CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = L116L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a116L116LsynctCctT840081300.96785727739-27741
ORF7a116L116LsynctCctA84002150.025595227739-27741
ORF7a116L116LsynctCctG8400480.0057142927739-27741
ORF7a116L116LsynCtCTtA840070.00083333327739-27741

Details of the mutation L116L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a116L116LctCctT81308400All0.001555
ORF7a116L116LctCctA2158400All0.000041
ORF7a116L116LctCctG488400All0.000009
ORF7a116L116LCtCTtA78400All0.000001
ORF7a116L116LctCctT25662598B.1.1.70.002297
ORF7a116L116LctCctA182598B.1.1.70.000016
ORF7a116L116LctCctG132598B.1.1.70.000012
ORF7a116L116LCtCTtA12598B.1.1.70.000001
ORF7a116L116LctCctT392539AY.40.00061
ORF7a116L116LctCctA147539AY.40.000229
ORF7a116L116LctCctT473478B.1.20.004165
ORF7a116L116LctCctA5478B.1.20.000044
ORF7a116L116LctCctT357367B.1.617.20.001344
ORF7a116L116LctCctA9367B.1.617.20.000034
ORF7a116L116LctCctG1367B.1.617.20.000004
ORF7a116L116LctCctT294300AY.440.00179
ORF7a116L116LctCctG4300AY.440.000024
ORF7a116L116LctCctA1300AY.440.000006
ORF7a116L116LCtCTtA1300AY.440.000006
ORF7a116L116LctCctT279290B.10.002556
ORF7a116L116LctCctG6290B.10.000055
ORF7a116L116LctCctA5290B.10.000046
ORF7a116L116LctCctT238238AY.1030.001478
ORF7a116L116LctCctT223224B.1.1770.002936
ORF7a116L116LctCctG1224B.1.1770.000013
ORF7a116L116LctCctT172173AY.30.001711
ORF7a116L116LctCctG1173AY.30.00001
ORF7a116L116LctCctT157158AY.430.000696
ORF7a116L116LctCctA1158AY.430.000004
ORF7a116L116LctCctT143145P.10.002253
ORF7a116L116LctCctA1145P.10.000016
ORF7a116L116LctCctG1145P.10.000016
ORF7a116L116LctCctT129135AY.250.000776
ORF7a116L116LctCctA5135AY.250.00003
ORF7a116L116LctCctG1135AY.250.000006
ORF7a116L116LctCctT127130B.1.5960.011067
ORF7a116L116LctCctG3130B.1.5960.000261
ORF7a116L116LctCctT127127B.1.177.560.08478
ORF7a116L116LctCctT121121B.1.1.500.082145
ORF7a116L116LctCctT106106B.1.2210.007529
ORF7a116L116LctCctT8989B.1.5260.002092
ORF7a116L116LctCctT8586AY.200.003304
ORF7a116L116LctCctA186AY.200.000039
ORF7a116L116LctCctT7878AY.470.002426
ORF7a116L116LctCctT7375B.1.10.001324
ORF7a116L116LctCctG275B.1.10.000036
ORF7a116L116LctCctT6363B.1.177.810.011927
ORF7a116L116LctCctT5659AY.260.001585
ORF7a116L116LctCctG359AY.260.000085
ORF7a116L116LctCctT5858B.1.1.2310.179567
ORF7a116L116LctCctT5555AY.1130.007831
ORF7a116L116LctCctT5355B.1.2430.003688
ORF7a116L116LctCctA255B.1.2430.000139
ORF7a116L116LctCctT4747AY.3.10.004007
ORF7a116L116LctCctT4747B.1.1.5190.001866
ORF7a116L116LctCctT4242AY.4.20.000911
ORF7a116L116LctCctT4242B.1.4290.000988
ORF7a116L116LctCctT4141B.1.6370.002996
ORF7a116L116LctCctT3737AY.50.000764
ORF7a116L116LctCctT3535B.1.1.510.060137
ORF7a116L116LctCctT3535B.1.4270.001767
ORF7a116L116LctCctT3232AY.39.10.001268
ORF7a116L116LctCctT3232B.1.36.160.045584
ORF7a116L116LctCctT3131B.1.1.4340.010805
ORF7a116L116LctCctT2729AY.1170.002282
ORF7a116L116LctCctA229AY.1170.000169
ORF7a116L116LctCctT2929N.100.852941
ORF7a116L116LctCctT2728AY.1020.000716
ORF7a116L116LctCctA128AY.1020.000027
ORF7a116L116LctCctT2727AY.290.000426
ORF7a116L116LctCctT2626AY.9.20.000955
ORF7a116L116LctCctT2525B.1.5510.032258
ORF7a116L116LctCctT2424B.1.1.2220.004896
ORF7a116L116LctCctT2323P.1.140.001099
ORF7a116L116LctCctT2121C.370.002437
ORF7a116L116LctCctT2020B.1.2340.002639
ORF7a116L116LctCctT2020P.1.150.004647
ORF7a116L116LctCctT1919B.1.177.210.001453
ORF7a116L116LctCctT1919P.20.003546
ORF7a116L116LctCctT1818B.1.3110.004942
ORF7a116L116LctCctT1717AY.330.001135
ORF7a116L116LctCctT1616AY.230.001116
ORF7a116L116LctCctT1416AY.390.000346
ORF7a116L116LctCctG216AY.390.000049
ORF7a116L116LctCctT1616B.1.36.290.008277
ORF7a116L116LctCctT1415AY.1000.000644
ORF7a116L116LctCctA115AY.1000.000046
ORF7a116L116LctCctT1515AY.1190.00053
ORF7a116L116LctCctT1415B.1.3510.000416
ORF7a116L116LctCctG115B.1.3510.00003
ORF7a116L116LctCctT1414B.1.1.3970.031532
ORF7a116L116LctCctT1414B.1.5500.191781
ORF7a116L116LctCctT1114B.1.5610.004367
ORF7a116L116LctCctA314B.1.5610.001191
ORF7a116L116LctCctT1414B.1.617.10.001806
ORF7a116L116LctCctT1113AY.420.000443
ORF7a116L116LctCctG213AY.420.00008
ORF7a116L116LctCctT1313AY.450.001582
ORF7a116L116LctCctT1313AY.610.001362
ORF7a116L116LctCctT1313AY.980.001027
ORF7a116L116LctCctT1313B.1.1110.015276
ORF7a116L116LctCctT1313B.1.160.270.19697
ORF7a116L116LctCctT1313Q.80.002144
ORF7a116L116LctCctT1112AY.1200.000409
ORF7a116L116LctCctA112AY.1200.000037
ORF7a116L116LctCctT1212AY.350.002797
ORF7a116L116LctCctT1212AY.360.001779
ORF7a116L116LctCctT1212B.1.360.001751
ORF7a116L116LctCctT1212B.1.5160.023483
ORF7a116L116LctCctT1111C.340.407407
ORF7a116L116LctCctT1010B.1.5250.001132
ORF7a116L116LctCctT1010P.1.40.009766
ORF7a116L116LctCctT99AY.20.003205
ORF7a116L116LctCctT99AY.740.001041
ORF7a116L116LctCctT99B.1.1.280.002801
ORF7a116L116LctCctT89B.1.2580.000532
ORF7a116L116LctCctA19B.1.2580.000067
ORF7a116L116LctCctT88AY.46.60.000578
ORF7a116L116LctCctT88AY.75.10.001442
ORF7a116L116LctCctT88B.1.1.330.003367
ORF7a116L116LctCctT88B.1.177.350.005529
ORF7a116L116LctCctT88B.1.438.10.000858
ORF7a116L116LctCctT88B.1.6210.000708
ORF7a116L116LctCctT78D.20.000525
ORF7a116L116LctCctA18D.20.000075
ORF7a116L116LctCctT77AY.950.005327
ORF7a116L116LctCctT77B.1.1.3050.027027
ORF7a116L116LctCctT77B.1.1.3060.003069
ORF7a116L116LctCctT77B.1.1.370.00135
ORF7a116L116LctCctT77B.1.466.20.002739
ORF7a116L116LctCctT77B.1.4990.007353
ORF7a116L116LctCctT66AY.29.10.001323
ORF7a116L116LctCctT66AY.460.000624
ORF7a116L116LctCctT56AY.750.00028
ORF7a116L116LctCctA16AY.750.000056
ORF7a116L116LctCctT66AY.90.000406
ORF7a116L116LctCctT66B.1.1.2840.000644
ORF7a116L116LctCctT66B.1.1600.000187
ORF7a116L116LctCctT66B.1.160.170.010204
ORF7a116L116LctCctT66B.1.177.70.000989
ORF7a116L116LctCctT66B.1.258.220.016
ORF7a116L116LctCctT66C.260.044118
ORF7a116L116LctCctT55AY.1100.000563
ORF7a116L116LctCctT25AY.60.000082
ORF7a116L116LctCctG25AY.60.000082
ORF7a116L116LctCctA15AY.60.000041
ORF7a116L116LctCctT55AY.99.20.000461
ORF7a116L116LctCctT55B.1.1.1570.004566
ORF7a116L116LctCctT55B.1.1.1760.002197
ORF7a116L116LctCctT55B.1.1.3490.051546
ORF7a116L116LctCctA35B.1.258.170.000312
ORF7a116L116LctCctT25B.1.258.170.000208
ORF7a116L116LctCctT55B.1.5750.001517
ORF7a116L116LctCctT44A.10.001127
ORF7a116L116LctCctT44AY.100.00212
ORF7a116L116LctCctT44AY.320.00213
ORF7a116L116LctCctT44B.1.1.3180.001207
ORF7a116L116LctCctT44B.1.2320.002149
ORF7a116L116LctCctT44B.1.351.20.00121
ORF7a116L116LctCctT44B.1.3690.001141
ORF7a116L116LctCctT44P.1.170.000647
ORF7a116L116LctCctT44Q.40.001819
ORF7a116L116LctCctT33A.2.50.001497
ORF7a116L116LctCctT33A.23.10.002113
ORF7a116L116LctCctT33AY.1070.001398
ORF7a116L116LctCctT33AY.1080.003308
ORF7a116L116LctCctT33AY.1180.000188
ORF7a116L116LctCctT33AY.270.000194
ORF7a116L116LctCctT33AY.380.001498
ORF7a116L116LctCctT33AY.590.001589
ORF7a116L116LctCctT33AY.850.001282
ORF7a116L116LctCctT33B0.000383
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.2160.002671
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.3170.001235
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.3290.011538
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.3440.032258
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.3480.002389
ORF7a116L116LctCctT33B.1.1.4320.003797
ORF7a116L116LctCctT33B.1.177.170.002463
ORF7a116L116LctCctT33B.1.177.60.00293
ORF7a116L116LctCctT33B.1.177.730.001699
ORF7a116L116LctCctT33B.1.2400.000647
ORF7a116L116LctCctT33B.1.258.140.002941
ORF7a116L116LctCctT33B.1.3260.022727
ORF7a116L116LctCctT33B.1.36.10.003421
ORF7a116L116LctCctT33B.1.36.180.001261
ORF7a116L116LctCctT33B.1.3750.002459
ORF7a116L116LctCctT33B.1.3990.005803
ORF7a116L116LctCctT33B.1.4200.03125
ORF7a116L116LctCctT33B.1.619.10.001924
ORF7a116L116LctCctT33P.1.120.001452
ORF7a116L116LctCctT22AA.50.032258
ORF7a116L116LctCctA22AE.10.022727
ORF7a116L116LctCctT22AY.10.000791
ORF7a116L116LCtCTtA22AY.160.000759
ORF7a116L116LctCctT22AY.4.50.000215
ORF7a116L116LctCctT22AY.46.40.000329
ORF7a116L116LctCctT22AY.5.40.000553
ORF7a116L116LctCctT22AY.670.000929
ORF7a116L116LctCctT22AY.690.000373
ORF7a116L116LctCctT22AY.860.00166
ORF7a116L116LctCctT22AY.98.10.000097
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.10.000653
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.1890.003026
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.2140.000111
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.2320.00363
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.250.001137
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.3220.017544
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.410.012658
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.4160.00181
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.4480.004065
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1.80.007168
ORF7a116L116LctCctT22B.1.1270.004396
ORF7a116L116LctCctT22B.1.177.120.000303
ORF7a116L116LctCctT22B.1.177.240.002591
ORF7a116L116LctCctT22B.1.177.570.000562
ORF7a116L116LctCctT22B.1.30.005236
ORF7a116L116LctCctT22B.1.3200.002491
ORF7a116L116LctCctT22B.1.3240.00321
ORF7a116L116LctCctT22B.1.351.30.001753
ORF7a116L116LctCctT22B.1.4220.001625
ORF7a116L116LctCctT22B.1.466.10.014388
ORF7a116L116LctCctT22B.1.4690.00722
ORF7a116L116LctCctT22B.1.5170.000854
ORF7a116L116LctCctT22B.1.5640.000852
ORF7a116L116LctCctT22B.1.5950.000522
ORF7a116L116LctCctT22B.1.621.10.001012
ORF7a116L116LctCctA12B.6.60.000889
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