CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : CodonNum = 83 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a83S83deldelTCA---47684768127640-27642

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a83S83delTCA---47684768All0.000912
ORF7a83S83delTCA---12061206AY.40.001877
ORF7a83S83delTCA---956956B.1.1.70.000856
ORF7a83S83delTCA---193193AY.1030.001198
ORF7a83S83delTCA---185185B.1.617.20.000697
ORF7a83S83delTCA---177177B.1.177.210.013535
ORF7a83S83delTCA---117117AY.290.001846
ORF7a83S83delTCA---114114AY.440.000694
ORF7a83S83delTCA---110110AY.390.002718
ORF7a83S83delTCA---109109AY.430.000483
ORF7a83S83delTCA---101101AY.1000.004647
ORF7a83S83delTCA---9696AY.30.000955
ORF7a83S83delTCA---7474AY.420.002977
ORF7a83S83delTCA---6868AY.980.005372
ORF7a83S83delTCA---6565AY.250.000391
ORF7a83S83delTCA---5757B.1.1770.000751
ORF7a83S83delTCA---4848B.1.5260.001128
ORF7a83S83delTCA---3838AY.260.001076
ORF7a83S83delTCA---3838B.1.1.2840.004081
ORF7a83S83delTCA---3838B.1.20.000335
ORF7a83S83delTCA---3737B.1.6210.003275
ORF7a83S83delTCA---3636AY.1200.001338
ORF7a83S83delTCA---3535AY.4.20.000759
ORF7a83S83delTCA---3333AY.3.10.002814
ORF7a83S83delTCA---3030B.10.000275
ORF7a83S83delTCA---2929P.10.000457
ORF7a83S83delTCA---2828AY.1190.000989
ORF7a83S83delTCA---2525AY.360.003705
ORF7a83S83delTCA---2424AY.46.60.001733
ORF7a83S83delTCA---2323AY.7.20.012864
ORF7a83S83delTCA---2323B.1.1.2140.001276
ORF7a83S83delTCA---2121B.1.6370.001535
ORF7a83S83delTCA---1919AY.750.001064
ORF7a83S83delTCA---1919B.1.1600.000593
ORF7a83S83delTCA---1818AY.46.40.002961
ORF7a83S83delTCA---1818B.1.3510.000535
ORF7a83S83delTCA---1717AY.200.000661
ORF7a83S83delTCA---1717AY.60.000699
ORF7a83S83delTCA---1515AY.300.005936
ORF7a83S83delTCA---1515AY.470.000467
ORF7a83S83delTCA---1414AY.50.000289
ORF7a83S83delTCA---1414B.1.1.2580.045603
ORF7a83S83delTCA---1212B.1.3240.019262
ORF7a83S83delTCA---1212B.1.4290.000282
ORF7a83S83delTCA---1212R.10.00108
ORF7a83S83delTCA---1111AY.1210.001488
ORF7a83S83delTCA---1111AY.230.000767
ORF7a83S83delTCA---1111B.1.10.0002
ORF7a83S83delTCA---1111C.370.001277
ORF7a83S83delTCA---1111N.70.323529
ORF7a83S83delTCA---99AY.1100.001014
ORF7a83S83delTCA---99AY.98.10.000436
ORF7a83S83delTCA---99B.1.5960.000784
ORF7a83S83delTCA---88AY.1170.000676
ORF7a83S83delTCA---88AY.1180.000501
ORF7a83S83delTCA---88AY.39.10.000317
ORF7a83S83delTCA---88B.1.1.2310.024768
ORF7a83S83delTCA---88Q.80.001319
ORF7a83S83delTCA---77AY.710.003325
ORF7a83S83delTCA---77AY.90.000473
ORF7a83S83delTCA---77B.1.5250.000792
ORF7a83S83delTCA---66AY.450.00073
ORF7a83S83delTCA---66AY.9.20.00022
ORF7a83S83delTCA---66P.1.150.001394
ORF7a83S83delTCA---55AY.1060.001674
ORF7a83S83delTCA---55AY.1140.001156
ORF7a83S83delTCA---55AY.330.000334
ORF7a83S83delTCA---55AY.800.005643
ORF7a83S83delTCA---55AY.99.20.000461
ORF7a83S83delTCA---55B.1.1.5190.000199
ORF7a83S83delTCA---55B.1.2430.000348
ORF7a83S83delTCA---55B.1.3750.004098
ORF7a83S83delTCA---55Q.10.000632
ORF7a83S83delTCA---44AY.1130.00057
ORF7a83S83delTCA---44AY.120.10.001284
ORF7a83S83delTCA---44AY.29.10.000882
ORF7a83S83delTCA---44AY.340.000388
ORF7a83S83delTCA---44AY.350.000932
ORF7a83S83delTCA---44AY.610.000419
ORF7a83S83delTCA---44AY.680.001095
ORF7a83S83delTCA---33AY.140.000264
ORF7a83S83delTCA---33AY.240.001293
ORF7a83S83delTCA---33AY.370.000948
ORF7a83S83delTCA---33AY.4.50.000322
ORF7a83S83delTCA---33AY.530.000863
ORF7a83S83delTCA---33AY.70.000588
ORF7a83S83delTCA---33AY.7.10.000338
ORF7a83S83delTCA---33AY.880.002653
ORF7a83S83delTCA---33B.1.1.1210.007282
ORF7a83S83delTCA---33B.1.1.1700.003741
ORF7a83S83delTCA---33B.1.1.250.001706
ORF7a83S83delTCA---33B.1.177.150.001893
ORF7a83S83delTCA---33B.1.214.20.001799
ORF7a83S83delTCA---33B.1.2340.000396
ORF7a83S83delTCA---33B.1.351.30.002629
ORF7a83S83delTCA---33B.1.4270.000151
ORF7a83S83delTCA---33B.1.5750.00091
ORF7a83S83delTCA---33B.1.6260.017143
ORF7a83S83delTCA---33C.120.021583
ORF7a83S83delTCA---220.111111
ORF7a83S83delTCA---22A0.000774
ORF7a83S83delTCA---22A.280.005291
ORF7a83S83delTCA---22AY.1080.002205
ORF7a83S83delTCA---22AY.1090.001479
ORF7a83S83delTCA---22AY.120.000632
ORF7a83S83delTCA---22AY.130.000322
ORF7a83S83delTCA---22AY.190.002281
ORF7a83S83delTCA---22AY.270.000129
ORF7a83S83delTCA---22AY.4.2.10.000298
ORF7a83S83delTCA---22AY.540.000191
ORF7a83S83delTCA---22AY.75.10.000361
ORF7a83S83delTCA---22AY.850.000854
ORF7a83S83delTCA---22AY.9.10.000167
ORF7a83S83delTCA---22AY.910.001461
ORF7a83S83delTCA---22AY.990.002099
ORF7a83S83delTCA---22B0.000256
ORF7a83S83delTCA---22B.1.1.2200.003717
ORF7a83S83delTCA---22B.1.1.2650.006309
ORF7a83S83delTCA---22B.1.1.5210.010695
ORF7a83S83delTCA---22B.1.1.700.000682
ORF7a83S83delTCA---22B.1.177.600.000437
ORF7a83S83delTCA---22B.1.177.860.000367
ORF7a83S83delTCA---22B.1.2210.000142
ORF7a83S83delTCA---22B.1.2580.000133
ORF7a83S83delTCA---22B.1.258.110.000793
ORF7a83S83delTCA---22B.1.351.20.000605
ORF7a83S83delTCA---22B.1.360.000292
ORF7a83S83delTCA---22B.1.5950.000522
ORF7a83S83delTCA---22P.1.140.000096
ORF7a83S83delTCA---11A.10.000282
ORF7a83S83delTCA---11A.2.20.001689
ORF7a83S83delTCA---11AY.1010.00049
ORF7a83S83delTCA---11AY.1020.000027
ORF7a83S83delTCA---11AY.1040.001984
ORF7a83S83delTCA---11AY.1110.000183
ORF7a83S83delTCA---11AY.1160.000287
ORF7a83S83delTCA---11AY.116.10.000311
ORF7a83S83delTCA---11AY.160.00038
ORF7a83S83delTCA---11AY.34.10.00051
ORF7a83S83delTCA---11AY.4.10.000737
ORF7a83S83delTCA---11AY.46.20.000635
ORF7a83S83delTCA---11AY.46.50.000198
ORF7a83S83delTCA---11AY.480.000465
ORF7a83S83delTCA---11AY.520.000814
ORF7a83S83delTCA---11AY.590.00053
ORF7a83S83delTCA---11AY.620.000436
ORF7a83S83delTCA---11AY.660.00107
ORF7a83S83delTCA---11AY.690.000187
ORF7a83S83delTCA---11AY.700.000209
ORF7a83S83delTCA---11AY.730.000665
ORF7a83S83delTCA---11AY.840.000437
ORF7a83S83delTCA---11AY.920.000287
ORF7a83S83delTCA---11AZ.20.000821
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.10.000327
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.1740.003378
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.1920.002309
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.1940.00495
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.2050.003717
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.2070.001182
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.2220.000204
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.2770.000759
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.3030.002762
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.3180.000302
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.330.000421
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.3660.015873
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.370.000193
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.4370.010417
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.4470.035714
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1.4480.002033
ORF7a83S83delTCA---11B.1.1150.021739
ORF7a83S83delTCA---11B.1.160.300.002976
ORF7a83S83delTCA---11B.1.177.100.000878
ORF7a83S83delTCA---11B.1.177.500.004695
ORF7a83S83delTCA---11B.1.177.570.000281
ORF7a83S83delTCA---11B.1.177.620.001192
ORF7a83S83delTCA---11B.1.177.810.000189
ORF7a83S83delTCA---11B.1.221.10.002907
ORF7a83S83delTCA---11B.1.2400.000216
ORF7a83S83delTCA---11B.1.2520.006623
ORF7a83S83delTCA---11B.1.258.170.000104
ORF7a83S83delTCA---11B.1.2650.001271
ORF7a83S83delTCA---11B.1.3190.003049
ORF7a83S83delTCA---11B.1.36.310.001751
ORF7a83S83delTCA---11B.1.3710.001122
ORF7a83S83delTCA---11B.1.4060.006061
ORF7a83S83delTCA---11B.1.4590.004082
ORF7a83S83delTCA---11B.1.4680.005714
ORF7a83S83delTCA---11B.1.4700.001404
ORF7a83S83delTCA---11B.1.4990.00105
ORF7a83S83delTCA---11B.1.5270.003704
ORF7a83S83delTCA---11B.1.564.10.001577
ORF7a83S83delTCA---11B.1.5760.000907
ORF7a83S83delTCA---11B.1.5770.000687
ORF7a83S83delTCA---11B.1.5820.000491
ORF7a83S83delTCA---11B.1.6020.006536
ORF7a83S83delTCA---11B.1.617.10.000129
ORF7a83S83delTCA---11B.1.6200.000946
ORF7a83S83delTCA---11B.1.621.10.000506
ORF7a83S83delTCA---11B.1.6380.052632
ORF7a83S83delTCA---11B.1.9.10.032258
ORF7a83S83delTCA---11B.1.930.000934
ORF7a83S83delTCA---11C.36.30.000567
ORF7a83S83delTCA---11D.20.000075
ORF7a83S83delTCA---11P.1.10.000318
ORF7a83S83delTCA---11P.1.120.000484
ORF7a83S83delTCA---11P.1.130.000898
ORF7a83S83delTCA---11P.1.160.000374
ORF7a83S83delTCA---11P.1.30.034483
ORF7a83S83delTCA---11P.1.40.000977
ORF7a83S83delTCA---11Q.70.001111