CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : CodonNum = 49 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF649Y49deldelTAT---198198127346-27348

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF649Y49delTAT---198198All0.000038
ORF649Y49delTAT---116116AY.40.000181
ORF649Y49delTAT---99B.1.1.70.000008
ORF649Y49delTAT---99B.1.617.20.000034
ORF649Y49delTAT---88AY.770.009019
ORF649Y49delTAT---55AY.390.000124
ORF649Y49delTAT---44AY.430.000018
ORF649Y49delTAT---33AY.1020.00008
ORF649Y49delTAT---33AY.1180.000188
ORF649Y49delTAT---33AY.420.000121
ORF649Y49delTAT---33AY.440.000018
ORF649Y49delTAT---22AY.1030.000012
ORF649Y49delTAT---22AY.1190.000071
ORF649Y49delTAT---22AY.30.00002
ORF649Y49delTAT---22B.1.5250.000226
ORF649Y49delTAT---22B.1.5260.000047
ORF649Y49delTAT---22P.10.000032
ORF649Y49delTAT---11AY.1000.000046
ORF649Y49delTAT---11AY.1060.000335
ORF649Y49delTAT---11AY.1130.000142
ORF649Y49delTAT---11AY.1170.000085
ORF649Y49delTAT---11AY.200.000039
ORF649Y49delTAT---11AY.270.000065
ORF649Y49delTAT---11AY.290.000016
ORF649Y49delTAT---11AY.4.20.000022
ORF649Y49delTAT---11AY.450.000122
ORF649Y49delTAT---11AY.470.000031
ORF649Y49delTAT---11AY.730.000665
ORF649Y49delTAT---11AY.840.000437
ORF649Y49delTAT---11AY.980.000079
ORF649Y49delTAT---11AY.990.001049
ORF649Y49delTAT---11B.10.000009
ORF649Y49delTAT---11B.1.1470.000756
ORF649Y49delTAT---11B.1.20.000009
ORF649Y49delTAT---11B.1.2430.00007
ORF649Y49delTAT---11B.1.4040.001302
ORF649Y49delTAT---11B.1.5640.000426
ORF649Y49delTAT---11B.1.617.10.000129
ORF649Y49delTAT---11B.1.617.30.002985
ORF649Y49delTAT---11B.1.6270.00202