CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = T89del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a89T89deldelACA---174174125657-25659

Details of the mutation T89del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a89T89delACA---174174All0.000033
ORF3a89T89delACA---3535B.1.1.70.000031
ORF3a89T89delACA---2121AY.40.000033
ORF3a89T89delACA---99B.1.1770.000119
ORF3a89T89delACA---88B.1.617.20.00003
ORF3a89T89delACA---66AY.430.000027
ORF3a89T89delACA---66AY.440.000037
ORF3a89T89delACA---66B.1.5250.000679
ORF3a89T89delACA---44AY.1020.000106
ORF3a89T89delACA---44AY.230.000279
ORF3a89T89delACA---44AY.290.000063
ORF3a89T89delACA---44B.10.000037
ORF3a89T89delACA---33AY.250.000018
ORF3a89T89delACA---22A0.000774
ORF3a89T89delACA---22AY.1000.000092
ORF3a89T89delACA---22AY.1030.000012
ORF3a89T89delACA---22AY.1170.000169
ORF3a89T89delACA---22AY.4.50.000215
ORF3a89T89delACA---22AY.460.000208
ORF3a89T89delACA---22AY.750.000112
ORF3a89T89delACA---22B.1.10.000036
ORF3a89T89delACA---22B.1.1600.000062
ORF3a89T89delACA---22B.1.177.600.000437
ORF3a89T89delACA---22B.1.5960.000174
ORF3a89T89delACA---22P.1.150.000465
ORF3a89T89delACA---22U.30.007722
ORF3a89T89delACA---11AH.30.003802
ORF3a89T89delACA---11AV.10.005051
ORF3a89T89delACA---11AY.1110.000183
ORF3a89T89delACA---11AY.1130.000142
ORF3a89T89delACA---11AY.1180.000063
ORF3a89T89delACA---11AY.1200.000037
ORF3a89T89delACA---11AY.3.10.000085
ORF3a89T89delACA---11AY.350.000233
ORF3a89T89delACA---11AY.360.000148
ORF3a89T89delACA---11AY.370.000316
ORF3a89T89delACA---11AY.390.000025
ORF3a89T89delACA---11AY.4.20.000022
ORF3a89T89delACA---11AY.46.20.000635
ORF3a89T89delACA---11AY.46.40.000165
ORF3a89T89delACA---11AY.470.000031
ORF3a89T89delACA---11AY.540.000095
ORF3a89T89delACA---11AY.580.000907
ORF3a89T89delACA---11AY.60.000041
ORF3a89T89delACA---11AY.620.000436
ORF3a89T89delACA---11AY.740.000116
ORF3a89T89delACA---11AY.9.20.000037
ORF3a89T89delACA---11B0.000128
ORF3a89T89delACA---11B.1.1.4090.002833
ORF3a89T89delACA---11B.1.1.4200.001006
ORF3a89T89delACA---11B.1.1.4340.000349
ORF3a89T89delACA---11B.1.1.700.000341
ORF3a89T89delACA---11B.1.1400.018868
ORF3a89T89delACA---11B.1.177.620.001192
ORF3a89T89delACA---11B.1.20.000009
ORF3a89T89delACA---11B.1.2340.000132
ORF3a89T89delACA---11B.1.2580.000067
ORF3a89T89delACA---11B.1.351.20.000303
ORF3a89T89delACA---11B.1.3620.001541
ORF3a89T89delACA---11B.1.617.10.000129
ORF3a89T89delACA---11B.1.6270.00202
ORF3a89T89delACA---11B.1.6310.003367
ORF3a89T89delACA---11B.1.6380.052632
ORF3a89T89delACA---11Q.40.000455