CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = V29del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a29V29deldelGTT---15611561125477-25479

Details of the mutation V29del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a29V29delGTT---15611561All0.000299
ORF3a29V29delGTT---829829AY.40.00129
ORF3a29V29delGTT---213213AY.490.680511
ORF3a29V29delGTT---6666AY.39.10.002614
ORF3a29V29delGTT---5757B.1.1.70.000051
ORF3a29V29delGTT---3232AY.1030.000199
ORF3a29V29delGTT---3131AY.30.000308
ORF3a29V29delGTT---3030P.10.000473
ORF3a29V29delGTT---2727AY.1190.000953
ORF3a29V29delGTT---2626AY.250.000156
ORF3a29V29delGTT---2323AY.440.00014
ORF3a29V29delGTT---2323B.1.10.000417
ORF3a29V29delGTT---1717AY.46.20.010801
ORF3a29V29delGTT---1414AY.4.20.000304
ORF3a29V29delGTT---1313AY.1140.003004
ORF3a29V29delGTT---1313AY.99.20.001198
ORF3a29V29delGTT---1313B.1.617.20.000049
ORF3a29V29delGTT---1010AY.290.000158
ORF3a29V29delGTT---1010AY.3.10.000853
ORF3a29V29delGTT---99AY.430.00004
ORF3a29V29delGTT---77AZ.20.005747
ORF3a29V29delGTT---66AY.4.50.000645
ORF3a29V29delGTT---66B.1.1770.000079
ORF3a29V29delGTT---55AY.320.002662
ORF3a29V29delGTT---55AY.450.000608
ORF3a29V29delGTT---44B.1.2580.000266
ORF3a29V29delGTT---33AY.420.000121
ORF3a29V29delGTT---33AY.9.20.00011
ORF3a29V29delGTT---33B.1.160.240.013274
ORF3a29V29delGTT---33B.1.214.10.06
ORF3a29V29delGTT---33B.1.2180.015464
ORF3a29V29delGTT---33U.30.011583
ORF3a29V29delGTT---22AY.130.000322
ORF3a29V29delGTT---22AY.220.004184
ORF3a29V29delGTT---22AY.230.000139
ORF3a29V29delGTT---22AY.260.000057
ORF3a29V29delGTT---22AY.540.000191
ORF3a29V29delGTT---22AY.70.000392
ORF3a29V29delGTT---22AY.810.003984
ORF3a29V29delGTT---22B.1.160.330.00885
ORF3a29V29delGTT---22B.1.6090.000959
ORF3a29V29delGTT---11AY.1110.000183
ORF3a29V29delGTT---11AY.120.000316
ORF3a29V29delGTT---11AY.1200.000037
ORF3a29V29delGTT---11AY.190.00114
ORF3a29V29delGTT---11AY.200.000039
ORF3a29V29delGTT---11AY.29.10.000221
ORF3a29V29delGTT---11AY.330.000067
ORF3a29V29delGTT---11AY.4.2.10.000149
ORF3a29V29delGTT---11AY.46.40.000165
ORF3a29V29delGTT---11AY.50.000021
ORF3a29V29delGTT---11AY.570.000656
ORF3a29V29delGTT---11AY.590.00053
ORF3a29V29delGTT---11AY.60.000041
ORF3a29V29delGTT---11AY.650.000533
ORF3a29V29delGTT---11AY.680.000274
ORF3a29V29delGTT---11AY.750.000056
ORF3a29V29delGTT---11AY.75.10.00018
ORF3a29V29delGTT---11B.10.000009
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1.1390.022727
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1.1890.001513
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1.3110.000358
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1.4090.002833
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1.700.000341
ORF3a29V29delGTT---11B.1.1600.000031
ORF3a29V29delGTT---11B.1.177.210.000076
ORF3a29V29delGTT---11B.1.177.60.000977
ORF3a29V29delGTT---11B.1.214.20.0006
ORF3a29V29delGTT---11B.1.2340.000132
ORF3a29V29delGTT---11B.1.2430.00007
ORF3a29V29delGTT---11B.1.36.180.00042
ORF3a29V29delGTT---11B.1.3890.001002
ORF3a29V29delGTT---11B.1.4270.00005
ORF3a29V29delGTT---11B.1.6380.052632
ORF3a29V29delGTT---11C.160.00106
ORF3a29V29delGTT---11D.20.000075
ORF3a29V29delGTT---11P.1.150.000232