CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = L116del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a116L116deldelCTC---32243224127739-27741

Details of the mutation L116del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a116L116delCTC---32243224All0.000617
ORF7a116L116delCTC---11101110B.1.1.70.000994
ORF7a116L116delCTC---420420AY.40.000654
ORF7a116L116delCTC---183183AY.830.315517
ORF7a116L116delCTC---152152AY.250.000914
ORF7a116L116delCTC---9898AY.330.006544
ORF7a116L116delCTC---9595B.1.617.20.000358
ORF7a116L116delCTC---7676AY.30.000756
ORF7a116L116delCTC---6262AY.290.000978
ORF7a116L116delCTC---5656AY.460.005828
ORF7a116L116delCTC---5555AY.440.000335
ORF7a116L116delCTC---5252AY.260.001472
ORF7a116L116delCTC---4949AY.1030.000304
ORF7a116L116delCTC---4848AY.420.001931
ORF7a116L116delCTC---4444AY.430.000195
ORF7a116L116delCTC---4141B.1.20.000361
ORF7a116L116delCTC---4141P.10.000646
ORF7a116L116delCTC---3434AY.740.003932
ORF7a116L116delCTC---3030B.10.000275
ORF7a116L116delCTC---2626AY.70.005096
ORF7a116L116delCTC---2121AY.530.006038
ORF7a116L116delCTC---2020B.1.1770.000263
ORF7a116L116delCTC---2020B.1.3700.16
ORF7a116L116delCTC---1919AY.390.00047
ORF7a116L116delCTC---1919B.1.1.5190.000755
ORF7a116L116delCTC---1818AY.1020.000477
ORF7a116L116delCTC---1717B.1.10.000308
ORF7a116L116delCTC---1717B.1.1.2140.000943
ORF7a116L116delCTC---1717B.1.5260.0004
ORF7a116L116delCTC---1616AY.1130.002278
ORF7a116L116delCTC---1515B.1.2340.001979
ORF7a116L116delCTC---1414B.1.1.370.0027
ORF7a116L116delCTC---1313AY.1210.001759
ORF7a116L116delCTC---1010AY.1190.000353
ORF7a116L116delCTC---1010AY.60.000411
ORF7a116L116delCTC---88AY.1200.000297
ORF7a116L116delCTC---88AY.910.005844
ORF7a116L116delCTC---88B.1.3510.000238
ORF7a116L116delCTC---77B.1.1.2840.000752
ORF7a116L116delCTC---66AY.200.000233
ORF7a116L116delCTC---66B.1.4290.000141
ORF7a116L116delCTC---66C.370.000696
ORF7a116L116delCTC---66D.20.00045
ORF7a116L116delCTC---55AY.4.20.000108
ORF7a116L116delCTC---55AY.46.60.000361
ORF7a116L116delCTC---55AY.790.006053
ORF7a116L116delCTC---55B.1.1.3180.001509
ORF7a116L116delCTC---55B.1.258.170.00052
ORF7a116L116delCTC---55B.1.6210.000443
ORF7a116L116delCTC---55P.1.70.001596
ORF7a116L116delCTC---55P.20.000933
ORF7a116L116delCTC---44AY.1140.000924
ORF7a116L116delCTC---44AY.1180.000251
ORF7a116L116delCTC---44AY.120.10.001284
ORF7a116L116delCTC---44AY.4.50.00043
ORF7a116L116delCTC---44AY.750.000224
ORF7a116L116delCTC---44B.1.1600.000125
ORF7a116L116delCTC---44B.1.177.70.000659
ORF7a116L116delCTC---44B.1.6280.001409
ORF7a116L116delCTC---44N.70.117647
ORF7a116L116delCTC---44P.1.140.000191
ORF7a116L116delCTC---44Q.80.00066
ORF7a116L116delCTC---33AY.1050.001929
ORF7a116L116delCTC---33AY.270.000194
ORF7a116L116delCTC---33AY.470.000093
ORF7a116L116delCTC---33AY.50.000062
ORF7a116L116delCTC---33AY.7.20.001678
ORF7a116L116delCTC---33B.1.1.580.016129
ORF7a116L116delCTC---33B.1.2210.000213
ORF7a116L116delCTC---33B.1.351.20.000908
ORF7a116L116delCTC---33B.1.360.000438
ORF7a116L116delCTC---33B.1.3890.003006
ORF7a116L116delCTC---33B.1.4270.000151
ORF7a116L116delCTC---33B.1.5250.000339
ORF7a116L116delCTC---33B.1.5750.00091
ORF7a116L116delCTC---33B.1.6260.017143
ORF7a116L116delCTC---33P.1.150.000697
ORF7a116L116delCTC---22AY.1000.000092
ORF7a116L116delCTC---22AY.1080.002205
ORF7a116L116delCTC---22AY.1160.000574
ORF7a116L116delCTC---22AY.1170.000169
ORF7a116L116delCTC---22AY.140.000176
ORF7a116L116delCTC---22AY.230.000139
ORF7a116L116delCTC---22AY.3.10.000171
ORF7a116L116delCTC---22AY.450.000243
ORF7a116L116delCTC---22AY.46.50.000397
ORF7a116L116delCTC---22AY.5.30.000675
ORF7a116L116delCTC---22AY.720.002721
ORF7a116L116delCTC---22AY.75.10.000361
ORF7a116L116delCTC---22AY.90.000135
ORF7a116L116delCTC---22B.1.1.1550.142857
ORF7a116L116delCTC---22B.1.1.330.000842
ORF7a116L116delCTC---22B.1.177.570.000562
ORF7a116L116delCTC---22B.1.177.600.000437
ORF7a116L116delCTC---22B.1.177.860.000367
ORF7a116L116delCTC---22B.1.2430.000139
ORF7a116L116delCTC---22B.1.2580.000133
ORF7a116L116delCTC---22B.1.258.110.000793
ORF7a116L116delCTC---22B.1.3110.000549
ORF7a116L116delCTC---22B.1.5960.000174
ORF7a116L116delCTC---22B.1.6120.005305
ORF7a116L116delCTC---22B.1.621.10.001012
ORF7a116L116delCTC---22P.1.100.000539
ORF7a116L116delCTC---22R.10.00018
ORF7a116L116delCTC---11A0.000387
ORF7a116L116delCTC---11A.10.000282
ORF7a116L116delCTC---11A.2.20.001689
ORF7a116L116delCTC---11A.230.010526
ORF7a116L116delCTC---11A.280.002646
ORF7a116L116delCTC---11AH.30.003802
ORF7a116L116delCTC---11AU.10.001266
ORF7a116L116delCTC---11AY.100.00053
ORF7a116L116delCTC---11AY.1010.00049
ORF7a116L116delCTC---11AY.1090.00074
ORF7a116L116delCTC---11AY.130.000161
ORF7a116L116delCTC---11AY.240.000431
ORF7a116L116delCTC---11AY.300.000396
ORF7a116L116delCTC---11AY.320.000532
ORF7a116L116delCTC---11AY.340.000097
ORF7a116L116delCTC---11AY.360.000148
ORF7a116L116delCTC---11AY.380.000499
ORF7a116L116delCTC---11AY.490.003195
ORF7a116L116delCTC---11AY.540.000095
ORF7a116L116delCTC---11AY.600.000938
ORF7a116L116delCTC---11AY.610.000105
ORF7a116L116delCTC---11AY.7.10.000113
ORF7a116L116delCTC---11AY.700.000209
ORF7a116L116delCTC---11AY.710.000475
ORF7a116L116delCTC---11AY.850.000427
ORF7a116L116delCTC---11AY.870.000833
ORF7a116L116delCTC---11AY.9.10.000084
ORF7a116L116delCTC---11AY.98.10.000048
ORF7a116L116delCTC---11AZ.20.000821
ORF7a116L116delCTC---11AZ.30.00152
ORF7a116L116delCTC---11B0.000128
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.2310.003096
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.2650.003155
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.2800.003086
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.3120.001912
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.3310.011628
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.4110.014706
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.4370.010417
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.4480.002033
ORF7a116L116delCTC---11B.1.1.700.000341
ORF7a116L116delCTC---11B.1.110.30.000718
ORF7a116L116delCTC---11B.1.177.210.000076
ORF7a116L116delCTC---11B.1.177.440.000519
ORF7a116L116delCTC---11B.1.177.500.004695
ORF7a116L116delCTC---11B.1.177.800.001912
ORF7a116L116delCTC---11B.1.214.20.0006
ORF7a116L116delCTC---11B.1.2320.000537
ORF7a116L116delCTC---11B.1.2350.002519
ORF7a116L116delCTC---11B.1.2400.000216
ORF7a116L116delCTC---11B.1.2650.001271
ORF7a116L116delCTC---11B.1.3620.001541
ORF7a116L116delCTC---11B.1.3710.001122
ORF7a116L116delCTC---11B.1.4590.004082
ORF7a116L116delCTC---11B.1.4680.005714
ORF7a116L116delCTC---11B.1.4700.001404
ORF7a116L116delCTC---11B.1.5030.002488
ORF7a116L116delCTC---11B.1.5170.000427
ORF7a116L116delCTC---11B.1.5270.003704
ORF7a116L116delCTC---11B.1.6090.000479
ORF7a116L116delCTC---11B.1.6300.005236
ORF7a116L116delCTC---11B.1.6370.000073
ORF7a116L116delCTC---11B.120.00641
ORF7a116L116delCTC---11N.50.001767
ORF7a116L116delCTC---11P.1.10.000318
ORF7a116L116delCTC---11P.1.120.000484
ORF7a116L116delCTC---11P.1.160.000374
ORF7a116L116delCTC---11P.1.170.000162
ORF7a116L116delCTC---11Q.10.000126