CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = Y40del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a40Y40deldelTAC---19211921127511-27513

Details of the mutation Y40del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a40Y40delTAC---19211921All0.000367
ORF7a40Y40delTAC---352352B.1.1.70.000315
ORF7a40Y40delTAC---264264AY.40.000411
ORF7a40Y40delTAC---219219B.1.617.20.000825
ORF7a40Y40delTAC---179179B.1.177.210.013688
ORF7a40Y40delTAC---158158AY.250.00095
ORF7a40Y40delTAC---7575AY.1030.000466
ORF7a40Y40delTAC---4949AY.30.000487
ORF7a40Y40delTAC---4949AY.3.10.004178
ORF7a40Y40delTAC---4646AY.290.000726
ORF7a40Y40delTAC---4545AY.440.000274
ORF7a40Y40delTAC---3636B.1.1.2840.003866
ORF7a40Y40delTAC---3232B.1.6210.002833
ORF7a40Y40delTAC---3030AY.430.000133
ORF7a40Y40delTAC---2727B.10.000247
ORF7a40Y40delTAC---2323B.1.1.2140.001276
ORF7a40Y40delTAC---1919AY.7.20.010626
ORF7a40Y40delTAC---1515AY.390.000371
ORF7a40Y40delTAC---1212AY.46.40.001974
ORF7a40Y40delTAC---1212B.1.3240.019262
ORF7a40Y40delTAC---1111AY.470.000342
ORF7a40Y40delTAC---1111C.370.001277
ORF7a40Y40delTAC---1010AY.200.000389
ORF7a40Y40delTAC---1010B.1.1770.000132
ORF7a40Y40delTAC---99AY.1000.000414
ORF7a40Y40delTAC---99AY.230.000628
ORF7a40Y40delTAC---99AY.260.000255
ORF7a40Y40delTAC---99P.10.000142
ORF7a40Y40delTAC---88B.1.20.00007
ORF7a40Y40delTAC---66B.1.4290.000141
ORF7a40Y40delTAC---66B.1.5260.000141
ORF7a40Y40delTAC---66B.1.6370.000438
ORF7a40Y40delTAC---55AY.98.10.000242
ORF7a40Y40delTAC---55B.1.10.000091
ORF7a40Y40delTAC---55B.1.1.560.089286
ORF7a40Y40delTAC---55B.1.1600.000156
ORF7a40Y40delTAC---55B.1.177.440.002595
ORF7a40Y40delTAC---55B.1.5250.000566
ORF7a40Y40delTAC---44AY.1210.000541
ORF7a40Y40delTAC---44AY.4.20.000087
ORF7a40Y40delTAC---44AY.50.000083
ORF7a40Y40delTAC---33AY.1020.00008
ORF7a40Y40delTAC---33AY.1180.000188
ORF7a40Y40delTAC---33AY.1200.000112
ORF7a40Y40delTAC---33AY.330.0002
ORF7a40Y40delTAC---33AY.350.000699
ORF7a40Y40delTAC---33AY.4.50.000322
ORF7a40Y40delTAC---33AY.420.000121
ORF7a40Y40delTAC---33AY.540.000286
ORF7a40Y40delTAC---33AY.750.000168
ORF7a40Y40delTAC---33AY.90.000203
ORF7a40Y40delTAC---33B.1.1.250.001706
ORF7a40Y40delTAC---33B.1.2340.000396
ORF7a40Y40delTAC---33B.1.6260.017143
ORF7a40Y40delTAC---33Q.80.000495
ORF7a40Y40delTAC---22A0.000774
ORF7a40Y40delTAC---22A.280.005291
ORF7a40Y40delTAC---22AY.1100.000225
ORF7a40Y40delTAC---22AY.1140.000462
ORF7a40Y40delTAC---22AY.1190.000071
ORF7a40Y40delTAC---22AY.120.10.000642
ORF7a40Y40delTAC---22AY.29.10.000441
ORF7a40Y40delTAC---22AY.340.000194
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.177.430.002954
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.177.860.000367
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.258.110.000793
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.3510.000059
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.360.000292
ORF7a40Y40delTAC---22B.1.5960.000174
ORF7a40Y40delTAC---22C.36.30.001134
ORF7a40Y40delTAC---22R.10.00018
ORF7a40Y40delTAC---11A.10.000282
ORF7a40Y40delTAC---11AY.1080.001103
ORF7a40Y40delTAC---11AY.1130.000142
ORF7a40Y40delTAC---11AY.120.000316
ORF7a40Y40delTAC---11AY.130.000161
ORF7a40Y40delTAC---11AY.160.00038
ORF7a40Y40delTAC---11AY.16.10.00047
ORF7a40Y40delTAC---11AY.39.10.00004
ORF7a40Y40delTAC---11AY.450.000122
ORF7a40Y40delTAC---11AY.460.000104
ORF7a40Y40delTAC---11AY.5.40.000277
ORF7a40Y40delTAC---11AY.60.000041
ORF7a40Y40delTAC---11AY.610.000105
ORF7a40Y40delTAC---11AY.660.00107
ORF7a40Y40delTAC---11AY.730.000665
ORF7a40Y40delTAC---11AY.740.000116
ORF7a40Y40delTAC---11AY.760.004831
ORF7a40Y40delTAC---11AY.790.001211
ORF7a40Y40delTAC---11AY.850.000427
ORF7a40Y40delTAC---11AY.9.10.000084
ORF7a40Y40delTAC---11AY.9.20.000037
ORF7a40Y40delTAC---11AY.920.000287
ORF7a40Y40delTAC---11AY.940.000443
ORF7a40Y40delTAC---11AY.980.000079
ORF7a40Y40delTAC---11AY.99.20.000092
ORF7a40Y40delTAC---11B0.000128
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.2070.001182
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.2220.000204
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.2770.000759
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.3180.000302
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.330.000421
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.5190.00004
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1.5220.017241
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.1150.021739
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.177.620.001192
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.177.800.001912
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.177.810.000189
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.177.830.001481
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.214.20.0006
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.2210.000071
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.2400.000216
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.2430.00007
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.258.170.000104
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.351.20.000303
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.4270.00005
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.438.10.000107
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.4590.004082
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.466.20.000391
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.4680.005714
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.4700.001404
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.5350.028571
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.5820.000491
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.617.30.002985
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.6200.000946
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.6360.006711
ORF7a40Y40delTAC---11B.1.6380.052632
ORF7a40Y40delTAC---11P.1.150.000232
ORF7a40Y40delTAC---11P.1.160.000374
ORF7a40Y40delTAC---11P.20.000187