CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : Mut = D30del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF630D30deldelGAT---19061906127289-27291

Details of the mutation D30del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF630D30delGAT---19061906All0.000365
ORF630D30delGAT---300300AY.40.000467
ORF630D30delGAT---269269B.1.1.70.000241
ORF630D30delGAT---8787AY.4.20.001887
ORF630D30delGAT---8484AY.440.000511
ORF630D30delGAT---6363B.1.617.20.000237
ORF630D30delGAT---5555AY.1030.000341
ORF630D30delGAT---5353AY.430.000235
ORF630D30delGAT---5050AY.470.001555
ORF630D30delGAT---4848AY.250.000289
ORF630D30delGAT---4545AY.1200.001673
ORF630D30delGAT---4141B.1.6161
ORF630D30delGAT---3939AY.30.000388
ORF630D30delGAT---3838B.10.000348
ORF630D30delGAT---3333P.10.00052
ORF630D30delGAT---3232N.81
ORF630D30delGAT---2727B.1.20.000238
ORF630D30delGAT---2323AY.1110.004212
ORF630D30delGAT---2121AY.390.000519
ORF630D30delGAT---2121AY.840.009186
ORF630D30delGAT---2020AY.50.000413
ORF630D30delGAT---2020B.1.1080.116279
ORF630D30delGAT---1818AY.130.002898
ORF630D30delGAT---1717AY.1180.001065
ORF630D30delGAT---1616B.1.177.210.001224
ORF630D30delGAT---1414B.1.4290.000329
ORF630D30delGAT---1414B.1.5260.000329
ORF630D30delGAT---1313AY.260.000368
ORF630D30delGAT---1313AY.290.000205
ORF630D30delGAT---1313AY.900.008898
ORF630D30delGAT---1212AY.360.001779
ORF630D30delGAT---1212AY.420.000483
ORF630D30delGAT---1111AY.1190.000388
ORF630D30delGAT---1111AY.850.004699
ORF630D30delGAT---1010AY.460.001041
ORF630D30delGAT---1010B.1.36.360.00602
ORF630D30delGAT---99AY.39.10.000357
ORF630D30delGAT---99AY.450.001095
ORF630D30delGAT---99AY.750.000504
ORF630D30delGAT---88AY.1060.002679
ORF630D30delGAT---88AY.4.2.10.001192
ORF630D30delGAT---88B.1.2400.001725
ORF630D30delGAT---77AY.1020.000186
ORF630D30delGAT---77AY.140.000616
ORF630D30delGAT---77AY.46.50.001389
ORF630D30delGAT---77AY.540.000667
ORF630D30delGAT---77AY.9.20.000257
ORF630D30delGAT---77B.1.1.5190.000278
ORF630D30delGAT---77B.1.6210.00062
ORF630D30delGAT---66AY.270.000388
ORF630D30delGAT---66AY.60.000247
ORF630D30delGAT---66B.1.2580.000399
ORF630D30delGAT---66B.1.3510.000178
ORF630D30delGAT---55AY.1000.00023
ORF630D30delGAT---55AY.3.10.000426
ORF630D30delGAT---55AY.610.000524
ORF630D30delGAT---55AY.98.10.000242
ORF630D30delGAT---55B.1.10.000091
ORF630D30delGAT---55B.1.1.3180.001509
ORF630D30delGAT---55B.1.2340.00066
ORF630D30delGAT---55B.1.3110.001373
ORF630D30delGAT---55B.1.4270.000252
ORF630D30delGAT---55P.1.100.001347
ORF630D30delGAT---44AU.20.009685
ORF630D30delGAT---44AY.200.000155
ORF630D30delGAT---44AY.230.000279
ORF630D30delGAT---44B.1.5250.000453
ORF630D30delGAT---44R.10.00036
ORF630D30delGAT---33AY.120.000948
ORF630D30delGAT---33AY.20.001068
ORF630D30delGAT---33AY.330.0002
ORF630D30delGAT---33AY.710.001425
ORF630D30delGAT---33AY.980.000237
ORF630D30delGAT---33B.1.1.2140.000166
ORF630D30delGAT---33B.1.1.2220.000612
ORF630D30delGAT---33B.1.214.20.001799
ORF630D30delGAT---33C.370.000348
ORF630D30delGAT---22A0.000774
ORF630D30delGAT---22A.10.000564
ORF630D30delGAT---22AY.280.003781
ORF630D30delGAT---22AY.380.000999
ORF630D30delGAT---22AY.4.50.000215
ORF630D30delGAT---22AY.400.001929
ORF630D30delGAT---22AY.46.20.001271
ORF630D30delGAT---22AY.520.001629
ORF630D30delGAT---22AY.530.000575
ORF630D30delGAT---22AY.700.000417
ORF630D30delGAT---22AY.9.10.000167
ORF630D30delGAT---22B0.000256
ORF630D30delGAT---22B.1.1.10.000653
ORF630D30delGAT---22B.1.1.2310.006192
ORF630D30delGAT---22B.1.1.330.000842
ORF630D30delGAT---22B.1.1.4610.024096
ORF630D30delGAT---22B.1.1770.000026
ORF630D30delGAT---22B.1.1950.01005
ORF630D30delGAT---22B.1.2290.019417
ORF630D30delGAT---22B.1.2430.000139
ORF630D30delGAT---22B.1.36.170.000988
ORF630D30delGAT---22B.1.4000.000858
ORF630D30delGAT---22B.1.438.10.000215
ORF630D30delGAT---22B.1.466.20.000782
ORF630D30delGAT---22B.1.5240.002813
ORF630D30delGAT---22B.1.5540.008811
ORF630D30delGAT---22B.1.5750.000607
ORF630D30delGAT---22B.1.617.10.000258
ORF630D30delGAT---22B.1.617.30.00597
ORF630D30delGAT---22D.20.00015
ORF630D30delGAT---22Q.80.00033
ORF630D30delGAT---11AU.10.001266
ORF630D30delGAT---11AY.1010.00049
ORF630D30delGAT---11AY.1100.000113
ORF630D30delGAT---11AY.1160.000287
ORF630D30delGAT---11AY.1170.000085
ORF630D30delGAT---11AY.120.10.000321
ORF630D30delGAT---11AY.120.20.001285
ORF630D30delGAT---11AY.120.2.10.000498
ORF630D30delGAT---11AY.1210.000135
ORF630D30delGAT---11AY.240.000431
ORF630D30delGAT---11AY.29.10.000221
ORF630D30delGAT---11AY.340.000097
ORF630D30delGAT---11AY.34.10.00051
ORF630D30delGAT---11AY.370.000316
ORF630D30delGAT---11AY.4.10.000737
ORF630D30delGAT---11AY.46.30.000934
ORF630D30delGAT---11AY.46.60.000072
ORF630D30delGAT---11AY.5.30.000337
ORF630D30delGAT---11AY.590.00053
ORF630D30delGAT---11AY.630.000387
ORF630D30delGAT---11AY.680.000274
ORF630D30delGAT---11AY.730.000665
ORF630D30delGAT---11AY.75.10.00018
ORF630D30delGAT---11AY.790.001211
ORF630D30delGAT---11AY.90.000068
ORF630D30delGAT---11AY.9.2.10.001976
ORF630D30delGAT---11AY.970.001701
ORF630D30delGAT---11AY.990.001049
ORF630D30delGAT---11B.1.1.2410.00207
ORF630D30delGAT---11B.1.1.250.000569
ORF630D30delGAT---11B.1.1.3160.000925
ORF630D30delGAT---11B.1.1.3690.000446
ORF630D30delGAT---11B.1.1.380.058824
ORF630D30delGAT---11B.1.1.4340.000349
ORF630D30delGAT---11B.1.1.500.000679
ORF630D30delGAT---11B.1.1.510.001718
ORF630D30delGAT---11B.1.1.630.000386
ORF630D30delGAT---11B.1.1.700.000341
ORF630D30delGAT---11B.1.1.80.003584
ORF630D30delGAT---11B.1.110.30.000718
ORF630D30delGAT---11B.1.1310.008772
ORF630D30delGAT---11B.1.177.160.000664
ORF630D30delGAT---11B.1.177.170.000821
ORF630D30delGAT---11B.1.177.90.001332
ORF630D30delGAT---11B.1.2210.000071
ORF630D30delGAT---11B.1.2320.000537
ORF630D30delGAT---11B.1.2390.001221
ORF630D30delGAT---11B.1.2600.003344
ORF630D30delGAT---11B.1.3190.003049
ORF630D30delGAT---11B.1.36.10.00114
ORF630D30delGAT---11B.1.36.240.006173
ORF630D30delGAT---11B.1.3620.001541
ORF630D30delGAT---11B.1.3910.001127
ORF630D30delGAT---11B.1.3960.000706
ORF630D30delGAT---11B.1.3980.002976
ORF630D30delGAT---11B.1.4620.007246
ORF630D30delGAT---11B.1.5760.000907
ORF630D30delGAT---11B.1.5950.000261
ORF630D30delGAT---11B.1.6270.00202
ORF630D30delGAT---11B.1.6370.000073
ORF630D30delGAT---11B.1.9.30.038462
ORF630D30delGAT---11C.2.10.006667
ORF630D30delGAT---11C.36.30.000567
ORF630D30delGAT---11C.36.3.10.002717
ORF630D30delGAT---11N.100.029412
ORF630D30delGAT---11P.1.10.000318
ORF630D30delGAT---11P.1.140.000048
ORF630D30delGAT---11P.1.160.000374
ORF630D30delGAT---11P.1.170.000162
ORF630D30delGAT---11P.1.70.000319