CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = F54del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a54F54deldelTTT---1122211222127553-27555

Details of the mutation F54del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a54F54delTTT---1122211222All0.002146
ORF7a54F54delTTT---22432243B.1.617.20.008446
ORF7a54F54delTTT---16231623AY.120.10.521027
ORF7a54F54delTTT---11861186AY.40.001846
ORF7a54F54delTTT---802802B.1.1.70.000718
ORF7a54F54delTTT---694694AY.430.003075
ORF7a54F54delTTT---661661AY.250.003976
ORF7a54F54delTTT---346346AY.1030.002148
ORF7a54F54delTTT---237237AY.1020.006284
ORF7a54F54delTTT---224224AY.30.002228
ORF7a54F54delTTT---217217AY.440.001321
ORF7a54F54delTTT---187187AY.1000.008603
ORF7a54F54delTTT---184184B.1.3510.00547
ORF7a54F54delTTT---181181B.1.177.210.013841
ORF7a54F54delTTT---160160AY.390.003954
ORF7a54F54delTTT---131131AY.290.002066
ORF7a54F54delTTT---124124AY.1200.00461
ORF7a54F54delTTT---108108AY.260.003057
ORF7a54F54delTTT---104104AY.7.10.011721
ORF7a54F54delTTT---7171AY.46.40.01168
ORF7a54F54delTTT---7070AY.1190.002472
ORF7a54F54delTTT---5353B.1.20.000467
ORF7a54F54delTTT---4949AY.750.002745
ORF7a54F54delTTT---4848AY.470.001493
ORF7a54F54delTTT---4747B.1.1770.000619
ORF7a54F54delTTT---4646B.10.000421
ORF7a54F54delTTT---4444AY.1170.003719
ORF7a54F54delTTT---4444B.1.1.2840.004726
ORF7a54F54delTTT---4343AY.3.10.003666
ORF7a54F54delTTT---3838AY.460.003955
ORF7a54F54delTTT---3737B.1.6210.003275
ORF7a54F54delTTT---3636AY.420.001448
ORF7a54F54delTTT---3636AY.540.003432
ORF7a54F54delTTT---3636B.1.5260.000846
ORF7a54F54delTTT---3535AY.1180.002193
ORF7a54F54delTTT---3131AY.230.002162
ORF7a54F54delTTT---3030AY.50.000619
ORF7a54F54delTTT---3030AY.60.001234
ORF7a54F54delTTT---2929P.10.000457
ORF7a54F54delTTT---2727AY.46.60.00195
ORF7a54F54delTTT---2626AY.330.001736
ORF7a54F54delTTT---2525B.1.1.2140.001386
ORF7a54F54delTTT---2424B.1.2340.003167
ORF7a54F54delTTT---2323AY.1070.010718
ORF7a54F54delTTT---2323AY.4.20.000499
ORF7a54F54delTTT---2121AY.7.20.011745
ORF7a54F54delTTT---2020AY.340.001939
ORF7a54F54delTTT---1818AY.9.10.001507
ORF7a54F54delTTT---1616AY.200.000622
ORF7a54F54delTTT---1616AY.90.001082
ORF7a54F54delTTT---1515AY.10.005936
ORF7a54F54delTTT---1515AY.1100.00169
ORF7a54F54delTTT---1515AY.1210.00203
ORF7a54F54delTTT---1515AY.39.10.000594
ORF7a54F54delTTT---1515AY.450.001825
ORF7a54F54delTTT---1515AY.9.20.000551
ORF7a54F54delTTT---1515AY.980.001185
ORF7a54F54delTTT---1515AY.98.10.000726
ORF7a54F54delTTT---1515B.1.5960.001307
ORF7a54F54delTTT---1515B.1.6370.001096
ORF7a54F54delTTT---1414AY.1060.004689
ORF7a54F54delTTT---1414C.370.001625
ORF7a54F54delTTT---1313AY.1110.002381
ORF7a54F54delTTT---1313AY.680.003559
ORF7a54F54delTTT---1313B.1.10.000236
ORF7a54F54delTTT---1313R.10.00117
ORF7a54F54delTTT---1212AY.1160.003441
ORF7a54F54delTTT---1212B.1.3240.019262
ORF7a54F54delTTT---1111AY.360.00163
ORF7a54F54delTTT---1111AY.370.003477
ORF7a54F54delTTT---1111AY.46.20.006989
ORF7a54F54delTTT---1111AY.610.001153
ORF7a54F54delTTT---1111AY.990.011542
ORF7a54F54delTTT---1010AY.160.003797
ORF7a54F54delTTT---1010AY.840.004374
ORF7a54F54delTTT---1010B.1.2430.000696
ORF7a54F54delTTT---99AY.1130.001282
ORF7a54F54delTTT---99AY.120.002845
ORF7a54F54delTTT---99AY.300.003562
ORF7a54F54delTTT---99L.10.017143
ORF7a54F54delTTT---88AY.70.001568
ORF7a54F54delTTT---88AY.99.20.000737
ORF7a54F54delTTT---88B.1.1.2310.024768
ORF7a54F54delTTT---88B.1.4290.000188
ORF7a54F54delTTT---77AY.350.001631
ORF7a54F54delTTT---77B.1.1600.000218
ORF7a54F54delTTT---77B.1.5250.000792
ORF7a54F54delTTT---77P.1.150.001626
ORF7a54F54delTTT---66AY.100.00318
ORF7a54F54delTTT---66AY.140.000528
ORF7a54F54delTTT---66AY.46.10.00616
ORF7a54F54delTTT---66AY.740.000694
ORF7a54F54delTTT---66B.1.4270.000303
ORF7a54F54delTTT---66P.20.00112
ORF7a54F54delTTT---55AY.1090.003698
ORF7a54F54delTTT---55AY.29.10.001103
ORF7a54F54delTTT---55AY.620.002179
ORF7a54F54delTTT---55AY.900.003422
ORF7a54F54delTTT---55AY.910.003652
ORF7a54F54delTTT---55B.1.1.5190.000199
ORF7a54F54delTTT---55B.1.1.560.089286
ORF7a54F54delTTT---55B.1.700.121951
ORF7a54F54delTTT---44A0.001548
ORF7a54F54delTTT---44AY.270.000259
ORF7a54F54delTTT---44AY.4.2.10.000596
ORF7a54F54delTTT---44AY.4.50.00043
ORF7a54F54delTTT---44AY.660.004278
ORF7a54F54delTTT---44AY.850.001709
ORF7a54F54delTTT---44AY.920.001149
ORF7a54F54delTTT---44AY.950.003044
ORF7a54F54delTTT---44D.20.0003
ORF7a54F54delTTT---33AY.1140.000693
ORF7a54F54delTTT---33AY.34.10.00153
ORF7a54F54delTTT---33AY.4.30.002525
ORF7a54F54delTTT---33AY.400.002893
ORF7a54F54delTTT---33AY.5.30.001012
ORF7a54F54delTTT---33AY.530.000863
ORF7a54F54delTTT---33AY.650.001599
ORF7a54F54delTTT---33B.1.1.1210.007282
ORF7a54F54delTTT---33B.1.214.20.001799
ORF7a54F54delTTT---33B.1.2210.000213
ORF7a54F54delTTT---33B.1.5820.001472
ORF7a54F54delTTT---33B.1.6260.017143
ORF7a54F54delTTT---33P.1.140.000143
ORF7a54F54delTTT---22A.2.40.006734
ORF7a54F54delTTT---22A.280.005291
ORF7a54F54delTTT---22AY.1080.002205
ORF7a54F54delTTT---22AY.130.000322
ORF7a54F54delTTT---22AY.190.002281
ORF7a54F54delTTT---22AY.240.000862
ORF7a54F54delTTT---22AY.480.00093
ORF7a54F54delTTT---22AY.510.001818
ORF7a54F54delTTT---22AY.690.000373
ORF7a54F54delTTT---22AY.710.00095
ORF7a54F54delTTT---22AY.730.001331
ORF7a54F54delTTT---22AY.880.001768
ORF7a54F54delTTT---22AY.930.000546
ORF7a54F54delTTT---22B.1.1.250.001137
ORF7a54F54delTTT---22B.1.1.3180.000604
ORF7a54F54delTTT---22B.1.160.160.001859
ORF7a54F54delTTT---22B.1.177.430.002954
ORF7a54F54delTTT---22B.1.177.550.004662
ORF7a54F54delTTT---22B.1.177.810.000379
ORF7a54F54delTTT---22B.1.177.860.000367
ORF7a54F54delTTT---22B.1.258.110.000793
ORF7a54F54delTTT---22B.1.3110.000549
ORF7a54F54delTTT---22B.1.351.20.000605
ORF7a54F54delTTT---22B.1.3750.001639
ORF7a54F54delTTT---22B.1.5750.000607
ORF7a54F54delTTT---22B.1.617.10.000258
ORF7a54F54delTTT---22B.1.621.10.001012
ORF7a54F54delTTT---22P.1.20.002312
ORF7a54F54delTTT---11A.10.000282
ORF7a54F54delTTT---11A.23.10.000704
ORF7a54F54delTTT---11AY.1010.00049
ORF7a54F54delTTT---11AY.1050.000643
ORF7a54F54delTTT---11AY.116.10.000311
ORF7a54F54delTTT---11AY.120.20.001285
ORF7a54F54delTTT---11AY.120.2.10.000498
ORF7a54F54delTTT---11AY.220.002092
ORF7a54F54delTTT---11AY.380.000499
ORF7a54F54delTTT---11AY.4.40.000409
ORF7a54F54delTTT---11AY.46.50.000198
ORF7a54F54delTTT---11AY.5.40.000277
ORF7a54F54delTTT---11AY.570.000656
ORF7a54F54delTTT---11AY.590.00053
ORF7a54F54delTTT---11AY.700.000209
ORF7a54F54delTTT---11AY.75.10.00018
ORF7a54F54delTTT---11AY.790.001211
ORF7a54F54delTTT---11AY.80.000606
ORF7a54F54delTTT---11AY.810.001992
ORF7a54F54delTTT---11AY.890.004902
ORF7a54F54delTTT---11AY.940.000443
ORF7a54F54delTTT---11AZ.20.000821
ORF7a54F54delTTT---11B0.000128
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.10.000327
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.1570.000913
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.1740.003378
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.1920.002309
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.2070.001182
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.2580.003257
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.3030.002762
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.330.000421
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.3480.000796
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.3660.015873
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1.5250.005464
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1150.021739
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1400.018868
ORF7a54F54delTTT---11B.1.1650.011905
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.100.000878
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.50.001242
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.500.004695
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.530.002392
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.570.000281
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.620.001192
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.630.002703
ORF7a54F54delTTT---11B.1.177.830.001481
ORF7a54F54delTTT---11B.1.2400.000216
ORF7a54F54delTTT---11B.1.2580.000067
ORF7a54F54delTTT---11B.1.258.170.000104
ORF7a54F54delTTT---11B.1.351.30.000876
ORF7a54F54delTTT---11B.1.3560.001727
ORF7a54F54delTTT---11B.1.3710.001122
ORF7a54F54delTTT---11B.1.4010.008197
ORF7a54F54delTTT---11B.1.4060.006061
ORF7a54F54delTTT---11B.1.416.10.001563
ORF7a54F54delTTT---11B.1.438.10.000107
ORF7a54F54delTTT---11B.1.4590.004082
ORF7a54F54delTTT---11B.1.466.20.000391
ORF7a54F54delTTT---11B.1.4700.001404
ORF7a54F54delTTT---11B.1.5350.028571
ORF7a54F54delTTT---11B.1.5680.001111
ORF7a54F54delTTT---11B.1.5950.000261
ORF7a54F54delTTT---11B.1.617.30.002985
ORF7a54F54delTTT---11B.1.6380.052632
ORF7a54F54delTTT---11B.1.9.10.032258
ORF7a54F54delTTT---11B.390.002331
ORF7a54F54delTTT---11C.36.30.000567
ORF7a54F54delTTT---11K.30.006173
ORF7a54F54delTTT---11P.1.10.000318
ORF7a54F54delTTT---11P.1.130.000898
ORF7a54F54delTTT---11P.1.160.000374
ORF7a54F54delTTT---11P.1.170.000162
ORF7a54F54delTTT---11P.1.30.034483
ORF7a54F54delTTT---11P.1.40.000977
ORF7a54F54delTTT---11Q.10.000126
ORF7a54F54delTTT---11Q.40.000455
ORF7a54F54delTTT---11Q.70.001111