CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = N28del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF628N28deldelAAT---28012801127283-27285

Details of the mutation N28del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF628N28delAAT---28012801All0.000536
ORF628N28delAAT---626626AY.40.000974
ORF628N28delAAT---358358B.1.1.70.00032
ORF628N28delAAT---109109B.1.617.20.00041
ORF628N28delAAT---106106AY.430.00047
ORF628N28delAAT---106106AY.440.000645
ORF628N28delAAT---9696AY.4.20.002082
ORF628N28delAAT---9191AY.250.000547
ORF628N28delAAT---6363B.10.000577
ORF628N28delAAT---6262AY.1030.000385
ORF628N28delAAT---5959AY.30.000587
ORF628N28delAAT---5959AY.470.001835
ORF628N28delAAT---5656AY.1200.002082
ORF628N28delAAT---5050B.1.20.00044
ORF628N28delAAT---4141B.1.6161
ORF628N28delAAT---3939P.10.000614
ORF628N28delAAT---3636AY.390.00089
ORF628N28delAAT---3232N.81
ORF628N28delAAT---2525AY.50.000516
ORF628N28delAAT---2525B.1.5260.000588
ORF628N28delAAT---2424AY.260.000679
ORF628N28delAAT---2323AY.1110.004212
ORF628N28delAAT---2121AY.840.009186
ORF628N28delAAT---2020B.1.1080.116279
ORF628N28delAAT---1818B.1.177.210.001376
ORF628N28delAAT---1717AY.130.002737
ORF628N28delAAT---1717AY.750.000952
ORF628N28delAAT---1616AY.1180.001002
ORF628N28delAAT---1515AY.290.000237
ORF628N28delAAT---1515AY.360.002223
ORF628N28delAAT---1515AY.420.000603
ORF628N28delAAT---1414AY.540.001335
ORF628N28delAAT---1313AY.1190.000459
ORF628N28delAAT---1313AY.900.008898
ORF628N28delAAT---1313B.1.1050.125
ORF628N28delAAT---1313B.1.4290.000306
ORF628N28delAAT---1212AY.200.000466
ORF628N28delAAT---1212AY.850.005126
ORF628N28delAAT---1212B.1.36.360.007225
ORF628N28delAAT---1111AY.1130.001566
ORF628N28delAAT---1111AY.9.20.000404
ORF628N28delAAT---1010AY.1000.00046
ORF628N28delAAT---1010AY.140.00088
ORF628N28delAAT---1010AY.39.10.000396
ORF628N28delAAT---1010AY.450.001217
ORF628N28delAAT---1010AY.460.001041
ORF628N28delAAT---99AY.1060.003014
ORF628N28delAAT---99AY.4.2.10.001341
ORF628N28delAAT---88AY.1020.000212
ORF628N28delAAT---88AY.46.50.001587
ORF628N28delAAT---88B.1.1770.000105
ORF628N28delAAT---88B.1.2400.001725
ORF628N28delAAT---88B.1.3510.000238
ORF628N28delAAT---77B.1.10.000127
ORF628N28delAAT---77B.1.2340.000924
ORF628N28delAAT---77B.1.351.20.002118
ORF628N28delAAT---77B.1.6210.00062
ORF628N28delAAT---66AY.270.000388
ORF628N28delAAT---66AY.3.10.000512
ORF628N28delAAT---66AY.60.000247
ORF628N28delAAT---66AY.610.000629
ORF628N28delAAT---66B.1.1.2140.000333
ORF628N28delAAT---66B.1.2580.000399
ORF628N28delAAT---66B.1.3110.001647
ORF628N28delAAT---55AY.330.000334
ORF628N28delAAT---55AY.340.000485
ORF628N28delAAT---55AY.980.000395
ORF628N28delAAT---55AY.98.10.000242
ORF628N28delAAT---55B.1.1.2220.00102
ORF628N28delAAT---55B.1.1.3180.001509
ORF628N28delAAT---55B.1.4270.000252
ORF628N28delAAT---55P.1.100.001347
ORF628N28delAAT---55R.10.00045
ORF628N28delAAT---44A0.001548
ORF628N28delAAT---44AU.20.009685
ORF628N28delAAT---44AY.1100.000451
ORF628N28delAAT---44AY.680.001095
ORF628N28delAAT---44AY.9.10.000335
ORF628N28delAAT---44B.1.1.5190.000159
ORF628N28delAAT---44B.1.5250.000453
ORF628N28delAAT---44P.1.170.000647
ORF628N28delAAT---33AY.120.000948
ORF628N28delAAT---33AY.20.001068
ORF628N28delAAT---33AY.4.50.000322
ORF628N28delAAT---33AY.46.60.000217
ORF628N28delAAT---33AY.710.001425
ORF628N28delAAT---33AY.90.000203
ORF628N28delAAT---33B0.000383
ORF628N28delAAT---33B.1.1.330.001263
ORF628N28delAAT---33B.1.177.100.002634
ORF628N28delAAT---33B.1.214.20.001799
ORF628N28delAAT---33B.1.6370.000219
ORF628N28delAAT---33C.370.000348
ORF628N28delAAT---22AY.120.20.002571
ORF628N28delAAT---22AY.230.000139
ORF628N28delAAT---22AY.280.003781
ORF628N28delAAT---22AY.400.001929
ORF628N28delAAT---22AY.46.20.001271
ORF628N28delAAT---22AY.520.001629
ORF628N28delAAT---22AY.530.000575
ORF628N28delAAT---22AY.740.000231
ORF628N28delAAT---22AY.75.10.000361
ORF628N28delAAT---22AY.99.20.000184
ORF628N28delAAT---22B.1.1.10.000653
ORF628N28delAAT---22B.1.1.2310.006192
ORF628N28delAAT---22B.1.1.4610.024096
ORF628N28delAAT---22B.1.177.70.00033
ORF628N28delAAT---22B.1.1950.01005
ORF628N28delAAT---22B.1.2290.019417
ORF628N28delAAT---22B.1.2430.000139
ORF628N28delAAT---22B.1.3320.006993
ORF628N28delAAT---22B.1.36.170.000988
ORF628N28delAAT---22B.1.4000.000858
ORF628N28delAAT---22B.1.438.10.000215
ORF628N28delAAT---22B.1.466.20.000782
ORF628N28delAAT---22B.1.5240.002813
ORF628N28delAAT---22B.1.5540.008811
ORF628N28delAAT---22B.1.5750.000607
ORF628N28delAAT---22B.1.5950.000522
ORF628N28delAAT---22B.1.5960.000174
ORF628N28delAAT---22B.1.617.10.000258
ORF628N28delAAT---22B.1.617.30.00597
ORF628N28delAAT---22D.20.00015
ORF628N28delAAT---22P.1.140.000096
ORF628N28delAAT---22P.30.00319
ORF628N28delAAT---22Q.80.00033
ORF628N28delAAT---11A.10.000282
ORF628N28delAAT---11AP.10.001502
ORF628N28delAAT---11AU.10.001266
ORF628N28delAAT---11AY.1010.00049
ORF628N28delAAT---11AY.1080.001103
ORF628N28delAAT---11AY.1160.000287
ORF628N28delAAT---11AY.1170.000085
ORF628N28delAAT---11AY.120.10.000321
ORF628N28delAAT---11AY.120.2.10.000498
ORF628N28delAAT---11AY.1210.000135
ORF628N28delAAT---11AY.160.00038
ORF628N28delAAT---11AY.29.10.000221
ORF628N28delAAT---11AY.300.000396
ORF628N28delAAT---11AY.34.10.00051
ORF628N28delAAT---11AY.370.000316
ORF628N28delAAT---11AY.380.000499
ORF628N28delAAT---11AY.4.10.000737
ORF628N28delAAT---11AY.46.30.000934
ORF628N28delAAT---11AY.5.30.000337
ORF628N28delAAT---11AY.570.000656
ORF628N28delAAT---11AY.590.00053
ORF628N28delAAT---11AY.630.000387
ORF628N28delAAT---11AY.700.000209
ORF628N28delAAT---11AY.790.001211
ORF628N28delAAT---11AY.880.000884
ORF628N28delAAT---11AY.9.2.10.001976
ORF628N28delAAT---11AY.970.001701
ORF628N28delAAT---11AY.990.001049
ORF628N28delAAT---11B.1.1.2410.00207
ORF628N28delAAT---11B.1.1.250.000569
ORF628N28delAAT---11B.1.1.3060.000438
ORF628N28delAAT---11B.1.1.3070.002532
ORF628N28delAAT---11B.1.1.3160.000925
ORF628N28delAAT---11B.1.1.3690.000446
ORF628N28delAAT---11B.1.1.380.058824
ORF628N28delAAT---11B.1.1.4340.000349
ORF628N28delAAT---11B.1.1.500.000679
ORF628N28delAAT---11B.1.1.510.001718
ORF628N28delAAT---11B.1.1.630.000386
ORF628N28delAAT---11B.1.1.700.000341
ORF628N28delAAT---11B.1.1.80.003584
ORF628N28delAAT---11B.1.1.830.00271
ORF628N28delAAT---11B.1.110.30.000718
ORF628N28delAAT---11B.1.1310.008772
ORF628N28delAAT---11B.1.1600.000031
ORF628N28delAAT---11B.1.177.160.000664
ORF628N28delAAT---11B.1.177.170.000821
ORF628N28delAAT---11B.1.177.50.001242
ORF628N28delAAT---11B.1.177.580.001332
ORF628N28delAAT---11B.1.177.90.001332
ORF628N28delAAT---11B.1.2210.000071
ORF628N28delAAT---11B.1.2320.000537
ORF628N28delAAT---11B.1.2390.001221
ORF628N28delAAT---11B.1.258.170.000104
ORF628N28delAAT---11B.1.2600.003344
ORF628N28delAAT---11B.1.3190.003049
ORF628N28delAAT---11B.1.36.10.00114
ORF628N28delAAT---11B.1.36.240.006173
ORF628N28delAAT---11B.1.36.290.000517
ORF628N28delAAT---11B.1.36.380.001642
ORF628N28delAAT---11B.1.3620.001541
ORF628N28delAAT---11B.1.3910.001127
ORF628N28delAAT---11B.1.3960.000706
ORF628N28delAAT---11B.1.3980.002976
ORF628N28delAAT---11B.1.429.10.012048
ORF628N28delAAT---11B.1.4620.007246
ORF628N28delAAT---11B.1.4690.00361
ORF628N28delAAT---11B.1.5650.00081
ORF628N28delAAT---11B.1.5760.000907
ORF628N28delAAT---11B.1.6270.00202
ORF628N28delAAT---11B.1.9.30.038462
ORF628N28delAAT---11B.310.003731
ORF628N28delAAT---11C.2.10.006667
ORF628N28delAAT---11C.36.30.000567
ORF628N28delAAT---11C.36.3.10.002717
ORF628N28delAAT---11N.100.029412
ORF628N28delAAT---11P.1.10.000318
ORF628N28delAAT---11P.1.160.000374
ORF628N28delAAT---11P.1.70.000319
ORF628N28delAAT---11Q.10.000126