CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = S81del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a81S81deldelTCA---68206820127634-27636

Details of the mutation S81del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a81S81delTCA---68206820All0.001304
ORF7a81S81delTCA---20362036AY.40.003169
ORF7a81S81delTCA---11871187B.1.1.70.001063
ORF7a81S81delTCA---407407AY.4.20.008827
ORF7a81S81delTCA---229229B.1.617.20.000862
ORF7a81S81delTCA---216216AY.1030.001341
ORF7a81S81delTCA---179179AY.390.004423
ORF7a81S81delTCA---179179B.1.177.210.013688
ORF7a81S81delTCA---155155AY.430.000687
ORF7a81S81delTCA---146146AY.440.000889
ORF7a81S81delTCA---114114AY.1000.005245
ORF7a81S81delTCA---113113AY.290.001782
ORF7a81S81delTCA---113113AY.30.001124
ORF7a81S81delTCA---9494AY.260.002661
ORF7a81S81delTCA---8484AY.250.000505
ORF7a81S81delTCA---7676AY.420.003057
ORF7a81S81delTCA---7373AY.980.005767
ORF7a81S81delTCA---5858AY.1200.002156
ORF7a81S81delTCA---5555B.1.1770.000724
ORF7a81S81delTCA---5555B.1.20.000484
ORF7a81S81delTCA---5454B.1.5260.001269
ORF7a81S81delTCA---4444B.1.6210.003895
ORF7a81S81delTCA---4141B.1.1.2840.004403
ORF7a81S81delTCA---3838B.10.000348
ORF7a81S81delTCA---3535P.10.000551
ORF7a81S81delTCA---3434AY.3.10.002899
ORF7a81S81delTCA---3232AY.46.60.002311
ORF7a81S81delTCA---3030AY.1190.001059
ORF7a81S81delTCA---2828AY.360.00415
ORF7a81S81delTCA---2727AY.470.00084
ORF7a81S81delTCA---2626AY.200.00101
ORF7a81S81delTCA---2626AY.7.20.014541
ORF7a81S81delTCA---2626B.1.1.2140.001442
ORF7a81S81delTCA---2525AY.50.000516
ORF7a81S81delTCA---2424AY.60.000987
ORF7a81S81delTCA---2222B.1.6370.001608
ORF7a81S81delTCA---2020B.1.3510.000595
ORF7a81S81delTCA---1919AY.46.40.003126
ORF7a81S81delTCA---1818AY.750.001008
ORF7a81S81delTCA---1717B.1.1600.00053
ORF7a81S81delTCA---1717B.1.4290.0004
ORF7a81S81delTCA---1515AY.300.005936
ORF7a81S81delTCA---1515AY.98.10.000726
ORF7a81S81delTCA---1515B.1.5250.001697
ORF7a81S81delTCA---1515C.370.001741
ORF7a81S81delTCA---1414AY.1170.001183
ORF7a81S81delTCA---1414B.1.10.000254
ORF7a81S81delTCA---1414B.1.1.2580.045603
ORF7a81S81delTCA---1212AY.1160.003441
ORF7a81S81delTCA---1212AY.230.000837
ORF7a81S81delTCA---1212AY.710.005701
ORF7a81S81delTCA---1212B.1.3240.019262
ORF7a81S81delTCA---1212R.10.00108
ORF7a81S81delTCA---1111AY.1100.00124
ORF7a81S81delTCA---1111AY.1210.001488
ORF7a81S81delTCA---1111AY.90.000744
ORF7a81S81delTCA---1111B.1.5960.000959
ORF7a81S81delTCA---1111N.70.323529
ORF7a81S81delTCA---1010AY.1180.000626
ORF7a81S81delTCA---1010AY.39.10.000396
ORF7a81S81delTCA---1010B.1.4270.000505
ORF7a81S81delTCA---1010Q.80.001649
ORF7a81S81delTCA---99AY.99.20.000829
ORF7a81S81delTCA---99B.1.1.5190.000357
ORF7a81S81delTCA---99L.10.017143
ORF7a81S81delTCA---88AY.1130.001139
ORF7a81S81delTCA---88AY.120.10.002568
ORF7a81S81delTCA---88AY.70.001568
ORF7a81S81delTCA---88B.1.1.2310.024768
ORF7a81S81delTCA---88B.1.160.310.064516
ORF7a81S81delTCA---77AY.29.10.001544
ORF7a81S81delTCA---77AY.340.000679
ORF7a81S81delTCA---77AY.350.001631
ORF7a81S81delTCA---77AY.450.000852
ORF7a81S81delTCA---77AY.540.000667
ORF7a81S81delTCA---77AY.9.20.000257
ORF7a81S81delTCA---66AY.330.000401
ORF7a81S81delTCA---66P.1.150.001394
ORF7a81S81delTCA---55AY.1060.001674
ORF7a81S81delTCA---55AY.1140.001156
ORF7a81S81delTCA---55AY.610.000524
ORF7a81S81delTCA---55AY.800.005643
ORF7a81S81delTCA---55B.1.2430.000348
ORF7a81S81delTCA---55B.1.3750.004098
ORF7a81S81delTCA---55B.1.700.121951
ORF7a81S81delTCA---44A0.001548
ORF7a81S81delTCA---44AY.1020.000106
ORF7a81S81delTCA---44AY.140.000352
ORF7a81S81delTCA---44AY.4.50.00043
ORF7a81S81delTCA---44AY.680.001095
ORF7a81S81delTCA---44B.1.1.250.002274
ORF7a81S81delTCA---44B.1.2340.000528
ORF7a81S81delTCA---44Q.10.000505
ORF7a81S81delTCA---33AY.130.000483
ORF7a81S81delTCA---33AY.240.001293
ORF7a81S81delTCA---33AY.370.000948
ORF7a81S81delTCA---33AY.530.000863
ORF7a81S81delTCA---33AY.7.10.000338
ORF7a81S81delTCA---33AY.880.002653
ORF7a81S81delTCA---33B.1.1.1210.007282
ORF7a81S81delTCA---33B.1.1.1700.003741
ORF7a81S81delTCA---33B.1.1.370.000579
ORF7a81S81delTCA---33B.1.214.20.001799
ORF7a81S81delTCA---33B.1.351.20.000908
ORF7a81S81delTCA---33B.1.5750.00091
ORF7a81S81delTCA---33B.1.6260.017143
ORF7a81S81delTCA---33C.120.021583
ORF7a81S81delTCA---220.111111
ORF7a81S81delTCA---22A.280.005291
ORF7a81S81delTCA---22AY.1080.002205
ORF7a81S81delTCA---22AY.1090.001479
ORF7a81S81delTCA---22AY.190.002281
ORF7a81S81delTCA---22AY.270.000129
ORF7a81S81delTCA---22AY.4.2.10.000298
ORF7a81S81delTCA---22AY.460.000208
ORF7a81S81delTCA---22AY.480.00093
ORF7a81S81delTCA---22AY.650.001066
ORF7a81S81delTCA---22AY.75.10.000361
ORF7a81S81delTCA---22AY.850.000854
ORF7a81S81delTCA---22AY.9.10.000167
ORF7a81S81delTCA---22AY.900.001369
ORF7a81S81delTCA---22AY.910.001461
ORF7a81S81delTCA---22AY.920.000575
ORF7a81S81delTCA---22AY.990.002099
ORF7a81S81delTCA---22B0.000256
ORF7a81S81delTCA---22B.1.1.2200.003717
ORF7a81S81delTCA---22B.1.1.5210.010695
ORF7a81S81delTCA---22B.1.1.700.000682
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.100.001756
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.150.001262
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.550.004662
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.600.000437
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.810.000379
ORF7a81S81delTCA---22B.1.177.860.000367
ORF7a81S81delTCA---22B.1.2210.000142
ORF7a81S81delTCA---22B.1.2400.000431
ORF7a81S81delTCA---22B.1.2580.000133
ORF7a81S81delTCA---22B.1.258.110.000793
ORF7a81S81delTCA---22B.1.360.000292
ORF7a81S81delTCA---22B.1.4990.002101
ORF7a81S81delTCA---22B.1.517.10.010526
ORF7a81S81delTCA---22B.1.5950.000522
ORF7a81S81delTCA---22P.1.140.000096
ORF7a81S81delTCA---11A.10.000282
ORF7a81S81delTCA---11A.2.20.001689
ORF7a81S81delTCA---11A.230.010526
ORF7a81S81delTCA---11AU.30.00211
ORF7a81S81delTCA---11AY.1010.00049
ORF7a81S81delTCA---11AY.1040.001984
ORF7a81S81delTCA---11AY.1110.000183
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ORF7a81S81delTCA---11AY.950.000761
ORF7a81S81delTCA---11AZ.20.000821
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.10.000327
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.1740.003378
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.1920.002309
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ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.2050.003717
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.2070.001182
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.2650.003155
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.2770.000759
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.3030.002762
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ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.330.000421
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.3660.015873
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.4370.010417
ORF7a81S81delTCA---11B.1.1.4480.002033
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ORF7a81S81delTCA---11B.1.177.310.011494
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ORF7a81S81delTCA---11B.1.177.500.004695
ORF7a81S81delTCA---11B.1.177.60.000977
ORF7a81S81delTCA---11B.1.177.620.001192
ORF7a81S81delTCA---11B.1.221.10.002907
ORF7a81S81delTCA---11B.1.2360.002053
ORF7a81S81delTCA---11B.1.2520.006623
ORF7a81S81delTCA---11B.1.258.170.000104
ORF7a81S81delTCA---11B.1.2650.001271
ORF7a81S81delTCA---11B.1.3190.003049
ORF7a81S81delTCA---11B.1.351.30.000876
ORF7a81S81delTCA---11B.1.36.310.001751
ORF7a81S81delTCA---11B.1.3710.001122
ORF7a81S81delTCA---11B.1.3960.000706
ORF7a81S81delTCA---11B.1.4060.006061
ORF7a81S81delTCA---11B.1.4590.004082
ORF7a81S81delTCA---11B.1.466.20.000391
ORF7a81S81delTCA---11B.1.4680.005714
ORF7a81S81delTCA---11B.1.4700.001404
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5270.003704
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5350.028571
ORF7a81S81delTCA---11B.1.564.10.001577
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5680.001111
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5760.000907
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5770.000687
ORF7a81S81delTCA---11B.1.5820.000491
ORF7a81S81delTCA---11B.1.6020.006536
ORF7a81S81delTCA---11B.1.617.10.000129
ORF7a81S81delTCA---11B.1.6200.000946
ORF7a81S81delTCA---11B.1.621.10.000506
ORF7a81S81delTCA---11B.1.6280.000352
ORF7a81S81delTCA---11B.1.6380.052632
ORF7a81S81delTCA---11B.1.88.10.004808
ORF7a81S81delTCA---11B.1.9.10.032258
ORF7a81S81delTCA---11B.1.930.000934
ORF7a81S81delTCA---11C.36.30.000567
ORF7a81S81delTCA---11D.20.000075
ORF7a81S81delTCA---11N.50.001767
ORF7a81S81delTCA---11P.1.10.000318
ORF7a81S81delTCA---11P.1.130.000898
ORF7a81S81delTCA---11P.1.160.000374
ORF7a81S81delTCA---11P.1.30.034483
ORF7a81S81delTCA---11P.1.40.000977
ORF7a81S81delTCA---11P.20.000187
ORF7a81S81delTCA---11Q.70.001111