CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = S162S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a162S162SsynagTagC18331833125876-25878

Details of the mutation S162S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a162S162SagTagC18331833All0.000351
ORF3a162S162SagTagC16291629B.1.177.540.987871
ORF3a162S162SagTagC4343V.10.977273
ORF3a162S162SagTagC3131V.21
ORF3a162S162SagTagC2727AY.30.000269
ORF3a162S162SagTagC2323B.1.20.000203
ORF3a162S162SagTagC1717B.10.000156
ORF3a162S162SagTagC1414P.1.40.013672
ORF3a162S162SagTagC1111P.10.000173
ORF3a162S162SagTagC1010B.1.1770.000132
ORF3a162S162SagTagC33B.1.1.70.000003
ORF3a162S162SagTagC33B.1.177.40.000633
ORF3a162S162SagTagC22AY.40.000003
ORF3a162S162SagTagC22B.1.10.000036
ORF3a162S162SagTagC22B.1.177.560.001335
ORF3a162S162SagTagC22D.20.00015
ORF3a162S162SagTagC11AY.1130.000142
ORF3a162S162SagTagC11AY.430.000004
ORF3a162S162SagTagC11AY.440.000006
ORF3a162S162SagTagC11AY.50.000021
ORF3a162S162SagTagC11AY.7.10.000113
ORF3a162S162SagTagC11AY.710.000475
ORF3a162S162SagTagC11AY.90.000068
ORF3a162S162SagTagC11AY.9.20.000037
ORF3a162S162SagTagC11AY.980.000079
ORF3a162S162SagTagC11B.1.1.280.000311
ORF3a162S162SagTagC11B.1.1.500.000679
ORF3a162S162SagTagC11B.1.177.810.000189
ORF3a162S162SagTagC11B.1.5250.000113
ORF3a162S162SagTagC11U.30.003861