CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = F28del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a28F28deldelTTT---20692069125474-25476

Details of the mutation F28del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a28F28delTTT---20692069All0.000396
ORF3a28F28delTTT---12331233B.1.214.20.739209
ORF3a28F28delTTT---216216AY.490.690096
ORF3a28F28delTTT---105105B.1.617.30.313433
ORF3a28F28delTTT---5454AY.40.000084
ORF3a28F28delTTT---3636B.1.1.70.000032
ORF3a28F28delTTT---3030AY.250.00018
ORF3a28F28delTTT---2727AY.1190.000953
ORF3a28F28delTTT---2424B.1.10.000435
ORF3a28F28delTTT---2121AY.46.20.013342
ORF3a28F28delTTT---2020B.10.000183
ORF3a28F28delTTT---1515B.1.617.20.000056
ORF3a28F28delTTT---1414AY.290.000221
ORF3a28F28delTTT---1414AY.440.000085
ORF3a28F28delTTT---1313AY.1030.000081
ORF3a28F28delTTT---1313AY.1140.003004
ORF3a28F28delTTT---1313AY.30.000129
ORF3a28F28delTTT---1313AY.430.000058
ORF3a28F28delTTT---1313AY.450.001582
ORF3a28F28delTTT---1313P.10.000205
ORF3a28F28delTTT---1010AY.3.10.000853
ORF3a28F28delTTT---99B.1.2100.01919
ORF3a28F28delTTT---99B.1.6390.195652
ORF3a28F28delTTT---88AY.4.20.000174
ORF3a28F28delTTT---77AY.390.000173
ORF3a28F28delTTT---77B.1.214.10.14
ORF3a28F28delTTT---66AY.230.000418
ORF3a28F28delTTT---66B.1.1770.000079
ORF3a28F28delTTT---55B.1.214.30.035714
ORF3a28F28delTTT---44AY.4.50.00043
ORF3a28F28delTTT---44AY.50.000083
ORF3a28F28delTTT---44AY.5.30.00135
ORF3a28F28delTTT---44AY.99.20.000369
ORF3a28F28delTTT---44B.1.2140.014652
ORF3a28F28delTTT---44B.1.617.10.000516
ORF3a28F28delTTT---33AY.330.0002
ORF3a28F28delTTT---33AY.540.000286
ORF3a28F28delTTT---33AY.880.002653
ORF3a28F28delTTT---33AY.9.20.00011
ORF3a28F28delTTT---33B.1.2180.015464
ORF3a28F28delTTT---33B.1.6090.001438
ORF3a28F28delTTT---33Q.10.000379
ORF3a28F28delTTT---33U.30.011583
ORF3a28F28delTTT---22AY.1020.000053
ORF3a28F28delTTT---22AY.120.000632
ORF3a28F28delTTT---22AY.1200.000074
ORF3a28F28delTTT---22AY.130.000322
ORF3a28F28delTTT---22AY.220.004184
ORF3a28F28delTTT---22AY.260.000057
ORF3a28F28delTTT---22AY.39.10.000079
ORF3a28F28delTTT---22AY.420.00008
ORF3a28F28delTTT---22AY.70.000392
ORF3a28F28delTTT---22AY.810.003984
ORF3a28F28delTTT---22B.1.160.330.00885
ORF3a28F28delTTT---22B.1.177.830.002963
ORF3a28F28delTTT---11A.23.10.000704
ORF3a28F28delTTT---11AY.1000.000046
ORF3a28F28delTTT---11AY.1110.000183
ORF3a28F28delTTT---11AY.1180.000063
ORF3a28F28delTTT---11AY.1210.000135
ORF3a28F28delTTT---11AY.160.00038
ORF3a28F28delTTT---11AY.190.00114
ORF3a28F28delTTT---11AY.200.000039
ORF3a28F28delTTT---11AY.340.000097
ORF3a28F28delTTT---11AY.370.000316
ORF3a28F28delTTT---11AY.4.2.10.000149
ORF3a28F28delTTT---11AY.460.000104
ORF3a28F28delTTT---11AY.470.000031
ORF3a28F28delTTT---11AY.590.00053
ORF3a28F28delTTT---11AY.60.000041
ORF3a28F28delTTT---11AY.650.000533
ORF3a28F28delTTT---11AY.680.000274
ORF3a28F28delTTT---11AY.750.000056
ORF3a28F28delTTT---11AY.990.001049
ORF3a28F28delTTT---11B0.000128
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.1390.022727
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.1890.001513
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.2160.00089
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.3110.000358
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.4090.002833
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1.4340.000349
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1530.018868
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1600.000031
ORF3a28F28delTTT---11B.1.177.210.000076
ORF3a28F28delTTT---11B.1.177.60.000977
ORF3a28F28delTTT---11B.1.1790.003759
ORF3a28F28delTTT---11B.1.2430.00007
ORF3a28F28delTTT---11B.1.2580.000067
ORF3a28F28delTTT---11B.1.36.180.00042
ORF3a28F28delTTT---11B.1.3890.001002
ORF3a28F28delTTT---11B.1.4270.00005
ORF3a28F28delTTT---11B.1.4590.004082
ORF3a28F28delTTT---11B.1.6190.000871
ORF3a28F28delTTT---11B.1.6380.052632
ORF3a28F28delTTT---11B.550.00295
ORF3a28F28delTTT---11C.160.00106
ORF3a28F28delTTT---11D.20.000075
ORF3a28F28delTTT---11P.1.150.000232