CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = F59del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a59F59deldelTTT---3267132671127568-27570

Details of the mutation F59del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a59F59delTTT---3267132671All0.006249
ORF7a59F59delTTT---1215012150AY.40.018911
ORF7a59F59delTTT---41304130B.1.1.70.003697
ORF7a59F59delTTT---34323432B.1.617.20.012923
ORF7a59F59delTTT---16661666AY.120.10.534831
ORF7a59F59delTTT---15911591AY.250.00957
ORF7a59F59delTTT---968968AY.430.004289
ORF7a59F59delTTT---662662AY.1030.00411
ORF7a59F59delTTT---586586AY.440.003567
ORF7a59F59delTTT---494494AY.30.004914
ORF7a59F59delTTT---441441AY.260.012485
ORF7a59F59delTTT---390390AY.390.009637
ORF7a59F59delTTT---337337AY.1020.008935
ORF7a59F59delTTT---276276AY.46.50.054762
ORF7a59F59delTTT---273273AY.290.004306
ORF7a59F59delTTT---257257AY.4.20.005574
ORF7a59F59delTTT---225225AY.1200.008365
ORF7a59F59delTTT---216216B.1.3510.006421
ORF7a59F59delTTT---185185B.1.177.210.014147
ORF7a59F59delTTT---174174AY.980.013745
ORF7a59F59delTTT---158158B.1.5260.003714
ORF7a59F59delTTT---147147AY.50.003035
ORF7a59F59delTTT---134134B.10.001227
ORF7a59F59delTTT---130130AY.540.012395
ORF7a59F59delTTT---126126AY.470.003919
ORF7a59F59delTTT---125125AY.1000.005751
ORF7a59F59delTTT---124124B.1.1770.001633
ORF7a59F59delTTT---116116AY.1190.004096
ORF7a59F59delTTT---115115AY.7.10.012961
ORF7a59F59delTTT---8989AY.46.40.014641
ORF7a59F59delTTT---8686B.1.20.000757
ORF7a59F59delTTT---8181AY.330.005409
ORF7a59F59delTTT---7777AY.46.60.00556
ORF7a59F59delTTT---6868AY.3.10.005798
ORF7a59F59delTTT---6464AY.420.002575
ORF7a59F59delTTT---6464AY.5.40.017709
ORF7a59F59delTTT---6060AY.450.007301
ORF7a59F59delTTT---5959AY.1130.008401
ORF7a59F59delTTT---5959AY.60.002427
ORF7a59F59delTTT---5858AY.460.006037
ORF7a59F59delTTT---5858P.10.000914
ORF7a59F59delTTT---5757AY.39.10.002258
ORF7a59F59delTTT---5757AY.750.003193
ORF7a59F59delTTT---5353AY.200.00206
ORF7a59F59delTTT---5353AY.230.003697
ORF7a59F59delTTT---5151B.1.6210.004514
ORF7a59F59delTTT---4545AY.130.007244
ORF7a59F59delTTT---4444AY.1070.020503
ORF7a59F59delTTT---4444AY.9.20.001616
ORF7a59F59delTTT---4444AY.98.10.002131
ORF7a59F59delTTT---4040AY.1180.002506
ORF7a59F59delTTT---4040AY.4.2.10.005959
ORF7a59F59delTTT---4040B.1.1.2840.004296
ORF7a59F59delTTT---3939AY.1100.004395
ORF7a59F59delTTT---3939P.1.140.001864
ORF7a59F59delTTT---3838B.1.10.000689
ORF7a59F59delTTT---3737AY.1170.003127
ORF7a59F59delTTT---3535AY.340.003394
ORF7a59F59delTTT---3535AY.70.00686
ORF7a59F59delTTT---3535AY.90.002366
ORF7a59F59delTTT---3535B.1.1600.001092
ORF7a59F59delTTT---3232B.1.1.2140.001775
ORF7a59F59delTTT---3030AY.910.021914
ORF7a59F59delTTT---2929AY.99.20.002673
ORF7a59F59delTTT---2828AY.600.026266
ORF7a59F59delTTT---2626AY.190.029647
ORF7a59F59delTTT---2626AY.610.002724
ORF7a59F59delTTT---2626AY.9.10.002177
ORF7a59F59delTTT---2626B.1.6370.0019
ORF7a59F59delTTT---2424AY.1210.003248
ORF7a59F59delTTT---2424AY.7.20.013423
ORF7a59F59delTTT---2323C.370.002669
ORF7a59F59delTTT---2222AY.300.008706
ORF7a59F59delTTT---2222AY.360.003261
ORF7a59F59delTTT---2222B.1.4290.000518
ORF7a59F59delTTT---2121AY.1060.007033
ORF7a59F59delTTT---1919AY.1160.005449
ORF7a59F59delTTT---1919B.1.1.2220.003876
ORF7a59F59delTTT---1919B.1.214.20.011391
ORF7a59F59delTTT---1818AY.1110.003297
ORF7a59F59delTTT---1717AY.4.50.001827
ORF7a59F59delTTT---1717AY.740.001966
ORF7a59F59delTTT---1717R.10.00153
ORF7a59F59delTTT---1616AY.10.006332
ORF7a59F59delTTT---1616AY.370.005057
ORF7a59F59delTTT---1616AY.620.006972
ORF7a59F59delTTT---1616B.1.4270.000808
ORF7a59F59delTTT---1515AY.140.00132
ORF7a59F59delTTT---1515AY.46.20.00953
ORF7a59F59delTTT---1515B.1.5960.001307
ORF7a59F59delTTT---1414AY.1140.003235
ORF7a59F59delTTT---1414B.1.1.2580.045603
ORF7a59F59delTTT---1414B.1.2430.000974
ORF7a59F59delTTT---1313AY.680.003559
ORF7a59F59delTTT---1313AY.840.005687
ORF7a59F59delTTT---1313B.1.1.5190.000516
ORF7a59F59delTTT---1313B.1.5250.001471
ORF7a59F59delTTT---1212AY.900.008214
ORF7a59F59delTTT---1212B.1.3240.019262
ORF7a59F59delTTT---1212Q.80.001979
ORF7a59F59delTTT---1111AY.120.003477
ORF7a59F59delTTT---1111AY.870.009159
ORF7a59F59delTTT---1111AY.990.011542
ORF7a59F59delTTT---1111B.1.177.600.002403
ORF7a59F59delTTT---1010AY.350.00233
ORF7a59F59delTTT---1010B.1.177.560.006676
ORF7a59F59delTTT---1010B.1.3910.011274
ORF7a59F59delTTT---99AY.1090.006657
ORF7a59F59delTTT---99B.1.258.90.045
ORF7a59F59delTTT---99L.10.017143
ORF7a59F59delTTT---88A.210.022161
ORF7a59F59delTTT---88AY.100.00424
ORF7a59F59delTTT---88AY.270.000518
ORF7a59F59delTTT---88AY.29.10.001764
ORF7a59F59delTTT---88AY.520.006515
ORF7a59F59delTTT---88AY.850.003417
ORF7a59F59delTTT---88B.1.1.2310.024768
ORF7a59F59delTTT---88P.1.150.001859
ORF7a59F59delTTT---88Q.10.001011
ORF7a59F59delTTT---77AY.650.003731
ORF7a59F59delTTT---77AY.710.003325
ORF7a59F59delTTT---77AY.75.10.001262
ORF7a59F59delTTT---77AY.920.002011
ORF7a59F59delTTT---77B.1.6280.002467
ORF7a59F59delTTT---66AY.1080.006615
ORF7a59F59delTTT---66AY.116.10.001869
ORF7a59F59delTTT---66AY.320.003195
ORF7a59F59delTTT---66AY.34.10.00306
ORF7a59F59delTTT---66AY.46.10.00616
ORF7a59F59delTTT---66B.1.177.200.009105
ORF7a59F59delTTT---55AY.160.001898
ORF7a59F59delTTT---55AY.4.40.002046
ORF7a59F59delTTT---55AY.480.002326
ORF7a59F59delTTT---55AY.660.005348
ORF7a59F59delTTT---55AY.800.005643
ORF7a59F59delTTT---55AY.930.001365
ORF7a59F59delTTT---55AY.950.003805
ORF7a59F59delTTT---55B.1.1.560.089286
ORF7a59F59delTTT---55B.1.3750.004098
ORF7a59F59delTTT---55B.1.5950.001305
ORF7a59F59delTTT---55B.1.700.121951
ORF7a59F59delTTT---55P.20.000933
ORF7a59F59delTTT---44A0.001548
ORF7a59F59delTTT---44AY.1010.001962
ORF7a59F59delTTT---44AY.220.008368
ORF7a59F59delTTT---44AY.530.00115
ORF7a59F59delTTT---44AY.590.002119
ORF7a59F59delTTT---44AY.700.000834
ORF7a59F59delTTT---44AY.730.002661
ORF7a59F59delTTT---44AY.790.004843
ORF7a59F59delTTT---44B.1.1.3180.001207
ORF7a59F59delTTT---44B.1.2340.000528
ORF7a59F59delTTT---44D.20.0003
ORF7a59F59delTTT---33A.23.10.002113
ORF7a59F59delTTT---33AY.120.20.003856
ORF7a59F59delTTT---33AY.120.2.10.001495
ORF7a59F59delTTT---33AY.240.001293
ORF7a59F59delTTT---33AY.4.30.002525
ORF7a59F59delTTT---33AY.400.002893
ORF7a59F59delTTT---33AY.410.000882
ORF7a59F59delTTT---33AY.5.30.001012
ORF7a59F59delTTT---33AY.640.001786
ORF7a59F59delTTT---33AY.690.00056
ORF7a59F59delTTT---33AY.860.00249
ORF7a59F59delTTT---33AY.880.002653
ORF7a59F59delTTT---33B.1.1.1180.030612
ORF7a59F59delTTT---33B.1.1.1210.007282
ORF7a59F59delTTT---33B.1.1.250.001706
ORF7a59F59delTTT---33B.1.1.330.001263
ORF7a59F59delTTT---33B.1.160.160.002788
ORF7a59F59delTTT---33B.1.177.100.002634
ORF7a59F59delTTT---33B.1.177.570.000843
ORF7a59F59delTTT---33B.1.177.60.00293
ORF7a59F59delTTT---33B.1.177.620.003576
ORF7a59F59delTTT---33B.1.177.810.000568
ORF7a59F59delTTT---33B.1.2210.000213
ORF7a59F59delTTT---33B.1.2580.0002
ORF7a59F59delTTT---33B.1.258.170.000312
ORF7a59F59delTTT---33B.1.351.20.000908
ORF7a59F59delTTT---33B.1.360.000438
ORF7a59F59delTTT---33B.1.5750.00091
ORF7a59F59delTTT---33B.1.5820.001472
ORF7a59F59delTTT---33B.1.617.10.000387
ORF7a59F59delTTT---33B.1.621.10.001517
ORF7a59F59delTTT---33B.1.6260.017143
ORF7a59F59delTTT---33P.1.160.001122
ORF7a59F59delTTT---22A.280.005291
ORF7a59F59delTTT---22AD.20.000438
ORF7a59F59delTTT---22AY.20.000712
ORF7a59F59delTTT---22AY.39.20.003082
ORF7a59F59delTTT---22AY.490.00639
ORF7a59F59delTTT---22AY.510.001818
ORF7a59F59delTTT---22AY.570.001312
ORF7a59F59delTTT---22AY.720.002721
ORF7a59F59delTTT---22AY.80.001212
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.10.000653
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.1700.002494
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.2190.01
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.2200.003717
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.370.000386
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.3720.001377
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1.5210.010695
ORF7a59F59delTTT---22B.1.177.160.001329
ORF7a59F59delTTT---22B.1.177.430.002954
ORF7a59F59delTTT---22B.1.177.50.002484
ORF7a59F59delTTT---22B.1.177.550.004662
ORF7a59F59delTTT---22B.1.177.860.000367
ORF7a59F59delTTT---22B.1.1900.02
ORF7a59F59delTTT---22B.1.258.110.000793
ORF7a59F59delTTT---22B.1.2640.024691
ORF7a59F59delTTT---22B.1.3110.000549
ORF7a59F59delTTT---22B.1.3490.00143
ORF7a59F59delTTT---22B.1.3690.00057
ORF7a59F59delTTT---22B.1.4010.016393
ORF7a59F59delTTT---22B.1.4700.002809
ORF7a59F59delTTT---22B.1.4970.00063
ORF7a59F59delTTT---22B.1.5760.001813
ORF7a59F59delTTT---22B.1.617.30.00597
ORF7a59F59delTTT---22B.1.6270.00404
ORF7a59F59delTTT---22C.36.30.001134
ORF7a59F59delTTT---22P.1.17.10.00175
ORF7a59F59delTTT---22P.1.20.002312
ORF7a59F59delTTT---11A.10.000282
ORF7a59F59delTTT---11A.2.5.30.010309
ORF7a59F59delTTT---11A.230.010526
ORF7a59F59delTTT---11AU.30.00211
ORF7a59F59delTTT---11AY.1040.001984
ORF7a59F59delTTT---11AY.1050.000643
ORF7a59F59delTTT---11AY.110.001339
ORF7a59F59delTTT---11AY.16.10.00047
ORF7a59F59delTTT---11AY.380.000499
ORF7a59F59delTTT---11AY.46.30.000934
ORF7a59F59delTTT---11AY.810.001992
ORF7a59F59delTTT---11AY.890.004902
ORF7a59F59delTTT---11AY.940.000443
ORF7a59F59delTTT---11AZ.20.000821
ORF7a59F59delTTT---11B0.000128
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.100.001115
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.1570.000913
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.1740.003378
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.1920.002309
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.1940.00495
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2050.003717
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2070.001182
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2090.008929
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2400.004695
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2410.00207
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2770.000759
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.2980.000862
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3030.002762
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3110.000358
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3290.003846
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3480.000796
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3660.015873
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3680.003086
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.3760.005952
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.390.00051
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.4090.002833
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.4320.001266
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.4340.000349
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.4370.010417
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.4860.001577
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.5250.005464
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1.700.000341
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1150.021739
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1280.000635
ORF7a59F59delTTT---11B.1.1400.018868
ORF7a59F59delTTT---11B.1.160.260.002421
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.120.000152
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.150.000631
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.40.000211
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.500.004695
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.530.002392
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.70.000165
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.80.000752
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.830.001481
ORF7a59F59delTTT---11B.1.177.90.001332
ORF7a59F59delTTT---11B.1.2360.002053
ORF7a59F59delTTT---11B.1.2400.000216
ORF7a59F59delTTT---11B.1.2650.001271
ORF7a59F59delTTT---11B.1.3200.001245
ORF7a59F59delTTT---11B.1.351.30.000876
ORF7a59F59delTTT---11B.1.36.190.009259
ORF7a59F59delTTT---11B.1.36.350.002604
ORF7a59F59delTTT---11B.1.3610.001289
ORF7a59F59delTTT---11B.1.3710.001122
ORF7a59F59delTTT---11B.1.3890.001002
ORF7a59F59delTTT---11B.1.4060.006061
ORF7a59F59delTTT---11B.1.4090.000781
ORF7a59F59delTTT---11B.1.416.10.001563
ORF7a59F59delTTT---11B.1.438.10.000107
ORF7a59F59delTTT---11B.1.4590.004082
ORF7a59F59delTTT---11B.1.466.20.000391
ORF7a59F59delTTT---11B.1.4680.005714
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5170.000427
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5340.0125
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5350.028571
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5640.000426
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5650.00081
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5680.001111
ORF7a59F59delTTT---11B.1.5770.000687
ORF7a59F59delTTT---11B.1.6090.000479
ORF7a59F59delTTT---11B.1.6230.000536
ORF7a59F59delTTT---11B.1.6380.052632
ORF7a59F59delTTT---11B.1.9.10.032258
ORF7a59F59delTTT---11B.110.005128
ORF7a59F59delTTT---11B.390.002331
ORF7a59F59delTTT---11C.280.04
ORF7a59F59delTTT---11K.30.006173
ORF7a59F59delTTT---11P.1.10.000318
ORF7a59F59delTTT---11P.1.130.000898
ORF7a59F59delTTT---11P.1.170.000162
ORF7a59F59delTTT---11P.1.30.034483
ORF7a59F59delTTT---11P.1.40.000977
ORF7a59F59delTTT---11Q.70.001111
ORF7a59F59delTTT---11Z.10.00289