CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = W27C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF627W27CnonsyntgGtgT1381320.95652227280-27282
ORF627W27CnonsyntgGtgC13860.043478327280-27282

Details of the mutation W27C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF627W27CtgGtgT132138All0.000025
ORF627W27CtgGtgC6138All0.000001
ORF627W27CtgGtgT4243B.1.1.70.000038
ORF627W27CtgGtgC143B.1.1.70.000001
ORF627W27CtgGtgT1010B.1.1.2140.000555
ORF627W27CtgGtgT77AY.1030.000043
ORF627W27CtgGtgT77B.1.6280.002467
ORF627W27CtgGtgT66AY.250.000036
ORF627W27CtgGtgT66B.1.617.20.000023
ORF627W27CtgGtgT55AY.40.000008
ORF627W27CtgGtgT55AY.430.000022
ORF627W27CtgGtgT44AD.20.000876
ORF627W27CtgGtgT44AY.440.000024
ORF627W27CtgGtgC23B.1.177.210.000153
ORF627W27CtgGtgT13B.1.177.210.000076
ORF627W27CtgGtgT22AY.1020.000053
ORF627W27CtgGtgT22AY.330.000134
ORF627W27CtgGtgT22B.10.000018
ORF627W27CtgGtgC22B.1.5260.000047
ORF627W27CtgGtgT22P.1.140.000096
ORF627W27CtgGtgT110.055556
ORF627W27CtgGtgT11AY.1050.000643
ORF627W27CtgGtgT11AY.1130.000142
ORF627W27CtgGtgT11AY.1190.000035
ORF627W27CtgGtgT11AY.1200.000037
ORF627W27CtgGtgT11AY.130.000161
ORF627W27CtgGtgT11AY.230.00007
ORF627W27CtgGtgT11AY.260.000028
ORF627W27CtgGtgT11AY.30.00001
ORF627W27CtgGtgT11AY.390.000025
ORF627W27CtgGtgT11AY.4.30.000842
ORF627W27CtgGtgT11AY.46.40.000165
ORF627W27CtgGtgT11AY.50.000021
ORF627W27CtgGtgT11AY.640.000595
ORF627W27CtgGtgT11B.1.1.1320.014925
ORF627W27CtgGtgT11B.1.1770.000013
ORF627W27CtgGtgT11B.1.177.120.000152
ORF627W27CtgGtgT11B.1.177.580.001332
ORF627W27CtgGtgT11B.1.177.600.000218
ORF627W27CtgGtgT11B.1.177.860.000183
ORF627W27CtgGtgT11B.1.20.000009
ORF627W27CtgGtgT11B.1.2430.00007
ORF627W27CtgGtgT11B.1.3110.000275
ORF627W27CtgGtgC11B.1.36.290.000517
ORF627W27CtgGtgT11B.1.4290.000024
ORF627W27CtgGtgT11B.1.617.10.000129
ORF627W27CtgGtgT11P.10.000016
ORF627W27CtgGtgT11P.1.20.001156