CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = S25del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF625S25deldelTCC---26282628127274-27276

Details of the mutation S25del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF625S25delTCC---26282628All0.000503
ORF625S25delTCC---439439AY.40.000683
ORF625S25delTCC---365365B.1.1.70.000327
ORF625S25delTCC---106106AY.430.00047
ORF625S25delTCC---106106B.1.617.20.000399
ORF625S25delTCC---100100AY.440.000609
ORF625S25delTCC---9595AY.4.20.00206
ORF625S25delTCC---9393AY.250.000559
ORF625S25delTCC---6464AY.1030.000397
ORF625S25delTCC---6363B.10.000577
ORF625S25delTCC---5959AY.470.001835
ORF625S25delTCC---5858AY.30.000577
ORF625S25delTCC---5252AY.1200.001933
ORF625S25delTCC---4949B.1.20.000431
ORF625S25delTCC---4141B.1.6161
ORF625S25delTCC---3737P.10.000583
ORF625S25delTCC---3636AY.390.00089
ORF625S25delTCC---3232N.81
ORF625S25delTCC---3131AY.50.00064
ORF625S25delTCC---2626B.1.5260.000611
ORF625S25delTCC---2424AY.260.000679
ORF625S25delTCC---2323AY.1110.004212
ORF625S25delTCC---2121AY.840.009186
ORF625S25delTCC---2020B.1.1080.116279
ORF625S25delTCC---1818B.1.177.210.001376
ORF625S25delTCC---1717AY.130.002737
ORF625S25delTCC---1717AY.750.000952
ORF625S25delTCC---1616AY.1180.001002
ORF625S25delTCC---1616AY.420.000644
ORF625S25delTCC---1515AY.360.002223
ORF625S25delTCC---1414AY.1190.000494
ORF625S25delTCC---1414AY.540.001335
ORF625S25delTCC---1313AY.290.000205
ORF625S25delTCC---1313AY.850.005553
ORF625S25delTCC---1313AY.900.008898
ORF625S25delTCC---1313B.1.1050.125
ORF625S25delTCC---1313B.1.4290.000306
ORF625S25delTCC---1212AY.200.000466
ORF625S25delTCC---1212B.1.36.360.007225
ORF625S25delTCC---1111AY.1130.001566
ORF625S25delTCC---1111AY.39.10.000436
ORF625S25delTCC---1111AY.460.001145
ORF625S25delTCC---1111AY.9.20.000404
ORF625S25delTCC---1010AY.140.00088
ORF625S25delTCC---99AY.1000.000414
ORF625S25delTCC---99AY.1060.003014
ORF625S25delTCC---99AY.4.2.10.001341
ORF625S25delTCC---99AY.450.001095
ORF625S25delTCC---99B.1.1770.000119
ORF625S25delTCC---99B.1.2400.00194
ORF625S25delTCC---88AY.46.50.001587
ORF625S25delTCC---88B.1.3510.000238
ORF625S25delTCC---77AY.1020.000186
ORF625S25delTCC---77AY.610.000733
ORF625S25delTCC---77B.1.10.000127
ORF625S25delTCC---77B.1.2340.000924
ORF625S25delTCC---77B.1.351.20.002118
ORF625S25delTCC---77B.1.36.260.02
ORF625S25delTCC---77B.1.6210.00062
ORF625S25delTCC---66AY.270.000388
ORF625S25delTCC---66AY.3.10.000512
ORF625S25delTCC---66AY.60.000247
ORF625S25delTCC---66AY.98.10.000291
ORF625S25delTCC---66B.1.1.2140.000333
ORF625S25delTCC---66B.1.1.2220.001224
ORF625S25delTCC---66B.1.2580.000399
ORF625S25delTCC---66B.1.3110.001647
ORF625S25delTCC---55AY.330.000334
ORF625S25delTCC---55AY.340.000485
ORF625S25delTCC---55AY.980.000395
ORF625S25delTCC---55B.1.1.3180.001509
ORF625S25delTCC---55B.1.4270.000252
ORF625S25delTCC---55P.1.100.001347
ORF625S25delTCC---55R.10.00045
ORF625S25delTCC---44A0.001548
ORF625S25delTCC---44AU.20.009685
ORF625S25delTCC---44AY.1100.000451
ORF625S25delTCC---44AY.680.001095
ORF625S25delTCC---44AY.9.10.000335
ORF625S25delTCC---44B.1.1.5190.000159
ORF625S25delTCC---44B.1.5250.000453
ORF625S25delTCC---44P.1.170.000647
ORF625S25delTCC---33AY.120.000948
ORF625S25delTCC---33AY.20.001068
ORF625S25delTCC---33AY.4.50.000322
ORF625S25delTCC---33AY.46.60.000217
ORF625S25delTCC---33AY.710.001425
ORF625S25delTCC---33AY.90.000203
ORF625S25delTCC---33B.1.1.330.001263
ORF625S25delTCC---33B.1.177.100.002634
ORF625S25delTCC---33B.1.214.20.001799
ORF625S25delTCC---33B.1.5960.000261
ORF625S25delTCC---33B.1.617.10.000387
ORF625S25delTCC---33B.1.6370.000219
ORF625S25delTCC---33C.370.000348
ORF625S25delTCC---33P.30.004785
ORF625S25delTCC---22AY.120.20.002571
ORF625S25delTCC---22AY.230.000139
ORF625S25delTCC---22AY.280.003781
ORF625S25delTCC---22AY.400.001929
ORF625S25delTCC---22AY.46.20.001271
ORF625S25delTCC---22AY.520.001629
ORF625S25delTCC---22AY.530.000575
ORF625S25delTCC---22AY.700.000417
ORF625S25delTCC---22AY.740.000231
ORF625S25delTCC---22AY.75.10.000361
ORF625S25delTCC---22AY.99.20.000184
ORF625S25delTCC---22B0.000256
ORF625S25delTCC---22B.1.1.10.000653
ORF625S25delTCC---22B.1.1.2310.006192
ORF625S25delTCC---22B.1.1.4610.024096
ORF625S25delTCC---22B.1.177.70.00033
ORF625S25delTCC---22B.1.1950.01005
ORF625S25delTCC---22B.1.2290.019417
ORF625S25delTCC---22B.1.2430.000139
ORF625S25delTCC---22B.1.3320.006993
ORF625S25delTCC---22B.1.36.170.000988
ORF625S25delTCC---22B.1.4000.000858
ORF625S25delTCC---22B.1.438.10.000215
ORF625S25delTCC---22B.1.466.20.000782
ORF625S25delTCC---22B.1.5240.002813
ORF625S25delTCC---22B.1.5540.008811
ORF625S25delTCC---22B.1.5750.000607
ORF625S25delTCC---22B.1.5950.000522
ORF625S25delTCC---22B.1.617.30.00597
ORF625S25delTCC---22D.20.00015
ORF625S25delTCC---22P.1.140.000096
ORF625S25delTCC---11A.10.000282
ORF625S25delTCC---11AP.10.001502
ORF625S25delTCC---11AU.10.001266
ORF625S25delTCC---11AY.1010.00049
ORF625S25delTCC---11AY.1080.001103
ORF625S25delTCC---11AY.1160.000287
ORF625S25delTCC---11AY.1170.000085
ORF625S25delTCC---11AY.120.10.000321
ORF625S25delTCC---11AY.120.2.10.000498
ORF625S25delTCC---11AY.1210.000135
ORF625S25delTCC---11AY.160.00038
ORF625S25delTCC---11AY.29.10.000221
ORF625S25delTCC---11AY.300.000396
ORF625S25delTCC---11AY.34.10.00051
ORF625S25delTCC---11AY.370.000316
ORF625S25delTCC---11AY.380.000499
ORF625S25delTCC---11AY.4.10.000737
ORF625S25delTCC---11AY.46.30.000934
ORF625S25delTCC---11AY.5.30.000337
ORF625S25delTCC---11AY.570.000656
ORF625S25delTCC---11AY.590.00053
ORF625S25delTCC---11AY.630.000387
ORF625S25delTCC---11AY.790.001211
ORF625S25delTCC---11AY.880.000884
ORF625S25delTCC---11AY.9.2.10.001976
ORF625S25delTCC---11AY.970.001701
ORF625S25delTCC---11AY.990.001049
ORF625S25delTCC---11B.1.1.2410.00207
ORF625S25delTCC---11B.1.1.250.000569
ORF625S25delTCC---11B.1.1.3060.000438
ORF625S25delTCC---11B.1.1.3070.002532
ORF625S25delTCC---11B.1.1.3160.000925
ORF625S25delTCC---11B.1.1.3690.000446
ORF625S25delTCC---11B.1.1.380.058824
ORF625S25delTCC---11B.1.1.4340.000349
ORF625S25delTCC---11B.1.1.500.000679
ORF625S25delTCC---11B.1.1.510.001718
ORF625S25delTCC---11B.1.1.630.000386
ORF625S25delTCC---11B.1.1.700.000341
ORF625S25delTCC---11B.1.1.80.003584
ORF625S25delTCC---11B.1.1.830.00271
ORF625S25delTCC---11B.1.110.30.000718
ORF625S25delTCC---11B.1.1310.008772
ORF625S25delTCC---11B.1.1600.000031
ORF625S25delTCC---11B.1.177.170.000821
ORF625S25delTCC---11B.1.177.440.000519
ORF625S25delTCC---11B.1.177.50.001242
ORF625S25delTCC---11B.1.177.580.001332
ORF625S25delTCC---11B.1.177.90.001332
ORF625S25delTCC---11B.1.2210.000071
ORF625S25delTCC---11B.1.2320.000537
ORF625S25delTCC---11B.1.2390.001221
ORF625S25delTCC---11B.1.258.170.000104
ORF625S25delTCC---11B.1.2600.003344
ORF625S25delTCC---11B.1.3190.003049
ORF625S25delTCC---11B.1.36.10.00114
ORF625S25delTCC---11B.1.36.240.006173
ORF625S25delTCC---11B.1.36.290.000517
ORF625S25delTCC---11B.1.36.380.001642
ORF625S25delTCC---11B.1.3620.001541
ORF625S25delTCC---11B.1.3910.001127
ORF625S25delTCC---11B.1.3960.000706
ORF625S25delTCC---11B.1.429.10.012048
ORF625S25delTCC---11B.1.4620.007246
ORF625S25delTCC---11B.1.4690.00361
ORF625S25delTCC---11B.1.5650.00081
ORF625S25delTCC---11B.1.5760.000907
ORF625S25delTCC---11B.1.6270.00202
ORF625S25delTCC---11B.1.9.30.038462
ORF625S25delTCC---11B.310.003731
ORF625S25delTCC---11C.2.10.006667
ORF625S25delTCC---11C.36.30.000567
ORF625S25delTCC---11C.36.3.10.002717
ORF625S25delTCC---11N.100.029412
ORF625S25delTCC---11P.1.10.000318
ORF625S25delTCC---11P.1.150.000232
ORF625S25delTCC---11P.1.160.000374
ORF625S25delTCC---11P.1.70.000319
ORF625S25delTCC---11Q.10.000126
ORF625S25delTCC---11Q.80.000165