.000007
ORF7b5S5TTcAAcT136All0
ORF7b5S5StcAtcG2736AY.40.000042
ORF7b5S5StcAtcT636AY.40.000009
ORF7b5S5StcAtcC336AY.40.000005
ORF7b5S5StcAtcT3334AY.980.002607
ORF7b5S5StcAtcC134AY.980.000079
ORF7b5S5LtCatTa3333AY.980.002607
ORF7b5S5delTCA---3232B.1.5620.592593
ORF7b5S5LtCatTa3131AY.46.60.002238
ORF7b5S5LtCatTa2929B.1.1.1860.099656
ORF7b5S5LtCatTa2828AY.4.20.000607
ORF7b5S5delTCA---2828P.10.000441
ORF7b5S5del2TCa--a2125All0.000004
ORF7b5S5del2tCAt--425All0.000001
ORF7b5S5LtCatTa2222AY.140.001936
ORF7b5S5delTCA---2222B.10.000202
ORF7b5S5LtCatTa2222B.1.3690.006275
ORF7b5S5TTcaAca2222B.1.4290.000518
ORF7b5S5LtCatTa2121AY.1020.000557
ORF7b5S5LtCatTa2121AY.720.028571
ORF7b5S5ATcaGca2121B.1.2430.001461
ORF7b5S5LtCatTa2020AY.530.00575
ORF7b5S5LtCatTa1919B.1.4970.00598
ORF7b5S5LtCatTa1818AY.1000.000828
ORF7b5S5StcAtcG1818AY.1100.002028
ORF7b5S5LtCatTa1818AY.30.000179
ORF7b5S5LtCatTa1717AY.290.000268
ORF7b5S5LtCatTa1717AY.46.30.015873
ORF7b5S5LtCatTa1717AY.46.40.002797
ORF7b5S5LtCatTa1717AY.750.000952
ORF7b5S5LtCatTa1717P.1.70.005428
ORF7b5S5XtCatGa1616AY.250.000096
ORF7b5S5LtCatTa1616B.1.1.5190.000635
ORF7b5S5PTcaCca1616B.1.1.70.000014
ORF7b5S5delTCA---1515AY.290.000237
ORF7b5S5LtCatTa1515AY.98.10.000726
ORF7b5S5LtCatTa1515B.1.3110.004119
ORF7b5S5ATcaGca1515B.1.4060.090909
ORF7b5S5delTCA---1515B.1.4270.000757
ORF7b5S5ATcaGca1515B.1.4290.000353
ORF7b5S5LtCatTa1515P.20.0028
ORF7b5S5LtCatTa1414AY.390.000346
ORF7b5S5StcAtcT1414AY.470.000435
ORF7b5S5del2TCa--a1014B.1.1.70.000009
ORF7b5S5del2tCAt--414B.1.1.70.000004
ORF7b5S5LtCatTa1313AY.200.000505
ORF7b5S5LtCatTa1313AY.60.000535
ORF7b5S5delTCA---1313B.1.10.000236
ORF7b5S5LtCatTa1212AY.260.00034
ORF7b5S5LtCatTa1212AY.39.10.000475
ORF7b5S5StcAtcG712AY.430.000031
ORF7b5S5StcAtcT412AY.430.000018
ORF7b5S5StcAtcC112AY.430.000004
ORF7b5S5delTCA---1212AY.470.000373
ORF7b5S5LtCatTa1212B.1.4290.000282
ORF7b5S5LtCatTa1212P.1.20.013873
ORF7b5S5LtCatTa1010AY.1190.000353
ORF7b5S5StcAtcG810AY.390.000198
ORF7b5S5StcAtcT210AY.390.000049
ORF7b5S5StcAtcG1010AY.440.000061
ORF7b5S5StcAtcG610B.10.000055
ORF7b5S5StcAtcT310B.10.000027
ORF7b5S5StcAtcC110B.10.000009
ORF7b5S5delTCA---1010B.1.2340.001319
ORF7b5S5LtCatTa1010B.1.6270.020202
ORF7b5S5del1Tca-ca710P.10.00011
ORF7b5S5del1TCa-Ta210P.10.000032
ORF7b5S5del1tcAtc-110P.10.000016
ORF7b5S5delTCA---99AY.260.000255
ORF7b5S5LtCatTa99AY.540.000858
ORF7b5S5LtCatTa99AY.9.10.000754
ORF7b5S5LtCatTa99B.1.2210.000639
ORF7b5S5del1Tca-ca99Q.80.001484
ORF7b5S5LtCatTa88AY.420.000322
ORF7b5S5delTCA---88AY.430.000035
ORF7b5S5StcAtcG88AY.590.004237
ORF7b5S5LtCatTa88B.1.1.280.00249
ORF7b5S5StcAtcG68B.1.20.000053
ORF7b5S5StcAtcT18B.1.20.000009
ORF7b5S5StcAtcC18B.1.20.000009
ORF7b5S5delTCA---88B.1.617.20.00003
ORF7b5S5LtCatTa88V.10.181818
ORF7b5S5delTCA---77A0.002709
ORF7b5S5ITCaATa47All0.000001
ORF7b5S5ITCAATT37All0.000001
ORF7b5S5delTCA---77AY.1030.000043
ORF7b5S5delTCA---77B.1.1770.000092
ORF7b5S5StcAtcG57B.1.1770.000066
ORF7b5S5StcAtcC27B.1.1770.000026
ORF7b5S5LtCatTa77B.1.6370.000512
ORF7b5S5LtCatTa66A.10.001691
ORF7b5S5StcAtcG56AY.1030.000031
ORF7b5S5StcAtcT16AY.1030.000006
ORF7b5S5LtCatTa66AY.160.002278
ORF7b5S5delTCA---66AY.250.000036
ORF7b5S5LtCatTa66AY.460.000624
ORF7b5S5XtCatGa56B.10.000046
ORF7b5S5XtCatAa16B.10.000009
ORF7b5S5StcAtcG36B.1.10.000054
ORF7b5S5StcAtcT36B.1.10.000054
ORF7b5S5delTCA---66B.1.1.5190.000238
ORF7b5S5LtCatTa66B.1.2580.000399
ORF7b5S5PTcaCca66P.10.000095
ORF7b5S5LtCatTa66P.1.150.001394
ORF7b5S5LtCatTa55AY.230.000349
ORF7b5S5StcAtcG55AY.280.009452
ORF7b5S5LtCatTa55AY.3.10.000426
ORF7b5S5delTCA---55AY.330.000334
ORF7b5S5del1tCat-a35AY.40.000005
ORF7b5S5del1Tca-ca15AY.40.000002
ORF7b5S5del1tcAtc-15AY.40.000002
ORF7b5S5LtCatTa55AY.610.000524
ORF7b5S5LtCatTa55AY.790.006053
ORF7b5S5delTCA---55B.1.1.2140.000277
ORF7b5S5LtCatTa55B.1.1.250.002843
ORF7b5S5delTCA---55B.1.1.3170.002058
ORF7b5S5LtCatTa55B.1.1600.000156
ORF7b5S5delTCA---55B.1.36.290.002587
ORF7b5S5ATcaGca55C.370.00058
ORF7b5S5LtCatTa55P.1.120.00242
ORF7b5S5ATcaGca44AY.1020.000106
ORF7b5S5LtCatTa44AY.1100.000451
ORF7b5S5LtCatTa44AY.1170.000338
ORF7b5S5LtCatTa44AY.1200.000149
ORF7b5S5LtCatTa44AY.1210.000541
ORF7b5S5StcAtcG24AY.250.000012
ORF7b5S5StcAtcC14AY.250.000006
ORF7b5S5StcAtcT14AY.250.000006
ORF7b5S5LtCatTa44AY.740.000463
ORF7b5S5delTCA---44B0.000511
ORF7b5S5StcAtcT44B.1.1.2410.008282
ORF7b5S5StcAtcG44B.1.1600.000125
ORF7b5S5ITCaATa44B.1.1600.000125
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.177.60.003906
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.177.770.002905
ORF7b5S5delTCA---44B.1.360.000584
ORF7b5S5LtCatTa34B.1.360.000438
ORF7b5S5LtCAtTG14B.1.360.000146
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.36.170.001976
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.3960.002823
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.4270.000202
ORF7b5S5delTCA---44B.1.4290.000094
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.438.10.000429
ORF7b5S5LtCatTa44B.1.5610.001588
ORF7b5S5PTcaCca44B.1.617.20.000015
ORF7b5S5del1Tca-ca44B.1.617.20.000015
ORF7b5S5StcAtcG44C.80.017857
ORF7b5S5delTCA---44P.1.140.000191
ORF7b5S5LtCatTa33AY.1050.001929
ORF7b5S5delTCA---33AY.1180.000188
ORF7b5S5LtCatTa33AY.120.000948
ORF7b5S5XtCatAa33AY.430.000013
ORF7b5S5PTcaCca33AY.430.000013
ORF7b5S5delTCA---33AY.440.000018
ORF7b5S5StcAtcG33AY.46.60.000217
ORF7b5S5StcAtcT33AY.480.001395
ORF7b5S5LtCatTa33AY.590.001589
ORF7b5S5LtCatTa33AY.9.20.00011
ORF7b5S5StcAtcG33AY.910.002191
ORF7b5S5TTcaAca33B.10.000027
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.2320.005445
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.2430.012245
ORF7b5S5del1Tca-ca33B.1.1.2840.000322
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.3440.032258
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.370.000579
ORF7b5S5StcAtcT23B.1.1.5190.000079
ORF7b5S5StcAtcG13B.1.1.5190.00004
ORF7b5S5del2TCa--a33B.1.20.000026
ORF7b5S5LtCatTa33B.1.2100.006397
ORF7b5S5LtCatTa33B.1.2320.001612
ORF7b5S5LtCatTa33B.1.2340.000396
ORF7b5S5delTCA---33B.1.3510.000089
ORF7b5S5LtCatTa23B.1.3510.000059
ORF7b5S5LtCAtTG13B.1.3510.00003
ORF7b5S5LtCAtTG33B.1.36.10.003421
ORF7b5S5LtCatTa33B.1.5260.000071
ORF7b5S5delTCA---33B.1.5950.000783
ORF7b5S5delTCA---33B.1.5960.000261
ORF7b5S5ATcaGca33B.1.617.20.000011
ORF7b5S5del1Tca-ca33B.1.6260.017143
ORF7b5S5LtCatTa33C.370.000348
ORF7b5S5ATcaGca33P.10.000047
ORF7b5S5LtCatTa33P.1.140.000143
ORF7b5S5delTCA---33P.1.150.000697
ORF7b5S5TTcaAca33P.1.70.000958
ORF7b5S5XtCatGa220.111111
ORF7b5S5delTCA---22AY.1080.002205
ORF7b5S5LtCatTa22AY.1090.001479
ORF7b5S5LtCatTa22AY.1130.000285
ORF7b5S5delTCA---22AY.1130.000285
ORF7b5S5LtCatTa22AY.1160.000574
ORF7b5S5StcAtcG22AY.1170.000169
ORF7b5S5delTCA---22AY.1200.000074
ORF7b5S5StcAtcT12AY.1200.000037
ORF7b5S5StcAtcG12AY.1200.000037
ORF7b5S5delTCA---22AY.200.000078
ORF7b5S5StcAtcC12AY.200.000039
ORF7b5S5StcAtcG12AY.200.000039
ORF7b5S5StcAtcG22AY.230.000139
ORF7b5S5del2TCa--a22AY.250.000012
ORF7b5S5StcAtcG12AY.3.10.000085
ORF7b5S5StcAtcC12AY.3.10.000085
ORF7b5S5delTCA---22AY.300.000791
ORF7b5S5ATcaGca22AY.330.000134
ORF7b5S5LtCatTa22AY.340.000194
ORF7b5S5LtCatTa22AY.350.000466
ORF7b5S5delTCA---22AY.390.000049
ORF7b5S5PTcaCca22AY.39.10.000079
ORF7b5S5PTcaCca22AY.40.000003
ORF7b5S5XtCatGa12AY.40.000002
ORF7b5S5XtCatAa12AY.40.000002
ORF7b5S5delTCA---22AY.4.20.000043
ORF7b5S5LtCatTa22AY.4.40.000818
ORF7b5S5PTcaCca22AY.46.40.000329
ORF7b5S5del1TCa-Ta22AY.470.000062
ORF7b5S5StcAtcG22AY.640.00119
ORF7b5S5delTCA---22AY.650.001066
ORF7b5S5StcAtcT22AY.650.001066
ORF7b5S5LtCatTa22AY.690.000373
ORF7b5S5LtCatTa22AY.75.10.000361
ORF7b5S5LtCatTa22AY.90.000135
ORF7b5S5LtCatTa22AY.990.002099
ORF7b5S5LtCatTa22AY.99.20.000184
ORF7b5S5ATcaGca22B.10.000018
ORF7b5S5PTcaCca22B.10.000018
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.2220.000408
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.2840.000215
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.1.3540.008772
ORF7b5S5XtCatAa22B.1.1.70.000002
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.750.021277
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.177.600.000437
ORF7b5S5delTCA---22B.1.177.600.000437
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.177.810.000379
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.2430.000139
ORF7b5S5delTCA---22B.1.2430.000139
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.36.290.001035
ORF7b5S5TTcaAca22B.1.4270.000101
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.4740.003802
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.4990.002101
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.5750.000607
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.5960.000174
ORF7b5S5LtCatTa22B.1.617.30.00597
ORF7b5S5delTCA---22C.370.000232
ORF7b5S5StcAtcC22C.370.000232
ORF7b5S5StcAtcG22D.20.00015
ORF7b5S5StcAtcG12P.10.000016
ORF7b5S5StcAtcC12P.10.000016
ORF7b5S5delTCA---22P.1.10.000635
ORF7b5S5delTCA---22P.1.40.001953
ORF7b5S5del1Tca-ca22Q.10.000253
ORF7b5S5LtCatTa22Q.20.001227
ORF7b5S5StcAtcC110.055556
ORF7b5S5LtCatTa110.055556
ORF7b5S5delTCA---11A.10.000282
ORF7b5S5delTCA---11A.20.000662
ORF7b5S5delTCA---11A.2.20.001689
ORF7b5S5StcAtcG11A.2.40.003367
ORF7b5S5LtCatTa11A.2.50.000499
ORF7b5S5LtCatTa11A.2.5.20.001572
ORF7b5S5delTCA---11A.230.010526
ORF7b5S5DTCAGAC11All0
ORF7b5S5RTCaAGa11All0
ORF7b5S5FtCAtTC11All0
ORF7b5S5LtCatTa11AW.10.003049
ORF7b5S5LtCatTa11AY.100.00053
ORF7b5S5delTCA---11AY.1000.000046
ORF7b5S5PTcaCca11AY.1010.00049
ORF7b5S5ATcaGca11AY.1030.000006
ORF7b5S5StcAtcT11AY.1060.000335
ORF7b5S5LtCatTa11AY.1110.000183
ORF7b5S5StcAtcG11AY.1110.000183
ORF7b5S5LtCatTa11AY.1140.000231
ORF7b5S5LtCatTa11AY.1150.005208
ORF7b5S5del1Tca-ca11AY.1190.000035
ORF7b5S5delTCA---11AY.120.000316
ORF7b5S5LtCatTa11AY.120.2.10.000498
ORF7b5S5LtCatTa11AY.130.000161
ORF7b5S5LtCatTa11AY.190.00114
ORF7b5S5StcAtcG11AY.20.000356
ORF7b5S5delTCA---11AY.20.000356
ORF7b5S5delTCA---11AY.240.000431
ORF7b5S5del1Tca-ca11AY.260.000028
ORF7b5S5del2TCa--a11AY.260.000028
ORF7b5S5LtCatTa11AY.270.000065
ORF7b5S5PTcaCca11AY.290.000016
ORF7b5S5StcAtcG11AY.300.000396
ORF7b5S5PTcaCca11AY.320.000532
ORF7b5S5StcAtcT11AY.330.000067
ORF7b5S5StcAtcG11AY.340.000097
ORF7b5S5LtCatTa11AY.360.000148
ORF7b5S5StcAtcG11AY.360.000148
ORF7b5S5delTCA---11AY.370.000316
ORF7b5S5LtCatTa11AY.370.000316
ORF7b5S5PTcaCca11AY.390.000025
ORF7b5S5TTcaAca11AY.390.000025
ORF7b5S5ATcaGca11AY.40.000002
ORF7b5S5StcAtcG11AY.4.20.000022
ORF7b5S5delTCA---11AY.4.2.10.000149
ORF7b5S5LtCatTa11AY.4.2.10.000149
ORF7b5S5StcAtcG11AY.4.2.10.000149
ORF7b5S5LtCatTa11AY.4.50.000107
ORF7b5S5del2TCa--a11AY.440.000006
ORF7b5S5LtCatTa11AY.450.000122
ORF7b5S5ATcaGca11AY.460.000104
ORF7b5S5StcAtcT11AY.460.000104
ORF7b5S5LtCatTa11AY.46.10.001027
ORF7b5S5LtCatTa11AY.46.20.000635
ORF7b5S5TTcaAca11AY.50.000021
ORF7b5S5StcAtcG11AY.50.000021
ORF7b5S5LtCatTa11AY.520.000814
ORF7b5S5delTCA---11AY.530.000288
ORF7b5S5LtCatTa11AY.550.000917
ORF7b5S5StcAtcG11AY.550.000917
ORF7b5S5LtCatTa11AY.560.001605
ORF7b5S5LtCatTa11AY.580.000907
ORF7b5S5delTCA---11AY.600.000938
ORF7b5S5ATcaGca11AY.610.000105
ORF7b5S5LtCatTa11AY.620.000436
ORF7b5S5del1TCA-NN11AY.650.000533
ORF7b5S5StcAtcG11AY.70.000196
ORF7b5S5delTCA---11AY.700.000209
ORF7b5S5StcAtcT11AY.710.000475
ORF7b5S5PTcaCca11AY.710.000475
ORF7b5S5LtCatTa11AY.710.000475
ORF7b5S5StcAtcT11AY.750.000056
ORF7b5S5delTCA---11AY.75.10.00018
ORF7b5S5delTCA---11AY.790.001211
ORF7b5S5LtCatTa11AY.80.000606
ORF7b5S5XtCatAa11AY.820.001357
ORF7b5S5StcAtcG11AY.880.000884
ORF7b5S5delTCA---11AY.9.20.000037
ORF7b5S5del1tcAtc-11AY.9.20.000037
ORF7b5S5LtCatTa11AY.920.000287
ORF7b5S5LtCatTa11AY.950.000761
ORF7b5S5delTCA---11AY.98.10.000048
ORF7b5S5LtCatTa11AZ.10.000867
ORF7b5S5delTCA---11AZ.20.000821
ORF7b5S5delTCA---11AZ.30.00152
ORF7b5S5LtCatTa11B0.000128
ORF7b5S5del2TCa--a11B.10.000009
ORF7b5S5FtCAtTC11B.10.000009
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.10.000018
ORF7b5S5TTcAAcT11B.1.10.000018
ORF7b5S5ITCAATT11B.1.10.000018
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.10.000018
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.10.000327
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.1010.01
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.1740.003378
ORF7b5S5del1tcAtc-11B.1.1.1860.003436
ORF7b5S5LtCAtTG11B.1.1.1890.001513
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.2050.003717
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.2070.001182
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2160.00089
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2310.003096
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.1.250.000569
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2540.011236
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2650.003155
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.1.280.000311
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.280.000311
ORF7b5S5LtCAtTG11B.1.1.2820.011628
ORF7b5S5StcAtcT11B.1.1.2910.000742
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.2980.000862
ORF7b5S5ITCAATT11B.1.1.3050.003861
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.3060.000438
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.1.3490.010309
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.3730.02381
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.390.00051
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.1.3980.003226
ORF7b5S5StcAtcT11B.1.1.4090.002833
ORF7b5S5ATcaGca11B.1.1.410.006329
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.4110.014706
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.4160.000905
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.4240.045455
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.1.4340.000349
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.4640.001473
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.1.500.000679
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.500.000679
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.5070.008696
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.1.5190.00004
ORF7b5S5XtCatAa11B.1.1.5190.00004
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.1.5190.00004
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.5250.005464
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.5260.003546
ORF7b5S5RTCaAGa11B.1.1.70.000001
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1.710.006061
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.1.890.006061
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.1040.00369
ORF7b5S5delTCA---11B.1.110.30.000718
ORF7b5S5XtCatAa11B.1.1600.000031
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1600.000031
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.160.110.005714
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.160.300.002976
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.120.000152
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.120.000152
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.150.000631
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.170.000821
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.210.000076
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.300.002513
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.310.011494
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.40.000211
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.177.40.000211
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.177.420.000894
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.177.440.000519
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.500.004695
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.540.000606
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.570.000281
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.630.002703
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.650.000665
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.70.000165
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.177.70.000165
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.730.000566
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.177.740.015152
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.177.820.000477
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.177.860.000183
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.177.870.000728
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.20.000009
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.20.000009
ORF7b5S5TTcaAca11B.1.20.000009
ORF7b5S5XtCatAa11B.1.20.000009
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2190.009434
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.2210.000071
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.2340.000132
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.2400.000216
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.2400.000216
ORF7b5S5LtCAtTG11B.1.2420.018868
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.2470.014925
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2580.000067
ORF7b5S5del1Tca-ca11B.1.258.110.000396
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.258.170.000104
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2650.001271
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.3060.005714
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.3240.001605
ORF7b5S5del2TCa--a11B.1.3510.00003
ORF7b5S5DTCAGAC11B.1.3510.00003
ORF7b5S5delTCA---11B.1.351.20.000303
ORF7b5S5delTCA---11B.1.351.30.000876
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.360.000146
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.3670.000792
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.3670.000792
ORF7b5S5ATcaGca11B.1.3750.00082
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.3990.001934
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.4090.000781
ORF7b5S5XtCatGa11B.1.4270.00005
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.4280.00102
ORF7b5S5XtCatAa11B.1.4290.000024
ORF7b5S5LtCAtTG11B.1.4380.006536
ORF7b5S5delTCA---11B.1.438.10.000107
ORF7b5S5StcAtcC11B.1.4460.02
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.4620.007246
ORF7b5S5delTCA---11B.1.4680.005714
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5240.001406
ORF7b5S5StcAtcC11B.1.5250.000113
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5250.000113
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.5260.000024
ORF7b5S5TTcaAca11B.1.5260.000024
ORF7b5S5delTCA---11B.1.5260.000024
ORF7b5S5del1tcAtc-11B.1.5260.000024
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5300.007143
ORF7b5S5PTcaCca11B.1.5300.007143
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5370.02
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5820.000491
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5900.004545
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.5950.000261
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.5960.000087
ORF7b5S5XtCatAa11B.1.5990.00365
ORF7b5S5delTCA---11B.1.6040.017241
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.6120.002653
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.617.10.000129
ORF7b5S5TTcaAca11B.1.617.10.000129
ORF7b5S5delTCA---11B.1.617.10.000129
ORF7b5S5StcAtcG11B.1.617.10.000129
ORF7b5S5ITCAATT11B.1.617.20.000004
ORF7b5S5del2TCa--a11B.1.617.20.000004
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.6210.000089
ORF7b5S5del2TCa--a11B.1.6210.000089
ORF7b5S5delTCA---11B.1.621.10.000506
ORF7b5S5delTCA---11B.1.6300.005236
ORF7b5S5LtCatTa11B.1.910.002075
ORF7b5S5delTCA---11B.60.00091
ORF7b5S5StcAtcT11B.60.00091
ORF7b5S5LtCatTa11B.60.00091
ORF7b5S5LtCatTa11B.6.60.000889
ORF7b5S5LtCatTa11B.600.015873
ORF7b5S5LtCatTa11C.1.20.004255
ORF7b5S5PTcaCca11C.350.000774
ORF7b5S5LtCatTa11C.36.30.000567
ORF7b5S5LtCatTa11C.390.018868
ORF7b5S5LtCatTa11D.20.000075
ORF7b5S5LtCatTa11L.30.003546
ORF7b5S5delTCA---11N.50.001767
ORF7b5S5LtCatTa11N.50.001767
ORF7b5S5XtCatGa11P.10.000016
ORF7b5S5delTCA---11P.1.120.000484
ORF7b5S5PTcaCca11P.1.140.000048
ORF7b5S5del1Tca-ca11P.1.150.000232
ORF7b5S5delTCA---11P.1.160.000374
ORF7b5S5delTCA---11P.1.70.000319
ORF7b5S5StcAtcG11P.20.000187
ORF7b5S5delTCA---11Q.10.000126
ORF7b5S5LtCatTa11Q.30.000145
ORF7b5S5LtCatTa11Q.80.000165
ORF7b5S5delTCA---11Q.80.000165
ORF7b5S5delTCA---11R.10.00009
ORF7b5S5LtCatTa11R.10.00009