CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = L106L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a106L106LsynctCctT53136527770.99324425708-25710
ORF3a106L106LsynctCctA531362140.004027425708-25710
ORF3a106L106LsynctCctG531361330.0025030125708-25710
ORF3a106L106LsynCtCTtG53136100.00018819625708-25710
ORF3a106L106LsynCtCTtA5313620.000037639325708-25710

Details of the mutation L106L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a106L106LctCctT5277753136All0.010094
ORF3a106L106LctCctA21453136All0.000041
ORF3a106L106LctCctG13353136All0.000025
ORF3a106L106LCtCTtG1053136All0.000002
ORF3a106L106LCtCTtA253136All0
ORF3a106L106LctCctT2977629776B.1.1600.928643
ORF3a106L106LctCctT49514956AY.30.049245
ORF3a106L106LctCctA44956AY.30.00004
ORF3a106L106LctCctG14956AY.30.00001
ORF3a106L106LctCctT24012584B.1.1.70.002149
ORF3a106L106LctCctA1072584B.1.1.70.000096
ORF3a106L106LctCctG732584B.1.1.70.000065
ORF3a106L106LCtCTtG32584B.1.1.70.000003
ORF3a106L106LctCctT24492449AY.630.947389
ORF3a106L106LctCctT10391039B.1.160.160.965613
ORF3a106L106LctCctT775775B.1.160.80.998711
ORF3a106L106LctCctT718730AY.40.001118
ORF3a106L106LctCctA8730AY.40.000012
ORF3a106L106LctCctG4730AY.40.000006
ORF3a106L106LctCctT585585B.1.160.170.994898
ORF3a106L106LctCctT535539B.10.0049
ORF3a106L106LctCctG2539B.10.000018
ORF3a106L106LctCctA2539B.10.000018
ORF3a106L106LctCctT479479B.1.160.70.995842
ORF3a106L106LctCctT451451B.1.160.140.955508
ORF3a106L106LctCctT409409B.1.160.260.990315
ORF3a106L106LctCctT374388B.1.617.20.001408
ORF3a106L106LctCctG8388B.1.617.20.00003
ORF3a106L106LctCctA6388B.1.617.20.000023
ORF3a106L106LctCctT338338B.1.160.280.988304
ORF3a106L106LctCctT269282AY.430.001192
ORF3a106L106LctCctA12282AY.430.000053
ORF3a106L106LctCctG1282AY.430.000004
ORF3a106L106LctCctT275275AY.1190.00971
ORF3a106L106LctCctT243246B.1.20.00214
ORF3a106L106LctCctG2246B.1.20.000018
ORF3a106L106LctCctA1246B.1.20.000009
ORF3a106L106LctCctT232232B.1.160.290.978903
ORF3a106L106LctCctT226226B.1.160.241
ORF3a106L106LctCctT225225B.1.160.330.995575
ORF3a106L106LctCctT198215AY.1030.001229
ORF3a106L106LctCctG17215AY.1030.000106
ORF3a106L106LctCctT205205B.1.160.230.990338
ORF3a106L106LctCctT198198B.1.160.150.980198
ORF3a106L106LctCctT197197B.1.160.300.58631
ORF3a106L106LctCctT185185B.1.160.320.793991
ORF3a106L106LctCctT174174B.1.160.110.994286
ORF3a106L106LctCctT144153AY.440.000876
ORF3a106L106LctCctA5153AY.440.00003
ORF3a106L106LctCctG4153AY.440.000024
ORF3a106L106LctCctT153153B.1.160.120.980769
ORF3a106L106LctCctT146146B.1.160.220.986486
ORF3a106L106LctCctT137138B.1.1770.001804
ORF3a106L106LctCctA1138B.1.1770.000013
ORF3a106L106LctCctT137137B.1.160.181
ORF3a106L106LctCctT136136B.1.160.90.978417
ORF3a106L106LctCctT122122B.1.160.310.983871
ORF3a106L106LctCctT121121AB.10.991803
ORF3a106L106LctCctT120120AY.250.000722
ORF3a106L106LctCctT115119B.1.10.002086
ORF3a106L106LctCctA4119B.1.10.000073
ORF3a106L106LctCctT117117B.1.160.100.943548
ORF3a106L106LctCctT95107AY.39.10.003763
ORF3a106L106LctCctA12107AY.39.10.000475
ORF3a106L106LctCctT9497AY.340.009115
ORF3a106L106LctCctA397AY.340.000291
ORF3a106L106LctCctT9595B.1.2210.006748
ORF3a106L106LctCctT9294AY.1020.002439
ORF3a106L106LctCctA294AY.1020.000053
ORF3a106L106LctCctT9090B.1.160.251
ORF3a106L106LctCctT7676B.1.160.200.678571
ORF3a106L106LctCctT7474B.1.6220.961039
ORF3a106L106LctCctT7272AY.1170.006085
ORF3a106L106LctCctT7071P.10.001103
ORF3a106L106LCtCTtG171P.10.000016
ORF3a106L106LctCctT6666AY.1000.003036
ORF3a106L106LctCctT6666B.1.160.271
ORF3a106L106LctCctT6565B.1.1640.970149
ORF3a106L106LctCctT5959B.1.4290.001388
ORF3a106L106LctCctT5357B.1.2580.003527
ORF3a106L106LctCctG357B.1.2580.0002
ORF3a106L106LctCctA157B.1.2580.000067
ORF3a106L106LctCctT5353AY.200.00206
ORF3a106L106LctCctT5252AY.470.001617
ORF3a106L106LctCctT5050AY.60.002056
ORF3a106L106LctCctT4949AY.3.10.004178
ORF3a106L106LctCctT4949B.1.160.211
ORF3a106L106LctCctT4647AY.290.000726
ORF3a106L106LctCctA147AY.290.000016
ORF3a106L106LctCctT4547B.1.5260.001058
ORF3a106L106LctCctG147B.1.5260.000024
ORF3a106L106LctCctA147B.1.5260.000024
ORF3a106L106LctCctT4545B.1.5970.208333
ORF3a106L106LctCctT3940AY.390.000964
ORF3a106L106LctCctA140AY.390.000025
ORF3a106L106LctCctT3838B.1.1.5190.001509
ORF3a106L106LctCctT3838B.1.177.310.436782
ORF3a106L106LctCctT3838B.1.5750.011529
ORF3a106L106LctCctT3536AY.50.000723
ORF3a106L106LctCctA136AY.50.000021
ORF3a106L106LctCctT3535B.1.160.130.972222
ORF3a106L106LctCctT3535B.1.351.20.01059
ORF3a106L106LctCctT3434B.1.177.440.017644
ORF3a106L106LctCctT3233B.1.1.2160.028495
ORF3a106L106LctCctG133B.1.1.2160.00089
ORF3a106L106LctCctT2833B.1.6210.002479
ORF3a106L106LCtCTtG533B.1.6210.000443
ORF3a106L106LctCctT3131P.20.005786
ORF3a106L106LctCctT2929AY.410.008524
ORF3a106L106LctCctT2828B.1.160.191
ORF3a106L106LctCctT2727B.1.1.2140.001497
ORF3a106L106LctCctT2727B.1.2400.00582
ORF3a106L106LctCctT2626AY.820.035278
ORF3a106L106LctCctT2525B.1.1.4450.925926
ORF3a106L106LctCctT2223B.1.2430.001531
ORF3a106L106LctCctG123B.1.2430.00007
ORF3a106L106LctCctT2323B.1.3510.000684
ORF3a106L106LctCctT2323B.1.6180.092742
ORF3a106L106LctCctT2222B.1.1390.016129
ORF3a106L106LctCctT2121AY.4.20.000455
ORF3a106L106LctCctT2121B.1.1.2910.01559
ORF3a106L106LctCctT2121B.1.360.003064
ORF3a106L106LctCctT2020B.1.4270.00101
ORF3a106L106LctCctT2020C.360.018215
ORF3a106L106LctCctT1719AY.1200.000632
ORF3a106L106LctCctA219AY.1200.000074
ORF3a106L106LctCctT1919AY.230.001325
ORF3a106L106LctCctT1919AY.4.10.014012
ORF3a106L106LctCctT1919B.1.1.2220.003876
ORF3a106L106LctCctT1919B.1.258.110.007531
ORF3a106L106LctCctT1717B0.002173
ORF3a106L106LctCctT1717Q.40.007731
ORF3a106L106LctCctT1616AY.450.001947
ORF3a106L106LctCctT1616AY.460.001665
ORF3a106L106LctCctA1216B.1.1.3060.005261
ORF3a106L106LctCctT416B.1.1.3060.001754
ORF3a106L106LctCctT1616B.1.1.4340.005577
ORF3a106L106LctCctT1616B.1.1110.018801
ORF3a106L106LctCctT1515A.2.50.007485
ORF3a106L106LctCctT1515AY.350.003496
ORF3a106L106LctCctT1515AY.980.001185
ORF3a106L106LctCctT1414AY.750.000784
ORF3a106L106LctCctT1414B.1.1.390.007136
ORF3a106L106LctCctT1414B.1.177.210.001071
ORF3a106L106LctCctT1414C.160.014846
ORF3a106L106LctCctT913AY.360.001334
ORF3a106L106LctCctA413AY.360.000593
ORF3a106L106LctCctT1313B.1.1.1570.011872
ORF3a106L106LctCctT1313B.1.1.4330.018519
ORF3a106L106LctCctT1313B.1.5090.011255
ORF3a106L106LctCctT1213B.230.035088
ORF3a106L106LctCctA113B.230.002924
ORF3a106L106LctCctT1213P.1.140.000574
ORF3a106L106LctCctA113P.1.140.000048
ORF3a106L106LctCctT1212AY.1210.001624
ORF3a106L106LctCctT1212AY.270.000777
ORF3a106L106LctCctT1012AY.420.000402
ORF3a106L106LctCctA212AY.420.00008
ORF3a106L106LctCctT1212AY.46.60.000866
ORF3a106L106LctCctT1212B.1.1.2770.009105
ORF3a106L106LctCctT1212B.1.177.430.017725
ORF3a106L106LctCctT1212B.1.177.730.006795
ORF3a106L106LctCctT1112B.1.3110.00302
ORF3a106L106LctCctA112B.1.3110.000275
ORF3a106L106LctCctT1212B.1.5960.001046
ORF3a106L106LctCctT1111AY.1180.000689
ORF3a106L106LctCctT1111B.1.2390.013431
ORF3a106L106LctCctT1111B.1.258.170.001144
ORF3a106L106LctCctT1111B.1.36.80.011
ORF3a106L106LctCctT1111Q.10.00139
ORF3a106L106LctCctT610AY.1130.000854
ORF3a106L106LctCctG410AY.1130.00057
ORF3a106L106LctCctT1010AY.260.000283
ORF3a106L106LctCctT910AY.5.30.003036
ORF3a106L106LctCctA110AY.5.30.000337
ORF3a106L106LctCctT910AY.5.40.00249
ORF3a106L106LctCctA110AY.5.40.000277
ORF3a106L106LctCctT1010AY.610.001048
ORF3a106L106LctCctT1010AY.620.004357
ORF3a106L106LctCctT710AY.9.20.000257
ORF3a106L106LctCctA310AY.9.20.00011
ORF3a106L106LctCctT1010B.1.1.2840.001074
ORF3a106L106LctCctT1010B.1.36.290.005173
ORF3a106L106LctCctT1010B.1.760.113636
ORF3a106L106LctCctT1010Q.80.001649
ORF3a106L106LctCctT99AY.1160.002581
ORF3a106L106LctCctT99AY.510.008182
ORF3a106L106LctCctT99AY.98.10.000436
ORF3a106L106LctCctT99B.1.1.500.00611
ORF3a106L106LctCctT99B.1.4090.007031
ORF3a106L106LctCctT99B.1.6370.000658
ORF3a106L106LctCctT99D.20.000675
ORF3a106L106LctCctT78AY.46.10.007187
ORF3a106L106LctCctA18AY.46.10.001027
ORF3a106L106LctCctT88AY.770.009019
ORF3a106L106LctCctT88B.1.1.3170.003294
ORF3a106L106LctCctT88B.1.177.770.00581
ORF3a106L106LctCctT88B.1.5610.003176
ORF3a106L106LctCctT88Q.70.008889
ORF3a106L106LctCctT88R.10.00072
ORF3a106L106LctCctT77AY.1060.002344
ORF3a106L106LctCctT77AY.4.2.10.001043
ORF3a106L106LctCctT77AY.550.006422
ORF3a106L106LctCctT77AY.880.006189
ORF3a106L106LctCctT77AY.90.000473
ORF3a106L106LctCctT67B.1.1.330.002525
ORF3a106L106LctCctG17B.1.1.330.000421
ORF3a106L106LctCctT77B.1.1470.005291
ORF3a106L106LctCctT77B.1.2320.003761
ORF3a106L106LctCctT77B.1.3460.009174
ORF3a106L106LctCctT77P.1.170.001132
ORF3a106L106LctCctT66AY.1110.001099
ORF3a106L106LctCctT66AY.330.000401
ORF3a106L106LctCctG46AY.520.003257
ORF3a106L106LctCctA16AY.520.000814
ORF3a106L106LctCctT16AY.520.000814
ORF3a106L106LctCctT66AY.75.10.001082
ORF3a106L106LctCctT66AY.840.002625
ORF3a106L106LctCctT66B.1.1.10.00196
ORF3a106L106LctCctT56B.1.1.250.002843
ORF3a106L106LctCctA16B.1.1.250.000569
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