CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = S37del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a37S37deldelTCT---16901690127502-27504

Details of the mutation S37del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a37S37delTCT---16901690All0.000323
ORF7a37S37delTCT---335335AY.40.000521
ORF7a37S37delTCT---311311B.1.1.70.000278
ORF7a37S37delTCT---199199B.1.617.20.000749
ORF7a37S37delTCT---179179B.1.177.210.013688
ORF7a37S37delTCT---126126AY.250.000758
ORF7a37S37delTCT---5757AY.1030.000354
ORF7a37S37delTCT---4545AY.30.000448
ORF7a37S37delTCT---4343AY.290.000678
ORF7a37S37delTCT---3939AY.440.000237
ORF7a37S37delTCT---2121AY.430.000093
ORF7a37S37delTCT---2121B.1.1.2140.001165
ORF7a37S37delTCT---2121U.10.269231
ORF7a37S37delTCT---1717AY.7.20.009508
ORF7a37S37delTCT---1616AY.3.10.001364
ORF7a37S37delTCT---1414C.370.001625
ORF7a37S37delTCT---1313AY.390.000321
ORF7a37S37delTCT---1111B.10.000101
ORF7a37S37delTCT---1010B.1.20.000088
ORF7a37S37delTCT---99B.1.1.2840.000967
ORF7a37S37delTCT---99P.10.000142
ORF7a37S37delTCT---88AY.230.000558
ORF7a37S37delTCT---88AY.470.000249
ORF7a37S37delTCT---77AY.200.000272
ORF7a37S37delTCT---66AY.1000.000276
ORF7a37S37delTCT---66AY.260.00017
ORF7a37S37delTCT---66B.1.1770.000079
ORF7a37S37delTCT---66B.1.177.440.003114
ORF7a37S37delTCT---55B.1.1.560.089286
ORF7a37S37delTCT---55B.1.4290.000118
ORF7a37S37delTCT---55B.1.5260.000118
ORF7a37S37delTCT---55B.1.6370.000365
ORF7a37S37delTCT---44AY.1210.000541
ORF7a37S37delTCT---44AY.4.20.000087
ORF7a37S37delTCT---44AY.98.10.000194
ORF7a37S37delTCT---33AY.1060.001005
ORF7a37S37delTCT---33AY.1180.000188
ORF7a37S37delTCT---33AY.4.50.000322
ORF7a37S37delTCT---33AY.420.000121
ORF7a37S37delTCT---33B.1.1.250.001706
ORF7a37S37delTCT---33B.1.2340.000396
ORF7a37S37delTCT---33B.1.3510.000089
ORF7a37S37delTCT---33B.1.6260.017143
ORF7a37S37delTCT---33Q.80.000495
ORF7a37S37delTCT---22A.280.005291
ORF7a37S37delTCT---22AY.1190.000071
ORF7a37S37delTCT---22AY.1200.000074
ORF7a37S37delTCT---22AY.29.10.000441
ORF7a37S37delTCT---22AY.330.000134
ORF7a37S37delTCT---22AY.340.000194
ORF7a37S37delTCT---22AY.50.000041
ORF7a37S37delTCT---22AY.5.30.000675
ORF7a37S37delTCT---22AY.750.000112
ORF7a37S37delTCT---22AY.90.000135
ORF7a37S37delTCT---22B.1.10.000036
ORF7a37S37delTCT---22B.1.1600.000062
ORF7a37S37delTCT---22B.1.177.430.002954
ORF7a37S37delTCT---22B.1.177.860.000367
ORF7a37S37delTCT---22B.1.2580.000133
ORF7a37S37delTCT---22B.1.258.110.000793
ORF7a37S37delTCT---22B.1.360.000292
ORF7a37S37delTCT---22B.1.5960.000174
ORF7a37S37delTCT---22C.36.30.001134
ORF7a37S37delTCT---11A0.000387
ORF7a37S37delTCT---11A.10.000282
ORF7a37S37delTCT---11AY.1020.000027
ORF7a37S37delTCT---11AY.1080.001103
ORF7a37S37delTCT---11AY.1100.000113
ORF7a37S37delTCT---11AY.1130.000142
ORF7a37S37delTCT---11AY.116.10.000311
ORF7a37S37delTCT---11AY.120.000316
ORF7a37S37delTCT---11AY.120.10.000321
ORF7a37S37delTCT---11AY.16.10.00047
ORF7a37S37delTCT---11AY.34.10.00051
ORF7a37S37delTCT---11AY.39.10.00004
ORF7a37S37delTCT---11AY.450.000122
ORF7a37S37delTCT---11AY.5.40.000277
ORF7a37S37delTCT---11AY.510.000909
ORF7a37S37delTCT---11AY.540.000095
ORF7a37S37delTCT---11AY.60.000041
ORF7a37S37delTCT---11AY.610.000105
ORF7a37S37delTCT---11AY.660.00107
ORF7a37S37delTCT---11AY.760.004831
ORF7a37S37delTCT---11AY.790.001211
ORF7a37S37delTCT---11AY.9.10.000084
ORF7a37S37delTCT---11AY.9.20.000037
ORF7a37S37delTCT---11AY.920.000287
ORF7a37S37delTCT---11AY.940.000443
ORF7a37S37delTCT---11AY.980.000079
ORF7a37S37delTCT---11AY.99.20.000092
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1.2070.001182
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1.2220.000204
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1.3180.000302
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1.5190.00004
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1.5220.017241
ORF7a37S37delTCT---11B.1.1150.021739
ORF7a37S37delTCT---11B.1.177.800.001912
ORF7a37S37delTCT---11B.1.177.810.000189
ORF7a37S37delTCT---11B.1.177.830.001481
ORF7a37S37delTCT---11B.1.2210.000071
ORF7a37S37delTCT---11B.1.2400.000216
ORF7a37S37delTCT---11B.1.258.170.000104
ORF7a37S37delTCT---11B.1.4270.00005
ORF7a37S37delTCT---11B.1.438.10.000107
ORF7a37S37delTCT---11B.1.4590.004082
ORF7a37S37delTCT---11B.1.466.20.000391
ORF7a37S37delTCT---11B.1.4680.005714
ORF7a37S37delTCT---11B.1.4700.001404
ORF7a37S37delTCT---11B.1.617.30.002985
ORF7a37S37delTCT---11B.1.6200.000946
ORF7a37S37delTCT---11B.1.6300.005236
ORF7a37S37delTCT---11B.1.6360.006711
ORF7a37S37delTCT---11R.10.00009