CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = I32I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF6	32	I32I		syn	atC	atT	10983	10908	0.993171	27295-27297
ORF6	32	I32I		syn	atC	atA	10983	75	0.00682874	27295-27297

Details of the mutation I32I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF6	32	I32I	atC	atT	10908	10983	All	0.002086
ORF6	32	I32I	atC	atA	75	10983	All	0.000014
ORF6	32	I32I	atC	atT	3126	3137	B.1.1.7	0.002798
ORF6	32	I32I	atC	atA	11	3137	B.1.1.7	0.00001
ORF6	32	I32I	atC	atT	1309	1310	AY.84	0.572616
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	1310	AY.84	0.000437
ORF6	32	I32I	atC	atT	574	577	B.1.617.2	0.002161
ORF6	32	I32I	atC	atA	3	577	B.1.617.2	0.000011
ORF6	32	I32I	atC	atT	530	530	AY.119	0.018713
ORF6	32	I32I	atC	atT	321	321	B.1.243	0.022337
ORF6	32	I32I	atC	atT	278	278	AY.4	0.000433
ORF6	32	I32I	atC	atT	235	238	B.1	0.002152
ORF6	32	I32I	atC	atA	3	238	B.1	0.000027
ORF6	32	I32I	atC	atT	238	238	B.1.2	0.002096
ORF6	32	I32I	atC	atT	195	195	AV.1	0.984848
ORF6	32	I32I	atC	atT	183	187	AY.44	0.001114
ORF6	32	I32I	atC	atA	4	187	AY.44	0.000024
ORF6	32	I32I	atC	atT	165	166	AY.25	0.000992
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	166	AY.25	0.000006
ORF6	32	I32I	atC	atT	162	162	AY.103	0.001006
ORF6	32	I32I	atC	atT	162	162	B.1.160	0.005052
ORF6	32	I32I	atC	atT	156	156	P.1	0.002458
ORF6	32	I32I	atC	atT	153	153	AY.13	0.02463
ORF6	32	I32I	atC	atT	146	147	B.1.177	0.001922
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	147	B.1.177	0.000013
ORF6	32	I32I	atC	atT	144	144	B.1.1.528	0.692308
ORF6	32	I32I	atC	atT	122	122	B.1.160.31	0.983871
ORF6	32	I32I	atC	atT	118	118	AY.27	0.007637
ORF6	32	I32I	atC	atT	115	116	AY.43	0.00051
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	116	AY.43	0.000004
ORF6	32	I32I	atC	atT	94	111	B.1.177.21	0.007188
ORF6	32	I32I	atC	atA	17	111	B.1.177.21	0.0013
ORF6	32	I32I	atC	atT	107	107	AY.54	0.010202
ORF6	32	I32I	atC	atT	97	97	AY.9.1	0.008121
ORF6	32	I32I	atC	atT	95	95	AY.20	0.003692
ORF6	32	I32I	atC	atT	95	95	AY.24	0.040948
ORF6	32	I32I	atC	atT	93	93	AY.3	0.000925
ORF6	32	I32I	atC	atT	92	92	Q.8	0.015172
ORF6	32	I32I	atC	atT	90	90	B.1.1	0.001633
ORF6	32	I32I	atC	atT	59	59	AY.39	0.001458
ORF6	32	I32I	atC	atT	53	53	AY.4.1	0.039086
ORF6	32	I32I	atC	atT	51	51	AY.26	0.001444
ORF6	32	I32I	atC	atT	50	50	AY.47	0.001555
ORF6	32	I32I	atC	atT	47	47	AY.98.1	0.002276
ORF6	32	I32I	atC	atT	40	40	AY.111	0.007326
ORF6	32	I32I	atC	atT	39	40	B.1.526	0.000917
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	40	B.1.526	0.000024
ORF6	32	I32I	atC	atT	34	35	AY.46.6	0.002455
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	35	AY.46.6	0.000072
ORF6	32	I32I	atC	atT	34	34	AY.6	0.001398
ORF6	32	I32I	atC	atT	34	34	B.1.628	0.01198
ORF6	32	I32I	atC	atT	32	32	AY.29	0.000505
ORF6	32	I32I	atC	atT	29	29	B.1.427	0.001464
ORF6	32	I32I	atC	atT	27	27	AY.9.2	0.000992
ORF6	32	I32I	atC	atT	27	27	B.1.637	0.001973
ORF6	32	I32I	atC	atT	26	26	AY.33	0.001736
ORF6	32	I32I	atC	atT	26	26	B.1.115	0.565217
ORF6	32	I32I	atC	atT	25	25	B.1.396	0.017643
ORF6	32	I32I	atC	atT	24	24	B.1.1.445	0.888889
ORF6	32	I32I	atC	atT	21	21	AY.118	0.001316
ORF6	32	I32I	atC	atT	21	21	B.1.429	0.000494
ORF6	32	I32I	atC	atT	20	20	B.1.1.519	0.000794
ORF6	32	I32I	atC	atT	19	19	B.1.1.284	0.002041
ORF6	32	I32I	atC	atT	18	19	B.1.351	0.000535
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	19	B.1.351	0.00003
ORF6	32	I32I	atC	atT	19	19	C.37	0.002205
ORF6	32	I32I	atC	atT	18	18	AY.9	0.001217
ORF6	32	I32I	atC	atA	13	17	B.1.1.33	0.005471
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	17	B.1.1.33	0.001684
ORF6	32	I32I	atC	atT	17	17	B.1.177.57	0.004777
ORF6	32	I32I	atC	atT	16	16	B.1.369	0.004564
ORF6	32	I32I	atC	atT	15	15	B.1.177.60	0.003277
ORF6	32	I32I	atC	atT	15	15	B.1.258.11	0.005945
ORF6	32	I32I	atC	atT	14	14	A.2.5	0.006986
ORF6	32	I32I	atC	atT	14	14	AY.5	0.000289
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	AY.12	0.004109
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	AY.34	0.001261
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	B.1.1.311	0.004656
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	B.1.1.376	0.077381
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	B.1.177.40	0.06701
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	B.1.400	0.005577
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	13	B.1.617.1	0.000903
ORF6	32	I32I	atC	atA	6	13	B.1.617.1	0.000774
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	P.2	0.002426
ORF6	32	I32I	atC	atT	13	13	Q.3	0.001885
ORF6	32	I32I	atC	atT	12	12	AY.75	0.000672
ORF6	32	I32I	atC	atT	12	12	B.1.36	0.001751
ORF6	32	I32I	atC	atT	11	11	AY.99.2	0.001014
ORF6	32	I32I	atC	atT	11	11	B.1.265	0.013977
ORF6	32	I32I	atC	atT	11	11	P.1.1	0.003494
ORF6	32	I32I	atC	atT	10	10	AY.117	0.000845
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	10	AY.39.1	0.000357
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	10	AY.39.1	0.00004
ORF6	32	I32I	atC	atT	10	10	B.1.1.115	0.089286
ORF6	32	I32I	atC	atT	10	10	B.1.177.50	0.046948
ORF6	32	I32I	atC	atT	10	10	B.1.234	0.001319
ORF6	32	I32I	atC	atT	10	10	B.1.258	0.000665
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	AY.36	0.001334
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	AY.45	0.001095
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	AY.5.3	0.003036
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	B.1.1.214	0.000499
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	B.1.240	0.00194
ORF6	32	I32I	atC	atT	9	9	B.1.525	0.001018
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	AY.120	0.000297
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	AZ.4	0.026846
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	B.1.1.70	0.002729
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	B.1.177.86	0.001468
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	B.1.406	0.048485
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	B.1.466.2	0.00313
ORF6	32	I32I	atC	atT	8	8	B.1.582	0.003925
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	7	AY.23	0.000488
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	7	AY.4.2	0.000152
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	7	B.1.1.306	0.003069
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	7	B.1.177.42	0.006261
ORF6	32	I32I	atC	atT	7	7	B.1.421	0.052239
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	AY.100	0.000276
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	AY.114	0.001387
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B	0.000767
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.1.34	0.078947
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.177.77	0.004357
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.177.82	0.002864
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.221	0.000426
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.311	0.001647
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.36.29	0.003104
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.36.8	0.006
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.399	0.011605
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.575	0.00182
ORF6	32	I32I	atC	atT	6	6	B.1.621	0.000531
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	A	0.001935
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	AY.86	0.004149
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.1.315	0.042373
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.258.17	0.00052
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.497	0.001574
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.564	0.002129
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.596	0.000436
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	B.1.623	0.002682
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	D.2	0.000375
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	P.1.7	0.001596
ORF6	32	I32I	atC	atT	5	5	Q.1	0.000632
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.106	0.00134
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.113	0.00057
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.3.1	0.000341
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.42	0.000161
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.48	0.00186
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.53	0.00115
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.74	0.000463
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	AY.98	0.000316
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	B.1.1.433	0.005698
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	B.1.177.12	0.000607
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	B.1.177.44	0.002076
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	B.1.36.18	0.001681
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	B.1.88.1	0.019231
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	C.35	0.003096
ORF6	32	I32I	atC	atA	4	4	N.4	0.017021
ORF6	32	I32I	atC	atA	3	4	N.5	0.0053
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	4	N.5	0.001767
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	P.1.14	0.000191
ORF6	32	I32I	atC	atT	4	4	P.3	0.00638
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3		0.166667
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	A.27	0.004967
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.109	0.002219
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.14	0.000264
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.29.1	0.000662
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.4.3	0.002525
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.62	0.001307
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	AY.91	0.002191
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.1.222	0.000612
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.1.317	0.001235
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.1.329	0.011538
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.177.16	0.001993
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.177.68	0.045455
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.305	0.006452
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.336	0.007317
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.367	0.002377
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.499	0.003151
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.1.561	0.001191
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.40	0.001093
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	B.6.6	0.002667
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	P.1.12	0.001452
ORF6	32	I32I	atC	atT	3	3	Q.6	0.019868
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AD.2	0.000438
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.110	0.000225
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.28	0.003781
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.30	0.000791
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.4.5	0.000215
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.41	0.000588
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.46.2	0.001271
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.68	0.000547
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.7	0.000392
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.85	0.000854
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	AY.95	0.001522
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.216	0.001781
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.28	0.000622
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.280	0.006173
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.348	0.001592
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.368	0.006173
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.37	0.000386
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.416	0.00181
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.420	0.002012
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.50	0.001358
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.1.63	0.000772
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.160.30	0.005952
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.177.73	0.001133
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.177.79	0.004684
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.177.80	0.003824
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.221.1	0.005814
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.324	0.00321
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.342	0.2
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.349	0.00143
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.351.2	0.000605
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.438.1	0.000215
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.470	0.002809
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.509	0.001732
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.595	0.000522
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.609	0.000959
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	B.1.620	0.001892
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	C.36.3	0.001134
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	P.1.10	0.000539
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	P.1.17	0.000324
ORF6	32	I32I	atC	atT	2	2	U.3	0.007722
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	A.2.4	0.003367
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AM.4	0.003571
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AU.3	0.00211
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.10	0.00053
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.102	0.000027
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.105	0.000643
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.107	0.000466
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.116.1	0.000311
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.120.1	0.000321
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.32	0.000532
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.35	0.000233
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.4.2.1	0.000149
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.46	0.000104
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.46.4	0.000165
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.5.4	0.000277
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.52	0.000814
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.59	0.00053
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.63	0.000387
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.64	0.000595
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.7.1	0.000113
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.70	0.000209
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.72	0.001361
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.76	0.004831
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.8	0.000606
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.80	0.001129
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.82	0.001357
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	AY.99	0.001049
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.1	0.000327
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.121	0.002427
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.170	0.001247
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.194	0.00495
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.196	0.005714
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.220	0.001859
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.231	0.003096
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.255	0.00303
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.263	0.001558
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.297	0.002237
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.305	0.003861
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.31	0.066667
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.318	0.000302
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.349	0.010309
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.354	0.004386
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.369	0.000446
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.374	0.002375
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.39	0.00051
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.398	0.003226
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.459	0.015385
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.464	0.001473
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.524	0.020833
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.526	0.003546
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.1.58	0.005376
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.110.3	0.000718
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.112	0.005181
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.126	0.001276
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.134	0.005464
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.167	0.007812
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.177.17	0.000821
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.177.52	0.001757
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.177.7	0.000165
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.177.9	0.001332
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.189	0.004292
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.218	0.005155
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.219	0.009434
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.22	0.001318
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.223	0.002778
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.236	0.002053
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	1	B.1.301	0.005917
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.320	0.001245
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.321	0.034483
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.329	0.000608
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.338	0.008621
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.351.5	0.0006
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.16	0.001425
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.19	0.009259
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.24	0.006173
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.27	0.000763
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.31	0.001751
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.34	0.021277
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.36.35	0.002604
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.361	0.001289
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.362	0.001541
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.382	0.008929
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.398	0.002976
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.402	0.009804
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.405	0.012346
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.411	0.003704
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.416.1	0.001563
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.420	0.010417
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.425	0.002994
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.429.1	0.012048
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.434	0.052632
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.436	0.001029
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.474	0.001901
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.504	0.03125
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.505	0.004386
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.524	0.001406
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.530	0.007143
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.535	0.028571
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.545	0.014493
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.560	0.00463
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.568	0.001111
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.587	0.001898
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.612	0.002653
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.619	0.000871
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	B.1.94	0.027027
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	1	B.6	0.00091
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	C.30	0.001727
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	C.36	0.000911
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	L.3	0.003546
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	N.10	0.029412
ORF6	32	I32I	atC	atA	1	1	N.3	0.005814
ORF6	32	I32I	atC	atT	1	1	R.1	0.00009

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.