CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = S209del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a209S209deldelTCA---2727126017-26019

Details of the mutation S209del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a209S209delTCA---2727All0.000005
ORF3a209S209delTCA---44AY.430.000018
ORF3a209S209delTCA---44B.1.5250.000453
ORF3a209S209delTCA---33B.1.1.70.000003
ORF3a209S209delTCA---220.111111
ORF3a209S209delTCA---11AY.1200.000037
ORF3a209S209delTCA---11AY.30.00001
ORF3a209S209delTCA---11AY.40.000002
ORF3a209S209delTCA---11AY.680.000274
ORF3a209S209delTCA---11AY.90.000068
ORF3a209S209delTCA---11B0.000128
ORF3a209S209delTCA---11B.10.000009
ORF3a209S209delTCA---11B.1.1770.000013
ORF3a209S209delTCA---11B.1.177.730.000566
ORF3a209S209delTCA---11B.1.20.000009
ORF3a209S209delTCA---11B.1.2210.000071
ORF3a209S209delTCA---11B.1.5770.000687
ORF3a209S209delTCA---11B.1.617.20.000004
ORF3a209S209delTCA---11R.10.00009