CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7b : CodonNum = 44

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7b44X44YnonsyntaAtaT677867660.9982327885-27887
ORF7b44X44YnonsyntaAtaC6778120.0017704327885-27887
ORF7b44X44deldelTAA---600600127885-27887
ORF7b44X44LnonsyntAatTa2031930.95073927885-27887
ORF7b44X44LnonsynTAACTT20350.024630527885-27887
ORF7b44X44LnonsynTAaCTa20340.019704427885-27887
ORF7b44X44LnonsyntAAtTG20310.0049261127885-27887
ORF7b44X44XsyntAatGa160880.5527885-27887
ORF7b44X44XsyntaAtaG160720.4527885-27887
ORF7b44X44del2delTAa--a64520.812527885-27887
ORF7b44X44del2deltAAt--64120.187527885-27887
ORF7b44X44QnonsynTaaCaa62610.98387127885-27887
ORF7b44X44QnonsynTaACaG6210.01612927885-27887
ORF7b44X44del1deltaAta-26180.69230827885-27887
ORF7b44X44del1delTaa-aa2650.19230827885-27887
ORF7b44X44del1delTAA-NN2620.076923127885-27887
ORF7b44X44del1deltAat-a2610.038461527885-27887
ORF7b44X44CnonsyntAAtGT1717127885-27887
ORF7b44X44KnonsynTaaAaa15140.93333327885-27887
ORF7b44X44KnonsynTaAAaG1510.066666727885-27887
ORF7b44X44EnonsynTaaGaa99127885-27887
ORF7b44X44HnonsynTaACaC320.66666727885-27887
ORF7b44X44HnonsynTaACaT310.33333327885-27887
ORF7b44X44FnonsyntAAtTT22127885-27887
ORF7b44X44SnonsyntAAtCC210.527885-27887
ORF7b44X44SnonsyntAatCa210.527885-27887

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7b44X44YtaAtaT67666778All0.001294
ORF7b44X44YtaAtaC126778All0.000002
ORF7b44X44YtaAtaT30883089B.1.1.3180.931804
ORF7b44X44YtaAtaC13089B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44YtaAtaT11521152AZ.10.999133
ORF7b44X44YtaAtaT11481148AZ.20.942529
ORF7b44X44YtaAtaT622622AZ.30.945289
ORF7b44X44delTAA---600600All0.000115
ORF7b44X44YtaAtaT274274AZ.40.919463
ORF7b44X44YtaAtaT225225AZ.50.789474
ORF7b44X44LtAatTa193203All0.000037
ORF7b44X44LTAACTT5203All0.000001
ORF7b44X44LTAaCTa4203All0.000001
ORF7b44X44LtAAtTG1203All0
ORF7b44X44XtAatGa88160All0.000017
ORF7b44X44XtaAtaG72160All0.000014
ORF7b44X44delTAA---156156B.1.1.2220.031824
ORF7b44X44YtaAtaT110110AZ.2.10.894309
ORF7b44X44delTAA---9797AY.40.000151
ORF7b44X44LtAatTa9494AY.1020.002492
ORF7b44X44YtaAtaT8989AZ.60.747899
ORF7b44X44del2TAa--a5264All0.00001
ORF7b44X44del2tAAt--1264All0.000002
ORF7b44X44QTaaCaa6162All0.000012
ORF7b44X44QTaACaG162All0
ORF7b44X44delTAA---5555B.1.1.70.000049
ORF7b44X44delTAA---4848B.1.2430.00334
ORF7b44X44del2TAa--a4747B.1.1.70.000042
ORF7b44X44XtaAtaG3637AY.1030.000224
ORF7b44X44XtAatGa137AY.1030.000006
ORF7b44X44delTAA---3737AY.290.000584
ORF7b44X44XtAatGa2828AY.440.00017
ORF7b44X44del1taAta-1826All0.000003
ORF7b44X44del1Taa-aa526All0.000001
ORF7b44X44del1TAA-NN226All0
ORF7b44X44del1tAat-a126All0
ORF7b44X44delTAA---2121B.1.10.000381
ORF7b44X44LtAatTa2121B.1.1.70.000019
ORF7b44X44QTaaCaa1818B.1.1.70.000016
ORF7b44X44CtAAtGT1717All0.000003
ORF7b44X44delTAA---1717B0.002173
ORF7b44X44KTaaAaa1415All0.000003
ORF7b44X44KTaAAaG115All0
ORF7b44X44del1taAta-1415B.1.1.3180.004225
ORF7b44X44del1tAat-a115B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44XtAatGa1515P.10.000236
ORF7b44X44CtAAtGT1414AZ.20.011494
ORF7b44X44delTAA---1313B.1.20.000114
ORF7b44X44QTaaCaa1313B.1.4080.04797
ORF7b44X44XtAatGa1012B.1.617.20.000038
ORF7b44X44XtaAtaG212B.1.617.20.000008
ORF7b44X44LtAatTa1111B.1.617.20.000041
ORF7b44X44delTAA---1010B.1.1.3180.003018
ORF7b44X44ETaaGaa99All0.000002
ORF7b44X44delTAA---99AY.1030.000056
ORF7b44X44XtAatGa99AY.23.10.003756
ORF7b44X44delTAA---99B.10.000082
ORF7b44X44LtAatTa99B.1.5260.000212
ORF7b44X44LtAatTa88AY.46.40.001316
ORF7b44X44YtaAtaT88B.1.10.000145
ORF7b44X44XtaAtaG48B.1.1.70.000004
ORF7b44X44XtAatGa48B.1.1.70.000004
ORF7b44X44YtaAtaT67AY.40.000009
ORF7b44X44YtaAtaC17AY.40.000002
ORF7b44X44LtAatTa37B.10.000027
ORF7b44X44LTAaCTa37B.10.000027
ORF7b44X44LTAACTT17B.10.000009
ORF7b44X44delTAA---660.333333
ORF7b44X44delTAA---66AY.29.10.001323
ORF7b44X44delTAA---66AY.30.00006
ORF7b44X44QTaaCaa66AY.40.000009
ORF7b44X44delTAA---66AY.430.000027
ORF7b44X44LtAatTa36B.1.10.000054
ORF7b44X44LTAACTT26B.1.10.000036
ORF7b44X44LTAaCTa16B.1.10.000018
ORF7b44X44delTAA---66B.1.1.2650.018927
ORF7b44X44ETaaGaa66B.1.1.70.000005
ORF7b44X44XtAatGa66B.1.20.000053
ORF7b44X44delTAA---66B.1.617.20.000023
ORF7b44X44YtaAtaT55AY.98.10.000242
ORF7b44X44delTAA---55AZ.50.017544
ORF7b44X44XtaAtaG45B.10.000037
ORF7b44X44XtAatGa15B.10.000009
ORF7b44X44delTAA---55B.1.1.5190.000199
ORF7b44X44delTAA---55B.1.5260.000118
ORF7b44X44QTaaCaa55B.1.617.20.000019
ORF7b44X44LtAatTa55P.10.000079
ORF7b44X44YtaAtaT44AT.10.020513
ORF7b44X44XtaAtaG44AY.1020.000106
ORF7b44X44LtAatTa44AY.30.00004
ORF7b44X44XtaAtaG24AY.30.00002
ORF7b44X44XtAatGa24AY.30.00002
ORF7b44X44LtAatTa44AY.390.000099
ORF7b44X44YtaAtaT34AY.430.000013
ORF7b44X44YtaAtaC14AY.430.000004
ORF7b44X44delTAA---44AY.440.000024
ORF7b44X44QTaaCaa44B.10.000037
ORF7b44X44YtaAtaT44B.10.000037
ORF7b44X44YtaAtaT34B.1.1.70.000003
ORF7b44X44YtaAtaC14B.1.1.70.000001
ORF7b44X44LtAatTa44B.1.3240.006421
ORF7b44X44XtaAtaG44B.1.4290.000094
ORF7b44X44YtaAtaT44B.1.617.20.000015
ORF7b44X44HTaACaC23All0
ORF7b44X44HTaACaT13All0
ORF7b44X44delTAA---33AY.250.000018
ORF7b44X44delTAA---33AY.370.000948
ORF7b44X44XtaAtaG33AY.40.000005
ORF7b44X44LtAatTa33AY.40.000005
ORF7b44X44LtAatTa33AY.4.20.000065
ORF7b44X44XtAatGa23AY.430.000009
ORF7b44X44XtaAtaG13AY.430.000004
ORF7b44X44delTAA---33B.1.1260.003827
ORF7b44X44YtaAtaT33P.10.000047
ORF7b44X44delTAA---33P.1.150.000697
ORF7b44X44XtAatGa33P.1.170.000485
ORF7b44X44XtAatGa220.111111
ORF7b44X44delTAA---22A.2.20.003378
ORF7b44X44delTAA---22AD.20.000438
ORF7b44X44FtAAtTT22All0
ORF7b44X44StAAtCC12All0
ORF7b44X44StAatCa12All0
ORF7b44X44LtAatTa22AY.1130.000285
ORF7b44X44delTAA---22AY.1180.000125
ORF7b44X44del2tAAt--22AY.200.000078
ORF7b44X44XtAatGa22AY.300.000791
ORF7b44X44del2tAAt--22AY.40.000003
ORF7b44X44LtAatTa22AY.430.000009
ORF7b44X44LtAatTa22AY.460.000208
ORF7b44X44delTAA---22AY.470.000062
ORF7b44X44YtaAtaC22AY.470.000062
ORF7b44X44delTAA---22AY.480.00093
ORF7b44X44LtAatTa22AY.530.000575
ORF7b44X44KTaAAaG12AY.840.000437
ORF7b44X44KTaaAaa12AY.840.000437
ORF7b44X44del2tAAt--22AZ.20.001642
ORF7b44X44delTAA---22AZ.20.001642
ORF7b44X44del1taAta-22AZ.30.00304
ORF7b44X44delTAA---22AZ.60.016807
ORF7b44X44KTaaAaa22B.10.000018
ORF7b44X44KTaaAaa22B.1.10.000036
ORF7b44X44delTAA---22B.1.1.2140.000111
ORF7b44X44del1Taa-aa22B.1.1.2140.000111
ORF7b44X44delTAA---22B.1.1.3060.000877
ORF7b44X44YtaAtaT22B.1.1.5190.000079
ORF7b44X44LTAACTT12B.1.1770.000013
ORF7b44X44LtAatTa12B.1.1770.000013
ORF7b44X44LtAatTa22B.1.20.000018
ORF7b44X44XtaAtaG22B.1.3510.000059
ORF7b44X44del2TAa--a22B.1.360.000292
ORF7b44X44delTAA---22B.1.4270.000101
ORF7b44X44YtaAtaT22B.1.5680.002222
ORF7b44X44delTAA---22B.1.6210.000177
ORF7b44X44ETaaGaa22P.10.000032
ORF7b44X44QTaaCaa22P.10.000032
ORF7b44X44del1Taa-aa11A.10.000282
ORF7b44X44LtAatTa11A.2.40.003367
ORF7b44X44delTAA---11A.2.50.000499
ORF7b44X44delTAA---11A.23.10.000704
ORF7b44X44delTAA---11AY.1000.000046
ORF7b44X44del2TAa--a11AY.1030.000006
ORF7b44X44LtAatTa11AY.1030.000006
ORF7b44X44delTAA---11AY.1080.001103
ORF7b44X44delTAA---11AY.1170.000085
ORF7b44X44LtAatTa11AY.1180.000063
ORF7b44X44XtaAtaG11AY.1190.000035
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.1200.000037
ORF7b44X44delTAA---11AY.1200.000037
ORF7b44X44delTAA---11AY.1210.000135
ORF7b44X44YtaAtaT11AY.1210.000135
ORF7b44X44delTAA---11AY.190.00114
ORF7b44X44YtaAtaC11AY.200.000039
ORF7b44X44LtAatTa11AY.200.000039
ORF7b44X44delTAA---11AY.230.00007
ORF7b44X44LtAatTa11AY.250.000006
ORF7b44X44del2tAAt--11AY.250.000006
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.250.000006
ORF7b44X44delTAA---11AY.260.000028
ORF7b44X44YtaAtaT11AY.290.000016
ORF7b44X44XtaAtaG11AY.3.10.000085
ORF7b44X44XtaAtaG11AY.320.000532
ORF7b44X44del2tAAt--11AY.360.000148
ORF7b44X44delTAA---11AY.390.000025
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.390.000025
ORF7b44X44KTaaAaa11AY.40.000002
ORF7b44X44delTAA---11AY.4.20.000022
ORF7b44X44delTAA---11AY.4.50.000107
ORF7b44X44StAAtCC11AY.430.000004
ORF7b44X44QTaACaG11AY.430.000004
ORF7b44X44del1Taa-aa11AY.430.000004
ORF7b44X44HTaACaC11AY.430.000004
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.440.000006
ORF7b44X44LtAatTa11AY.440.000006
ORF7b44X44YtaAtaT11AY.440.000006
ORF7b44X44delTAA---11AY.460.000104
ORF7b44X44delTAA---11AY.550.000917
ORF7b44X44LtAatTa11AY.580.000907
ORF7b44X44delTAA---11AY.610.000105
ORF7b44X44delTAA---11AY.670.000464
ORF7b44X44del2TAa--a11AY.710.000475
ORF7b44X44del2tAAt--11AY.740.000116
ORF7b44X44delTAA---11AY.750.000056
ORF7b44X44ETaaGaa11AY.75.10.00018
ORF7b44X44XtaAtaG11AY.840.000437
ORF7b44X44XtAatGa11AY.9.20.000037
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.98.10.000048
ORF7b44X44delTAA---11AY.990.001049
ORF7b44X44QTaaCaa11AY.990.001049
ORF7b44X44YtaAtaT11AY.99.10.001553
ORF7b44X44del1taAta-11AZ.20.000821
ORF7b44X44XtaAtaG11AZ.30.00152
ORF7b44X44KTaaAaa11B0.000128
ORF7b44X44XtaAtaG11B.1.10.000018
ORF7b44X44YtaAtaC11B.1.1.2140.000055
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1.2160.00089
ORF7b44X44LTAACTT11B.1.1.2820.011628
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1.2840.000107
ORF7b44X44XtaAtaG11B.1.1.2940.001266
ORF7b44X44KTaaAaa11B.1.1.3060.000438
ORF7b44X44KTaaAaa11B.1.1.3160.000925
ORF7b44X44XtAatGa11B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44HTaACaT11B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44del2tAAt--11B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44CtAAtGT11B.1.1.3180.000302
ORF7b44X44YtaAtaC11B.1.1.3480.000796
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1.3540.004386
ORF7b44X44YtaAtaC11B.1.1.370.000193
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1.440.00241
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1.4640.001473
ORF7b44X44del1TAA-NN11B.1.1.70.000001
ORF7b44X44KTaaAaa11B.1.1.70.000001
ORF7b44X44del2tAAt--11B.1.1600.000031
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1770.000013
ORF7b44X44StAatCa11B.1.1770.000013
ORF7b44X44QTaaCaa11B.1.1770.000013
ORF7b44X44delTAA---11B.1.177.630.002703
ORF7b44X44delTAA---11B.1.177.70.000165
ORF7b44X44delTAA---11B.1.177.830.001481
ORF7b44X44delTAA---11B.1.1950.005025
ORF7b44X44YtaAtaT11B.1.20.000009
ORF7b44X44KTaaAaa11B.1.20.000009
ORF7b44X44del1taAta-11B.1.20.000009
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