CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = G172R

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a172G172RnonsynGgtCgt16103160230.99503225906-25908
ORF3a172G172RnonsynGgTAgA16103790.0049059225906-25908
ORF3a172G172RnonsynGgTCgC1610310.000062100225906-25908

Details of the mutation G172R within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a172G172RGgtCgt1602316103All0.003065
ORF3a172G172RGgTAgA7916103All0.000015
ORF3a172G172RGgTCgC116103All0
ORF3a172G172RGgtCgt1306813068B.1.2210.928257
ORF3a172G172RGgtCgt11921192B.1.221.30.993333
ORF3a172G172RGgtCgt341341B.1.221.10.991279
ORF3a172G172RGgtCgt240240AY.440.001461
ORF3a172G172RGgtCgt239239B.1.221.40.995833
ORF3a172G172RGgtCgt194194B.1.221.20.779116
ORF3a172G172RGgtCgt9696B.10.000879
ORF3a172G172RGgTAgA7994C.370.009169
ORF3a172G172RGgtCgt1594C.370.001741
ORF3a172G172RGgtCgt4949AY.480.022791
ORF3a172G172RGgtCgt4848AY.40.000075
ORF3a172G172RGgtCgt4747B.1.1770.000619
ORF3a172G172RGgtCgt4242B.1.1.70.000038
ORF3a172G172RGgtCgt4242B.1.617.20.000158
ORF3a172G172RGgtCgt3434C.160.036055
ORF3a172G172RGgtCgt3030B.1.1.3170.012351
ORF3a172G172RGgtCgt2626B.1.2340.003431
ORF3a172G172RGgtCgt2121B.1.2580.001397
ORF3a172G172RGgtCgt2020AY.1020.00053
ORF3a172G172RGgtCgt1919AY.430.000084
ORF3a172G172RGgtCgt1313AY.1000.000598
ORF3a172G172RGgtCgt1313B.1.6200.012299
ORF3a172G172RGgtCgt1212B.1.2100.025586
ORF3a172G172RGgtCgt1010B.1.10.000181
ORF3a172G172RGgtCgt1010B.1.1600.000312
ORF3a172G172RGgtCgt99AY.250.000054
ORF3a172G172RGgtCgt99AY.390.000222
ORF3a172G172RGgtCgt99AY.610.000943
ORF3a172G172RGgtCgt99B.1.36.10.010262
ORF3a172G172RGgtCgt99P.1.140.00043
ORF3a172G172RGgtCgt77AY.50.000145
ORF3a172G172RGgtCgt77B.1.160.320.030043
ORF3a172G172RGgtCgt77B.1.177.430.01034
ORF3a172G172RGgtCgt66AY.770.006764
ORF3a172G172RGgtCgt66B.1.1.700.002046
ORF3a172G172RGgtCgt66C.360.005464
ORF3a172G172RGgtCgt55B.1.20.000044
ORF3a172G172RGgtCgt44AY.230.000279
ORF3a172G172RGgtCgt44B0.000511
ORF3a172G172RGgtCgt44B.1.160.280.011696
ORF3a172G172RGgtCgt44P.20.000747
ORF3a172G172RGgtCgt33A.2.40.010101
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.1200.000112
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.16.10.00141
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.30.00003
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.560.004815
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.75.10.000541
ORF3a172G172RGgtCgt33AY.98.10.000145
ORF3a172G172RGgtCgt33B.1.1.1620.088235
ORF3a172G172RGgtCgt33B.1.177.40.000633
ORF3a172G172RGgtCgt33B.1.177.620.003576
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.200.000078
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.270.000129
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.290.000032
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.46.60.000144
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.520.001629
ORF3a172G172RGgtCgt22AY.670.000929
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.1.3060.000877
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.1.330.000842
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.1.3740.004751
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.177.600.000437
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.177.730.001133
ORF3a172G172RGgtCgt22B.1.2430.000139
ORF3a172G172RGgtCgt22P.10.000032
ORF3a172G172RGgtCgt22Q.40.00091
ORF3a172G172RGgtCgt11A.23.10.000704
ORF3a172G172RGgtCgt11AV.10.005051
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.100.00053
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.1030.000006
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.1170.000085
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.1210.000135
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.160.00038
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.190.00114
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.320.000532
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.4.40.000409
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.400.000964
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.460.000104
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.46.20.000635
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.620.000436
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.80.000606
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.820.001357
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.870.000833
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.9.20.000037
ORF3a172G172RGgtCgt11AY.99.20.000092
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.1.1890.001513
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.1.1920.002309
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.1.2070.001182
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.1.2910.000742
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.1.5260.003546
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.160.160.000929
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.177.770.000726
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.177.810.000189
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.177.860.000183
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.2220.001692
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.360.000146
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.36.310.001751
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.36.390.002217
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.3820.008929
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.4700.001404
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.4740.001901
ORF3a172G172RGgTCgC11B.1.4970.000315
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.5240.001406
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.575.10.002439
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.6090.000479
ORF3a172G172RGgtCgt11B.1.940.027027