CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = V29L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a29V29LnonsynGtaTta287028290.98571427478-27480
ORF7a29V29LnonsynGtaCta2870400.013937327478-27480
ORF7a29V29LnonsynGtACtG287010.00034843227478-27480

Details of the mutation V29L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a29V29LGtaTta28292870All0.000541
ORF7a29V29LGtaCta402870All0.000008
ORF7a29V29LGtACtG12870All0
ORF7a29V29LGtaTta364365AY.40.000567
ORF7a29V29LGtaCta1365AY.40.000002
ORF7a29V29LGtaTta345357B.1.1.70.000309
ORF7a29V29LGtaCta12357B.1.1.70.000011
ORF7a29V29LGtaTta286290B.1.617.20.001077
ORF7a29V29LGtaCta4290B.1.617.20.000015
ORF7a29V29LGtaTta272276AY.430.001205
ORF7a29V29LGtaCta4276AY.430.000018
ORF7a29V29LGtaTta210217AY.250.001263
ORF7a29V29LGtaCta7217AY.250.000042
ORF7a29V29LGtaTta121122AY.1030.000751
ORF7a29V29LGtaCta1122AY.1030.000006
ORF7a29V29LGtaTta7474C.140.320346
ORF7a29V29LGtaTta7373B.1.619.10.046825
ORF7a29V29LGtaTta7070AY.1210.009472
ORF7a29V29LGtaTta6767B.1.4290.001576
ORF7a29V29LGtaTta5050B.1.4800.124378
ORF7a29V29LGtaTta4747AY.1060.01574
ORF7a29V29LGtaTta4345B.1.20.000379
ORF7a29V29LGtaCta245B.1.20.000018
ORF7a29V29LGtaTta3636B.10.00033
ORF7a29V29LGtaTta3133P.10.000488
ORF7a29V29LGtaCta233P.10.000032
ORF7a29V29LGtaTta2727AY.290.000426
ORF7a29V29LGtaTta2222AY.98.10.001065
ORF7a29V29LGtaTta2020AK.20.909091
ORF7a29V29LGtaTta2020AY.420.000805
ORF7a29V29LGtaTta2020B.1.1770.000263
ORF7a29V29LGtaTta1919AY.30.000189
ORF7a29V29LGtaTta1919AY.440.000116
ORF7a29V29LGtaTta1919C.370.002205
ORF7a29V29LGtaTta1616AY.750.000896
ORF7a29V29LGtaTta1616B.1.10.00029
ORF7a29V29LGtaTta1616B.1.351.50.009592
ORF7a29V29LGtaTta1515AY.390.000371
ORF7a29V29LGtaTta1414AY.1100.001578
ORF7a29V29LGtaTta1414B.1.438.10.001502
ORF7a29V29LGtaTta1313AY.1000.000598
ORF7a29V29LGtaTta1313AY.330.000868
ORF7a29V29LGtaTta1313B.1.1.1590.060748
ORF7a29V29LGtaTta1313B.1.177.160.008638
ORF7a29V29LGtaTta1012AY.1020.000265
ORF7a29V29LGtaCta212AY.1020.000053
ORF7a29V29LGtaTta1212B.1.3510.000357
ORF7a29V29LGtaTta1111AY.200.000428
ORF7a29V29LGtaTta1111B.1.30.028796
ORF7a29V29LGtaTta1011B.1.5260.000235
ORF7a29V29LGtaCta111B.1.5260.000024
ORF7a29V29LGtaTta99AY.460.000937
ORF7a29V29LGtaTta99B.1.6210.000797
ORF7a29V29LGtaTta88AY.50.000165
ORF7a29V29LGtaTta88AY.90.000541
ORF7a29V29LGtaTta88R.10.00072
ORF7a29V29LGtaTta77AY.1130.000997
ORF7a29V29LGtaTta67AY.70.001176
ORF7a29V29LGtaCta17AY.70.000196
ORF7a29V29LGtaTta77B.1.1600.000218
ORF7a29V29LGtaTta66AY.1170.000507
ORF7a29V29LGtaTta66AY.230.000418
ORF7a29V29LGtaTta66AY.260.00017
ORF7a29V29LGtaTta66AY.4.20.00013
ORF7a29V29LGtaTta56AY.5.30.001687
ORF7a29V29LGtACtG16AY.5.30.000337
ORF7a29V29LGtaTta66AY.640.003571
ORF7a29V29LGtaTta66B.1.2210.000426
ORF7a29V29LGtaTta55AY.1050.003215
ORF7a29V29LGtaTta55AY.380.002496
ORF7a29V29LGtaTta45AY.39.10.000158
ORF7a29V29LGtaCta15AY.39.10.00004
ORF7a29V29LGtaTta55AY.60.000206
ORF7a29V29LGtaTta55AY.9.10.000419
ORF7a29V29LGtaTta55B.1.1.10.001633
ORF7a29V29LGtaTta55B.1.2430.000348
ORF7a29V29LGtaTta55B.1.36.180.002101
ORF7a29V29LGtaTta55P.1.140.000239
ORF7a29V29LGtaTta55P.20.000933
ORF7a29V29LGtaTta44A0.001548
ORF7a29V29LGtaTta44AY.190.004561
ORF7a29V29LGtaTta44AY.4.2.10.000596
ORF7a29V29LGtaTta44AY.470.000124
ORF7a29V29LGtaTta44AY.710.0019
ORF7a29V29LGtaTta44B.1.1.1530.004381
ORF7a29V29LGtaTta44B.1.1.3020.008299
ORF7a29V29LGtaTta44B.1.177.480.0125
ORF7a29V29LGtaTta44B.1.4270.000202
ORF7a29V29LGtaTta33AY.1140.000693
ORF7a29V29LGtaTta33AY.160.001139
ORF7a29V29LGtaTta33AY.3.10.000256
ORF7a29V29LGtaTta33AY.34.10.00153
ORF7a29V29LGtaTta23AY.46.50.000397
ORF7a29V29LGtaCta13AY.46.50.000198
ORF7a29V29LGtaTta33AY.540.000286
ORF7a29V29LGtaTta33AY.610.000314
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.1.2220.000612
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.1.2940.003797
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.1.3970.006757
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.1.5160.2
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.1.5190.000119
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.2400.000647
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.2580.0002
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.360.000438
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.36.210.006479
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.3750.002459
ORF7a29V29LGtaTta33B.1.5750.00091
ORF7a29V29LGtaTta33P.1.10.000953
ORF7a29V29LGtaTta33P.1.130.002695
ORF7a29V29LGtaTta33P.1.150.000697
ORF7a29V29LGtaTta33P.1.170.000485
ORF7a29V29LGtaTta22AB.10.016393
ORF7a29V29LGtaTta22AY.1010.000981
ORF7a29V29LGtaTta22AY.120.000632
ORF7a29V29LGtaTta22AY.140.000176
ORF7a29V29LGtaTta22AY.270.000129
ORF7a29V29LGtaTta22AY.360.000296
ORF7a29V29LGtaTta22AY.590.001059
ORF7a29V29LGtaTta22AY.80.001212
ORF7a29V29LGtaTta22AY.910.001461
ORF7a29V29LGtaTta22AY.99.20.000184
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.1.2140.000111
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.1.280.000622
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.1.3110.000716
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.1.580.010753
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.160.260.004843
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.177.560.001335
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.177.800.003824
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.36.80.002
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.466.20.000782
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.5240.002813
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.5860.021978
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.5960.000174
ORF7a29V29LGtaTta22B.1.6370.000146
ORF7a29V29LGtaTta22B.400.000729
ORF7a29V29LGtaTta22C.40.02
ORF7a29V29LGtaTta22Q.80.00033
ORF7a29V29LGtaTta11A.10.000282
ORF7a29V29LGtaTta11A.2.40.003367
ORF7a29V29LGtaTta11A.230.010526
ORF7a29V29LGtaTta11A.23.10.000704
ORF7a29V29LGtaTta11A.290.005319
ORF7a29V29LGtaTta11AD.20.000219
ORF7a29V29LGtaTta11AY.120.10.000321
ORF7a29V29LGtaTta11AY.130.000161
ORF7a29V29LGtaTta11AY.320.000532
ORF7a29V29LGtaTta11AY.340.000097
ORF7a29V29LGtaTta11AY.350.000233
ORF7a29V29LGtaTta11AY.4.50.000107
ORF7a29V29LGtaTta11AY.450.000122
ORF7a29V29LGtaTta11AY.46.30.000934
ORF7a29V29LGtaTta11AY.46.60.000072
ORF7a29V29LGtaTta11AY.5.40.000277
ORF7a29V29LGtaTta11AY.550.000917
ORF7a29V29LGtaTta11AY.620.000436
ORF7a29V29LGtaTta11AY.650.000533
ORF7a29V29LGtaTta11AY.7.10.000113
ORF7a29V29LGtaTta11AY.7.20.000559
ORF7a29V29LGtaTta11AY.720.001361
ORF7a29V29LGtaTta11AY.830.001724
ORF7a29V29LGtaTta11AY.840.000437
ORF7a29V29LGtaTta11AY.9.20.000037
ORF7a29V29LGtaTta11AY.920.000287
ORF7a29V29LGtaTta11AY.980.000079
ORF7a29V29LGtaTta11B0.000128
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.1570.000913
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.2160.00089
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.2770.000759
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.3060.000438
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.3160.000925
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.3480.000796
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.4040.015873
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.4190.007407
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.5250.005464
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1.630.000386
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.1100.004525
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.160.80.001289
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.100.000878
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.210.000076
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.410.0025
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.460.000918
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.60.000977
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.600.000218
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.177.650.000665
ORF7a29V29LGtaCta11B.1.2190.009434
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.2200.01087
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.258.160.001637
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.258.170.000104
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.258.240.010753
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.2790.000514
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.2980.002114
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.351.20.000303
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.36.100.004785
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.36.290.000517
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.36.380.001642
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.4250.002994
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.4560.003268
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.4990.00105
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.5070.011236
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.5250.000113
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.6090.000479
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.6230.000536
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.6250.002353
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.6280.000352
ORF7a29V29LGtaTta11B.1.9.40.006135
ORF7a29V29LGtaTta11B.60.00091
ORF7a29V29LGtaTta11C.360.000911
ORF7a29V29LGtaTta11L.30.003546
ORF7a29V29LGtaTta11P.1.100.000269
ORF7a29V29LGtaTta11P.1.70.000319