CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = Y189C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a189Y189CnonsyntAttGt173217300.99884525957-25959
ORF3a189Y189CnonsyntATtGC173220.0011547325957-25959

Details of the mutation Y189C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a189Y189CtAttGt17301732All0.000331
ORF3a189Y189CtATtGC21732All0
ORF3a189Y189CtAttGt399399B.1.1.70.000357
ORF3a189Y189CtAttGt304304AY.40.000473
ORF3a189Y189CtAttGt250250AY.200.009716
ORF3a189Y189CtAttGt7575B.1.1.3510.209497
ORF3a189Y189CtAttGt7272AY.290.001136
ORF3a189Y189CtAttGt6060B.1.617.20.000226
ORF3a189Y189CtAttGt5252B.1.1.170.866667
ORF3a189Y189CtAttGt3838B.1.1770.0005
ORF3a189Y189CtAttGt3636AY.1030.000224
ORF3a189Y189CtAttGt3333B.1.177.600.007208
ORF3a189Y189CtAttGt2828AY.30.000278
ORF3a189Y189CtAttGt2222AY.250.000132
ORF3a189Y189CtAttGt2222B.1.2580.001464
ORF3a189Y189CtAttGt2121AY.440.000128
ORF3a189Y189CtAttGt1818B.1.1600.000561
ORF3a189Y189CtAttGt1515AY.430.000066
ORF3a189Y189CtAttGt1414AY.3.10.001194
ORF3a189Y189CtAttGt1313AY.390.000321
ORF3a189Y189CtAttGt1111B.1.10.0002
ORF3a189Y189CtAttGt1010AY.1000.00046
ORF3a189Y189CtAttGt1010B.1.1.3060.004384
ORF3a189Y189CtAttGt1010B.1.258.110.003964
ORF3a189Y189CtAttGt99AY.1140.00208
ORF3a189Y189CtAttGt99AY.260.000255
ORF3a189Y189CtAttGt99B.1.6300.04712
ORF3a189Y189CtAttGt88AY.330.000534
ORF3a189Y189CtAttGt88B.1.4000.003432
ORF3a189Y189CtAttGt88P.10.000126
ORF3a189Y189CtAttGt77AY.230.000488
ORF3a189Y189CtAttGt460.222222
ORF3a189Y189CtATtGC260.111111
ORF3a189Y189CtAttGt66AY.420.000241
ORF3a189Y189CtAttGt66AY.90.000406
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.1470.004535
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.20.000053
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.5960.000523
ORF3a189Y189CtAttGt55AY.470.000156
ORF3a189Y189CtAttGt55B.1.1390.003666
ORF3a189Y189CtAttGt55B.1.617.10.000645
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.270.000259
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.7.10.000451
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.99.20.000369
ORF3a189Y189CtAttGt44B.1.1.5190.000159
ORF3a189Y189CtAttGt44B.1.5260.000094
ORF3a189Y189CtAttGt44Q.80.00066
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.1020.00008
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.1190.000106
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.370.000948
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.4.20.000065
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.60.000123
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.770.003382
ORF3a189Y189CtAttGt33B.1.5750.00091
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.1060.00067
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.29.10.000441
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.50.000041
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.5.10.007519
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.610.00021
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.258.170.000208
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.466.20.000782
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.5090.001732
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.5880.00182
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.6210.000177
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.6340.006849
ORF3a189Y189CtAttGt22B.6.60.001778
ORF3a189Y189CtAttGt22C.370.000232
ORF3a189Y189CtAttGt22P.1.140.000096
ORF3a189Y189CtAttGt22P.1.20.002312
ORF3a189Y189CtAttGt22P.20.000373
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.1160.000287
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.1210.000135
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.130.000161
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.140.000088
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.4.2.10.000149
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.450.000122
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.46.40.000165
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.510.000909
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.680.000274
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.9.10.000084
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.900.000684
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.930.000273
ORF3a189Y189CtAttGt11B0.000128
ORF3a189Y189CtAttGt11B.10.000009
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.1980.001468
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.2840.000107
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.330.000421
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.370.000193
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.4800.025
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.130.002375
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.177.240.001295
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.177.530.002392
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.214.20.0006
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.351.20.000303
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.36.170.000494
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.4290.000024
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.4970.000315
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.5170.000427
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.6090.000479
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.619.10.000641
ORF3a189Y189CtAttGt11D.20.000075
ORF3a189Y189CtAttGt11P.1.70.000319
ORF3a189Y189CtAttGt11Q.10.000126