CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = W27X

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF627W27XnonsyntGgtAg1961040.53061227280-27282
ORF627W27XnonsyntgGtgA196850.43367327280-27282
ORF627W27XnonsyntGGtAA19670.035714327280-27282

Details of the mutation W27X within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF627W27XtGgtAg104196All0.00002
ORF627W27XtgGtgA85196All0.000016
ORF627W27XtGGtAA7196All0.000001
ORF627W27XtGgtAg2429B.1.617.20.00009
ORF627W27XtgGtgA529B.1.617.20.000019
ORF627W27XtgGtgA1119B.1.1.70.00001
ORF627W27XtGgtAg619B.1.1.70.000005
ORF627W27XtGGtAA219B.1.1.70.000002
ORF627W27XtGgtAg711AY.40.000011
ORF627W27XtgGtgA411AY.40.000006
ORF627W27XtGgtAg510AY.440.00003
ORF627W27XtgGtgA410AY.440.000024
ORF627W27XtGGtAA110AY.440.000006
ORF627W27XtGgtAg89B.1.177.210.000612
ORF627W27XtgGtgA19B.1.177.210.000076
ORF627W27XtGgtAg78AY.1000.000322
ORF627W27XtgGtgA18AY.1000.000046
ORF627W27XtGgtAg58B.10.000046
ORF627W27XtgGtgA38B.10.000027
ORF627W27XtgGtgA67AY.260.00017
ORF627W27XtGgtAg17AY.260.000028
ORF627W27XtgGtgA77D.20.000525
ORF627W27XtGgtAg66AY.46.40.000987
ORF627W27XtgGtgA250.111111
ORF627W27XtGGtAA250.111111
ORF627W27XtGgtAg150.055556
ORF627W27XtGgtAg35AY.1030.000019
ORF627W27XtgGtgA25AY.1030.000012
ORF627W27XtgGtgA45AY.250.000024
ORF627W27XtGgtAg15AY.250.000006
ORF627W27XtgGtgA24AY.1020.000053
ORF627W27XtGgtAg24AY.1020.000053
ORF627W27XtgGtgA34AY.430.000013
ORF627W27XtGgtAg14AY.430.000004
ORF627W27XtGgtAg44AY.450.000487
ORF627W27XtGgtAg23AY.200.000078
ORF627W27XtgGtgA13AY.200.000039
ORF627W27XtgGtgA23AY.290.000032
ORF627W27XtGgtAg13AY.290.000016
ORF627W27XtgGtgA33AY.30.00003
ORF627W27XtGgtAg33AY.4.20.000065
ORF627W27XtgGtgA23AY.420.00008
ORF627W27XtGgtAg13AY.420.00004
ORF627W27XtgGtgA23B.1.20.000018
ORF627W27XtGgtAg13B.1.20.000009
ORF627W27XtgGtgA33B.1.2220.005076
ORF627W27XtGgtAg33B.1.4090.002344
ORF627W27XtGgtAg12AY.390.000025
ORF627W27XtgGtgA12AY.390.000025
ORF627W27XtGGtAA12AY.7.10.000113
ORF627W27XtgGtgA12AY.7.10.000113
ORF627W27XtGgtAg22AY.9.20.000073
ORF627W27XtGgtAg11AY.1010.00049
ORF627W27XtGgtAg11AY.1130.000142
ORF627W27XtGgtAg11AY.1170.000085
ORF627W27XtgGtgA11AY.300.000396
ORF627W27XtGgtAg11AY.39.10.00004
ORF627W27XtGgtAg11AY.46.20.000635
ORF627W27XtgGtgA11AY.46.50.000198
ORF627W27XtGgtAg11AY.5.40.000277
ORF627W27XtgGtgA11AY.610.000105
ORF627W27XtgGtgA11AY.80.000606
ORF627W27XtGgtAg11AY.9.10.000084
ORF627W27XtgGtgA11B0.000128
ORF627W27XtGGtAA11B.1.10.000018
ORF627W27XtgGtgA11B.1.1.5190.00004
ORF627W27XtgGtgA11B.1.1600.000031
ORF627W27XtGgtAg11B.1.2580.000067
ORF627W27XtgGtgA11B.1.438.10.000107
ORF627W27XtgGtgA11B.1.5260.000024
ORF627W27XtGgtAg11B.1.5800.004065
ORF627W27XtgGtgA11B.1.617.10.000129
ORF627W27XtgGtgA11B.1.6370.000073
ORF627W27XtgGtgA11B.6.60.000889
ORF627W27XtgGtgA11C.36.30.000567
ORF627W27XtgGtgA11C.370.000116
ORF627W27XtgGtgA11W.40.001351