CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = X62del1

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF662X62del1deltAat-a8357540.90299427385-27387
ORF662X62del1deltaAta-835700.083832327385-27387
ORF662X62del1delTaa-aa835110.013173727385-27387

Details of the mutation X62del1 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF662X62del1tAat-a754835All0.000144
ORF662X62del1taAta-70835All0.000013
ORF662X62del1Taa-aa11835All0.000002
ORF662X62del1tAat-a480480A.270.794702
ORF662X62del1tAat-a8085AY.40.000125
ORF662X62del1taAta-585AY.40.000008
ORF662X62del1tAat-a1827AY.440.00011
ORF662X62del1taAta-927AY.440.000055
ORF662X62del1tAat-a2025B.1.1.70.000018
ORF662X62del1taAta-325B.1.1.70.000003
ORF662X62del1Taa-aa225B.1.1.70.000002
ORF662X62del1tAat-a1315B.1.10.000236
ORF662X62del1Taa-aa115B.1.10.000018
ORF662X62del1taAta-115B.1.10.000018
ORF662X62del1taAta-1114P.10.000173
ORF662X62del1tAat-a214P.10.000032
ORF662X62del1Taa-aa114P.10.000016
ORF662X62del1tAat-a1212B.1.2400.002587
ORF662X62del1tAat-a911B.10.000082
ORF662X62del1Taa-aa111B.10.000009
ORF662X62del1taAta-111B.10.000009
ORF662X62del1tAat-a1111B.1.5750.003337
ORF662X62del1tAat-a1011B.1.617.20.000038
ORF662X62del1taAta-111B.1.617.20.000004
ORF662X62del1taAta-810AY.30.00008
ORF662X62del1tAat-a210AY.30.00002
ORF662X62del1tAat-a1010AY.380.004993
ORF662X62del1tAat-a69AY.250.000036
ORF662X62del1taAta-39AY.250.000018
ORF662X62del1taAta-99B.1.5250.001018
ORF662X62del1tAat-a77A0.002709
ORF662X62del1tAat-a47AY.1030.000025
ORF662X62del1Taa-aa27AY.1030.000012
ORF662X62del1taAta-17AY.1030.000006
ORF662X62del1tAat-a56AY.390.000124
ORF662X62del1taAta-16AY.390.000025
ORF662X62del1tAat-a66B.1.1.5190.000238
ORF662X62del1tAat-a55B0.000639
ORF662X62del1tAat-a44AY.1020.000106
ORF662X62del1tAat-a33A.290.015957
ORF662X62del1tAat-a23AY.1000.000092
ORF662X62del1taAta-13AY.1000.000046
ORF662X62del1tAat-a23AY.340.000194
ORF662X62del1taAta-13AY.340.000097
ORF662X62del1taAta-33AY.4.50.000322
ORF662X62del1taAta-33B.1.1390.002199
ORF662X62del1tAat-a22AY.260.000057
ORF662X62del1tAat-a12AY.4.20.000022
ORF662X62del1taAta-12AY.4.20.000022
ORF662X62del1taAta-12B.1.1.280.000311
ORF662X62del1tAat-a12B.1.1.280.000311
ORF662X62del1tAat-a12B.1.1.330.000421
ORF662X62del1Taa-aa12B.1.1.330.000421
ORF662X62del1tAat-a22B.1.1.4340.000697
ORF662X62del1tAat-a12B.1.1600.000031
ORF662X62del1Taa-aa12B.1.1600.000031
ORF662X62del1tAat-a12B.1.1770.000013
ORF662X62del1taAta-12B.1.1770.000013
ORF662X62del1tAat-a22B.1.177.60.001953
ORF662X62del1tAat-a22B.1.20.000018
ORF662X62del1taAta-12B.1.2430.00007
ORF662X62del1tAat-a12B.1.2430.00007
ORF662X62del1tAat-a22P.1.10.000635
ORF662X62del1tAat-a11A.10.000282
ORF662X62del1tAat-a11A.20.000662
ORF662X62del1tAat-a11AY.1130.000142
ORF662X62del1tAat-a11AY.116.10.000311
ORF662X62del1tAat-a11AY.1190.000035
ORF662X62del1tAat-a11AY.140.000088
ORF662X62del1tAat-a11AY.320.000532
ORF662X62del1tAat-a11AY.430.000004
ORF662X62del1tAat-a11AY.450.000122
ORF662X62del1tAat-a11AY.470.000031
ORF662X62del1taAta-11AY.780.001541
ORF662X62del1tAat-a11B.1.1.1610.003534
ORF662X62del1tAat-a11B.1.1.2610.008621
ORF662X62del1tAat-a11B.1.1.2980.000862
ORF662X62del1tAat-a11B.1.1.3690.000446
ORF662X62del1tAat-a11B.1.1110.001175
ORF662X62del1tAat-a11B.1.160.330.004425
ORF662X62del1tAat-a11B.1.177.120.000152
ORF662X62del1tAat-a11B.1.177.70.000165
ORF662X62del1Taa-aa11B.1.2340.000132
ORF662X62del1tAat-a11B.1.3200.001245
ORF662X62del1tAat-a11B.1.351.20.000303
ORF662X62del1taAta-11B.1.3690.000285
ORF662X62del1tAat-a11B.1.4160.001269
ORF662X62del1taAta-11B.1.5260.000024
ORF662X62del1tAat-a11B.1.5640.000426
ORF662X62del1tAat-a11B.1.5950.000261
ORF662X62del1tAat-a11B.1.5960.000087
ORF662X62del1taAta-11B.1.6290.013333
ORF662X62del1Taa-aa11B.1.6370.000073
ORF662X62del1tAat-a11B.400.000364
ORF662X62del1taAta-11C.370.000116
ORF662X62del1tAat-a11P.1.170.000162
ORF662X62del1tAat-a11P.20.000187