CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = L65L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a65L65LsynctCctT1137093370.82119625585-25587
ORF3a65L65LsynctCctA1137019640.17273525585-25587
ORF3a65L65LsynctCctG11370690.006068625585-25587

Details of the mutation L65L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a65L65LctCctT933711370All0.001786
ORF3a65L65LctCctA196411370All0.000376
ORF3a65L65LctCctG6911370All0.000013
ORF3a65L65LctCctA13962166AY.40.002173
ORF3a65L65LctCctT7672166AY.40.001194
ORF3a65L65LctCctG32166AY.40.000005
ORF3a65L65LctCctT17251823B.1.1.70.001544
ORF3a65L65LctCctA961823B.1.1.70.000086
ORF3a65L65LctCctG21823B.1.1.70.000002
ORF3a65L65LctCctT992999AY.1030.006159
ORF3a65L65LctCctA6999AY.1030.000037
ORF3a65L65LctCctG1999AY.1030.000006
ORF3a65L65LctCctT588631B.1.20.005178
ORF3a65L65LctCctA27631B.1.20.000238
ORF3a65L65LctCctG16631B.1.20.000141
ORF3a65L65LctCctT369390AY.430.001635
ORF3a65L65LctCctA19390AY.430.000084
ORF3a65L65LctCctG2390AY.430.000009
ORF3a65L65LctCctT270303B.1.617.20.001017
ORF3a65L65LctCctA33303B.1.617.20.000124
ORF3a65L65LctCctT289289B.1.4270.014594
ORF3a65L65LctCctT277278B.1.5260.006511
ORF3a65L65LctCctA1278B.1.5260.000024
ORF3a65L65LctCctT219255B.1.4290.005153
ORF3a65L65LctCctA36255B.1.4290.000847
ORF3a65L65LctCctT217219AY.330.014491
ORF3a65L65LctCctA2219AY.330.000134
ORF3a65L65LctCctT194194B.1.160.150.960396
ORF3a65L65LctCctT173190P.10.002725
ORF3a65L65LctCctA17190P.10.000268
ORF3a65L65LctCctT175175B.1.1.5190.006949
ORF3a65L65LctCctT156161B.1.1770.002054
ORF3a65L65LctCctA4161B.1.1770.000053
ORF3a65L65LctCctG1161B.1.1770.000013
ORF3a65L65LctCctT79152AY.250.000475
ORF3a65L65LctCctA72152AY.250.000433
ORF3a65L65LctCctG1152AY.250.000006
ORF3a65L65LctCctT152152AY.540.014493
ORF3a65L65LctCctT147148AY.4.20.003188
ORF3a65L65LctCctA1148AY.4.20.000022
ORF3a65L65LctCctT115120B.1.1600.003587
ORF3a65L65LctCctA5120B.1.1600.000156
ORF3a65L65LctCctT107114B.10.00098
ORF3a65L65LctCctA7114B.10.000064
ORF3a65L65LctCctT98113AY.440.000597
ORF3a65L65LctCctA14113AY.440.000085
ORF3a65L65LctCctG1113AY.440.000006
ORF3a65L65LctCctT110112B.1.1.2220.02244
ORF3a65L65LctCctA2112B.1.1.2220.000408
ORF3a65L65LctCctT9393AY.98.10.004504
ORF3a65L65LctCctT8384AY.1190.002931
ORF3a65L65LctCctA184AY.1190.000035
ORF3a65L65LctCctT7582AY.30.000746
ORF3a65L65LctCctA782AY.30.00007
ORF3a65L65LctCctT7982B.1.10.001433
ORF3a65L65LctCctA382B.1.10.000054
ORF3a65L65LctCctT6568AY.470.002022
ORF3a65L65LctCctA368AY.470.000093
ORF3a65L65LctCctT5461AY.390.001334
ORF3a65L65LctCctA761AY.390.000173
ORF3a65L65LctCctT5959B.1.177.590.951613
ORF3a65L65LctCctA5056B.1.6370.003654
ORF3a65L65LctCctT656B.1.6370.000438
ORF3a65L65LctCctT5050B.1.3510.001486
ORF3a65L65LctCctT4747AY.1200.001747
ORF3a65L65LctCctT4445B.1.2430.003062
ORF3a65L65LctCctA145B.1.2430.00007
ORF3a65L65LctCctT3544AY.290.000552
ORF3a65L65LctCctA944AY.290.000142
ORF3a65L65LctCctT4444B.1.2210.003125
ORF3a65L65LctCctT4144C.370.004759
ORF3a65L65LctCctA244C.370.000232
ORF3a65L65LctCctG144C.370.000116
ORF3a65L65LctCctT3838AY.3.10.00324
ORF3a65L65LctCctA3136AY.270.002006
ORF3a65L65LctCctT536AY.270.000324
ORF3a65L65LctCctT3536AY.39.10.001386
ORF3a65L65LctCctA136AY.39.10.00004
ORF3a65L65LctCctT3535B.1.1.3230.492958
ORF3a65L65LctCctT3434P.1.150.0079
ORF3a65L65LctCctT3333B.1.1.2190.165
ORF3a65L65LctCctT3132B.1.5950.00809
ORF3a65L65LctCctA132B.1.5950.000261
ORF3a65L65LctCctT3131B.1.360.004523
ORF3a65L65LctCctT3131B.1.6280.010923
ORF3a65L65LctCctT2830AY.1020.000742
ORF3a65L65LctCctA130AY.1020.000027
ORF3a65L65LctCctG130AY.1020.000027
ORF3a65L65LctCctT2930AY.90.00196
ORF3a65L65LctCctA130AY.90.000068
ORF3a65L65LctCctT3030B.1.177.330.049342
ORF3a65L65LctCctT2426B.1.1.2320.043557
ORF3a65L65LctCctA226B.1.1.2320.00363
ORF3a65L65LctCctG2226B.1.1.3060.009645
ORF3a65L65LctCctT426B.1.1.3060.001754
ORF3a65L65LctCctT2626B.1.1.3280.440678
ORF3a65L65LctCctT2424AY.120.007585
ORF3a65L65LctCctT2424B.1.5170.010248
ORF3a65L65LctCctT2323B.1.3690.00656
ORF3a65L65LctCctT2121B.1.2340.002771
ORF3a65L65LctCctT2121P.1.140.001004
ORF3a65L65LctCctT1519AY.230.001046
ORF3a65L65LctCctA319AY.230.000209
ORF3a65L65LctCctG119AY.230.00007
ORF3a65L65LctCctT1919B.1.177.810.003597
ORF3a65L65LctCctT1717AY.5.30.005735
ORF3a65L65LctCctT1516B.1.258.170.00156
ORF3a65L65LctCctA116B.1.258.170.000104
ORF3a65L65LctCctT1616P.70.069869
ORF3a65L65LctCctT815AY.450.000973
ORF3a65L65LctCctA715AY.450.000852
ORF3a65L65LctCctT1415B.1.1.280.004357
ORF3a65L65LctCctG115B.1.1.280.000311
ORF3a65L65LctCctA1515B.1.1.4200.015091
ORF3a65L65LctCctA1515B.1.1.4320.018987
ORF3a65L65LctCctT1515C.160.015907
ORF3a65L65LctCctT1515Q.20.009202
ORF3a65L65LctCctT1314AY.200.000505
ORF3a65L65LctCctA114AY.200.000039
ORF3a65L65LctCctT1314AY.50.000268
ORF3a65L65LctCctA114AY.50.000021
ORF3a65L65LctCctT1314B.1.2580.000865
ORF3a65L65LctCctA114B.1.2580.000067
ORF3a65L65LctCctT1414B.1.5270.051852
ORF3a65L65LctCctT1212AY.4.30.010101
ORF3a65L65LctCctT1212AY.710.005701
ORF3a65L65LctCctT1212B.1.1.2940.01519
ORF3a65L65LctCctT1012B.1.617.10.00129
ORF3a65L65LctCctA212B.1.617.10.000258
ORF3a65L65LctCctG1011AY.740.001156
ORF3a65L65LctCctT111AY.740.000116
ORF3a65L65LctCctT1111AY.950.008371
ORF3a65L65LctCctT1111B.1.1.10.003594
ORF3a65L65LctCctT1111B.1.1.2910.008166
ORF3a65L65LctCctT1011B.1.5250.001132
ORF3a65L65LctCctA111B.1.5250.000113
ORF3a65L65LctCctT1111B.1.5960.000959
ORF3a65L65LctCctT1010AY.1000.00046
ORF3a65L65LctCctT910AY.1130.001282
ORF3a65L65LctCctA110AY.1130.000142
ORF3a65L65LctCctT1010B.1.4780.117647
ORF3a65L65LctCctT99AY.620.003922
ORF3a65L65LctCctT89P.20.001493
ORF3a65L65LctCctA19P.20.000187
ORF3a65L65LctCctT99Q.10.001137
ORF3a65L65LctCctT88AY.1170.000676
ORF3a65L65LctCctT88AY.260.000226
ORF3a65L65LctCctT68AY.420.000241
ORF3a65L65LctCctA28AY.420.00008
ORF3a65L65LctCctT78AY.610.000733
ORF3a65L65LctCctA18AY.610.000105
ORF3a65L65LctCctT88AY.760.038647
ORF3a65L65LctCctT78AY.9.20.000257
ORF3a65L65LctCctA18AY.9.20.000037
ORF3a65L65LctCctT88B.1.1.370.001543
ORF3a65L65LctCctT88B.1.1.390.004077
ORF3a65L65LctCctT88B.1.564.10.012618
ORF3a65L65LctCctA47AY.160.001519
ORF3a65L65LctCctT37AY.160.001139
ORF3a65L65LctCctT57B.1.1.2140.000277
ORF3a65L65LctCctG27B.1.1.2140.000111
ORF3a65L65LctCctT77B.1.4040.009115
ORF3a65L65LctCctT77B.1.4220.005686
ORF3a65L65LctCctT47B.1.6210.000354
ORF3a65L65LctCctA37B.1.6210.000266
ORF3a65L65LctCctT77Q.80.001154
ORF3a65L65LctCctT66B.1.1.330.002525
ORF3a65L65LctCctT66B.1.177.860.001101
ORF3a65L65LctCctT66B.1.2400.001293
ORF3a65L65LctCctT66B.1.2500.086957
ORF3a65L65LctCctT66B.1.36.10.006842
ORF3a65L65LctCctT66B.1.6090.002876
ORF3a65L65LctCctT550.277778
ORF3a65L65LctCctT55A.2.5.20.007862
ORF3a65L65LctCctT55AY.320.002662
ORF3a65L65LctCctT55AY.46.40.000823
ORF3a65L65LctCctT55AY.60.000206
ORF3a65L65LctCctT55AY.750.00028
ORF3a65L65LctCctT45AY.840.00175
ORF3a65L65LctCctG15AY.840.000437
ORF3a65L65LctCctT45AY.980.000316
ORF3a65L65LctCctA15AY.980.000079
ORF3a65L65LctCctT55B0.000639
ORF3a65L65LctCctT55B.1.1.1710.018382
ORF3a65L65LctCctT44A0.001548
ORF3a65L65LctCctT44A.270.006623
ORF3a65L65LctCctA44AY.46.50.000794
ORF3a65L65LctCctT34AY.99.20.000276
ORF3a65L65LctCctA14AY.99.20.000092
ORF3a65L65LctCctT44B.1.1.2840.00043
ORF3a65L65LctCctT44B.1.1.3170.001647
ORF3a65L65LctCctA34B.1.177.160.001993
ORF3a65L65LctCctG14B.1.177.160.000664
ORF3a65L65LctCctA44B.1.2130.059701
ORF3a65L65LctCctT44B.1.351.20.00121
ORF3a65L65LctCctT44B.1.5510.005161
ORF3a65L65LctCctT24C.260.014706
ORF3a65L65LctCctA24C.260.014706
ORF3a65L65LctCctT44D.20.0003
ORF3a65L65LctCctT44N.50.007067
ORF3a65L65LctCctT34P.1.10.000953
ORF3a65L65LctCctA14P.1.10.000318
ORF3a65L65LctCctT44R.10.00036
ORF3a65L65LctCctT33A.2.50.001497
ORF3a65L65LctCctT33A.23.10.002113
ORF3a65L65LctCctT33AY.1090.002219
ORF3a65L65LctCctT33AY.1110.000549
ORF3a65L65LctCctT33AY.130.000483
ORF3a65L65LctCctT33AY.380.001498
ORF3a65L65LctCctT33AY.4.50.000322
ORF3a65L65LctCctT33AY.460.000312
ORF3a65L65LctCctA33AY.46.20.001906
ORF3a65L65LctCctT33AY.730.001996
ORF3a65L65LctCctT23AY.75.10.000361
ORF3a65L65LctCctA13AY.75.10.00018
ORF3a65L65LctCctT33AY.920.000862
ORF3a65L65LctCctT33AY.930.000819
ORF3a65L65LctCctA33AY.940.001328
ORF3a65L65LctCctT23AZ.20.001642
ORF3a65L65LctCctA13AZ.20.000821
ORF3a65L65LctCctT33B.1.1.2410.006211
ORF3a65L65LctCctT33B.1.1.3880.136364
ORF3a65L65LctCctT33B.1.177.100.002634
ORF3a65L65LctCctT23B.1.177.730.001133
ORF3a65L65LctCctA13B.1.177.730.000566
ORF3a65L65LctCctT33B.1.5750.00091
ORF3a65L65LctCctT33B.1.6190.002613
ORF3a65L65LctCctT33C.280.12
ORF3a65L65LctCctT33C.36.30.001702
ORF3a65L65LctCctT33P.1.100.000808
ORF3a65L65LctCctT22A.20.001324
ORF3a65L65LctCctT22AY.1060.00067
ORF3a65L65LctCctT22AY.1070.000932
ORF3a65L65LctCctT22AY.1080.002205
ORF3a65L65LctCctT22AY.1100.000225
ORF3a65L65LctCctA22AY.1180.000125
ORF3a65L65LctCctA12AY.1210.000135
ORF3a65L65LctCctT12AY.1210.000135
ORF3a65L65LctCctA22AY.190.002281
ORF3a65L65LctCctT12AY.340.000097
ORF3a65L65LctCctA12AY.340.000097
ORF3a65L65LctCctT22AY.34.10.00102
ORF3a65L65LctCctA12AY.350.000233
ORF3a65L65LctCctT12AY.350.000233
ORF3a65L65LctCctT22AY.46.60.000144
ORF3a65L65LctCctT22AY.550.001835
ORF3a65L65LctCctT22AY.9.10.000167
ORF3a65L65LctCctT22B.1.1.150.027027
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