CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = V259del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a259V259deldelGTA---21562156126167-26169

Details of the mutation V259del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a259V259delGTA---21562156All0.000412
ORF3a259V259delGTA---411411B.1.1.70.000368
ORF3a259V259delGTA---158158B.1.617.20.000595
ORF3a259V259delGTA---137137AY.40.000213
ORF3a259V259delGTA---136136AY.1030.000844
ORF3a259V259delGTA---126126AY.430.000558
ORF3a259V259delGTA---123123AY.260.003482
ORF3a259V259delGTA---100100B.10.000916
ORF3a259V259delGTA---7373AY.4.20.001583
ORF3a259V259delGTA---7070AY.440.000426
ORF3a259V259delGTA---6767AY.250.000403
ORF3a259V259delGTA---5555B.1.5170.023484
ORF3a259V259delGTA---4040AY.30.000398
ORF3a259V259delGTA---3535B.1.20.000308
ORF3a259V259delGTA---3131AY.470.000964
ORF3a259V259delGTA---3030B.1.1770.000395
ORF3a259V259delGTA---2828B.1.6210.002479
ORF3a259V259delGTA---2727AY.130.004346
ORF3a259V259delGTA---2121AY.390.000519
ORF3a259V259delGTA---2020AY.510.018182
ORF3a259V259delGTA---2020B.1.1.5190.000794
ORF3a259V259delGTA---1717AY.710.008076
ORF3a259V259delGTA---1616B.1.1600.000499
ORF3a259V259delGTA---1414AY.50.000289
ORF3a259V259delGTA---1313AY.1020.000345
ORF3a259V259delGTA---1313B.1.177.210.000994
ORF3a259V259delGTA---1212AY.750.000672
ORF3a259V259delGTA---1212AY.910.008766
ORF3a259V259delGTA---1212P.10.000189
ORF3a259V259delGTA---1111B.1.6370.000804
ORF3a259V259delGTA---1010AY.290.000158
ORF3a259V259delGTA---1010B.1.3510.000297
ORF3a259V259delGTA---99B.1.3110.002471
ORF3a259V259delGTA---99B.1.4290.000212
ORF3a259V259delGTA---99B.1.5260.000212
ORF3a259V259delGTA---88AY.1180.000501
ORF3a259V259delGTA---88B.1.1.2820.093023
ORF3a259V259delGTA---77AY.98.10.000339
ORF3a259V259delGTA---77B.1.177.110.011885
ORF3a259V259delGTA---66A.270.009934
ORF3a259V259delGTA---66AY.3.10.000512
ORF3a259V259delGTA---66AY.70.001176
ORF3a259V259delGTA---66AY.90.000406
ORF3a259V259delGTA---66B.1.5250.000679
ORF3a259V259delGTA---66B.1.5960.000523
ORF3a259V259delGTA---55AY.200.000194
ORF3a259V259delGTA---55B.1.3890.00501
ORF3a259V259delGTA---55B.1.4270.000252
ORF3a259V259delGTA---440.222222
ORF3a259V259delGTA---44AY.1170.000338
ORF3a259V259delGTA---44AY.1190.000141
ORF3a259V259delGTA---44AY.120.10.001284
ORF3a259V259delGTA---44AY.450.000487
ORF3a259V259delGTA---44B.1.2340.000528
ORF3a259V259delGTA---44B.1.2430.000278
ORF3a259V259delGTA---44P.1.160.001496
ORF3a259V259delGTA---44R.10.00036
ORF3a259V259delGTA---33AY.10.001187
ORF3a259V259delGTA---33AY.1070.001398
ORF3a259V259delGTA---33AY.1160.00086
ORF3a259V259delGTA---33AY.120.000948
ORF3a259V259delGTA---33AY.1200.000112
ORF3a259V259delGTA---33AY.1210.000406
ORF3a259V259delGTA---33AY.530.000863
ORF3a259V259delGTA---33AY.60.000123
ORF3a259V259delGTA---33AY.880.002653
ORF3a259V259delGTA---33B.1.10.000054
ORF3a259V259delGTA---33B.1.1.1890.004539
ORF3a259V259delGTA---33B.1.177.40.000633
ORF3a259V259delGTA---33B.1.2580.0002
ORF3a259V259delGTA---33B.1.258.110.001189
ORF3a259V259delGTA---33B.1.621.10.001517
ORF3a259V259delGTA---33C.260.022059
ORF3a259V259delGTA---33C.370.000348
ORF3a259V259delGTA---33Q.80.000495
ORF3a259V259delGTA---22AY.1000.000092
ORF3a259V259delGTA---22AY.140.000176
ORF3a259V259delGTA---22AY.350.000466
ORF3a259V259delGTA---22AY.360.000296
ORF3a259V259delGTA---22AY.39.10.000079
ORF3a259V259delGTA---22AY.610.00021
ORF3a259V259delGTA---22AY.75.10.000361
ORF3a259V259delGTA---22AY.990.002099
ORF3a259V259delGTA---22B.1.1.10.000653
ORF3a259V259delGTA---22B.1.1.2160.001781
ORF3a259V259delGTA---22B.1.1.280.000622
ORF3a259V259delGTA---22B.1.1.3170.000823
ORF3a259V259delGTA---22B.1.1.4340.000697
ORF3a259V259delGTA---22B.1.177.620.002384
ORF3a259V259delGTA---22B.1.177.70.00033
ORF3a259V259delGTA---22B.1.36.10.002281
ORF3a259V259delGTA---22P.1.100.000539
ORF3a259V259delGTA---22P.20.000373
ORF3a259V259delGTA---22Q.10.000253
ORF3a259V259delGTA---11AU.10.001266
ORF3a259V259delGTA---11AV.10.005051
ORF3a259V259delGTA---11AY.1010.00049
ORF3a259V259delGTA---11AY.1090.00074
ORF3a259V259delGTA---11AY.1110.000183
ORF3a259V259delGTA---11AY.120.2.10.000498
ORF3a259V259delGTA---11AY.160.00038
ORF3a259V259delGTA---11AY.20.000356
ORF3a259V259delGTA---11AY.210.001898
ORF3a259V259delGTA---11AY.240.000431
ORF3a259V259delGTA---11AY.29.10.000221
ORF3a259V259delGTA---11AY.300.000396
ORF3a259V259delGTA---11AY.320.000532
ORF3a259V259delGTA---11AY.380.000499
ORF3a259V259delGTA---11AY.4.2.10.000149
ORF3a259V259delGTA---11AY.4.50.000107
ORF3a259V259delGTA---11AY.420.00004
ORF3a259V259delGTA---11AY.46.40.000165
ORF3a259V259delGTA---11AY.5.30.000337
ORF3a259V259delGTA---11AY.590.00053
ORF3a259V259delGTA---11AY.650.000533
ORF3a259V259delGTA---11AY.670.000464
ORF3a259V259delGTA---11AY.680.000274
ORF3a259V259delGTA---11AY.740.000116
ORF3a259V259delGTA---11AY.80.000606
ORF3a259V259delGTA---11AY.9.10.000084
ORF3a259V259delGTA---11AY.9.20.000037
ORF3a259V259delGTA---11AY.920.000287
ORF3a259V259delGTA---11AZ.20.000821
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.2220.000204
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.250.000569
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.2850.006536
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.330.000421
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.3720.000689
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.40.002976
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.4200.001006
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.4320.001266
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1.440.00241
ORF3a259V259delGTA---11B.1.110.30.000718
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1280.000635
ORF3a259V259delGTA---11B.1.1490.003425
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.150.000631
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.160.000664
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.240.001295
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.50.001242
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.600.000218
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.810.000189
ORF3a259V259delGTA---11B.1.177.870.000728
ORF3a259V259delGTA---11B.1.2210.000071
ORF3a259V259delGTA---11B.1.2370.004975
ORF3a259V259delGTA---11B.1.2650.001271
ORF3a259V259delGTA---11B.1.2790.000514
ORF3a259V259delGTA---11B.1.2980.002114
ORF3a259V259delGTA---11B.1.3200.001245
ORF3a259V259delGTA---11B.1.3360.002439
ORF3a259V259delGTA---11B.1.360.000146
ORF3a259V259delGTA---11B.1.36.290.000517
ORF3a259V259delGTA---11B.1.3800.006623
ORF3a259V259delGTA---11B.1.4090.000781
ORF3a259V259delGTA---11B.1.4590.004082
ORF3a259V259delGTA---11B.1.4730.019231
ORF3a259V259delGTA---11B.1.4970.000315
ORF3a259V259delGTA---11B.1.5210.004975
ORF3a259V259delGTA---11B.1.5510.00129
ORF3a259V259delGTA---11B.1.617.10.000129
ORF3a259V259delGTA---11B.1.6280.000352
ORF3a259V259delGTA---11C.36.30.000567
ORF3a259V259delGTA---11C.36.3.10.002717
ORF3a259V259delGTA---11D.20.000075
ORF3a259V259delGTA---11P.1.140.000048
ORF3a259V259delGTA---11P.60.003145
ORF3a259V259delGTA---11Q.20.000613