CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7a : CodonNum = 5 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7a5L5deldelCTT---64076407127406-27408

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7a5L5delCTT---64076407All0.001225
ORF7a5L5delCTT---57685768B.1.1.70.005164
ORF7a5L5delCTT---179179B.1.177.210.013688
ORF7a5L5delCTT---135135AY.40.00021
ORF7a5L5delCTT---2121AY.290.000331
ORF7a5L5delCTT---1818AY.30.000179
ORF7a5L5delCTT---1616AY.250.000096
ORF7a5L5delCTT---1414AY.1030.000087
ORF7a5L5delCTT---1414AY.430.000062
ORF7a5L5delCTT---1414B.10.000128
ORF7a5L5delCTT---1414B.1.617.20.000053
ORF7a5L5delCTT---1212AY.390.000297
ORF7a5L5delCTT---1212AY.440.000073
ORF7a5L5delCTT---99B.1.1.2840.000967
ORF7a5L5delCTT---99C.80.040179
ORF7a5L5delCTT---77AY.1180.000439
ORF7a5L5delCTT---77B.1.1.2140.000388
ORF7a5L5delCTT---77B.1.1770.000092
ORF7a5L5delCTT---77C.370.000812
ORF7a5L5delCTT---77P.10.00011
ORF7a5L5delCTT---66AY.470.000187
ORF7a5L5delCTT---66B.1.20.000053
ORF7a5L5delCTT---66B.1.5260.000141
ORF7a5L5delCTT---55AY.260.000142
ORF7a5L5delCTT---55AY.98.10.000242
ORF7a5L5delCTT---55B.1.177.440.002595
ORF7a5L5delCTT---55Q.80.000825
ORF7a5L5delCTT---44AY.1060.00134
ORF7a5L5delCTT---44B.1.10.000073
ORF7a5L5delCTT---44B.1.4290.000094
ORF7a5L5delCTT---44P.1.160.001496
ORF7a5L5delCTT---33B.1.2340.000396
ORF7a5L5delCTT---33B.1.6260.017143
ORF7a5L5delCTT---22A.280.005291
ORF7a5L5delCTT---22AY.1000.000092
ORF7a5L5delCTT---22AY.1190.000071
ORF7a5L5delCTT---22AY.200.000078
ORF7a5L5delCTT---22AY.29.10.000441
ORF7a5L5delCTT---22AY.3.10.000171
ORF7a5L5delCTT---22AY.330.000134
ORF7a5L5delCTT---22AY.420.00008
ORF7a5L5delCTT---22AY.750.000112
ORF7a5L5delCTT---22B.1.1600.000062
ORF7a5L5delCTT---22B.1.177.860.000367
ORF7a5L5delCTT---22B.1.258.110.000793
ORF7a5L5delCTT---22B.1.3510.000059
ORF7a5L5delCTT---22B.1.360.000292
ORF7a5L5delCTT---22B.1.5960.000174
ORF7a5L5delCTT---22B.1.6210.000177
ORF7a5L5delCTT---22B.1.6370.000146
ORF7a5L5delCTT---22Q.10.000253
ORF7a5L5delCTT---11A0.000387
ORF7a5L5delCTT---11AY.1070.000466
ORF7a5L5delCTT---11AY.1080.001103
ORF7a5L5delCTT---11AY.1090.00074
ORF7a5L5delCTT---11AY.1200.000037
ORF7a5L5delCTT---11AY.120.10.000321
ORF7a5L5delCTT---11AY.1210.000135
ORF7a5L5delCTT---11AY.320.000532
ORF7a5L5delCTT---11AY.340.000097
ORF7a5L5delCTT---11AY.4.20.000022
ORF7a5L5delCTT---11AY.450.000122
ORF7a5L5delCTT---11AY.540.000095
ORF7a5L5delCTT---11AY.660.00107
ORF7a5L5delCTT---11AY.790.001211
ORF7a5L5delCTT---11AY.840.000437
ORF7a5L5delCTT---11AY.90.000068
ORF7a5L5delCTT---11AY.9.20.000037
ORF7a5L5delCTT---11AY.940.000443
ORF7a5L5delCTT---11AY.990.001049
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1.2070.001182
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1.2220.000204
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1.2580.003257
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1.5190.00004
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1150.021739
ORF7a5L5delCTT---11B.1.1610.017241
ORF7a5L5delCTT---11B.1.177.630.002703
ORF7a5L5delCTT---11B.1.177.810.000189
ORF7a5L5delCTT---11B.1.2210.000071
ORF7a5L5delCTT---11B.1.2400.000216
ORF7a5L5delCTT---11B.1.4270.00005
ORF7a5L5delCTT---11B.1.466.20.000391
ORF7a5L5delCTT---11B.1.4680.005714
ORF7a5L5delCTT---11B.1.4700.001404
ORF7a5L5delCTT---11B.1.5250.000113
ORF7a5L5delCTT---11B.1.617.10.000129
ORF7a5L5delCTT---11B.1.617.30.002985
ORF7a5L5delCTT---11B.1.6200.000946
ORF7a5L5delCTT---11B.1.6300.005236
ORF7a5L5delCTT---11C.36.30.000567
ORF7a5L5delCTT---11P.20.000187
ORF7a5L5delCTT---11Q.50.016949