CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : Mut = C58del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a58C58deldelTGC---2842928429127565-27567

Details of the mutation C58del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a58C58delTGC---2842928429All0.005437
ORF7a58C58delTGC---1183211832AY.40.018416
ORF7a58C58delTGC---31993199B.1.617.20.012046
ORF7a58C58delTGC---20222022B.1.1.70.00181
ORF7a58C58delTGC---16661666AY.120.10.534831
ORF7a58C58delTGC---15271527AY.250.009185
ORF7a58C58delTGC---857857AY.430.003797
ORF7a58C58delTGC---609609AY.1030.003781
ORF7a58C58delTGC---437437AY.440.00266
ORF7a58C58delTGC---435435AY.30.004327
ORF7a58C58delTGC---433433AY.260.012258
ORF7a58C58delTGC---380380AY.390.00939
ORF7a58C58delTGC---314314AY.1020.008325
ORF7a58C58delTGC---259259AY.290.004085
ORF7a58C58delTGC---202202B.1.3510.006005
ORF7a58C58delTGC---199199AY.1200.007399
ORF7a58C58delTGC---193193AY.4.20.004186
ORF7a58C58delTGC---184184B.1.177.210.014071
ORF7a58C58delTGC---172172AY.980.013587
ORF7a58C58delTGC---120120AY.1190.004237
ORF7a58C58delTGC---118118AY.7.10.013299
ORF7a58C58delTGC---117117AY.470.003639
ORF7a58C58delTGC---117117B.10.001072
ORF7a58C58delTGC---116116AY.1000.005337
ORF7a58C58delTGC---116116B.1.5260.002727
ORF7a58C58delTGC---9797B.1.1770.001277
ORF7a58C58delTGC---8989AY.46.40.014641
ORF7a58C58delTGC---8080AY.330.005342
ORF7a58C58delTGC---8080B.1.20.000704
ORF7a58C58delTGC---7272AY.46.60.005199
ORF7a58C58delTGC---7070AY.50.001445
ORF7a58C58delTGC---6262AY.3.10.005286
ORF7a58C58delTGC---6060AY.450.007301
ORF7a58C58delTGC---5858AY.39.10.002298
ORF7a58C58delTGC---5757AY.750.003193
ORF7a58C58delTGC---5656AY.1130.007974
ORF7a58C58delTGC---5656AY.420.002253
ORF7a58C58delTGC---5454AY.60.002221
ORF7a58C58delTGC---5252AY.230.003627
ORF7a58C58delTGC---5151AY.200.001982
ORF7a58C58delTGC---5050AY.460.005204
ORF7a58C58delTGC---4949B.1.6210.004337
ORF7a58C58delTGC---4949P.10.000772
ORF7a58C58delTGC---4747AY.540.004481
ORF7a58C58delTGC---4747B.1.1.2840.005048
ORF7a58C58delTGC---4545AY.1070.020969
ORF7a58C58delTGC---4444AY.130.007083
ORF7a58C58delTGC---3737AY.98.10.001792
ORF7a58C58delTGC---3636AY.1100.004057
ORF7a58C58delTGC---3636AY.1180.002255
ORF7a58C58delTGC---3232AY.90.002163
ORF7a58C58delTGC---3131AY.340.003006
ORF7a58C58delTGC---3131AY.70.006076
ORF7a58C58delTGC---3030AY.910.021914
ORF7a58C58delTGC---3030B.1.10.000544
ORF7a58C58delTGC---3030B.1.1.2140.001664
ORF7a58C58delTGC---2929AY.9.20.001065
ORF7a58C58delTGC---2828AY.1170.002366
ORF7a58C58delTGC---2828AY.600.026266
ORF7a58C58delTGC---2828AY.99.20.00258
ORF7a58C58delTGC---2525AY.190.028506
ORF7a58C58delTGC---2424AY.7.20.013423
ORF7a58C58delTGC---2424AY.9.10.002009
ORF7a58C58delTGC---2323AY.300.009102
ORF7a58C58delTGC---2121AY.360.003112
ORF7a58C58delTGC---2121AY.610.0022
ORF7a58C58delTGC---2020AY.1210.002706
ORF7a58C58delTGC---1919AY.1060.006363
ORF7a58C58delTGC---1919B.1.6370.001388
ORF7a58C58delTGC---1717AY.4.50.001827
ORF7a58C58delTGC---1717AY.740.001966
ORF7a58C58delTGC---1717B.1.4270.000858
ORF7a58C58delTGC---1717B.1.4290.0004
ORF7a58C58delTGC---1717R.10.00153
ORF7a58C58delTGC---1616AY.10.006332
ORF7a58C58delTGC---1616B.1.1600.000499
ORF7a58C58delTGC---1616C.370.001857
ORF7a58C58delTGC---1515AY.1160.004302
ORF7a58C58delTGC---1515B.1.1.2220.00306
ORF7a58C58delTGC---1414AY.1110.002564
ORF7a58C58delTGC---1414AY.1140.003235
ORF7a58C58delTGC---1414AY.46.20.008895
ORF7a58C58delTGC---1414B.1.1.2580.045603
ORF7a58C58delTGC---1414B.1.2430.000974
ORF7a58C58delTGC---1414B.1.5960.00122
ORF7a58C58delTGC---1313AY.140.001144
ORF7a58C58delTGC---1313AY.370.004109
ORF7a58C58delTGC---1313AY.680.003559
ORF7a58C58delTGC---1212AY.840.005249
ORF7a58C58delTGC---1212B.1.3240.019262
ORF7a58C58delTGC---1111AY.4.2.10.001639
ORF7a58C58delTGC---1111AY.870.009159
ORF7a58C58delTGC---1111AY.990.011542
ORF7a58C58delTGC---1010AY.120.003161
ORF7a58C58delTGC---1010AY.350.00233
ORF7a58C58delTGC---1010AY.5.40.002767
ORF7a58C58delTGC---1010AY.900.006845
ORF7a58C58delTGC---1010B.1.5250.001132
ORF7a58C58delTGC---1010Q.80.001649
ORF7a58C58delTGC---99AY.1090.006657
ORF7a58C58delTGC---99AY.620.003922
ORF7a58C58delTGC---99B.1.1.5190.000357
ORF7a58C58delTGC---99B.1.258.90.045
ORF7a58C58delTGC---99L.10.017143
ORF7a58C58delTGC---88AY.100.00424
ORF7a58C58delTGC---88AY.270.000518
ORF7a58C58delTGC---88AY.29.10.001764
ORF7a58C58delTGC---88B.1.1.2310.024768
ORF7a58C58delTGC---88P.1.140.000382
ORF7a58C58delTGC---88P.1.150.001859
ORF7a58C58delTGC---77AY.46.50.001389
ORF7a58C58delTGC---77AY.710.003325
ORF7a58C58delTGC---77AY.850.00299
ORF7a58C58delTGC---77B.1.214.20.004197
ORF7a58C58delTGC---66AY.1080.006615
ORF7a58C58delTGC---66AY.46.10.00616
ORF7a58C58delTGC---66AY.650.003198
ORF7a58C58delTGC---66AY.920.001724
ORF7a58C58delTGC---66Q.10.000758
ORF7a58C58delTGC---55AY.160.001898
ORF7a58C58delTGC---55AY.4.40.002046
ORF7a58C58delTGC---55AY.480.002326
ORF7a58C58delTGC---55AY.520.004072
ORF7a58C58delTGC---55AY.660.005348
ORF7a58C58delTGC---55AY.800.005643
ORF7a58C58delTGC---55AY.950.003805
ORF7a58C58delTGC---55B.1.1.560.089286
ORF7a58C58delTGC---55B.1.3750.004098
ORF7a58C58delTGC---55B.1.5950.001305
ORF7a58C58delTGC---55B.1.700.121951
ORF7a58C58delTGC---55P.20.000933
ORF7a58C58delTGC---44A0.001548
ORF7a58C58delTGC---44AY.34.10.00204
ORF7a58C58delTGC---44AY.590.002119
ORF7a58C58delTGC---44AY.730.002661
ORF7a58C58delTGC---44B.1.2340.000528
ORF7a58C58delTGC---44D.20.0003
ORF7a58C58delTGC---33AY.1010.001471
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ORF7a58C58delTGC---33AY.4.30.002525
ORF7a58C58delTGC---33AY.400.002893
ORF7a58C58delTGC---33AY.410.000882
ORF7a58C58delTGC---33AY.5.30.001012
ORF7a58C58delTGC---33AY.530.000863
ORF7a58C58delTGC---33AY.690.00056
ORF7a58C58delTGC---33AY.75.10.000541
ORF7a58C58delTGC---33AY.790.003632
ORF7a58C58delTGC---33AY.860.00249
ORF7a58C58delTGC---33AY.880.002653
ORF7a58C58delTGC---33AY.930.000819
ORF7a58C58delTGC---33B.1.1.1210.007282
ORF7a58C58delTGC---33B.1.1.250.001706
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ORF7a58C58delTGC---33B.1.160.160.002788
ORF7a58C58delTGC---33B.1.177.570.000843
ORF7a58C58delTGC---33B.1.177.60.00293
ORF7a58C58delTGC---33B.1.177.600.000655
ORF7a58C58delTGC---33B.1.177.810.000568
ORF7a58C58delTGC---33B.1.2580.0002
ORF7a58C58delTGC---33B.1.351.20.000908
ORF7a58C58delTGC---33B.1.360.000438
ORF7a58C58delTGC---33B.1.5750.00091
ORF7a58C58delTGC---33B.1.5820.001472
ORF7a58C58delTGC---33B.1.6260.017143
ORF7a58C58delTGC---33P.1.160.001122
ORF7a58C58delTGC---22A.280.005291
ORF7a58C58delTGC---22AD.20.000438
ORF7a58C58delTGC---22AY.116.10.000623
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ORF7a58C58delTGC---22AY.120.2.10.000997
ORF7a58C58delTGC---22AY.20.000712
ORF7a58C58delTGC---22AY.220.004184
ORF7a58C58delTGC---22AY.39.20.003082
ORF7a58C58delTGC---22AY.490.00639
ORF7a58C58delTGC---22AY.510.001818
ORF7a58C58delTGC---22AY.570.001312
ORF7a58C58delTGC---22AY.640.00119
ORF7a58C58delTGC---22AY.700.000417
ORF7a58C58delTGC---22AY.80.001212
ORF7a58C58delTGC---22B.1.1.10.000653
ORF7a58C58delTGC---22B.1.1.2200.003717
ORF7a58C58delTGC---22B.1.1.370.000386
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ORF7a58C58delTGC---22B.1.177.100.001756
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ORF7a58C58delTGC---22B.1.177.430.002954
ORF7a58C58delTGC---22B.1.177.550.004662
ORF7a58C58delTGC---22B.1.177.860.000367
ORF7a58C58delTGC---22B.1.2210.000142
ORF7a58C58delTGC---22B.1.258.110.000793
ORF7a58C58delTGC---22B.1.2640.024691
ORF7a58C58delTGC---22B.1.3110.000549
ORF7a58C58delTGC---22B.1.3690.00057
ORF7a58C58delTGC---22B.1.416.10.003125
ORF7a58C58delTGC---22B.1.4700.002809
ORF7a58C58delTGC---22B.1.617.30.00597
ORF7a58C58delTGC---22B.1.621.10.001012
ORF7a58C58delTGC---22C.36.30.001134
ORF7a58C58delTGC---22P.1.17.10.00175
ORF7a58C58delTGC---22P.1.20.002312
ORF7a58C58delTGC---11A.10.000282
ORF7a58C58delTGC---11A.2.5.30.010309
ORF7a58C58delTGC---11A.23.10.000704
ORF7a58C58delTGC---11AU.30.00211
ORF7a58C58delTGC---11AY.1040.001984
ORF7a58C58delTGC---11AY.1050.000643
ORF7a58C58delTGC---11AY.110.001339
ORF7a58C58delTGC---11AY.320.000532
ORF7a58C58delTGC---11AY.380.000499
ORF7a58C58delTGC---11AY.720.001361
ORF7a58C58delTGC---11AY.810.001992
ORF7a58C58delTGC---11AY.890.004902
ORF7a58C58delTGC---11AY.940.000443
ORF7a58C58delTGC---11AZ.20.000821
ORF7a58C58delTGC---11B0.000128
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.1570.000913
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.1740.003378
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.1920.002309
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.1940.00495
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2050.003717
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2070.001182
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2090.008929
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2400.004695
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2410.00207
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2770.000759
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.2980.000862
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.3030.002762
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.3110.000358
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.330.000421
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.3480.000796
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.3660.015873
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.4320.001266
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.4370.010417
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.5250.005464
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1.700.000341
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1150.021739
ORF7a58C58delTGC---11B.1.1400.018868
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.150.000631
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.40.000211
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.500.004695
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.530.002392
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.620.001192
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.630.002703
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.70.000165
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.80.000752
ORF7a58C58delTGC---11B.1.177.830.001481
ORF7a58C58delTGC---11B.1.2360.002053
ORF7a58C58delTGC---11B.1.2400.000216
ORF7a58C58delTGC---11B.1.258.170.000104
ORF7a58C58delTGC---11B.1.2650.001271
ORF7a58C58delTGC---11B.1.351.30.000876
ORF7a58C58delTGC---11B.1.36.350.002604
ORF7a58C58delTGC---11B.1.3710.001122
ORF7a58C58delTGC---11B.1.3890.001002
ORF7a58C58delTGC---11B.1.4010.008197
ORF7a58C58delTGC---11B.1.4060.006061
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