CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF3a | 224 | G224C | nonsyn | Ggt | Tgt | 30062 | 30062 | 1 | 26062-26064 |
Details of the mutation G224C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 30062 | 30062 | All | 0.00575 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 15351 | 15351 | AY.75 | 0.86 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5362 | 5362 | B.1.1.7 | 0.0048 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1986 | 1986 | B.1.160 | 0.061939 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1152 | 1152 | B.1.617.2 | 0.004338 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 415 | 415 | AY.22 | 0.868201 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 375 | 375 | AY.4 | 0.000584 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 360 | 360 | B.1.1.170 | 0.448878 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 305 | 305 | AY.39 | 0.007537 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 271 | 271 | P.1 | 0.004269 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 239 | 239 | B.1 | 0.002189 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 234 | 234 | B.1.1 | 0.004245 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 231 | 231 | A.21 | 0.639889 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 191 | 191 | AY.9 | 0.012911 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 188 | 188 | AY.98.1 | 0.009105 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 184 | 184 | AY.44 | 0.00112 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 160 | 160 | AY.43 | 0.000709 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 154 | 154 | B.1.2 | 0.001356 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 123 | 123 | A.2.2 | 0.20777 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 90 | 90 | B.1.36 | 0.013131 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 88 | 88 | AY.25 | 0.000529 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 88 | 88 | B.1.1.518 | 0.556962 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 86 | 86 | B.1.36.2 | 0.924731 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 76 | 76 | B.1.609 | 0.036433 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 75 | 75 | B.1.177 | 0.000988 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 71 | 71 | AY.103 | 0.000441 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 66 | 66 | B.1.36.29 | 0.034144 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 63 | 63 | AY.5 | 0.001301 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 63 | 63 | B.1.1.163 | 0.480916 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 61 | 61 | B.1.1.432 | 0.077215 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 58 | 58 | B.1.1.306 | 0.025427 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 58 | 58 | B.1.1.372 | 0.039945 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 56 | 56 | B.1.1.348 | 0.044586 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 56 | 56 | B.1.1.39 | 0.028542 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 44 | 44 | B.1.1.368 | 0.135802 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 42 | 42 | B.1.351 | 0.001249 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 42 | 42 | R.1 | 0.00378 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 41 | 41 | B.1.1.384 | 0.97619 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 41 | 41 | Q.8 | 0.006761 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 34 | 34 | AY.102 | 0.000901 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 33 | 33 | AY.118 | 0.002067 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 32 | 32 | AY.29 | 0.000505 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | B.1.1.519 | 0.001231 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | B.1.243 | 0.002157 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 31 | 31 | B.1.429 | 0.000729 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 30 | 30 | B.1.637 | 0.002192 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 29 | 29 | AY.3 | 0.000288 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 28 | 28 | AY.26 | 0.000793 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 27 | 27 | B.1.1.28 | 0.008403 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 27 | 27 | B.1.177.60 | 0.005898 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 26 | 26 | AY.3.1 | 0.002217 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 26 | 26 | AY.93 | 0.0071 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 26 | 26 | B.1.596.1 | 0.242991 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 24 | 24 | B.1.1.241 | 0.049689 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 24 | 24 | B.1.617.1 | 0.003095 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 24 | 24 | C.37 | 0.002786 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 23 | 23 | AY.20 | 0.000894 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 22 | 22 | AY.75.1 | 0.003967 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 22 | 22 | B.1.1.47 | 0.117647 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 20 | 20 | B.1.258 | 0.001331 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 19 | 19 | AY.100 | 0.000874 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | AY.4.2 | 0.00039 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | AY.62 | 0.007843 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | B.1.177.58 | 0.023968 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | B.1.438.1 | 0.001931 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | AY.16.1 | 0.007989 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | AY.65 | 0.009062 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | AY.85 | 0.007262 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | B.1.1.317 | 0.006999 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | P.1.14 | 0.000813 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 16 | 16 | B.1.177.21 | 0.001224 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 16 | 16 | P.2 | 0.002986 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 15 | 15 | AY.119 | 0.00053 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 15 | 15 | B.1.621 | 0.001328 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 14 | 14 | B.1.110.3 | 0.010057 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 13 | 13 | AY.54 | 0.00124 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 13 | 13 | B.1.1.174 | 0.043919 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 13 | 13 | B.1.1.214 | 0.000721 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 12 | 12 | AY.120 | 0.000446 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 12 | 12 | AY.27 | 0.000777 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 12 | 12 | B | 0.001534 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 11 | 11 | AY.47 | 0.000342 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 11 | 11 | B.1.1.182 | 1 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 10 | 10 | B.1.1.277 | 0.007587 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 10 | 10 | B.1.537 | 0.2 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 10 | 10 | B.1.600 | 0.05848 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | P.1.4 | 0.008789 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.113 | 0.001139 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.42 | 0.000322 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.56 | 0.012841 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.74 | 0.000925 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.83 | 0.013793 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | B.1.1.326 | 0.014085 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | B.1.509 | 0.006926 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.13 | 0.001127 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.5.3 | 0.002362 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.7 | 0.001372 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.97 | 0.011905 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.1.1 | 0.002287 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.1.50 | 0.004752 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.1.51 | 0.012027 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.311 | 0.001922 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.596 | 0.00061 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.116.1 | 0.001869 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.121 | 0.000812 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.23 | 0.000418 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.33 | 0.000401 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.45 | 0.00073 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.9.2 | 0.00022 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.91 | 0.004383 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.98 | 0.000474 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | B.1.427 | 0.000303 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | B.1.621.1 | 0.003035 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | P.3 | 0.009569 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | AY.52 | 0.004072 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.176 | 0.002197 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.222 | 0.00102 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.25 | 0.002843 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.279 | 0.005605 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.33 | 0.002104 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.1.354 | 0.02193 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.177.43 | 0.007386 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.177.6 | 0.004883 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | A | 0.001548 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.16 | 0.001519 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.46 | 0.000416 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.46.6 | 0.000289 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.60 | 0.003752 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.69 | 0.000747 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.1.192 | 0.009238 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.1.318 | 0.001207 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.177.65 | 0.002661 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.234 | 0.000528 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.240 | 0.000862 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.36.8 | 0.004 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.369 | 0.001141 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.40 | 0.001457 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.117 | 0.000254 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.12 | 0.000948 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.24 | 0.001293 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.39.1 | 0.000119 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.46.5 | 0.000595 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.61 | 0.000314 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.70 | 0.000626 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.79 | 0.003632 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.90 | 0.002053 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.99.2 | 0.000276 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.135 | 0.014085 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.159 | 0.014019 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.269 | 0.00406 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.486 | 0.004732 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.177.35 | 0.002073 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.177.57 | 0.000843 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.181 | 0.058824 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.221 | 0.000213 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.324 | 0.004815 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.538 | 0.024194 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.560 | 0.013889 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.627 | 0.006061 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.9.5 | 0.017045 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | C.36 | 0.002732 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | P.1.1 | 0.000953 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | P.1.16 | 0.001122 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | P.1.17 | 0.000485 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.105 | 0.001286 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.14 | 0.000176 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.34 | 0.000194 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.34.1 | 0.00102 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.55 | 0.001835 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.67 | 0.000929 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.7.1 | 0.000225 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.9.1 | 0.000167 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.92 | 0.000575 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.95 | 0.001522 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.198 | 0.002937 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.311 | 0.000716 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.312 | 0.003824 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.370 | 0.025316 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.409 | 0.005666 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.434 | 0.000697 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.524 | 0.041667 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1.70 | 0.000682 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.210 | 0.004264 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.22 | 0.002635 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.232 | 0.001075 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.237 | 0.00995 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.251 | 0.043478 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.260 | 0.006689 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.36.16 | 0.002849 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.36.22 | 0.002415 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.396 | 0.001411 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.400 | 0.000858 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.428.2 | 0.066667 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.462 | 0.014493 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.468 | 0.011429 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.471 | 0.005464 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.525 | 0.000226 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.551 | 0.002581 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | C.1 | 0.004785 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | C.14 | 0.008658 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | C.16 | 0.002121 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | D.2 | 0.00015 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | P.1.12 | 0.000968 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | P.7 | 0.008734 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | Q.4 | 0.00091 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | S.1 | 0.009901 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.2 | 0.000662 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.2.5.2 | 0.001572 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.23.1 | 0.000704 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.10 | 0.00053 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.108 | 0.001103 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.110 | 0.000113 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.116 | 0.000287 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.21 | 0.001898 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.30 | 0.000396 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.46.1 | 0.001027 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.48 | 0.000465 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.53 | 0.000288 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.7.2 | 0.000559 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.73 | 0.000665 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.77 | 0.001127 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.87 | 0.000833 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.96 | 0.002075 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.99.1 | 0.001553 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AZ.2 | 0.000821 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.134 | 0.011364 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.141 | 0.002012 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.161 | 0.003534 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.194 | 0.00495 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.216 | 0.00089 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.284 | 0.000107 |
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ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
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ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.160.33 | 0.004425 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.160.8 | 0.001289 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.20 | 0.001517 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.24 | 0.001295 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.82 | 0.000477 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.206 | 0.000816 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.212 | 0.016667 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.214 | 0.003663 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.221.1 | 0.002907 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.258.11 | 0.000396 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.280 | 0.007143 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.351.3 | 0.000876 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36.23 | 0.016393 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.381 | 0.007812 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.395 | 0.007042 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.404 | 0.001302 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.453 | 0.003236 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.561 | 0.000397 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.595.4 | 0.007299 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.606 | 0.006024 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.619.1 | 0.000641 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.633 | 0.041667 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.53 | 0.011765 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.6.6 | 0.000889 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.7 | 0.034483 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | K.1 | 0.02381 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | P.1.11 | 0.010204 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
ORF3a | 224 | G224C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | Q.6 | 0.006623 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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