CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = F101del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a101F101deldelTTT---97019701127694-27696

Details of the mutation F101del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a101F101delTTT---97019701All0.001855
ORF7a101F101delTTT---23372337B.1.1.70.002092
ORF7a101F101delTTT---10301030AY.39.1.10.746377
ORF7a101F101delTTT---10011001AY.40.001558
ORF7a101F101delTTT---609609AY.250.003663
ORF7a101F101delTTT---576576B.1.617.20.002169
ORF7a101F101delTTT---343343AY.1020.009094
ORF7a101F101delTTT---253253AY.750.014174
ORF7a101F101delTTT---248248AY.39.10.009824
ORF7a101F101delTTT---214214AY.440.001303
ORF7a101F101delTTT---178178AY.4.20.003861
ORF7a101F101delTTT---178178AY.430.000789
ORF7a101F101delTTT---159159AY.30.001581
ORF7a101F101delTTT---150150AY.1030.000931
ORF7a101F101delTTT---131131AY.1200.00487
ORF7a101F101delTTT---107107AY.330.007145
ORF7a101F101delTTT---8585AY.390.0021
ORF7a101F101delTTT---8181B.1.20.000713
ORF7a101F101delTTT---7272AY.290.001136
ORF7a101F101delTTT---7070AY.460.007286
ORF7a101F101delTTT---6868B.1.6280.023961
ORF7a101F101delTTT---6666P.10.00104
ORF7a101F101delTTT---6363AY.46.40.010364
ORF7a101F101delTTT---6363AY.50.001301
ORF7a101F101delTTT---5858B.1.5260.001363
ORF7a101F101delTTT---5252AY.260.001472
ORF7a101F101delTTT---5252B.1.6210.004603
ORF7a101F101delTTT---4848B.10.00044
ORF7a101F101delTTT---4747B.1.1770.000619
ORF7a101F101delTTT---4545AY.1180.002819
ORF7a101F101delTTT---4444AY.90.002974
ORF7a101F101delTTT---4343AY.70.008428
ORF7a101F101delTTT---3939B.1.10.000707
ORF7a101F101delTTT---3636AY.360.005336
ORF7a101F101delTTT---3636AY.470.00112
ORF7a101F101delTTT---3434AY.740.003932
ORF7a101F101delTTT---3232AY.1190.00113
ORF7a101F101delTTT---2626AY.530.007476
ORF7a101F101delTTT---2424AY.420.000966
ORF7a101F101delTTT---2424B.1.1.2140.001331
ORF7a101F101delTTT---2222B.1.1.5190.000874
ORF7a101F101delTTT---2222B.1.3250.151724
ORF7a101F101delTTT---2222B.1.4270.001111
ORF7a101F101delTTT---2121AY.1000.000966
ORF7a101F101delTTT---2121AY.7.20.011745
ORF7a101F101delTTT---2121AY.9.10.001758
ORF7a101F101delTTT---1919B.1.1600.000593
ORF7a101F101delTTT---1919B.1.3510.000565
ORF7a101F101delTTT---1717AD.20.003722
ORF7a101F101delTTT---1717AY.1210.0023
ORF7a101F101delTTT---1616AY.46.10.016427
ORF7a101F101delTTT---1616AY.60.000658
ORF7a101F101delTTT---1616AY.950.012177
ORF7a101F101delTTT---1616B.1.1.2220.003264
ORF7a101F101delTTT---1515AY.340.001454
ORF7a101F101delTTT---1414B.1.1.370.0027
ORF7a101F101delTTT---1414C.370.001625
ORF7a101F101delTTT---1212AY.1130.001709
ORF7a101F101delTTT---1111AY.1110.002015
ORF7a101F101delTTT---1111AY.120.10.003531
ORF7a101F101delTTT---1111AY.230.000767
ORF7a101F101delTTT---1111AY.3.10.000938
ORF7a101F101delTTT---1111AY.700.002294
ORF7a101F101delTTT---1111AY.9.20.000404
ORF7a101F101delTTT---1111AY.910.008035
ORF7a101F101delTTT---1111AY.98.10.000533
ORF7a101F101delTTT---1111B.1.2340.001451
ORF7a101F101delTTT---1111B.1.6370.000804
ORF7a101F101delTTT---1010AY.850.004272
ORF7a101F101delTTT---1010B.1.1.3180.003018
ORF7a101F101delTTT---1010B.1.2430.000696
ORF7a101F101delTTT---99AY.160.003417
ORF7a101F101delTTT---99AY.99.20.000829
ORF7a101F101delTTT---88AY.200.000311
ORF7a101F101delTTT---88AY.270.000518
ORF7a101F101delTTT---88P.1.150.001859
ORF7a101F101delTTT---88R.10.00072
ORF7a101F101delTTT---77AY.1170.000592
ORF7a101F101delTTT---77AY.190.007982
ORF7a101F101delTTT---77AY.29.10.001544
ORF7a101F101delTTT---77AY.540.000667
ORF7a101F101delTTT---77AY.860.005809
ORF7a101F101delTTT---77B0.000895
ORF7a101F101delTTT---77B.1.1.2840.000752
ORF7a101F101delTTT---77B.1.160.160.006506
ORF7a101F101delTTT---77B.1.2210.000497
ORF7a101F101delTTT---77B.1.5250.000792
ORF7a101F101delTTT---77D.20.000525
ORF7a101F101delTTT---66AY.4.50.000645
ORF7a101F101delTTT---66AY.450.00073
ORF7a101F101delTTT---66AY.46.50.00119
ORF7a101F101delTTT---66AY.680.001642
ORF7a101F101delTTT---66AY.980.000474
ORF7a101F101delTTT---66B.1.177.170.004926
ORF7a101F101delTTT---66B.1.617.10.000774
ORF7a101F101delTTT---66P.1.10.001906
ORF7a101F101delTTT---66Q.80.000989
ORF7a101F101delTTT---55AY.140.00044
ORF7a101F101delTTT---55AY.790.006053
ORF7a101F101delTTT---55B.1.177.600.001092
ORF7a101F101delTTT---55B.1.4290.000118
ORF7a101F101delTTT---55P.20.000933
ORF7a101F101delTTT---55Q.10.000632
ORF7a101F101delTTT---44AY.1050.002572
ORF7a101F101delTTT---44AY.1140.000924
ORF7a101F101delTTT---44AY.120.001264
ORF7a101F101delTTT---44AY.240.001724
ORF7a101F101delTTT---44AY.300.001583
ORF7a101F101delTTT---44AY.350.000932
ORF7a101F101delTTT---44AY.46.60.000289
ORF7a101F101delTTT---44AY.640.002381
ORF7a101F101delTTT---44AY.7.10.000451
ORF7a101F101delTTT---44AY.75.10.000721
ORF7a101F101delTTT---44B.1.2580.000266
ORF7a101F101delTTT---44B.1.258.110.001585
ORF7a101F101delTTT---44B.1.258.170.000416
ORF7a101F101delTTT---44B.1.3110.001098
ORF7a101F101delTTT---44N.70.117647
ORF7a101F101delTTT---44P.1.140.000191
ORF7a101F101delTTT---44P.1.70.001277
ORF7a101F101delTTT---44Q.40.001819
ORF7a101F101delTTT---33AY.1080.003308
ORF7a101F101delTTT---33AY.1160.00086
ORF7a101F101delTTT---33AY.20.001068
ORF7a101F101delTTT---33AY.370.000948
ORF7a101F101delTTT---33AY.46.20.001906
ORF7a101F101delTTT---33AY.990.003148
ORF7a101F101delTTT---33B.1.1.1700.003741
ORF7a101F101delTTT---33B.1.1.280.000934
ORF7a101F101delTTT---33B.1.130.007126
ORF7a101F101delTTT---33B.1.177.120.000455
ORF7a101F101delTTT---33B.1.177.70.000495
ORF7a101F101delTTT---33B.1.177.860.00055
ORF7a101F101delTTT---33B.1.351.20.000908
ORF7a101F101delTTT---33B.1.360.000438
ORF7a101F101delTTT---33B.1.36.170.001482
ORF7a101F101delTTT---33B.1.3890.003006
ORF7a101F101delTTT---33B.1.5950.000783
ORF7a101F101delTTT---33B.1.5960.000261
ORF7a101F101delTTT---33B.1.6260.017143
ORF7a101F101delTTT---33B.1.6340.010274
ORF7a101F101delTTT---33B.310.011194
ORF7a101F101delTTT---33P.1.120.001452
ORF7a101F101delTTT---33Q.30.000435
ORF7a101F101delTTT---220.111111
ORF7a101F101delTTT---22A.2.50.000998
ORF7a101F101delTTT---22A.280.005291
ORF7a101F101delTTT---22AY.1010.000981
ORF7a101F101delTTT---22AY.1040.003968
ORF7a101F101delTTT---22AY.1090.001479
ORF7a101F101delTTT---22AY.480.00093
ORF7a101F101delTTT---22AY.5.30.000675
ORF7a101F101delTTT---22AY.5.40.000553
ORF7a101F101delTTT---22AY.590.001059
ORF7a101F101delTTT---22AY.600.001876
ORF7a101F101delTTT---22AY.770.002255
ORF7a101F101delTTT---22AY.80.001212
ORF7a101F101delTTT---22AY.840.000875
ORF7a101F101delTTT---22AY.870.001665
ORF7a101F101delTTT---22AY.920.000575
ORF7a101F101delTTT---22AZ.60.016807
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.10.000653
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.1550.142857
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.2320.00363
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.330.000842
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.3480.001592
ORF7a101F101delTTT---22B.1.1.4490.045455
ORF7a101F101delTTT---22B.1.177.150.001262
ORF7a101F101delTTT---22B.1.177.210.000153
ORF7a101F101delTTT---22B.1.177.570.000562
ORF7a101F101delTTT---22B.1.177.800.003824
ORF7a101F101delTTT---22B.1.2400.000431
ORF7a101F101delTTT---22B.1.3060.011429
ORF7a101F101delTTT---22B.1.3500.005865
ORF7a101F101delTTT---22B.1.4000.000858
ORF7a101F101delTTT---22B.1.5750.000607
ORF7a101F101delTTT---22B.1.5770.001375
ORF7a101F101delTTT---22B.1.6120.005305
ORF7a101F101delTTT---22B.1.621.10.001012
ORF7a101F101delTTT---22B.4.50.02381
ORF7a101F101delTTT---22B.400.000729
ORF7a101F101delTTT---22C.36.30.001134
ORF7a101F101delTTT---11A0.000387
ORF7a101F101delTTT---11A.10.000282
ORF7a101F101delTTT---11A.2.20.001689
ORF7a101F101delTTT---11A.210.00277
ORF7a101F101delTTT---11A.60.005128
ORF7a101F101delTTT---11AH.30.003802
ORF7a101F101delTTT---11AW.10.003049
ORF7a101F101delTTT---11AY.10.000396
ORF7a101F101delTTT---11AY.100.00053
ORF7a101F101delTTT---11AY.1060.000335
ORF7a101F101delTTT---11AY.1070.000466
ORF7a101F101delTTT---11AY.110.001339
ORF7a101F101delTTT---11AY.130.000161
ORF7a101F101delTTT---11AY.320.000532
ORF7a101F101delTTT---11AY.34.10.00051
ORF7a101F101delTTT---11AY.510.000909
ORF7a101F101delTTT---11AY.580.000907
ORF7a101F101delTTT---11AY.610.000105
ORF7a101F101delTTT---11AY.620.000436
ORF7a101F101delTTT---11AY.690.000187
ORF7a101F101delTTT---11AY.720.001361
ORF7a101F101delTTT---11AY.730.000665
ORF7a101F101delTTT---11AY.880.000884
ORF7a101F101delTTT---11AZ.20.000821
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.1210.002427
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.1320.014925
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.1530.001095
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.1680.026316
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.1890.001513
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.2580.003257
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.2650.003155
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.2770.000759
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.2800.003086
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.2980.000862
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.3160.000925
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.3170.000412
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.3690.000446
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.3760.005952
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.3980.003226
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.4110.014706
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.4340.000349
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.4480.002033
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.4860.001577
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1.700.000341
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1150.021739
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1260.001276
ORF7a101F101delTTT---11B.1.1570.002985
ORF7a101F101delTTT---11B.1.177.100.000878
ORF7a101F101delTTT---11B.1.177.160.000664
ORF7a101F101delTTT---11B.1.177.40.000211
ORF7a101F101delTTT---11B.1.177.500.004695
ORF7a101F101delTTT---11B.1.177.540.000606
ORF7a101F101delTTT---11B.1.214.20.0006
ORF7a101F101delTTT---11B.1.2320.000537
ORF7a101F101delTTT---11B.1.2470.014925
ORF7a101F101delTTT---11B.1.258.90.005
ORF7a101F101delTTT---11B.1.2650.001271
ORF7a101F101delTTT---11B.1.3200.001245
ORF7a101F101delTTT---11B.1.351.30.000876
ORF7a101F101delTTT---11B.1.3560.001727
ORF7a101F101delTTT---11B.1.36.180.00042
ORF7a101F101delTTT---11B.1.36.200.016949
ORF7a101F101delTTT---11B.1.3620.001541
ORF7a101F101delTTT---11B.1.3710.001122
ORF7a101F101delTTT---11B.1.3750.00082
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4090.000781
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4160.001269
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4220.000812
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4590.004082
ORF7a101F101delTTT---11B.1.466.20.000391
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4680.005714
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4700.001404
ORF7a101F101delTTT---11B.1.4990.00105
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5030.002488
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5170.000427
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5270.003704
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5670.003333
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5820.000491
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5850.027778
ORF7a101F101delTTT---11B.1.5880.00091
ORF7a101F101delTTT---11B.1.6090.000479
ORF7a101F101delTTT---11B.1.6250.002353
ORF7a101F101delTTT---11B.1.6380.052632
ORF7a101F101delTTT---11B.1.9.10.032258
ORF7a101F101delTTT---11B.120.00641
ORF7a101F101delTTT---11N.50.001767
ORF7a101F101delTTT---11P.1.160.000374
ORF7a101F101delTTT---11P.1.170.000162
ORF7a101F101delTTT---11P.1.40.000977
ORF7a101F101delTTT---11Q.20.000613
ORF7a101F101delTTT---11U.30.003861