CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = V256del1

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a256V256del1delgtTgt-146112610.86310726158-26160
ORF3a256V256del1delGtt-tt14611200.082135526158-26160
ORF3a256V256del1delGTT-NN1461400.027378526158-26160
ORF3a256V256del1delGtT-tN1461180.012320326158-26160
ORF3a256V256del1delgTtg-t1461150.010266926158-26160
ORF3a256V256del1delgTTg-N146130.0020533926158-26160
ORF3a256V256del1delGtTNt-146120.0013689326158-26160
ORF3a256V256del1delGTt-Nt146110.00068446326158-26160
ORF3a256V256del1delGtTTt-146110.00068446326158-26160

Details of the mutation V256del1 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a256V256del1gtTgt-12611461All0.000241
ORF3a256V256del1Gtt-tt1201461All0.000023
ORF3a256V256del1GTT-NN401461All0.000008
ORF3a256V256del1GtT-tN181461All0.000003
ORF3a256V256del1gTtg-t151461All0.000003
ORF3a256V256del1gTTg-N31461All0.000001
ORF3a256V256del1GtTNt-21461All0
ORF3a256V256del1GtTTt-11461All0
ORF3a256V256del1GTt-Nt11461All0
ORF3a256V256del1gtTgt-512512A.270.847682
ORF3a256V256del1gtTgt-200218AY.40.000311
ORF3a256V256del1gTtg-t13218AY.40.00002
ORF3a256V256del1Gtt-tt4218AY.40.000006
ORF3a256V256del1gTTg-N1218AY.40.000002
ORF3a256V256del1gtTgt-120141B.1.1.70.000107
ORF3a256V256del1Gtt-tt20141B.1.1.70.000018
ORF3a256V256del1GtT-tN1141B.1.1.70.000001
ORF3a256V256del1GTT-NN2547B.1.6210.002213
ORF3a256V256del1Gtt-tt1147B.1.6210.000974
ORF3a256V256del1GtT-tN1047B.1.6210.000885
ORF3a256V256del1gtTgt-147B.1.6210.000089
ORF3a256V256del1gtTgt-3444B.1.617.20.000128
ORF3a256V256del1Gtt-tt1044B.1.617.20.000038
ORF3a256V256del1gtTgt-3738AY.4.20.000802
ORF3a256V256del1Gtt-tt138AY.4.20.000022
ORF3a256V256del1Gtt-tt1934AY.440.000116
ORF3a256V256del1gtTgt-1434AY.440.000085
ORF3a256V256del1GtT-tN134AY.440.000006
ORF3a256V256del1gtTgt-3133B.1.20.000273
ORF3a256V256del1Gtt-tt233B.1.20.000018
ORF3a256V256del1gtTgt-2930AY.750.001625
ORF3a256V256del1Gtt-tt130AY.750.000056
ORF3a256V256del1gtTgt-2324AY.1030.000143
ORF3a256V256del1gTtg-t124AY.1030.000006
ORF3a256V256del1gtTgt-2021AY.250.00012
ORF3a256V256del1GtTTt-121AY.250.000006
ORF3a256V256del1gtTgt-2121AY.30.000209
ORF3a256V256del1gtTgt-2021AY.430.000089
ORF3a256V256del1Gtt-tt121AY.430.000004
ORF3a256V256del1gtTgt-1519AY.39.10.000594
ORF3a256V256del1Gtt-tt419AY.39.10.000158
ORF3a256V256del1Gtt-tt1014B.1.1770.000132
ORF3a256V256del1gtTgt-414B.1.1770.000053
ORF3a256V256del1Gtt-tt714B.1.2210.000497
ORF3a256V256del1gtTgt-714B.1.2210.000497
ORF3a256V256del1gtTgt-1313AY.290.000205
ORF3a256V256del1gtTgt-812B.10.000073
ORF3a256V256del1GTT-NN412B.10.000037
ORF3a256V256del1gtTgt-510AY.46.40.000823
ORF3a256V256del1Gtt-tt510AY.46.40.000823
ORF3a256V256del1GTT-NN510B.1.6280.001762
ORF3a256V256del1Gtt-tt210B.1.6280.000705
ORF3a256V256del1GtT-tN210B.1.6280.000705
ORF3a256V256del1GtTNt-110B.1.6280.000352
ORF3a256V256del1gtTgt-99A0.003483
ORF3a256V256del1gtTgt-79AY.50.000145
ORF3a256V256del1gTTg-N29AY.50.000041
ORF3a256V256del1gtTgt-79B.1.4290.000165
ORF3a256V256del1Gtt-tt29B.1.4290.000047
ORF3a256V256del1Gtt-tt68B.1.10.000109
ORF3a256V256del1gtTgt-18B.1.10.000018
ORF3a256V256del1GTT-NN18B.1.10.000018
ORF3a256V256del1gtTgt-88B.1.177.210.000612
ORF3a256V256del1gtTgt-66AY.1130.000854
ORF3a256V256del1gtTgt-66AY.420.000241
ORF3a256V256del1gtTgt-56AY.99.20.000461
ORF3a256V256del1Gtt-tt16AY.99.20.000092
ORF3a256V256del1gtTgt-66B0.000767
ORF3a256V256del1gtTgt-66B.1.1.3720.004132
ORF3a256V256del1gtTgt-56B.1.5260.000118
ORF3a256V256del1GtT-tN16B.1.5260.000024
ORF3a256V256del1gtTgt-36P.10.000047
ORF3a256V256del1Gtt-tt36P.10.000047
ORF3a256V256del1gtTgt-35AY.390.000074
ORF3a256V256del1Gtt-tt25AY.390.000049
ORF3a256V256del1gtTgt-55AY.980.000395
ORF3a256V256del1gtTgt-55P.20.000933
ORF3a256V256del1GTT-NN34AY.140.000264
ORF3a256V256del1GtT-tN14AY.140.000088
ORF3a256V256del1gtTgt-44AY.90.00027
ORF3a256V256del1gtTgt-33A.290.015957
ORF3a256V256del1gtTgt-33AY.1020.00008
ORF3a256V256del1gtTgt-33AY.1180.000188
ORF3a256V256del1GTT-NN23B.1.243.20.028986
ORF3a256V256del1GTt-Nt13B.1.243.20.014493
ORF3a256V256del1gtTgt-23B.1.6370.000146
ORF3a256V256del1GtTNt-13B.1.6370.000073
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.1000.000092
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.3.10.000171
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.470.000062
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.5.30.000675
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.60.000082
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.9.20.000073
ORF3a256V256del1gtTgt-22AY.970.003401
ORF3a256V256del1Gtt-tt22B.1.1.2200.003717
ORF3a256V256del1gtTgt-22B.1.1.2300.018349
ORF3a256V256del1gtTgt-22B.1.1600.000062
ORF3a256V256del1gtTgt-22B.1.160.160.001859
ORF3a256V256del1gtTgt-11A.10.000282
ORF3a256V256del1gtTgt-11A.20.000662
ORF3a256V256del1gtTgt-11A.210.00277
ORF3a256V256del1Gtt-tt11AY.100.00053
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.1190.000035
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.130.000161
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.200.000039
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.340.000097
ORF3a256V256del1Gtt-tt11AY.450.000122
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.530.000288
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.540.000095
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.610.000105
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.70.000196
ORF3a256V256del1gtTgt-11AY.870.000833
ORF3a256V256del1Gtt-tt11AY.98.10.000048
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.1.10.000327
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.1.2140.000055
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.1.3510.002793
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.1.5190.00004
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.1.630.000386
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.160.330.004425
ORF3a256V256del1Gtt-tt11B.1.177.540.000606
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.177.70.000165
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.177.860.000183
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.221.40.004167
ORF3a256V256del1gTtg-t11B.1.2580.000067
ORF3a256V256del1GtT-tN11B.1.3510.00003
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.3890.001002
ORF3a256V256del1Gtt-tt11B.1.4270.00005
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.466.20.000391
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.4700.001404
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.5210.004975
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.5610.000397
ORF3a256V256del1Gtt-tt11B.1.5640.000426
ORF3a256V256del1gtTgt-11B.1.5770.000687
ORF3a256V256del1Gtt-tt11B.1.6270.00202
ORF3a256V256del1GtT-tN11B.1.6310.003367
ORF3a256V256del1gtTgt-11Q.30.000145
ORF3a256V256del1gtTgt-11Q.80.000165
ORF3a256V256del1gtTgt-11R.10.00009