CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = S74F

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a74S74FnonsyntCctTc12891127370.98805425612-25614
ORF3a74S74FnonsyntCCtTT128911540.011946325612-25614

Details of the mutation S74F within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a74S74FtCctTc1273712891All0.002436
ORF3a74S74FtCCtTT15412891All0.000029
ORF3a74S74FtCctTc19651967A.2.50.980539
ORF3a74S74FtCCtTT21967A.2.50.000998
ORF3a74S74FtCctTc17251733AY.40.002685
ORF3a74S74FtCCtTT81733AY.40.000012
ORF3a74S74FtCctTc12661273B.1.1.70.001133
ORF3a74S74FtCCtTT71273B.1.1.70.000006
ORF3a74S74FtCctTc688689P.1.120.333011
ORF3a74S74FtCCtTT1689P.1.120.000484
ORF3a74S74FtCctTc636651B.1.1.4320.805063
ORF3a74S74FtCCtTT15651B.1.1.4320.018987
ORF3a74S74FtCctTc625625A.2.5.20.982704
ORF3a74S74FtCctTc402402B.1.438.10.043119
ORF3a74S74FtCctTc352352AY.440.002143
ORF3a74S74FtCctTc284285B.1.617.20.001069
ORF3a74S74FtCCtTT1285B.1.617.20.000004
ORF3a74S74FtCctTc269269B.1.20.002369
ORF3a74S74FtCctTc231231B.1.214.20.138489
ORF3a74S74FtCctTc230230AY.1030.001428
ORF3a74S74FtCctTc216216AY.330.014424
ORF3a74S74FtCctTc210210AY.250.001263
ORF3a74S74FtCctTc208208A.2.5.11
ORF3a74S74FtCctTc169169AY.30.001681
ORF3a74S74FtCctTc168168AY.9.20.006171
ORF3a74S74FtCctTc164164B.1.177.210.012541
ORF3a74S74FtCctTc156156AY.23.10.065109
ORF3a74S74FtCctTc148148B.10.001356
ORF3a74S74FtCctTc144144AY.230.010044
ORF3a74S74FtCctTc138138AY.430.000611
ORF3a74S74FtCctTc136136B.1.4290.0032
ORF3a74S74FtCctTc123123P.10.001938
ORF3a74S74FtCctTc118118AY.590.0625
ORF3a74S74FtCCtTT112114AY.4.20.002429
ORF3a74S74FtCctTc2114AY.4.20.000043
ORF3a74S74FtCctTc9999AY.98.10.004795
ORF3a74S74FtCctTc9494A.2.5.30.969072
ORF3a74S74FtCctTc8383AY.390.002051
ORF3a74S74FtCctTc7880B.1.1770.001027
ORF3a74S74FtCCtTT280B.1.1770.000026
ORF3a74S74FtCctTc6162B.1.10.001107
ORF3a74S74FtCCtTT162B.1.10.000018
ORF3a74S74FtCctTc5454B.1.3510.001605
ORF3a74S74FtCctTc4747AY.1020.001246
ORF3a74S74FtCctTc4444AY.1190.001554
ORF3a74S74FtCctTc4242AY.46.60.003033
ORF3a74S74FtCctTc4040P.1.150.009294
ORF3a74S74FtCctTc3939B.1.1600.001216
ORF3a74S74FtCctTc3838B.1.2340.005014
ORF3a74S74FtCctTc3838B.1.5250.0043
ORF3a74S74FtCctTc3737C.191
ORF3a74S74FtCctTc3333AY.260.000934
ORF3a74S74FtCctTc2727AY.1200.001004
ORF3a74S74FtCctTc2626B.1.177.810.004922
ORF3a74S74FtCctTc2626C.370.003018
ORF3a74S74FtCctTc2525AY.1000.00115
ORF3a74S74FtCctTc2323AY.290.000363
ORF3a74S74FtCctTc2323B.1.596.10.214953
ORF3a74S74FtCctTc2222B.1.5960.001917
ORF3a74S74FtCctTc2222B.1.6210.001947
ORF3a74S74FtCctTc2121AY.99.20.001935
ORF3a74S74FtCctTc2020B.1.2430.001392
ORF3a74S74FtCctTc2020B.1.5750.006068
ORF3a74S74FtCctTc1919AY.1130.002705
ORF3a74S74FtCctTc1919AY.140.001672
ORF3a74S74FtCctTc1818AY.340.001745
ORF3a74S74FtCctTc1717AY.750.000952
ORF3a74S74FtCctTc1717B.1.5260.0004
ORF3a74S74FtCctTc1616AY.470.000498
ORF3a74S74FtCctTc1616AY.950.012177
ORF3a74S74FtCctTc1515B.1.3110.004119
ORF3a74S74FtCctTc1515B.1.4270.000757
ORF3a74S74FtCctTc1313AY.200.000505
ORF3a74S74FtCctTc1313AY.450.001582
ORF3a74S74FtCctTc1313B.1.1.5190.000516
ORF3a74S74FtCctTc1313Q.80.002144
ORF3a74S74FtCctTc1212AY.1060.004019
ORF3a74S74FtCctTc1212AY.900.008214
ORF3a74S74FtCctTc1212B.1.5640.005111
ORF3a74S74FtCctTc1111A0.004257
ORF3a74S74FtCctTc1111AY.50.000227
ORF3a74S74FtCctTc1111AY.610.001153
ORF3a74S74FtCctTc1111B.1.1.330.00463
ORF3a74S74FtCctTc1111B.1.1.740.047414
ORF3a74S74FtCctTc1010AD.20.00219
ORF3a74S74FtCctTc1010AY.420.000402
ORF3a74S74FtCctTc1010B.1.1.3060.004384
ORF3a74S74FtCctTc1010B.1.2100.021322
ORF3a74S74FtCctTc99AY.120.10.002889
ORF3a74S74FtCctTc88AY.1170.000676
ORF3a74S74FtCctTc88B0.001022
ORF3a74S74FtCctTc88B.1.1.280.00249
ORF3a74S74FtCctTc88B.1.1.500.005431
ORF3a74S74FtCctTc77AY.4.40.002864
ORF3a74S74FtCctTc77AY.5.30.002362
ORF3a74S74FtCctTc77AY.60.000288
ORF3a74S74FtCctTc77AY.920.002011
ORF3a74S74FtCctTc77AY.980.000553
ORF3a74S74FtCctTc77B.1.351.30.006135
ORF3a74S74FtCctTc77B.1.36.180.002941
ORF3a74S74FtCctTc66A.23.10.004225
ORF3a74S74FtCctTc66AY.730.003992
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.1.2140.000333
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.1.2220.001224
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.1.2820.069767
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.1.3170.00247
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.2210.000426
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.2580.000399
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.258.140.005882
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.2650.007624
ORF3a74S74FtCctTc66B.1.360.000875
ORF3a74S74FtCctTc66C.320.139535
ORF3a74S74FtCctTc66P.1.140.000287
ORF3a74S74FtCctTc55AY.300.001979
ORF3a74S74FtCctTc55AY.4.30.004209
ORF3a74S74FtCctTc55AY.670.002321
ORF3a74S74FtCctTc55AY.990.005247
ORF3a74S74FtCctTc55B.1.1.10.001633
ORF3a74S74FtCctTc55B.1.1.5230.007812
ORF3a74S74FtCctTc55B.1.1.630.001929
ORF3a74S74FtCctTc55B.1.36.10.005701
ORF3a74S74FtCctTc55B.1.5170.002135
ORF3a74S74FtCctTc55P.20.000933
ORF3a74S74FtCctTc340.166667
ORF3a74S74FtCCtTT140.055556
ORF3a74S74FtCctTc44AY.1210.000541
ORF3a74S74FtCctTc44AY.320.00213
ORF3a74S74FtCctTc44AY.360.000593
ORF3a74S74FtCctTc44AY.39.10.000158
ORF3a74S74FtCctTc44AY.4.50.00043
ORF3a74S74FtCctTc44AY.540.000381
ORF3a74S74FtCctTc44AY.710.0019
ORF3a74S74FtCctTc44AY.850.001709
ORF3a74S74FtCctTc44AY.90.00027
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.1.2200.007435
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.1.2690.005413
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.5580.018265
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.5950.001044
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.6020.026144
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.6250.009412
ORF3a74S74FtCctTc44B.1.6280.001409
ORF3a74S74FtCctTc44B.60.00364
ORF3a74S74FtCctTc44C.350.003096
ORF3a74S74FtCctTc44D.20.0003
ORF3a74S74FtCctTc44P.1.60.007782
ORF3a74S74FtCctTc44P.1.70.001277
ORF3a74S74FtCctTc44R.10.00036
ORF3a74S74FtCctTc33AY.130.000483
ORF3a74S74FtCctTc33AY.16.10.00141
ORF3a74S74FtCctTc33AY.3.10.000256
ORF3a74S74FtCctTc33AY.350.000699
ORF3a74S74FtCCtTT33AY.4.2.10.000447
ORF3a74S74FtCctTc33AY.75.10.000541
ORF3a74S74FtCctTc33AY.870.002498
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.1.1530.003286
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.1.2440.046154
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.1.390.001529
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.130.007126
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.177.70.000495
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.177.860.00055
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.36.310.005254
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.4000.001287
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.466.20.001174
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.617.10.000387
ORF3a74S74FtCctTc33B.1.9.40.018405
ORF3a74S74FtCctTc33C.360.002732
ORF3a74S74FtCctTc33L.30.010638
ORF3a74S74FtCctTc22A.20.001324
ORF3a74S74FtCctTc22AY.1040.003968
ORF3a74S74FtCctTc22AY.1080.002205
ORF3a74S74FtCctTc22AY.1160.000574
ORF3a74S74FtCctTc22AY.4.10.001475
ORF3a74S74FtCctTc22AY.400.001929
ORF3a74S74FtCctTc22AY.460.000208
ORF3a74S74FtCctTc22AY.46.30.001867
ORF3a74S74FtCctTc22AY.520.001629
ORF3a74S74FtCctTc22AY.650.001066
ORF3a74S74FtCctTc22AY.690.000373
ORF3a74S74FtCctTc22AY.840.000875
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.1610.007067
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.2160.001781
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.2650.006309
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.2940.002532
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.3970.004505
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.4180.045455
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1.4500.068966
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1080.011628
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.1570.00597
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.2060.001631
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.351.20.000605
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.36.190.018519
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.36.80.002
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.3690.00057
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.3960.001411
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.5090.001732
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.5430.02
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.5610.000794
ORF3a74S74FtCctTc12B.1.5770.000687
ORF3a74S74FtCCtTT12B.1.5770.000687
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.6190.001742
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.6230.001073
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.6270.00404
ORF3a74S74FtCctTc22B.1.6370.000146
ORF3a74S74FtCctTc22B.400.000729
ORF3a74S74FtCctTc22B.520.020202
ORF3a74S74FtCctTc22Q.10.000253
ORF3a74S74FtCctTc11A.2.40.003367
ORF3a74S74FtCctTc11AE.80.000489
ORF3a74S74FtCctTc11AH.20.012048
ORF3a74S74FtCctTc11AY.100.00053
ORF3a74S74FtCctTc11AY.1090.00074
ORF3a74S74FtCctTc11AY.1100.000113
ORF3a74S74FtCctTc11AY.1110.000183
ORF3a74S74FtCctTc11AY.1180.000063
ORF3a74S74FtCctTc11AY.120.20.001285
ORF3a74S74FtCctTc11AY.160.00038
ORF3a74S74FtCctTc11AY.240.000431
ORF3a74S74FtCctTc11AY.270.000065
ORF3a74S74FtCctTc11AY.34.10.00051
ORF3a74S74FtCctTc11AY.380.000499
ORF3a74S74FtCctTc11AY.410.000294
ORF3a74S74FtCctTc11AY.46.20.000635
ORF3a74S74FtCctTc11AY.46.40.000165
ORF3a74S74FtCctTc11AY.46.50.000198
ORF3a74S74FtCctTc11AY.530.000288
ORF3a74S74FtCctTc11AY.550.000917
ORF3a74S74FtCctTc11AY.620.000436
ORF3a74S74FtCctTc11AY.700.000209
ORF3a74S74FtCctTc11AY.720.001361
ORF3a74S74FtCctTc11AY.740.000116
ORF3a74S74FtCctTc11AY.780.001541
ORF3a74S74FtCctTc11AY.860.00083
ORF3a74S74FtCctTc11AY.9.10.000084
ORF3a74S74FtCctTc11AY.930.000273
ORF3a74S74FtCctTc11AY.940.000443
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.100.001115
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.1980.001468
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.2390.032258
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.250.000569
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.2980.000862
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3050.003861
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3110.000358
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3180.000302
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3260.001761
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3540.004386
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.3980.003226
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4030.025641
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4090.002833
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.410.006329
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4120.007634
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4130.006897
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4160.000905
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4190.007407
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.4640.001473
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.5240.020833
ORF3a74S74FtCctTc11B.1.1.890.006061
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