CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = S26del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a26S26deldelTCA---18181818125468-25470

Details of the mutation S26del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a26S26delTCA---18181818All0.000348
ORF3a26S26delTCA---12711271B.1.214.20.76199
ORF3a26S26delTCA---104104B.1.617.30.310448
ORF3a26S26delTCA---5858AY.40.00009
ORF3a26S26delTCA---4545B.1.1.70.00004
ORF3a26S26delTCA---4444AY.250.000265
ORF3a26S26delTCA---2727AY.1190.000953
ORF3a26S26delTCA---2323AY.490.073482
ORF3a26S26delTCA---2323B.1.10.000417
ORF3a26S26delTCA---2020AY.430.000089
ORF3a26S26delTCA---2020B.10.000183
ORF3a26S26delTCA---1515AY.290.000237
ORF3a26S26delTCA---1010AY.1030.000062
ORF3a26S26delTCA---99AY.440.000055
ORF3a26S26delTCA---99B.1.2100.01919
ORF3a26S26delTCA---99B.1.6390.195652
ORF3a26S26delTCA---77AY.46.20.004447
ORF3a26S26delTCA---77B.1.1770.000092
ORF3a26S26delTCA---77B.1.214.10.14
ORF3a26S26delTCA---66AY.260.00017
ORF3a26S26delTCA---66B.1.617.20.000023
ORF3a26S26delTCA---55AY.230.000349
ORF3a26S26delTCA---55B.1.214.30.035714
ORF3a26S26delTCA---44AY.30.00004
ORF3a26S26delTCA---44AY.4.50.00043
ORF3a26S26delTCA---44B.1.2140.014652
ORF3a26S26delTCA---44B.1.2180.020619
ORF3a26S26delTCA---33AY.1020.00008
ORF3a26S26delTCA---33AY.330.0002
ORF3a26S26delTCA---33AY.470.000093
ORF3a26S26delTCA---33AY.50.000062
ORF3a26S26delTCA---33B.1.6090.001438
ORF3a26S26delTCA---33Q.10.000379
ORF3a26S26delTCA---33U.30.011583
ORF3a26S26delTCA---22AY.540.000191
ORF3a26S26delTCA---22AY.70.000392
ORF3a26S26delTCA---22AY.790.002421
ORF3a26S26delTCA---22AY.810.003984
ORF3a26S26delTCA---22AY.9.20.000073
ORF3a26S26delTCA---22AY.99.20.000184
ORF3a26S26delTCA---11A.23.10.000704
ORF3a26S26delTCA---11AY.1110.000183
ORF3a26S26delTCA---11AY.1200.000037
ORF3a26S26delTCA---11AY.190.00114
ORF3a26S26delTCA---11AY.390.000025
ORF3a26S26delTCA---11AY.39.10.00004
ORF3a26S26delTCA---11AY.420.00004
ORF3a26S26delTCA---11AY.460.000104
ORF3a26S26delTCA---11AY.60.000041
ORF3a26S26delTCA---11AY.680.000274
ORF3a26S26delTCA---11AY.820.001357
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1.2160.00089
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1.3110.000358
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1.4090.002833
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1.4340.000349
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1.5280.004808
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1600.000031
ORF3a26S26delTCA---11B.1.160.330.004425
ORF3a26S26delTCA---11B.1.177.110.001698
ORF3a26S26delTCA---11B.1.177.190.001431
ORF3a26S26delTCA---11B.1.177.210.000076
ORF3a26S26delTCA---11B.1.177.40.000211
ORF3a26S26delTCA---11B.1.177.60.000977
ORF3a26S26delTCA---11B.1.1790.003759
ORF3a26S26delTCA---11B.1.221.10.002907
ORF3a26S26delTCA---11B.1.2430.00007
ORF3a26S26delTCA---11B.1.2580.000067
ORF3a26S26delTCA---11B.1.36.170.000494
ORF3a26S26delTCA---11B.1.36.180.00042
ORF3a26S26delTCA---11B.1.3890.001002
ORF3a26S26delTCA---11B.1.4270.00005
ORF3a26S26delTCA---11B.1.4590.004082
ORF3a26S26delTCA---11B.1.6190.000871
ORF3a26S26delTCA---11B.1.6380.052632
ORF3a26S26delTCA---11B.550.00295
ORF3a26S26delTCA---11C.160.00106
ORF3a26S26delTCA---11D.20.000075
ORF3a26S26delTCA---11P.10.000016
ORF3a26S26delTCA---11P.1.150.000232