CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF6 : CodonNum = 24

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF624V24deldelGTT---25752575127271-27273
ORF624V24FnonsynGttTtt232223170.99784727271-27273
ORF624V24FnonsynGtTTtC232250.0021533227271-27273
ORF624V24InonsynGttAtt4514470.99113127271-27273
ORF624V24InonsynGtTAtA45130.0066518827271-27273
ORF624V24InonsynGtTAtC45110.0022172927271-27273
ORF624V24VsyngtTgtC1821570.86263727271-27273
ORF624V24VsyngtTgtA182140.076923127271-27273
ORF624V24VsyngtTgtG182110.060439627271-27273
ORF624V24AnonsyngTtgCt9494127271-27273
ORF624V24LnonsynGttCtt2828127271-27273
ORF624V24del1delgTtg-t1260.527271-27273
ORF624V24del1delGtt-tt1250.41666727271-27273
ORF624V24del1delGTT-NN1210.083333327271-27273
ORF624V24del2delgTTg--1060.627271-27273
ORF624V24del2delGTt--t1010.127271-27273
ORF624V24del2delGTT--A1010.127271-27273
ORF624V24del2delGTT--N1010.127271-27273
ORF624V24del2delGTTA--1010.127271-27273
ORF624V24GnonsyngTtgGt99127271-27273
ORF624V24DnonsyngTtgAt88127271-27273
ORF624V24NnonsynGTtAAt760.85714327271-27273
ORF624V24SnonsynGTtAGt760.85714327271-27273
ORF624V24SnonsynGTtTCt710.14285727271-27273
ORF624V24NnonsynGTTAAC710.14285727271-27273
ORF624V24PnonsynGTtCCt33127271-27273
ORF624V24YnonsynGTTTAC11127271-27273
ORF624V24TnonsynGTtACt11127271-27273

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF624V24delGTT---25752575All0.000492
ORF624V24FGttTtt23172322All0.000443
ORF624V24FGtTTtC52322All0.000001
ORF624V24FGttTtt497497AY.430.002202
ORF624V24IGttAtt447451All0.000085
ORF624V24IGtTAtA3451All0.000001
ORF624V24IGtTAtC1451All0
ORF624V24delGTT---426426AY.40.000663
ORF624V24FGttTtt413413AY.40.000643
ORF624V24delGTT---377377B.1.1.70.000337
ORF624V24FGttTtt248248B.1.1770.003266
ORF624V24FGttTtt222224B.1.1.70.000199
ORF624V24FGtTTtC2224B.1.1.70.000002
ORF624V24FGttTtt208208B.1.617.20.000783
ORF624V24IGttAtt194194AY.200.00754
ORF624V24VgtTgtC157182All0.00003
ORF624V24VgtTgtA14182All0.000003
ORF624V24VgtTgtG11182All0.000002
ORF624V24FGttTtt121121AY.1030.000751
ORF624V24delGTT---105105AY.430.000465
ORF624V24delGTT---102102B.1.617.20.000384
ORF624V24delGTT---9999AY.440.000603
ORF624V24VgtTgtC9696B.1.1.70.000086
ORF624V24AgTtgCt9494All0.000018
ORF624V24delGTT---9191AY.250.000547
ORF624V24delGTT---8989AY.4.20.00193
ORF624V24FGttTtt7575B.1.5260.001763
ORF624V24delGTT---6363AY.1030.000391
ORF624V24delGTT---6363B.10.000577
ORF624V24FGttTtt6060AY.440.000365
ORF624V24delGTT---5959AY.470.001835
ORF624V24delGTT---5656AY.30.000557
ORF624V24delGTT---5151AY.1200.001896
ORF624V24delGTT---4949B.1.20.000431
ORF624V24delGTT---4141B.1.6161
ORF624V24delGTT---3737P.10.000583
ORF624V24delGTT---3636AY.390.00089
ORF624V24delGTT---3232N.81
ORF624V24AgTtgCt3131B.1.1.70.000028
ORF624V24IGttAtt2929C.370.003366
ORF624V24LGttCtt2828All0.000005
ORF624V24IGttAtt2626AY.1030.000161
ORF624V24IGttAtt2526B.1.1.70.000022
ORF624V24IGtTAtC126B.1.1.70.000001
ORF624V24delGTT---2626B.1.5260.000611
ORF624V24FGttTtt2525AY.290.000394
ORF624V24IGttAtt2525AY.30.000249
ORF624V24delGTT---2424AY.50.000496
ORF624V24FGttTtt2124B.1.177.210.001606
ORF624V24FGtTTtC324B.1.177.210.000229
ORF624V24delGTT---2323AY.1110.004212
ORF624V24delGTT---2323AY.260.000651
ORF624V24IGttAtt2222AY.40.000034
ORF624V24FGttTtt2222P.10.000347
ORF624V24delGTT---2121AY.840.009186
ORF624V24IGttAtt2020AY.60.000823
ORF624V24delGTT---2020B.1.1080.116279
ORF624V24IGttAtt2020B.1.177.210.001529
ORF624V24FGttTtt1919AY.1180.00119
ORF624V24VgtTgtC1919AY.360.002816
ORF624V24IGttAtt1919AY.440.000116
ORF624V24FGttTtt1818AY.250.000108
ORF624V24FGttTtt1818AY.30.000179
ORF624V24FGttTtt1818B.1.4290.000424
ORF624V24delGTT---1717AY.130.002737
ORF624V24FGttTtt1717AY.390.00042
ORF624V24FGttTtt1717B.10.000156
ORF624V24delGTT---1717B.1.177.210.0013
ORF624V24FGttTtt1717B.1.6210.001505
ORF624V24FGttTtt1717Q.10.002148
ORF624V24FGttTtt1616AY.1020.000424
ORF624V24delGTT---1616AY.1180.001002
ORF624V24delGTT---1616AY.420.000644
ORF624V24delGTT---1515AY.360.002223
ORF624V24delGTT---1515AY.750.00084
ORF624V24delGTT---1414AY.540.001335
ORF624V24FGttTtt1313AY.1000.000598
ORF624V24delGTT---1313AY.850.005553
ORF624V24delGTT---1313AY.900.008898
ORF624V24delGTT---1313B.1.1050.125
ORF624V24delGTT---1313B.1.4290.000306
ORF624V24del1gTtg-t612All0.000001
ORF624V24del1Gtt-tt512All0.000001
ORF624V24del1GTT-NN112All0
ORF624V24VgtTgtC1212AY.40.000019
ORF624V24delGTT---1212B.1.36.360.007225
ORF624V24VgtTgtA611AY.1030.000037
ORF624V24VgtTgtC311AY.1030.000019
ORF624V24VgtTgtG211AY.1030.000012
ORF624V24delGTT---1111AY.1130.001566
ORF624V24delGTT---1111AY.1190.000388
ORF624V24delGTT---1111AY.290.000174
ORF624V24delGTT---1111AY.39.10.000436
ORF624V24delGTT---1111AY.9.20.000404
ORF624V24del2gTTg--610All0.000001
ORF624V24del2GTt--t110All0
ORF624V24del2GTTA--110All0
ORF624V24del2GTT--A110All0
ORF624V24del2GTT--N110All0
ORF624V24delGTT---1010AY.140.00088
ORF624V24FGttTtt1010AY.200.000389
ORF624V24delGTT---1010AY.200.000389
ORF624V24AgTtgCt1010AY.250.00006
ORF624V24delGTT---1010AY.460.001041
ORF624V24GgTtgGt99All0.000002
ORF624V24delGTT---99AY.1000.000414
ORF624V24delGTT---99AY.1060.003014
ORF624V24FGttTtt99AY.230.000628
ORF624V24delGTT---99AY.4.2.10.001341
ORF624V24AgTtgCt99AY.430.00004
ORF624V24AgTtgCt99AY.440.000055
ORF624V24delGTT---99AY.450.001095
ORF624V24FGttTtt99B.1.1.370.001736
ORF624V24AgTtgCt99B.1.617.20.000034
ORF624V24VgtTgtG49B.1.617.20.000015
ORF624V24VgtTgtA49B.1.617.20.000015
ORF624V24VgtTgtC19B.1.617.20.000004
ORF624V24DgTtgAt88All0.000002
ORF624V24FGttTtt88AY.3.10.000682
ORF624V24FGttTtt88AY.460.000833
ORF624V24delGTT---88AY.46.50.001587
ORF624V24FGttTtt88AY.75.10.001442
ORF624V24delGTT---88B.1.1770.000105
ORF624V24delGTT---88B.1.2400.001725
ORF624V24FGttTtt88B.1.617.10.001032
ORF624V24LGttCtt88B.1.617.20.00003
ORF624V24SGTtAGt67All0.000001
ORF624V24NGTtAAt67All0.000001
ORF624V24NGTTAAC17All0
ORF624V24SGTtTCt17All0
ORF624V24delGTT---77AY.1020.000186
ORF624V24FGttTtt77B.1.10.000127
ORF624V24delGTT---77B.1.10.000127
ORF624V24IGttAtt67B.1.10.000109
ORF624V24IGtTAtA17B.1.10.000018
ORF624V24NGTtAAt67B.1.177.210.000459
ORF624V24NGTTAAC17B.1.177.210.000076
ORF624V24delGTT---77B.1.2340.000924
ORF624V24delGTT---77B.1.3510.000208
ORF624V24delGTT---77B.1.351.20.002118
ORF624V24delGTT---77B.1.6210.00062
ORF624V24delGTT---66AY.270.000388
ORF624V24delGTT---66AY.3.10.000512
ORF624V24delGTT---66AY.60.000247
ORF624V24delGTT---66AY.610.000629
ORF624V24FGttTtt66AY.980.000474
ORF624V24delGTT---66AY.98.10.000291
ORF624V24delGTT---66B.1.1.2140.000333
ORF624V24delGTT---66B.1.1.2220.001224
ORF624V24GgTtgGt66B.1.177.210.000459
ORF624V24delGTT---66B.1.2580.000399
ORF624V24AgTtgCt55AY.1020.000133
ORF624V24delGTT---55AY.330.000334
ORF624V24delGTT---55AY.340.000485
ORF624V24FGttTtt55AY.420.000201
ORF624V24delGTT---55AY.980.000395
ORF624V24FGttTtt55AY.98.10.000242
ORF624V24delGTT---55B.1.1.3180.001509
ORF624V24SGTtAGt45B.1.177.210.000306
ORF624V24SGTtTCt15B.1.177.210.000076
ORF624V24delGTT---55B.1.3110.001373
ORF624V24IGttAtt55B.1.36.380.00821
ORF624V24delGTT---55B.1.4270.000252
ORF624V24FGttTtt55B.1.5960.000436
ORF624V24delGTT---55P.1.100.001347
ORF624V24delGTT---55R.10.00045
ORF624V24delGTT---44A0.001548
ORF624V24delGTT---44AU.20.009685
ORF624V24delGTT---44AY.1100.000451
ORF624V24FGttTtt44AY.1190.000141
ORF624V24IGttAtt44AY.250.000024
ORF624V24VgtTgtC34AY.250.000018
ORF624V24VgtTgtA14AY.250.000006
ORF624V24FGttTtt44AY.260.000113
ORF624V24IGttAtt44AY.260.000113
ORF624V24LGttCtt44AY.40.000006
ORF624V24IGttAtt44AY.4.20.000087
ORF624V24VgtTgtC44AY.430.000018
ORF624V24IGttAtt44AY.50.000083
ORF624V24delGTT---44AY.680.001095
ORF624V24delGTT---44AY.9.10.000335
ORF624V24FGttTtt44B.1.1.330.001684
ORF624V24delGTT---44B.1.1.5190.000159
ORF624V24del1Gtt-tt34B.1.177.210.000229
ORF624V24del1GTT-NN14B.1.177.210.000076
ORF624V24FGttTtt44B.1.177.40.000844
ORF624V24FGttTtt44B.1.20.000035
ORF624V24FGttTtt44B.1.351.30.003506
ORF624V24delGTT---44B.1.5250.000453
ORF624V24IGttAtt44B.1.617.20.000015
ORF624V24FGttTtt44P.1.140.000191
ORF624V24delGTT---44P.1.170.000647
ORF624V24FGttTtt44P.20.000747
ORF624V24IGttAtt44P.20.000747
ORF624V24IGttAtt44Q.20.002454
ORF624V24PGTtCCt33All0.000001
ORF624V24delGTT---33AY.120.000948
ORF624V24delGTT---33AY.20.001068
ORF624V24FGttTtt33AY.270.000194
ORF624V24delGTT---33AY.4.50.000322
ORF624V24LGttCtt33AY.430.000013
ORF624V24delGTT---33AY.46.60.000217
ORF624V24FGttTtt33AY.50.000062
ORF624V24FGttTtt33AY.530.000863
ORF624V24FGttTtt33AY.540.000286
ORF624V24delGTT---33AY.710.001425
ORF624V24FGttTtt33AY.750.000168
ORF624V24FGttTtt33AY.90.000203
ORF624V24delGTT---33AY.90.000203
ORF624V24FGttTtt33AY.9.20.00011
ORF624V24FGttTtt33AY.930.000819
ORF624V24IGttAtt33B.10.000027
ORF624V24delGTT---33B.1.1.330.001263
ORF624V24delGTT---33B.1.177.100.002634
ORF624V24DgTtgAt33B.1.177.210.000229
ORF624V24del2GTT--A13B.1.177.210.000076
ORF624V24del2GTTA--13B.1.177.210.000076
ORF624V24del2GTt--t13B.1.177.210.000076
ORF624V24delGTT---33B.1.214.20.001799
ORF624V24delGTT---33B.1.5960.000261
ORF624V24delGTT---33B.1.617.10.000387
ORF624V24delGTT---33B.1.6370.000219
ORF624V24delGTT---33C.370.000348
ORF624V24delGTT---33P.30.004785
ORF624V24VgtTgtA220.111111
ORF624V24IGtTAtA220.111111
ORF624V24AgTtgCt220.111111
ORF624V24LGttCtt220.111111
ORF624V24IGttAtt22AY.120.10.000642
ORF624V24delGTT---22AY.120.20.002571
ORF624V24del2gTTg--22AY.200.000078
ORF624V24VgtTgtC12AY.200.000039
ORF624V24VgtTgtG12AY.200.000039
ORF624V24delGTT---22AY.230.000139
ORF624V24delGTT---22AY.280.003781
ORF624V24FGttTtt22AY.330.000134
ORF624V24FGttTtt22AY.360.000296
ORF624V24AgTtgCt22AY.40.000003
ORF624V24del1Gtt-tt22AY.40.000003
ORF624V24FGttTtt22AY.4.20.000043
ORF624V24delGTT---22AY.400.001929
ORF624V24AgTtgCt22AY.420.00008
ORF624V24IGttAtt22AY.430.000009
ORF624V24FGttTtt22AY.450.000243
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ORF624V24FGttTtt22AY.46.20.001271
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