CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : CodonNum = 27

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF627W27LnonsyntGgtTg604760460.99983527280-27282
ORF627W27LnonsyntGGtTA604710.00016537127280-27282
ORF627W27deldelTGG---28422842127280-27282
ORF627W27RnonsynTggCgg4183230.77272727280-27282
ORF627W27RnonsynTggAgg418930.22248827280-27282
ORF627W27RnonsynTgGCgT41820.0047846927280-27282
ORF627W27XnonsyntGgtAg1961040.53061227280-27282
ORF627W27XnonsyntgGtgA196850.43367327280-27282
ORF627W27XnonsyntGGtAA19670.035714327280-27282
ORF627W27CnonsyntgGtgT1381320.95652227280-27282
ORF627W27CnonsyntgGtgC13860.043478327280-27282
ORF627W27GnonsynTggGgg61580.9508227280-27282
ORF627W27GnonsynTgGGgA6120.032786927280-27282
ORF627W27GnonsynTgGGgT6110.016393427280-27282
ORF627W27SnonsyntGgtCg20190.9527280-27282
ORF627W27SnonsynTgGAgT2010.0527280-27282
ORF627W27del2deltGGt--1390.69230827280-27282
ORF627W27del2delTGg--g1340.30769227280-27282
ORF627W27del1deltGgt-g860.7527280-27282
ORF627W27del1deltgGtg-820.2527280-27282
ORF627W27FnonsyntGGtTT650.83333327280-27282
ORF627W27FnonsyntGGtTC610.16666727280-27282
ORF627W27YnonsyntGGtAT33127280-27282
ORF627W27TnonsynTGgACg22127280-27282
ORF627W27DnonsynTGGGAT11127280-27282
ORF627W27EnonsynTGgGAg11127280-27282
ORF627W27HnonsynTGGCAT11127280-27282
ORF627W27QnonsynTGgCAg11127280-27282

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF627W27LtGgtTg60466047All0.001156
ORF627W27LtGGtTA16047All0
ORF627W27delTGG---28422842All0.000544
ORF627W27LtGgtTg14231423B.1.1.70.001274
ORF627W27LtGgtTg687687B.1.617.20.002587
ORF627W27delTGG---632632AY.40.000984
ORF627W27LtGgtTg540540AY.40.00084
ORF627W27RTggCgg323418All0.000062
ORF627W27RTggAgg93418All0.000018
ORF627W27RTgGCgT2418All0
ORF627W27delTGG---362362B.1.1.70.000324
ORF627W27XtGgtAg104196All0.00002
ORF627W27XtgGtgA85196All0.000016
ORF627W27XtGGtAA7196All0.000001
ORF627W27LtGgtTg181181B.1.20.001594
ORF627W27LtGgtTg174174AY.290.002745
ORF627W27LtGgtTg172172AY.50.003552
ORF627W27RTggCgg166166AY.420.006678
ORF627W27LtGgtTg165165B.1.1.891
ORF627W27LtGgtTg149149AY.430.00066
ORF627W27LtGgtTg139139AY.99.10.215839
ORF627W27CtgGtgT132138All0.000025
ORF627W27CtgGtgC6138All0.000001
ORF627W27LtGgtTg124124AY.440.000755
ORF627W27delTGG---112112B.1.617.20.000422
ORF627W27LtGgtTg110110AY.1020.002917
ORF627W27delTGG---109109AY.430.000483
ORF627W27delTGG---106106AY.440.000645
ORF627W27LtGgtTg105105AY.250.000632
ORF627W27LtGgtTg103103AY.1030.00064
ORF627W27delTGG---9696AY.4.20.002082
ORF627W27LtGgtTg9595P.10.001497
ORF627W27delTGG---9292AY.250.000553
ORF627W27RTggCgg7878B.1.20.000687
ORF627W27LtGgtTg7676B.1.10.001379
ORF627W27LtGgtTg7474B.1.1.4340.025793
ORF627W27LtGgtTg7373B.10.000669
ORF627W27RTggAgg7172AY.40.000111
ORF627W27RTggCgg172AY.40.000002
ORF627W27delTGG---6363B.10.000577
ORF627W27delTGG---6262AY.1030.000385
ORF627W27GTggGgg5861All0.000011
ORF627W27GTgGGgA261All0
ORF627W27GTgGGgT161All0
ORF627W27delTGG---6060AY.30.000597
ORF627W27delTGG---5959AY.470.001835
ORF627W27delTGG---5757AY.1200.002119
ORF627W27LtGgtTg5555AY.30.000547
ORF627W27LtGgtTg5353AY.90.003583
ORF627W27LtGgtTg5252B.1.438.21
ORF627W27LtGgtTg5151AY.200.001982
ORF627W27LtGgtTg5151B.1.1770.000672
ORF627W27delTGG---4949B.1.20.000431
ORF627W27LtGgtTg4747AY.330.003139
ORF627W27LtGgtTg4444AY.4.20.000954
ORF627W27LtGgtTg4444B.1.177.830.065185
ORF627W27CtgGtgT4243B.1.1.70.000038
ORF627W27CtgGtgC143B.1.1.70.000001
ORF627W27delTGG---4141B.1.6161
ORF627W27delTGG---4040P.10.00063
ORF627W27LtGgtTg4040P.20.007465
ORF627W27LtGgtTg3939AY.140.003432
ORF627W27delTGG---3737AY.390.000914
ORF627W27GTggGgg3636B.1.4220.029245
ORF627W27delTGG---3232N.81
ORF627W27LtGgtTg2929AY.390.000717
ORF627W27delTGG---2929AY.50.000599
ORF627W27LtGgtTg2929B.1.4290.000682
ORF627W27XtGgtAg2429B.1.617.20.00009
ORF627W27XtgGtgA529B.1.617.20.000019
ORF627W27delTGG---2525B.1.5260.000588
ORF627W27LtGgtTg2424AY.260.000679
ORF627W27delTGG---2424AY.260.000679
ORF627W27LtGgtTg2424AY.340.002327
ORF627W27LtGgtTg2324B.1.177.210.001759
ORF627W27LtGGtTA124B.1.177.210.000076
ORF627W27delTGG---2323AY.1110.004212
ORF627W27LtGgtTg2323AY.46.60.001661
ORF627W27LtGgtTg2323C.360.020947
ORF627W27LtGgtTg2222B.1.177.560.014686
ORF627W27LtGgtTg2222B.1.2210.001563
ORF627W27delTGG---2121AY.60.000864
ORF627W27delTGG---2121AY.840.009186
ORF627W27StGgtCg1920All0.000004
ORF627W27STgGAgT120All0
ORF627W27delTGG---2020B.1.1080.116279
ORF627W27LtGgtTg1919AY.610.001991
ORF627W27XtgGtgA1119B.1.1.70.00001
ORF627W27XtGgtAg619B.1.1.70.000005
ORF627W27XtGGtAA219B.1.1.70.000002
ORF627W27LtGgtTg1818AY.1190.000636
ORF627W27LtGgtTg1818AY.640.010714
ORF627W27LtGgtTg1717AY.1200.000632
ORF627W27delTGG---1717AY.130.002737
ORF627W27delTGG---1717AY.750.000952
ORF627W27LtGgtTg1717B.1.1.630.006559
ORF627W27delTGG---1717B.1.177.210.0013
ORF627W27LtGgtTg1717B.1.6280.00599
ORF627W27LtGgtTg1616AY.1170.001352
ORF627W27delTGG---1616AY.1180.001002
ORF627W27LtGgtTg1616B.1.5510.020645
ORF627W27delTGG---1515AY.360.002223
ORF627W27delTGG---1515AY.420.000603
ORF627W27LtGgtTg1515B.1.360.002189
ORF627W27delTGG---1414AY.540.001335
ORF627W27LtGgtTg1414B.1.177.520.024605
ORF627W27LtGgtTg1414B.6.60.012444
ORF627W27del2tGGt--913All0.000002
ORF627W27del2TGg--g413All0.000001
ORF627W27delTGG---1313AY.1190.000459
ORF627W27delTGG---1313AY.290.000205
ORF627W27LtGgtTg1313AY.3.10.001108
ORF627W27LtGgtTg1313AY.60.000535
ORF627W27LtGgtTg1313AY.740.001503
ORF627W27delTGG---1313AY.900.008898
ORF627W27LtGgtTg1313AY.98.10.00063
ORF627W27delTGG---1313B.1.1050.125
ORF627W27LtGgtTg1313B.1.3510.000386
ORF627W27LtGgtTg1313B.1.36.220.0157
ORF627W27delTGG---1313B.1.4290.000306
ORF627W27LtGgtTg1313B.1.5950.003392
ORF627W27delTGG---1212AY.200.000466
ORF627W27delTGG---1212AY.850.005126
ORF627W27LtGgtTg1212B.1.1.5190.000477
ORF627W27LtGgtTg1212B.1.177.810.002272
ORF627W27delTGG---1212B.1.36.360.007225
ORF627W27LtGgtTg1212B.1.6210.001062
ORF627W27LtGgtTg1111AY.1110.002015
ORF627W27delTGG---1111AY.1130.001566
ORF627W27delTGG---1111AY.39.10.000436
ORF627W27XtGgtAg711AY.40.000011
ORF627W27XtgGtgA411AY.40.000006
ORF627W27LtGgtTg1111AY.470.000342
ORF627W27delTGG---1111AY.9.20.000404
ORF627W27LtGgtTg1111B.1.2320.005911
ORF627W27LtGgtTg1111B.1.5260.000259
ORF627W27LtGgtTg1111Q.80.001814
ORF627W27LtGgtTg1010AY.1000.00046
ORF627W27delTGG---1010AY.1000.00046
ORF627W27delTGG---1010AY.140.00088
ORF627W27LtGgtTg1010AY.400.009643
ORF627W27XtGgtAg510AY.440.00003
ORF627W27XtgGtgA410AY.440.000024
ORF627W27XtGGtAA110AY.440.000006
ORF627W27delTGG---1010AY.450.001217
ORF627W27delTGG---1010AY.460.001041
ORF627W27CtgGtgT1010B.1.1.2140.000555
ORF627W27LtGgtTg1010B.1.1.3060.004384
ORF627W27LtGgtTg1010D.20.00075
ORF627W27delTGG---99AY.1060.003014
ORF627W27LtGgtTg99AY.130.001449
ORF627W27RTggCgg59AY.200.000194
ORF627W27RTggAgg49AY.200.000155
ORF627W27RTggCgg99AY.4.20.000195
ORF627W27delTGG---99AY.4.2.10.001341
ORF627W27LtGgtTg99AY.750.000504
ORF627W27delTGG---99B.1.1770.000119
ORF627W27XtGgtAg89B.1.177.210.000612
ORF627W27XtgGtgA19B.1.177.210.000076
ORF627W27LtGgtTg99B.1.177.440.00467
ORF627W27delTGG---99B.1.2400.00194
ORF627W27del1tGgt-g68All0.000001
ORF627W27del1tgGtg-28All0
ORF627W27XtGgtAg78AY.1000.000322
ORF627W27XtgGtgA18AY.1000.000046
ORF627W27delTGG---88AY.1020.000212
ORF627W27RTggCgg88AY.1030.00005
ORF627W27LtGgtTg88AY.230.000558
ORF627W27LtGgtTg88AY.39.10.000317
ORF627W27LtGgtTg88AY.460.000833
ORF627W27delTGG---88AY.46.50.001587
ORF627W27LtGgtTg88AY.5.40.002214
ORF627W27LtGgtTg88AY.650.004264
ORF627W27LtGgtTg88AY.9.20.000294
ORF627W27XtGgtAg58B.10.000046
ORF627W27XtgGtgA38B.10.000027
ORF627W27RTggCgg58B.1.1.70.000004
ORF627W27RTggAgg38B.1.1.70.000003
ORF627W27LtGgtTg88B.1.2430.000557
ORF627W27delTGG---88B.1.3510.000238
ORF627W27LtGgtTg88C.370.000929
ORF627W27LtGgtTg88P.1.70.002554
ORF627W27CtgGtgT77AY.1030.000043
ORF627W27StGgtCg77AY.1030.000043
ORF627W27LtGgtTg77AY.1210.000947
ORF627W27XtgGtgA67AY.260.00017
ORF627W27XtGgtAg17AY.260.000028
ORF627W27LtGgtTg77AY.450.000852
ORF627W27LtGgtTg77AY.5.30.002362
ORF627W27LtGgtTg77AY.540.000667
ORF627W27LtGgtTg77AY.590.003708
ORF627W27delTGG---77AY.610.000733
ORF627W27delTGG---77B.1.10.000127
ORF627W27delTGG---77B.1.2340.000924
ORF627W27delTGG---77B.1.351.20.002118
ORF627W27LtGgtTg77B.1.4270.000353
ORF627W27LtGgtTg77B.1.438.10.000751
ORF627W27LtGgtTg77B.1.5960.00061
ORF627W27delTGG---77B.1.6210.00062
ORF627W27CtgGtgT77B.1.6280.002467
ORF627W27XtgGtgA77D.20.000525
ORF627W27LtGgtTg77P.1.140.000335
ORF627W27LtGgtTg77P.1.170.001132
ORF627W27FtGGtTT56All0.000001
ORF627W27FtGGtTC16All0
ORF627W27GTggGgg66AY.1050.003859
ORF627W27LtGgtTg66AY.1130.000854
ORF627W27LtGgtTg66AY.1140.001387
ORF627W27CtgGtgT66AY.250.000036
ORF627W27delTGG---66AY.270.000388
ORF627W27delTGG---66AY.3.10.000512
ORF627W27RTggCgg56AY.440.00003
ORF627W27RTggAgg16AY.440.000006
ORF627W27XtGgtAg66AY.46.40.000987
ORF627W27LtGgtTg66AY.670.002786
ORF627W27LtGgtTg66AY.840.002625
ORF627W27LtGgtTg66B.1.1.2140.000333
ORF627W27delTGG---66B.1.1.2140.000333
ORF627W27LtGgtTg66B.1.1.2220.001224
ORF627W27LtGgtTg66B.1.1.4200.006036
ORF627W27del2tGGt--56B.1.1.70.000004
ORF627W27del2TGg--g16B.1.1.70.000001
ORF627W27LtGgtTg66B.1.177.90.007989
ORF627W27delTGG---66B.1.2580.000399
ORF627W27delTGG---66B.1.3110.001647
ORF627W27LtGgtTg66B.1.3690.001711
ORF627W27LtGgtTg66B.1.617.10.000774
ORF627W27CtgGtgT66B.1.617.20.000023
ORF627W27RTggCgg66B.1.617.20.000023
ORF627W27XtGGtAA250.111111
ORF627W27XtgGtgA250.111111
ORF627W27XtGgtAg150.055556
ORF627W27XtGgtAg35AY.1030.000019
ORF627W27XtgGtgA25AY.1030.000012
ORF627W27LtGgtTg55AY.1090.003698
ORF627W27LtGgtTg55AY.16.10.00235
ORF627W27XtgGtgA45AY.250.000024
ORF627W27XtGgtAg15AY.250.000006
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ORF627W27delTGG---55AY.340.000485
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