CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF6 | 32 | I32I | syn | atC | atT | 10983 | 10908 | 0.993171 | 27295-27297 | |
ORF6 | 32 | I32I | syn | atC | atA | 10983 | 75 | 0.00682874 | 27295-27297 |
Details of the mutation I32I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10908 | 10983 | All | 0.002086 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 75 | 10983 | All | 0.000014 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3126 | 3137 | B.1.1.7 | 0.002798 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 11 | 3137 | B.1.1.7 | 0.00001 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1309 | 1310 | AY.84 | 0.572616 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 1310 | AY.84 | 0.000437 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 574 | 577 | B.1.617.2 | 0.002161 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 3 | 577 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 530 | 530 | AY.119 | 0.018713 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 321 | 321 | B.1.243 | 0.022337 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 278 | 278 | AY.4 | 0.000433 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 235 | 238 | B.1 | 0.002152 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 3 | 238 | B.1 | 0.000027 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 238 | 238 | B.1.2 | 0.002096 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 195 | 195 | AV.1 | 0.984848 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 183 | 187 | AY.44 | 0.001114 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 4 | 187 | AY.44 | 0.000024 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 165 | 166 | AY.25 | 0.000992 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 166 | AY.25 | 0.000006 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 162 | 162 | AY.103 | 0.001006 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 162 | 162 | B.1.160 | 0.005052 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 156 | 156 | P.1 | 0.002458 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 153 | 153 | AY.13 | 0.02463 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 146 | 147 | B.1.177 | 0.001922 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 147 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 144 | 144 | B.1.1.528 | 0.692308 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 122 | 122 | B.1.160.31 | 0.983871 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 118 | 118 | AY.27 | 0.007637 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 115 | 116 | AY.43 | 0.00051 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 116 | AY.43 | 0.000004 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 94 | 111 | B.1.177.21 | 0.007188 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 17 | 111 | B.1.177.21 | 0.0013 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 107 | 107 | AY.54 | 0.010202 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 97 | 97 | AY.9.1 | 0.008121 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 95 | 95 | AY.20 | 0.003692 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 95 | 95 | AY.24 | 0.040948 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 93 | 93 | AY.3 | 0.000925 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 92 | 92 | Q.8 | 0.015172 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 90 | 90 | B.1.1 | 0.001633 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 59 | 59 | AY.39 | 0.001458 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 53 | 53 | AY.4.1 | 0.039086 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 51 | 51 | AY.26 | 0.001444 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 50 | 50 | AY.47 | 0.001555 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 47 | 47 | AY.98.1 | 0.002276 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 40 | 40 | AY.111 | 0.007326 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 39 | 40 | B.1.526 | 0.000917 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 40 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 34 | 35 | AY.46.6 | 0.002455 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 35 | AY.46.6 | 0.000072 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 34 | 34 | AY.6 | 0.001398 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 34 | 34 | B.1.628 | 0.01198 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 32 | 32 | AY.29 | 0.000505 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 29 | 29 | B.1.427 | 0.001464 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 27 | 27 | AY.9.2 | 0.000992 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 27 | 27 | B.1.637 | 0.001973 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 26 | 26 | AY.33 | 0.001736 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 26 | 26 | B.1.115 | 0.565217 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 25 | 25 | B.1.396 | 0.017643 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 24 | 24 | B.1.1.445 | 0.888889 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 21 | 21 | AY.118 | 0.001316 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 21 | 21 | B.1.429 | 0.000494 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 20 | 20 | B.1.1.519 | 0.000794 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 19 | 19 | B.1.1.284 | 0.002041 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 18 | 19 | B.1.351 | 0.000535 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 19 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 19 | 19 | C.37 | 0.002205 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 18 | 18 | AY.9 | 0.001217 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 13 | 17 | B.1.1.33 | 0.005471 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 17 | B.1.1.33 | 0.001684 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 17 | 17 | B.1.177.57 | 0.004777 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 16 | 16 | B.1.369 | 0.004564 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 15 | 15 | B.1.177.60 | 0.003277 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 15 | 15 | B.1.258.11 | 0.005945 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 14 | 14 | A.2.5 | 0.006986 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 14 | 14 | AY.5 | 0.000289 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | AY.12 | 0.004109 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | AY.34 | 0.001261 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | B.1.1.311 | 0.004656 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | B.1.1.376 | 0.077381 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | B.1.177.40 | 0.06701 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | B.1.400 | 0.005577 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 13 | B.1.617.1 | 0.000903 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 6 | 13 | B.1.617.1 | 0.000774 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | P.2 | 0.002426 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 13 | 13 | Q.3 | 0.001885 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 12 | 12 | AY.75 | 0.000672 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 12 | 12 | B.1.36 | 0.001751 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 11 | 11 | AY.99.2 | 0.001014 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 11 | 11 | B.1.265 | 0.013977 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 11 | 11 | P.1.1 | 0.003494 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10 | 10 | AY.117 | 0.000845 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 10 | AY.39.1 | 0.000357 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 10 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10 | 10 | B.1.1.115 | 0.089286 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10 | 10 | B.1.177.50 | 0.046948 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10 | 10 | B.1.234 | 0.001319 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 10 | 10 | B.1.258 | 0.000665 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | AY.36 | 0.001334 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | AY.45 | 0.001095 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | AY.5.3 | 0.003036 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.1.214 | 0.000499 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.240 | 0.00194 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 9 | 9 | B.1.525 | 0.001018 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | AY.120 | 0.000297 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | AZ.4 | 0.026846 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.1.70 | 0.002729 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.177.86 | 0.001468 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.406 | 0.048485 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.466.2 | 0.00313 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 8 | 8 | B.1.582 | 0.003925 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 7 | AY.23 | 0.000488 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 7 | AY.4.2 | 0.000152 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 7 | B.1.1.306 | 0.003069 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 7 | B.1.177.42 | 0.006261 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 7 | 7 | B.1.421 | 0.052239 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | AY.100 | 0.000276 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | AY.114 | 0.001387 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B | 0.000767 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.1.34 | 0.078947 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.177.77 | 0.004357 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.177.82 | 0.002864 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.221 | 0.000426 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.311 | 0.001647 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.36.29 | 0.003104 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.36.8 | 0.006 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.399 | 0.011605 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.575 | 0.00182 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 6 | 6 | B.1.621 | 0.000531 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | A | 0.001935 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | AY.86 | 0.004149 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.1.315 | 0.042373 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.258.17 | 0.00052 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.497 | 0.001574 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.564 | 0.002129 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.596 | 0.000436 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | B.1.623 | 0.002682 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | D.2 | 0.000375 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | P.1.7 | 0.001596 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 5 | 5 | Q.1 | 0.000632 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.106 | 0.00134 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.113 | 0.00057 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.3.1 | 0.000341 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.42 | 0.000161 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.48 | 0.00186 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.53 | 0.00115 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.74 | 0.000463 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | AY.98 | 0.000316 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.1.433 | 0.005698 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.177.12 | 0.000607 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.177.44 | 0.002076 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.36.18 | 0.001681 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | B.1.88.1 | 0.019231 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | C.35 | 0.003096 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 4 | 4 | N.4 | 0.017021 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 3 | 4 | N.5 | 0.0053 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 4 | N.5 | 0.001767 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | P.1.14 | 0.000191 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 4 | 4 | P.3 | 0.00638 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | 0.166667 | |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | A.27 | 0.004967 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.109 | 0.002219 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.14 | 0.000264 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.29.1 | 0.000662 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.4.3 | 0.002525 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.62 | 0.001307 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | AY.91 | 0.002191 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.222 | 0.000612 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.317 | 0.001235 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.1.329 | 0.011538 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.177.16 | 0.001993 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.177.68 | 0.045455 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.305 | 0.006452 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.336 | 0.007317 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.367 | 0.002377 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.499 | 0.003151 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.1.561 | 0.001191 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.40 | 0.001093 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | B.6.6 | 0.002667 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | P.1.12 | 0.001452 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 3 | 3 | Q.6 | 0.019868 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AD.2 | 0.000438 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.110 | 0.000225 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.28 | 0.003781 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.30 | 0.000791 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.4.5 | 0.000215 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.41 | 0.000588 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.46.2 | 0.001271 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.68 | 0.000547 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.7 | 0.000392 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.85 | 0.000854 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | AY.95 | 0.001522 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.216 | 0.001781 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.28 | 0.000622 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.280 | 0.006173 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.348 | 0.001592 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.368 | 0.006173 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.416 | 0.00181 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.420 | 0.002012 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.50 | 0.001358 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.1.63 | 0.000772 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.160.30 | 0.005952 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.73 | 0.001133 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.79 | 0.004684 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.177.80 | 0.003824 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.221.1 | 0.005814 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.324 | 0.00321 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.342 | 0.2 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.349 | 0.00143 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.351.2 | 0.000605 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.438.1 | 0.000215 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.470 | 0.002809 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.509 | 0.001732 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.595 | 0.000522 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.609 | 0.000959 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | B.1.620 | 0.001892 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | C.36.3 | 0.001134 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | P.1.10 | 0.000539 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | P.1.17 | 0.000324 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 2 | 2 | U.3 | 0.007722 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AM.4 | 0.003571 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AU.3 | 0.00211 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.10 | 0.00053 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.116.1 | 0.000311 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.59 | 0.00053 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.63 | 0.000387 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.76 | 0.004831 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.8 | 0.000606 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.80 | 0.001129 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.82 | 0.001357 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.121 | 0.002427 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.170 | 0.001247 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.194 | 0.00495 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.196 | 0.005714 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.220 | 0.001859 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.231 | 0.003096 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.255 | 0.00303 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.263 | 0.001558 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.297 | 0.002237 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.305 | 0.003861 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.31 | 0.066667 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.349 | 0.010309 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.374 | 0.002375 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.398 | 0.003226 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.459 | 0.015385 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.524 | 0.020833 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.526 | 0.003546 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.1.58 | 0.005376 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.112 | 0.005181 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.126 | 0.001276 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.134 | 0.005464 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.167 | 0.007812 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.52 | 0.001757 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.177.9 | 0.001332 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.189 | 0.004292 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.218 | 0.005155 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.219 | 0.009434 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.22 | 0.001318 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.223 | 0.002778 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.236 | 0.002053 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 1 | B.1.301 | 0.005917 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.320 | 0.001245 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.321 | 0.034483 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.329 | 0.000608 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.338 | 0.008621 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.351.5 | 0.0006 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.16 | 0.001425 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.19 | 0.009259 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.24 | 0.006173 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.27 | 0.000763 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.31 | 0.001751 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.34 | 0.021277 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.36.35 | 0.002604 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.382 | 0.008929 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.398 | 0.002976 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.402 | 0.009804 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.405 | 0.012346 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.411 | 0.003704 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.416.1 | 0.001563 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.420 | 0.010417 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.425 | 0.002994 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.429.1 | 0.012048 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.434 | 0.052632 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.436 | 0.001029 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.474 | 0.001901 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.504 | 0.03125 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.505 | 0.004386 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.535 | 0.028571 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.545 | 0.014493 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.568 | 0.001111 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.587 | 0.001898 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.612 | 0.002653 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.619 | 0.000871 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | B.1.94 | 0.027027 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | C.30 | 0.001727 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | L.3 | 0.003546 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | N.10 | 0.029412 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atA | 1 | 1 | N.3 | 0.005814 |
ORF6 | 32 | I32I | atC | atT | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
![]() |
![]() |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|