CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = L86L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a86L86LsynttGttA7256260.86344825648-25650
ORF3a86L86LsynTtgCtg725960.13241425648-25650
ORF3a86L86LsynTtGCtT72530.0041379325648-25650

Details of the mutation L86L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a86L86LttGttA626725All0.00012
ORF3a86L86LTtgCtg96725All0.000018
ORF3a86L86LTtGCtT3725All0.000001
ORF3a86L86LttGttA351354AY.250.002111
ORF3a86L86LTtgCtg2354AY.250.000012
ORF3a86L86LTtGCtT1354AY.250.000006
ORF3a86L86LttGttA3762B.1.1.70.000033
ORF3a86L86LTtgCtg2362B.1.1.70.000021
ORF3a86L86LTtGCtT262B.1.1.70.000002
ORF3a86L86LttGttA4249AY.40.000065
ORF3a86L86LTtgCtg749AY.40.000011
ORF3a86L86LttGttA2425B.1.10.000435
ORF3a86L86LTtgCtg125B.1.10.000018
ORF3a86L86LttGttA1921B.1.617.20.000072
ORF3a86L86LTtgCtg221B.1.617.20.000008
ORF3a86L86LttGttA1920AY.1030.000118
ORF3a86L86LTtgCtg120AY.1030.000006
ORF3a86L86LttGttA2020AY.710.009501
ORF3a86L86LttGttA1315AY.440.000079
ORF3a86L86LTtgCtg215AY.440.000012
ORF3a86L86LttGttA714AY.200.000272
ORF3a86L86LTtgCtg714AY.200.000272
ORF3a86L86LTtgCtg1212B.1.177.430.017725
ORF3a86L86LTtgCtg611P.10.000095
ORF3a86L86LttGttA511P.10.000079
ORF3a86L86LttGttA99AY.3.10.000767
ORF3a86L86LttGttA88AY.30.00008
ORF3a86L86LttGttA77AY.270.000453
ORF3a86L86LttGttA36AY.330.0002
ORF3a86L86LTtgCtg36AY.330.0002
ORF3a86L86LttGttA56AY.430.000022
ORF3a86L86LTtgCtg16AY.430.000004
ORF3a86L86LTtgCtg55AY.4.10.003687
ORF3a86L86LttGttA55B.1.5990.018248
ORF3a86L86LTtgCtg44AY.1000.000184
ORF3a86L86LttGttA34AY.1020.00008
ORF3a86L86LTtgCtg14AY.1020.000027
ORF3a86L86LttGttA33AY.390.000074
ORF3a86L86LTtgCtg33B.1.1.2220.000612
ORF3a86L86LTtgCtg33B.1.1770.00004
ORF3a86L86LttGttA33B.1.177.90.003995
ORF3a86L86LttGttA23B.1.20.000018
ORF3a86L86LTtgCtg13B.1.20.000009
ORF3a86L86LTtgCtg33B.1.36.290.001552
ORF3a86L86LTtgCtg220.111111
ORF3a86L86LttGttA22AY.1180.000125
ORF3a86L86LTtgCtg12AY.1200.000037
ORF3a86L86LttGttA12AY.1200.000037
ORF3a86L86LttGttA22AY.590.001059
ORF3a86L86LTtgCtg22AY.660.002139
ORF3a86L86LttGttA22B.1.1.3050.007722
ORF3a86L86LttGttA22B.1.1.4870.011173
ORF3a86L86LttGttA22P.20.000373
ORF3a86L86LttGttA11AY.1070.000466
ORF3a86L86LttGttA11AY.1190.000035
ORF3a86L86LttGttA11AY.120.2.10.000498
ORF3a86L86LttGttA11AY.360.000148
ORF3a86L86LttGttA11AY.380.000499
ORF3a86L86LttGttA11AY.39.10.00004
ORF3a86L86LttGttA11AY.4.50.000107
ORF3a86L86LttGttA11AY.400.000964
ORF3a86L86LttGttA11AY.450.000122
ORF3a86L86LttGttA11AY.460.000104
ORF3a86L86LttGttA11AY.46.10.001027
ORF3a86L86LttGttA11AY.46.40.000165
ORF3a86L86LttGttA11AY.46.60.000072
ORF3a86L86LttGttA11AY.470.000031
ORF3a86L86LttGttA11AY.50.000021
ORF3a86L86LttGttA11AY.610.000105
ORF3a86L86LttGttA11AY.750.000056
ORF3a86L86LTtgCtg11AY.9.20.000037
ORF3a86L86LttGttA11AY.920.000287
ORF3a86L86LTtgCtg11AY.98.10.000048
ORF3a86L86LttGttA11B.10.000009
ORF3a86L86LttGttA11B.1.1600.000031
ORF3a86L86LTtgCtg11B.1.177.860.000183
ORF3a86L86LttGttA11B.1.2340.000132
ORF3a86L86LttGttA11B.1.3510.00003
ORF3a86L86LttGttA11B.1.360.000146
ORF3a86L86LttGttA11B.1.3610.001289
ORF3a86L86LttGttA11B.1.3970.004854
ORF3a86L86LttGttA11B.1.4290.000024
ORF3a86L86LttGttA11B.1.5260.000024
ORF3a86L86LttGttA11B.1.5760.000907
ORF3a86L86LTtgCtg11B.1.5950.000261
ORF3a86L86LttGttA11C.60.037037
ORF3a86L86LttGttA11Q.10.000126