CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = M260I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a260M260InonsynatGatT424033940.80047226170-26172
ORF3a260M260InonsynatGatA42408410.19834926170-26172
ORF3a260M260InonsynatGatC424050.0011792526170-26172

Details of the mutation M260I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a260M260IatGatT33944240All0.000649
ORF3a260M260IatGatA8414240All0.000161
ORF3a260M260IatGatC54240All0.000001
ORF3a260M260IatGatT799832B.1.617.20.003009
ORF3a260M260IatGatA33832B.1.617.20.000124
ORF3a260M260IatGatT611785AY.30.006077
ORF3a260M260IatGatA174785AY.30.001731
ORF3a260M260IatGatT228407AY.40.000355
ORF3a260M260IatGatA179407AY.40.000279
ORF3a260M260IatGatT335350AY.430.001484
ORF3a260M260IatGatA15350AY.430.000066
ORF3a260M260IatGatT279279AY.1020.007397
ORF3a260M260IatGatT279279P.60.877358
ORF3a260M260IatGatA249249AY.4.20.0054
ORF3a260M260IatGatT111132B.1.1.70.000099
ORF3a260M260IatGatA20132B.1.1.70.000018
ORF3a260M260IatGatC1132B.1.1.70.000001
ORF3a260M260IatGatT9495AY.390.002323
ORF3a260M260IatGatA195AY.390.000025
ORF3a260M260IatGatT6068AY.440.000365
ORF3a260M260IatGatA868AY.440.000049
ORF3a260M260IatGatT4951B.1.20.000431
ORF3a260M260IatGatA251B.1.20.000018
ORF3a260M260IatGatT3031AY.1130.004272
ORF3a260M260IatGatA131AY.1130.000142
ORF3a260M260IatGatT3131B.1.258.170.003223
ORF3a260M260IatGatT2129AY.1030.00013
ORF3a260M260IatGatA829AY.1030.00005
ORF3a260M260IatGatT2429AY.1140.005547
ORF3a260M260IatGatA529AY.1140.001156
ORF3a260M260IatGatT2629AY.340.002521
ORF3a260M260IatGatC329AY.340.000291
ORF3a260M260IatGatA1828AY.250.000108
ORF3a260M260IatGatT1028AY.250.00006
ORF3a260M260IatGatT2323AY.39.1.10.016667
ORF3a260M260IatGatA2222B.1.1.3450.956522
ORF3a260M260IatGatT2020AY.9.20.000735
ORF3a260M260IatGatT1019B.10.000092
ORF3a260M260IatGatA919B.10.000082
ORF3a260M260IatGatT1617B.1.4290.000376
ORF3a260M260IatGatA117B.1.4290.000024
ORF3a260M260IatGatT1516AY.230.001046
ORF3a260M260IatGatA116AY.230.00007
ORF3a260M260IatGatT1515AY.1200.000558
ORF3a260M260IatGatT1515AY.99.20.001382
ORF3a260M260IatGatA814AY.1160.002294
ORF3a260M260IatGatT614AY.1160.001721
ORF3a260M260IatGatA1313AY.46.60.000939
ORF3a260M260IatGatT1313B.1.36.10.014823
ORF3a260M260IatGatT1012AY.1170.000845
ORF3a260M260IatGatA212AY.1170.000169
ORF3a260M260IatGatA712B.1.5260.000165
ORF3a260M260IatGatT512B.1.5260.000118
ORF3a260M260IatGatT611AY.290.000095
ORF3a260M260IatGatA511AY.290.000079
ORF3a260M260IatGatT911B.1.10.000163
ORF3a260M260IatGatA211B.1.10.000036
ORF3a260M260IatGatT1011B.1.36.290.005173
ORF3a260M260IatGatA111B.1.36.290.000517
ORF3a260M260IatGatT911P.10.000142
ORF3a260M260IatGatA211P.10.000032
ORF3a260M260IatGatT1010AY.460.001041
ORF3a260M260IatGatT910AY.50.000186
ORF3a260M260IatGatA110AY.50.000021
ORF3a260M260IatGatA910B.1.2580.000599
ORF3a260M260IatGatT110B.1.2580.000067
ORF3a260M260IatGatT99AY.7.10.001014
ORF3a260M260IatGatT88AY.46.40.001316
ORF3a260M260IatGatT88B.1.1170.1
ORF3a260M260IatGatT77A.280.018519
ORF3a260M260IatGatT67AY.980.000474
ORF3a260M260IatGatA17AY.980.000079
ORF3a260M260IatGatT77B.1.1.2220.001428
ORF3a260M260IatGatT66AY.1070.002796
ORF3a260M260IatGatA56AY.3.10.000426
ORF3a260M260IatGatT16AY.3.10.000085
ORF3a260M260IatGatT55AY.940.002213
ORF3a260M260IatGatT55B.1.5610.001985
ORF3a260M260IatGatT44AY.1060.00134
ORF3a260M260IatGatT44AY.34.10.00204
ORF3a260M260IatGatT24AY.4.50.000215
ORF3a260M260IatGatA24AY.4.50.000215
ORF3a260M260IatGatT44B.1.1.2180.030769
ORF3a260M260IatGatA34B.1.2340.000396
ORF3a260M260IatGatT14B.1.2340.000132
ORF3a260M260IatGatT44B.1.3130.026316
ORF3a260M260IatGatA34B.1.3510.000089
ORF3a260M260IatGatT14B.1.3510.00003
ORF3a260M260IatGatT44B.1.5880.00364
ORF3a260M260IatGatT44P.40.015209
ORF3a260M260IatGatT33AY.120.000948
ORF3a260M260IatGatT33AY.260.000085
ORF3a260M260IatGatT33AY.450.000365
ORF3a260M260IatGatT23AY.610.00021
ORF3a260M260IatGatA13AY.610.000105
ORF3a260M260IatGatT23AY.680.000547
ORF3a260M260IatGatA13AY.680.000274
ORF3a260M260IatGatT33AY.750.000168
ORF3a260M260IatGatT33AY.780.004622
ORF3a260M260IatGatT23AY.920.000575
ORF3a260M260IatGatA13AY.920.000287
ORF3a260M260IatGatT33AY.98.10.000145
ORF3a260M260IatGatA23B0.000256
ORF3a260M260IatGatT13B0.000128
ORF3a260M260IatGatT33B.1.1.2160.002671
ORF3a260M260IatGatT23B.1.360.000292
ORF3a260M260IatGatA13B.1.360.000146
ORF3a260M260IatGatT33B.1.466.20.001174
ORF3a260M260IatGatA23C.370.000232
ORF3a260M260IatGatT13C.370.000116
ORF3a260M260IatGatT22AY.1080.002205
ORF3a260M260IatGatA12AY.1150.005208
ORF3a260M260IatGatT12AY.1150.005208
ORF3a260M260IatGatT22AY.1190.000071
ORF3a260M260IatGatT12AY.200.000039
ORF3a260M260IatGatA12AY.200.000039
ORF3a260M260IatGatA22AY.210.003795
ORF3a260M260IatGatA12AY.4.2.10.000149
ORF3a260M260IatGatT12AY.4.2.10.000149
ORF3a260M260IatGatA12AY.420.00004
ORF3a260M260IatGatT12AY.420.00004
ORF3a260M260IatGatT22AY.46.50.000397
ORF3a260M260IatGatT22AY.5.30.000675
ORF3a260M260IatGatT22AY.5.40.000553
ORF3a260M260IatGatA22AY.60.000082
ORF3a260M260IatGatT22AY.840.000875
ORF3a260M260IatGatA22AY.90.000135
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1.2890.004167
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1160.023256
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1920.018519
ORF3a260M260IatGatT22B.1.2210.000142
ORF3a260M260IatGatT22B.1.2430.000139
ORF3a260M260IatGatT22B.1.36.180.00084
ORF3a260M260IatGatT22B.1.4480.005249
ORF3a260M260IatGatT22B.1.6190.001742
ORF3a260M260IatGatT22P.1.150.000465
ORF3a260M260IatGatA12P.1.70.000319
ORF3a260M260IatGatT12P.1.70.000319
ORF3a260M260IatGatT22Q.10.000253
ORF3a260M260IatGatT22Q.20.001227
ORF3a260M260IatGatT11A0.000387
ORF3a260M260IatGatA11A.2.50.000499
ORF3a260M260IatGatA11A.30.002096
ORF3a260M260IatGatA11AY.1000.000046
ORF3a260M260IatGatT11AY.1050.000643
ORF3a260M260IatGatT11AY.1110.000183
ORF3a260M260IatGatT11AY.160.00038
ORF3a260M260IatGatT11AY.16.10.00047
ORF3a260M260IatGatT11AY.270.000065
ORF3a260M260IatGatT11AY.330.000067
ORF3a260M260IatGatT11AY.39.10.00004
ORF3a260M260IatGatA11AY.4.10.000737
ORF3a260M260IatGatT11AY.4.40.000409
ORF3a260M260IatGatT11AY.410.000294
ORF3a260M260IatGatT11AY.490.003195
ORF3a260M260IatGatT11AY.500.000799
ORF3a260M260IatGatT11AY.590.00053
ORF3a260M260IatGatT11AY.670.000464
ORF3a260M260IatGatA11AY.700.000209
ORF3a260M260IatGatT11AY.740.000116
ORF3a260M260IatGatT11AY.850.000427
ORF3a260M260IatGatT11AY.870.000833
ORF3a260M260IatGatT11AY.880.000884
ORF3a260M260IatGatT11AY.900.000684
ORF3a260M260IatGatT11AY.960.002075
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.100.001115
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF3a260M260IatGatA11B.1.1.3180.000302
ORF3a260M260IatGatA11B.1.1.3320.03125
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.4030.025641
ORF3a260M260IatGatC11B.1.1.470.005348
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.5170.006803
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.5190.00004
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1770.000013
ORF3a260M260IatGatT11B.1.2060.000816
ORF3a260M260IatGatT11B.1.2140.003663
ORF3a260M260IatGatT11B.1.36.70.004
ORF3a260M260IatGatA11B.1.3780.006849
ORF3a260M260IatGatT11B.1.3980.002976
ORF3a260M260IatGatA11B.1.4270.00005
ORF3a260M260IatGatA11B.1.438.10.000107
ORF3a260M260IatGatT11B.1.4700.001404
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5090.000866
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5600.00463
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5960.000087
ORF3a260M260IatGatT11B.1.6210.000089
ORF3a260M260IatGatT11B.1.6370.000073
ORF3a260M260IatGatT11C.230.005814
ORF3a260M260IatGatT11L.30.003546
ORF3a260M260IatGatT11N.50.001767
ORF3a260M260IatGatT11P.1.140.000048
ORF3a260M260IatGatA11P.1.170.000162
ORF3a260M260IatGatA11P.20.000187
ORF3a260M260IatGatT11Q.30.000145
ORF3a260M260IatGatT11Q.70.001111