CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = D61V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF661D61VnonsyngAtgTt3552130.627382-27384
ORF661D61VnonsyngATgTC3551370.38591527382-27384
ORF661D61VnonsyngATgTA35550.014084527382-27384

Details of the mutation D61V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF661D61VgAtgTt213355All0.000041
ORF661D61VgATgTC137355All0.000026
ORF661D61VgATgTA5355All0.000001
ORF661D61VgAtgTt6092B.1.1.70.000054
ORF661D61VgATgTC3292B.1.1.70.000029
ORF661D61VgAtgTt2033AY.40.000031
ORF661D61VgATgTC1333AY.40.00002
ORF661D61VgATgTC1122B.10.000101
ORF661D61VgAtgTt1122B.10.000101
ORF661D61VgAtgTt812B.1.20.00007
ORF661D61VgATgTC412B.1.20.000035
ORF661D61VgATgTC1012B.1.617.20.000038
ORF661D61VgAtgTt212B.1.617.20.000008
ORF661D61VgAtgTt79AY.850.00299
ORF661D61VgATgTC29AY.850.000854
ORF661D61VgAtgTt48B.1.1.2790.004484
ORF661D61VgATgTC48B.1.1.2790.004484
ORF661D61VgAtgTt46AY.1010.001962
ORF661D61VgATgTA26AY.1010.000981
ORF661D61VgAtgTt56AY.250.00003
ORF661D61VgATgTC16AY.250.000006
ORF661D61VgAtgTt66AY.420.000241
ORF661D61VgAtgTt36B.1.1770.00004
ORF661D61VgATgTC36B.1.1770.00004
ORF661D61VgAtgTt46P.10.000063
ORF661D61VgATgTA16P.10.000016
ORF661D61VgATgTC16P.10.000016
ORF661D61VgATgTC55AY.1000.00023
ORF661D61VgAtgTt35B.1.10.000054
ORF661D61VgATgTC25B.1.10.000036
ORF661D61VgATgTC34AY.1210.000406
ORF661D61VgAtgTt14AY.1210.000135
ORF661D61VgAtgTt24AY.30.00002
ORF661D61VgATgTC24AY.30.00002
ORF661D61VgAtgTt34AY.430.000013
ORF661D61VgATgTC14AY.430.000004
ORF661D61VgATgTC24AY.750.000112
ORF661D61VgAtgTt24AY.750.000112
ORF661D61VgAtgTt34B.1.6370.000219
ORF661D61VgATgTC14B.1.6370.000073
ORF661D61VgATgTC24C.370.000232
ORF661D61VgAtgTt24C.370.000232
ORF661D61VgATgTC44Q.40.001819
ORF661D61VgAtgTt23AY.1170.000169
ORF661D61VgATgTC13AY.1170.000085
ORF661D61VgAtgTt23AY.610.00021
ORF661D61VgATgTC13AY.610.000105
ORF661D61VgAtgTt33B.1.258.170.000312
ORF661D61VgATgTC220.111111
ORF661D61VgAtgTt12A.2.5.20.001572
ORF661D61VgATgTC12A.2.5.20.001572
ORF661D61VgATgTC12AY.1130.000142
ORF661D61VgAtgTt12AY.1130.000142
ORF661D61VgAtgTt22AY.200.000078
ORF661D61VgAtgTt12AY.23.10.000417
ORF661D61VgATgTC12AY.23.10.000417
ORF661D61VgATgTC12AY.440.000006
ORF661D61VgAtgTt12AY.440.000006
ORF661D61VgATgTC12AY.50.000021
ORF661D61VgAtgTt12AY.50.000021
ORF661D61VgAtgTt12AY.540.000095
ORF661D61VgATgTC12AY.540.000095
ORF661D61VgAtgTt12AY.680.000274
ORF661D61VgATgTC12AY.680.000274
ORF661D61VgATgTC12AY.940.000443
ORF661D61VgAtgTt12AY.940.000443
ORF661D61VgAtgTt12AY.98.10.000048
ORF661D61VgATgTC12AY.98.10.000048
ORF661D61VgAtgTt22B.1.1.2070.002364
ORF661D61VgATgTC12B.1.1.3060.000438
ORF661D61VgAtgTt12B.1.1.3060.000438
ORF661D61VgAtgTt12B.1.1.3110.000358
ORF661D61VgATgTC12B.1.1.3110.000358
ORF661D61VgATgTC12B.1.1.5190.00004
ORF661D61VgAtgTt12B.1.1.5190.00004
ORF661D61VgAtgTt12B.1.160.110.005714
ORF661D61VgATgTC12B.1.160.110.005714
ORF661D61VgAtgTt12B.1.177.210.000076
ORF661D61VgATgTC12B.1.177.210.000076
ORF661D61VgATgTC12B.1.2400.000216
ORF661D61VgAtgTt12B.1.2400.000216
ORF661D61VgATgTC12B.1.2430.00007
ORF661D61VgAtgTt12B.1.2430.00007
ORF661D61VgATgTC12B.1.30.002618
ORF661D61VgAtgTt12B.1.30.002618
ORF661D61VgATgTC12B.1.3690.000285
ORF661D61VgAtgTt12B.1.3690.000285
ORF661D61VgATgTC12B.1.438.10.000107
ORF661D61VgAtgTt12B.1.438.10.000107
ORF661D61VgATgTC12B.1.466.20.000391
ORF661D61VgAtgTt12B.1.466.20.000391
ORF661D61VgATgTC12B.1.5260.000024
ORF661D61VgAtgTt12B.1.5260.000024
ORF661D61VgAtgTt12B.1.5820.000491
ORF661D61VgATgTC12B.1.5820.000491
ORF661D61VgATgTC12B.1.617.10.000129
ORF661D61VgAtgTt12B.1.617.10.000129
ORF661D61VgAtgTt12B.30.000831
ORF661D61VgATgTC12B.30.000831
ORF661D61VgAtgTt12B.4.70.010101
ORF661D61VgATgTC12B.4.70.010101
ORF661D61VgATgTC12B.400.000364
ORF661D61VgAtgTt12B.400.000364
ORF661D61VgATgTA12P.1.120.000484
ORF661D61VgAtgTt12P.1.120.000484
ORF661D61VgATgTC12P.1.150.000232
ORF661D61VgAtgTt12P.1.150.000232
ORF661D61VgAtgTt12P.20.000187
ORF661D61VgATgTA12P.20.000187
ORF661D61VgATgTC12Q.10.000126
ORF661D61VgAtgTt12Q.10.000126
ORF661D61VgAtgTt11AY.1030.000006
ORF661D61VgAtgTt11AY.29.10.000221
ORF661D61VgATgTC11AY.300.000396
ORF661D61VgAtgTt11AY.4.40.000409
ORF661D61VgAtgTt11AY.46.30.000934
ORF661D61VgAtgTt11AY.840.000437
ORF661D61VgAtgTt11AY.9.20.000037
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1.10.000327
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1.1920.002309
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1.2140.000055
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1.2250.007194
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1.280.000311
ORF661D61VgAtgTt11B.1.1600.000031
ORF661D61VgAtgTt11B.1.177.150.000631
ORF661D61VgAtgTt11B.1.177.40.000211
ORF661D61VgATgTC11B.1.177.540.000606
ORF661D61VgAtgTt11B.1.360.000146
ORF661D61VgAtgTt11B.1.4150.014286
ORF661D61VgAtgTt11B.1.4260.001009
ORF661D61VgAtgTt11B.1.4290.000024
ORF661D61VgAtgTt11B.1.4520.013699
ORF661D61VgAtgTt11C.350.000774
ORF661D61VgAtgTt11P.1.160.000374
ORF661D61VgAtgTt11P.70.004367