CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : CodonNum = 26

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF626I26deldelATT---28372837127277-27279
ORF626I26VnonsynAttGtt875875127277-27279
ORF626I26IsynatTatC2352270.96595727277-27279
ORF626I26IsynatTatA23580.034042627277-27279
ORF626I26TnonsynaTtaCt2042020.99019627277-27279
ORF626I26TnonsynaTTaCC20420.0098039227277-27279
ORF626I26FnonsynAttTtt1181080.91525427277-27279
ORF626I26FnonsynAtTTtC118100.084745827277-27279
ORF626I26MnonsynatTatG109109127277-27279
ORF626I26LnonsynAttCtt1091040.95412827277-27279
ORF626I26LnonsynAtTCtC10940.036697227277-27279
ORF626I26LnonsynAtTCtG10910.0091743127277-27279
ORF626I26del1delAtt-tt34160.47058827277-27279
ORF626I26del1delaTta-t34110.32352927277-27279
ORF626I26del1delatTat-3460.17647127277-27279
ORF626I26del1delATt-At3410.029411827277-27279
ORF626I26NnonsynaTtaAt16110.687527277-27279
ORF626I26NnonsynaTTaAC1650.312527277-27279
ORF626I26SnonsynaTtaGt15120.827277-27279
ORF626I26SnonsynATtTCt1530.227277-27279
ORF626I26del2delATt--t320.66666727277-27279
ORF626I26del2delaTTa--310.33333327277-27279
ORF626I26PnonsynATTCCA22127277-27279

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF626I26delATT---28372837All0.000543
ORF626I26VAttGtt875875All0.000167
ORF626I26delATT---617617AY.40.00096
ORF626I26delATT---363363B.1.1.70.000325
ORF626I26VAttGtt294294B.1.1.70.000263
ORF626I26IatTatC227235All0.000043
ORF626I26IatTatA8235All0.000002
ORF626I26TaTtaCt202204All0.000039
ORF626I26TaTTaCC2204All0
ORF626I26VAttGtt185185AY.40.000288
ORF626I26FAttTtt108118All0.000021
ORF626I26FAtTTtC10118All0.000002
ORF626I26IatTatC117117AY.200.004547
ORF626I26delATT---112112B.1.617.20.000422
ORF626I26MatTatG109109All0.000021
ORF626I26LAttCtt104109All0.00002
ORF626I26LAtTCtC4109All0.000001
ORF626I26LAtTCtG1109All0
ORF626I26delATT---108108AY.430.000478
ORF626I26delATT---102102AY.440.000621
ORF626I26delATT---101101AY.4.20.002191
ORF626I26MatTatG9898B.1.1.4530.830508
ORF626I26delATT---9292AY.250.000553
ORF626I26VAttGtt8484B.1.617.20.000316
ORF626I26LAttCtt6266B.1.177.210.004741
ORF626I26LAtTCtC466B.1.177.210.000306
ORF626I26delATT---6363AY.1030.000391
ORF626I26delATT---6363B.10.000577
ORF626I26FAttTtt5363B.1.177.210.004053
ORF626I26FAtTTtC1063B.1.177.210.000765
ORF626I26delATT---6161AY.30.000607
ORF626I26delATT---5959AY.470.001835
ORF626I26TaTtaCt5254B.1.1.70.000047
ORF626I26TaTTaCC254B.1.1.70.000002
ORF626I26delATT---5252AY.1200.001933
ORF626I26delATT---4949B.1.20.000431
ORF626I26delATT---4141B.1.6161
ORF626I26delATT---3838P.10.000599
ORF626I26delATT---3737AY.390.000914
ORF626I26VAttGtt3636AY.30.000358
ORF626I26del1Att-tt1634All0.000003
ORF626I26del1aTta-t1134All0.000002
ORF626I26del1atTat-634All0.000001
ORF626I26del1ATt-At134All0
ORF626I26VAttGtt3434AY.7.10.003832
ORF626I26TaTtaCt3434P.1.140.001625
ORF626I26delATT---3232N.81
ORF626I26delATT---3131AY.50.00064
ORF626I26VAttGtt2828AY.1030.000174
ORF626I26delATT---2525B.1.5260.000588
ORF626I26delATT---2424AY.260.000679
ORF626I26delATT---2323AY.1110.004212
ORF626I26TaTtaCt2121AY.40.000033
ORF626I26delATT---2121AY.60.000864
ORF626I26delATT---2121AY.840.009186
ORF626I26delATT---2020B.1.1080.116279
ORF626I26VAttGtt2020B.1.20.000176
ORF626I26FAttTtt1818B.1.1.70.000016
ORF626I26delATT---1717AY.130.002737
ORF626I26delATT---1717AY.750.000952
ORF626I26delATT---1717B.1.177.210.0013
ORF626I26NaTtaAt1116All0.000002
ORF626I26NaTTaAC516All0.000001
ORF626I26delATT---1616AY.1180.001002
ORF626I26VAttGtt1616B.1.360.002334
ORF626I26SaTtaGt1215All0.000002
ORF626I26SATtTCt315All0.000001
ORF626I26delATT---1515AY.360.002223
ORF626I26delATT---1515AY.420.000603
ORF626I26delATT---1414AY.540.001335
ORF626I26delATT---1313AY.1190.000459
ORF626I26delATT---1313AY.290.000205
ORF626I26VAttGtt1313AY.440.000079
ORF626I26TaTtaCt1313AY.46.40.002139
ORF626I26delATT---1313AY.850.005553
ORF626I26delATT---1313AY.900.008898
ORF626I26delATT---1313B.1.1050.125
ORF626I26delATT---1313B.1.4290.000306
ORF626I26delATT---1212AY.200.000466
ORF626I26delATT---1212B.1.36.360.007225
ORF626I26IatTatC1111AY.1030.000068
ORF626I26delATT---1111AY.1130.001566
ORF626I26VAttGtt1111AY.200.000428
ORF626I26VAttGtt1111AY.390.000272
ORF626I26delATT---1111AY.39.10.000436
ORF626I26LAttCtt1111AY.40.000017
ORF626I26VAttGtt1111AY.430.000049
ORF626I26delATT---1111AY.460.001145
ORF626I26delATT---1111AY.9.20.000404
ORF626I26IatTatC1011B.1.1.70.000009
ORF626I26IatTatA111B.1.1.70.000001
ORF626I26IatTatC1011B.1.617.20.000038
ORF626I26IatTatA111B.1.617.20.000004
ORF626I26FAttTtt1111P.10.000173
ORF626I26delATT---1010AY.1000.00046
ORF626I26delATT---1010AY.140.00088
ORF626I26TaTtaCt1010AY.250.00006
ORF626I26delATT---1010AY.450.001217
ORF626I26IatTatC1010B.1.1600.000312
ORF626I26VAttGtt1010B.1.3290.006075
ORF626I26delATT---99AY.1060.003014
ORF626I26VAttGtt99AY.260.000255
ORF626I26IatTatC69AY.40.000009
ORF626I26IatTatA39AY.40.000005
ORF626I26delATT---99AY.4.2.10.001341
ORF626I26TaTtaCt99AY.430.00004
ORF626I26VAttGtt99B.1.1.390.004587
ORF626I26IatTatC89B.1.1.500.005431
ORF626I26IatTatA19B.1.1.500.000679
ORF626I26del1Att-tt59B.1.1.70.000004
ORF626I26del1atTat-29B.1.1.70.000002
ORF626I26del1aTta-t29B.1.1.70.000002
ORF626I26delATT---99B.1.1770.000119
ORF626I26delATT---99B.1.2400.00194
ORF626I26delATT---88AY.1020.000212
ORF626I26delATT---88AY.46.50.001587
ORF626I26VAttGtt88AY.60.000329
ORF626I26delATT---88B.1.3510.000238
ORF626I26TaTtaCt88B.1.617.20.00003
ORF626I26VAttGtt77AY.110.009371
ORF626I26delATT---77AY.610.000733
ORF626I26delATT---77B.1.10.000127
ORF626I26delATT---77B.1.2340.000924
ORF626I26delATT---77B.1.351.20.002118
ORF626I26delATT---77B.1.36.260.02
ORF626I26delATT---77B.1.6210.00062
ORF626I26delATT---66AY.270.000388
ORF626I26delATT---66AY.3.10.000512
ORF626I26delATT---66AY.98.10.000291
ORF626I26delATT---66B.1.1.2140.000333
ORF626I26delATT---66B.1.1.2220.001224
ORF626I26LAttCtt66B.1.1.70.000005
ORF626I26TaTtaCt66B.1.20.000053
ORF626I26TaTtaCt66B.1.2430.000418
ORF626I26delATT---66B.1.2580.000399
ORF626I26delATT---66B.1.3110.001647
ORF626I26VAttGtt66D.20.00045
ORF626I26VAttGtt55AY.130.000805
ORF626I26delATT---55AY.330.000334
ORF626I26delATT---55AY.340.000485
ORF626I26delATT---55AY.980.000395
ORF626I26delATT---55B.1.1.3180.001509
ORF626I26delATT---55B.1.4270.000252
ORF626I26delATT---55P.1.100.001347
ORF626I26delATT---55R.10.00045
ORF626I26NaTtaAt240.111111
ORF626I26NaTTaAC240.111111
ORF626I26delATT---44A0.001548
ORF626I26delATT---44AU.20.009685
ORF626I26delATT---44AY.1100.000451
ORF626I26TaTtaCt44AY.290.000063
ORF626I26IatTatC44AY.46.60.000289
ORF626I26delATT---44AY.680.001095
ORF626I26VAttGtt44AY.90.00027
ORF626I26delATT---44AY.9.10.000335
ORF626I26VAttGtt44B.10.000037
ORF626I26IatTatC44B.1.10.000073
ORF626I26VAttGtt44B.1.10.000073
ORF626I26delATT---44B.1.1.5190.000159
ORF626I26IatTatC44B.1.3960.002823
ORF626I26delATT---44B.1.5250.000453
ORF626I26VAttGtt44P.10.000063
ORF626I26delATT---44P.1.170.000647
ORF626I26del2ATt--t23All0
ORF626I26del2aTTa--13All0
ORF626I26TaTtaCt33AY.1030.000019
ORF626I26LAttCtt33AY.1160.00086
ORF626I26delATT---33AY.120.000948
ORF626I26delATT---33AY.20.001068
ORF626I26VAttGtt33AY.230.000209
ORF626I26LAttCtt33AY.30.00003
ORF626I26TaTtaCt33AY.330.0002
ORF626I26SaTtaGt33AY.40.000005
ORF626I26delATT---33AY.4.50.000322
ORF626I26IatTatC33AY.440.000018
ORF626I26delATT---33AY.46.60.000217
ORF626I26SaTtaGt33AY.610.000314
ORF626I26delATT---33AY.710.001425
ORF626I26delATT---33AY.90.000203
ORF626I26FAttTtt33B.1.10.000054
ORF626I26delATT---33B.1.1.330.001263
ORF626I26TaTtaCt33B.1.1.5190.000119
ORF626I26VAttGtt33B.1.1770.00004
ORF626I26delATT---33B.1.177.100.002634
ORF626I26VAttGtt33B.1.177.210.000229
ORF626I26SATtTCt33B.1.177.210.000229
ORF626I26IatTatC33B.1.20.000026
ORF626I26delATT---33B.1.214.20.001799
ORF626I26VAttGtt33B.1.36.80.003
ORF626I26delATT---33B.1.617.10.000387
ORF626I26delATT---33B.1.6370.000219
ORF626I26IatTatC33C.370.000348
ORF626I26delATT---33C.370.000348
ORF626I26VAttGtt33P.1.10.000953
ORF626I26VAttGtt33P.20.00056
ORF626I26delATT---33P.30.004785
ORF626I26FAttTtt220.111111
ORF626I26PATTCCA220.111111
ORF626I26PATTCCA22All0
ORF626I26VAttGtt22AY.1020.000053
ORF626I26IatTatC22AY.1020.000053
ORF626I26TaTtaCt22AY.1020.000053
ORF626I26SaTtaGt22AY.1030.000012
ORF626I26del1Att-tt12AY.1030.000006
ORF626I26del1ATt-At12AY.1030.000006
ORF626I26VAttGtt22AY.1190.000071
ORF626I26delATT---22AY.120.20.002571
ORF626I26IatTatC22AY.140.000176
ORF626I26delATT---22AY.230.000139
ORF626I26IatTatC22AY.240.000862
ORF626I26LAttCtt22AY.250.000012
ORF626I26VAttGtt22AY.250.000012
ORF626I26delATT---22AY.280.003781
ORF626I26TaTtaCt22AY.30.00002
ORF626I26TaTtaCt22AY.350.000466
ORF626I26NaTtaAt22AY.40.000003
ORF626I26TaTtaCt22AY.4.20.000043
ORF626I26delATT---22AY.400.001929
ORF626I26IatTatC22AY.430.000009
ORF626I26FAttTtt22AY.430.000009
ORF626I26TaTtaCt22AY.440.000012
ORF626I26del1Att-tt12AY.440.000006
ORF626I26del1atTat-12AY.440.000006
ORF626I26delATT---22AY.46.20.001271
ORF626I26FAttTtt22AY.470.000062
ORF626I26TaTtaCt22AY.50.000041
ORF626I26VAttGtt22AY.50.000041
ORF626I26delATT---22AY.520.001629
ORF626I26delATT---22AY.530.000575
ORF626I26delATT---22AY.700.000417
ORF626I26delATT---22AY.740.000231
ORF626I26delATT---22AY.75.10.000361
ORF626I26IatTatC22AY.99.20.000184
ORF626I26VAttGtt22AY.99.20.000184
ORF626I26delATT---22AY.99.20.000184
ORF626I26delATT---22B0.000256
ORF626I26FAttTtt22B.10.000018
ORF626I26LAttCtt22B.10.000018
ORF626I26del1aTta-t12B.10.000009
ORF626I26del1atTat-12B.10.000009
ORF626I26delATT---22B.1.1.10.000653
ORF626I26VAttGtt22B.1.1.2160.001781
ORF626I26delATT---22B.1.1.2310.006192
ORF626I26VAttGtt22B.1.1.4340.000697
ORF626I26delATT---22B.1.1.4610.024096
ORF626I26MatTatG22B.1.1.70.000002
ORF626I26del1Att-tt22B.1.177.210.000153
ORF626I26TaTtaCt22B.1.177.600.000437
ORF626I26delATT---22B.1.177.70.00033
ORF626I26delATT---22B.1.1950.01005
ORF626I26VAttGtt22B.1.2210.000142
ORF626I26delATT---22B.1.2210.000142
ORF626I26delATT---22B.1.2290.019417
ORF626I26delATT---22B.1.2430.000139
ORF626I26IatTatC22B.1.2580.000133
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