CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = L29del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF629L29deldelCTT---27432743127286-27288

Details of the mutation L29del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF629L29delCTT---27432743All0.000525
ORF629L29delCTT---625625AY.40.000973
ORF629L29delCTT---352352B.1.1.70.000315
ORF629L29delCTT---105105B.1.617.20.000395
ORF629L29delCTT---104104AY.440.000633
ORF629L29delCTT---103103AY.430.000456
ORF629L29delCTT---9696AY.4.20.002082
ORF629L29delCTT---8888AY.250.000529
ORF629L29delCTT---6262B.10.000568
ORF629L29delCTT---6060AY.30.000597
ORF629L29delCTT---5959AY.1030.000366
ORF629L29delCTT---5959AY.470.001835
ORF629L29delCTT---5656AY.1200.002082
ORF629L29delCTT---4848B.1.20.000423
ORF629L29delCTT---4141B.1.6161
ORF629L29delCTT---3737P.10.000583
ORF629L29delCTT---3636AY.390.00089
ORF629L29delCTT---3232N.81
ORF629L29delCTT---2525B.1.5260.000588
ORF629L29delCTT---2424AY.260.000679
ORF629L29delCTT---2323AY.1110.004212
ORF629L29delCTT---2323AY.50.000475
ORF629L29delCTT---2121AY.840.009186
ORF629L29delCTT---2020B.1.1080.116279
ORF629L29delCTT---1818B.1.177.210.001376
ORF629L29delCTT---1717AY.1180.001065
ORF629L29delCTT---1717AY.130.002737
ORF629L29delCTT---1717AY.750.000952
ORF629L29delCTT---1616AY.290.000252
ORF629L29delCTT---1515AY.360.002223
ORF629L29delCTT---1515AY.420.000603
ORF629L29delCTT---1414AY.540.001335
ORF629L29delCTT---1313AY.900.008898
ORF629L29delCTT---1212AY.1190.000424
ORF629L29delCTT---1212B.1.36.360.007225
ORF629L29delCTT---1111AY.1130.001566
ORF629L29delCTT---1111AY.850.004699
ORF629L29delCTT---1111AY.9.20.000404
ORF629L29delCTT---1010AY.1000.00046
ORF629L29delCTT---1010AY.200.000389
ORF629L29delCTT---1010AY.39.10.000396
ORF629L29delCTT---1010AY.450.001217
ORF629L29delCTT---1010AY.460.001041
ORF629L29delCTT---1010B.1.4290.000235
ORF629L29delCTT---99AY.1060.003014
ORF629L29delCTT---99AY.140.000792
ORF629L29delCTT---99AY.4.2.10.001341
ORF629L29delCTT---88AY.1020.000212
ORF629L29delCTT---88AY.46.50.001587
ORF629L29delCTT---88B.1.1770.000105
ORF629L29delCTT---88B.1.2400.001725
ORF629L29delCTT---88B.1.3510.000238
ORF629L29delCTT---77B.1.10.000127
ORF629L29delCTT---77B.1.2340.000924
ORF629L29delCTT---77B.1.351.20.002118
ORF629L29delCTT---77B.1.6210.00062
ORF629L29delCTT---66AY.270.000388
ORF629L29delCTT---66AY.60.000247
ORF629L29delCTT---66AY.610.000629
ORF629L29delCTT---66B.1.1.2140.000333
ORF629L29delCTT---66B.1.1.2220.001224
ORF629L29delCTT---66B.1.2580.000399
ORF629L29delCTT---66B.1.3110.001647
ORF629L29delCTT---55AY.3.10.000426
ORF629L29delCTT---55AY.340.000485
ORF629L29delCTT---55AY.980.000395
ORF629L29delCTT---55AY.98.10.000242
ORF629L29delCTT---55B.1.1.3180.001509
ORF629L29delCTT---55B.1.4270.000252
ORF629L29delCTT---55P.1.100.001347
ORF629L29delCTT---55R.10.00045
ORF629L29delCTT---44A0.001548
ORF629L29delCTT---44AU.20.009685
ORF629L29delCTT---44AY.1100.000451
ORF629L29delCTT---44AY.330.000267
ORF629L29delCTT---44AY.680.001095
ORF629L29delCTT---44AY.9.10.000335
ORF629L29delCTT---44B.1.1.5190.000159
ORF629L29delCTT---44B.1.5250.000453
ORF629L29delCTT---44P.1.170.000647
ORF629L29delCTT---33AY.120.000948
ORF629L29delCTT---33AY.20.001068
ORF629L29delCTT---33AY.4.50.000322
ORF629L29delCTT---33AY.46.60.000217
ORF629L29delCTT---33AY.710.001425
ORF629L29delCTT---33B.1.214.20.001799
ORF629L29delCTT---33B.1.6370.000219
ORF629L29delCTT---33C.370.000348
ORF629L29delCTT---22AY.120.20.002571
ORF629L29delCTT---22AY.230.000139
ORF629L29delCTT---22AY.280.003781
ORF629L29delCTT---22AY.400.001929
ORF629L29delCTT---22AY.46.20.001271
ORF629L29delCTT---22AY.520.001629
ORF629L29delCTT---22AY.530.000575
ORF629L29delCTT---22AY.75.10.000361
ORF629L29delCTT---22AY.90.000135
ORF629L29delCTT---22AY.99.20.000184
ORF629L29delCTT---22B0.000256
ORF629L29delCTT---22B.1.1.10.000653
ORF629L29delCTT---22B.1.1.2310.006192
ORF629L29delCTT---22B.1.1.330.000842
ORF629L29delCTT---22B.1.1.4610.024096
ORF629L29delCTT---22B.1.177.70.00033
ORF629L29delCTT---22B.1.1950.01005
ORF629L29delCTT---22B.1.2290.019417
ORF629L29delCTT---22B.1.2430.000139
ORF629L29delCTT---22B.1.3320.006993
ORF629L29delCTT---22B.1.36.170.000988
ORF629L29delCTT---22B.1.4000.000858
ORF629L29delCTT---22B.1.438.10.000215
ORF629L29delCTT---22B.1.466.20.000782
ORF629L29delCTT---22B.1.5240.002813
ORF629L29delCTT---22B.1.5540.008811
ORF629L29delCTT---22B.1.5750.000607
ORF629L29delCTT---22B.1.5950.000522
ORF629L29delCTT---22B.1.5960.000174
ORF629L29delCTT---22B.1.617.10.000258
ORF629L29delCTT---22B.1.617.30.00597
ORF629L29delCTT---22D.20.00015
ORF629L29delCTT---22P.1.140.000096
ORF629L29delCTT---22Q.80.00033
ORF629L29delCTT---11A.10.000282
ORF629L29delCTT---11AU.10.001266
ORF629L29delCTT---11AY.1010.00049
ORF629L29delCTT---11AY.1080.001103
ORF629L29delCTT---11AY.1160.000287
ORF629L29delCTT---11AY.1170.000085
ORF629L29delCTT---11AY.120.10.000321
ORF629L29delCTT---11AY.120.2.10.000498
ORF629L29delCTT---11AY.1210.000135
ORF629L29delCTT---11AY.160.00038
ORF629L29delCTT---11AY.29.10.000221
ORF629L29delCTT---11AY.300.000396
ORF629L29delCTT---11AY.34.10.00051
ORF629L29delCTT---11AY.370.000316
ORF629L29delCTT---11AY.380.000499
ORF629L29delCTT---11AY.4.10.000737
ORF629L29delCTT---11AY.46.30.000934
ORF629L29delCTT---11AY.5.30.000337
ORF629L29delCTT---11AY.570.000656
ORF629L29delCTT---11AY.590.00053
ORF629L29delCTT---11AY.630.000387
ORF629L29delCTT---11AY.700.000209
ORF629L29delCTT---11AY.730.000665
ORF629L29delCTT---11AY.790.001211
ORF629L29delCTT---11AY.880.000884
ORF629L29delCTT---11AY.9.2.10.001976
ORF629L29delCTT---11AY.970.001701
ORF629L29delCTT---11AY.990.001049
ORF629L29delCTT---11B.1.1.2410.00207
ORF629L29delCTT---11B.1.1.250.000569
ORF629L29delCTT---11B.1.1.3060.000438
ORF629L29delCTT---11B.1.1.3070.002532
ORF629L29delCTT---11B.1.1.3160.000925
ORF629L29delCTT---11B.1.1.3690.000446
ORF629L29delCTT---11B.1.1.380.058824
ORF629L29delCTT---11B.1.1.4340.000349
ORF629L29delCTT---11B.1.1.500.000679
ORF629L29delCTT---11B.1.1.510.001718
ORF629L29delCTT---11B.1.1.630.000386
ORF629L29delCTT---11B.1.1.700.000341
ORF629L29delCTT---11B.1.1.80.003584
ORF629L29delCTT---11B.1.1.830.00271
ORF629L29delCTT---11B.1.110.30.000718
ORF629L29delCTT---11B.1.1310.008772
ORF629L29delCTT---11B.1.1600.000031
ORF629L29delCTT---11B.1.177.160.000664
ORF629L29delCTT---11B.1.177.170.000821
ORF629L29delCTT---11B.1.177.50.001242
ORF629L29delCTT---11B.1.177.580.001332
ORF629L29delCTT---11B.1.177.90.001332
ORF629L29delCTT---11B.1.2210.000071
ORF629L29delCTT---11B.1.2320.000537
ORF629L29delCTT---11B.1.2390.001221
ORF629L29delCTT---11B.1.258.170.000104
ORF629L29delCTT---11B.1.2600.003344
ORF629L29delCTT---11B.1.3190.003049
ORF629L29delCTT---11B.1.36.10.00114
ORF629L29delCTT---11B.1.36.240.006173
ORF629L29delCTT---11B.1.36.290.000517
ORF629L29delCTT---11B.1.36.380.001642
ORF629L29delCTT---11B.1.3620.001541
ORF629L29delCTT---11B.1.3910.001127
ORF629L29delCTT---11B.1.3960.000706
ORF629L29delCTT---11B.1.3980.002976
ORF629L29delCTT---11B.1.429.10.012048
ORF629L29delCTT---11B.1.4620.007246
ORF629L29delCTT---11B.1.4690.00361
ORF629L29delCTT---11B.1.5650.00081
ORF629L29delCTT---11B.1.5760.000907
ORF629L29delCTT---11B.1.6270.00202
ORF629L29delCTT---11B.1.9.30.038462
ORF629L29delCTT---11B.310.003731
ORF629L29delCTT---11C.2.10.006667
ORF629L29delCTT---11C.36.30.000567
ORF629L29delCTT---11C.36.3.10.002717
ORF629L29delCTT---11N.100.029412
ORF629L29delCTT---11P.1.10.000318
ORF629L29delCTT---11P.1.160.000374
ORF629L29delCTT---11P.1.70.000319
ORF629L29delCTT---11Q.10.000126