CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = D27del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a27D27deldelGAT---21822182125471-25473

Details of the mutation D27del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a27D27delGAT---21822182All0.000417
ORF3a27D27delGAT---12701270B.1.214.20.761391
ORF3a27D27delGAT---214214AY.490.683706
ORF3a27D27delGAT---104104B.1.617.30.310448
ORF3a27D27delGAT---8686AY.40.000134
ORF3a27D27delGAT---5959AY.250.000355
ORF3a27D27delGAT---3737B.1.1.70.000033
ORF3a27D27delGAT---3131AY.430.000137
ORF3a27D27delGAT---2727AY.1190.000953
ORF3a27D27delGAT---2424B.1.10.000435
ORF3a27D27delGAT---2222AY.46.20.013977
ORF3a27D27delGAT---2020B.10.000183
ORF3a27D27delGAT---1515AY.1030.000093
ORF3a27D27delGAT---1515AY.30.000149
ORF3a27D27delGAT---1515B.1.617.20.000056
ORF3a27D27delGAT---1414AY.290.000221
ORF3a27D27delGAT---1414AY.440.000085
ORF3a27D27delGAT---1313AY.450.001582
ORF3a27D27delGAT---1010AY.3.10.000853
ORF3a27D27delGAT---99B.1.2100.01919
ORF3a27D27delGAT---99B.1.6390.195652
ORF3a27D27delGAT---88AY.230.000558
ORF3a27D27delGAT---88AY.4.20.000174
ORF3a27D27delGAT---88AY.50.000165
ORF3a27D27delGAT---77B.1.214.10.14
ORF3a27D27delGAT---66AY.1020.000159
ORF3a27D27delGAT---66AY.260.00017
ORF3a27D27delGAT---66B.1.1770.000079
ORF3a27D27delGAT---55AY.390.000124
ORF3a27D27delGAT---55B.1.214.30.035714
ORF3a27D27delGAT---44AY.4.50.00043
ORF3a27D27delGAT---44AY.5.30.00135
ORF3a27D27delGAT---44AY.540.000381
ORF3a27D27delGAT---44AY.99.20.000369
ORF3a27D27delGAT---44B.1.2140.014652
ORF3a27D27delGAT---44B.1.2180.020619
ORF3a27D27delGAT---44B.1.617.10.000516
ORF3a27D27delGAT---33AY.330.0002
ORF3a27D27delGAT---33AY.470.000093
ORF3a27D27delGAT---33AY.880.002653
ORF3a27D27delGAT---33AY.9.20.00011
ORF3a27D27delGAT---33B.1.6090.001438
ORF3a27D27delGAT---33Q.10.000379
ORF3a27D27delGAT---33U.30.011583
ORF3a27D27delGAT---22AY.120.000632
ORF3a27D27delGAT---22AY.1200.000074
ORF3a27D27delGAT---22AY.130.000322
ORF3a27D27delGAT---22AY.220.004184
ORF3a27D27delGAT---22AY.39.10.000079
ORF3a27D27delGAT---22AY.420.00008
ORF3a27D27delGAT---22AY.60.000082
ORF3a27D27delGAT---22AY.70.000392
ORF3a27D27delGAT---22AY.790.002421
ORF3a27D27delGAT---22AY.810.003984
ORF3a27D27delGAT---22B.1.177.830.002963
ORF3a27D27delGAT---11A.23.10.000704
ORF3a27D27delGAT---11AY.1000.000046
ORF3a27D27delGAT---11AY.1110.000183
ORF3a27D27delGAT---11AY.1140.000231
ORF3a27D27delGAT---11AY.1180.000063
ORF3a27D27delGAT---11AY.1210.000135
ORF3a27D27delGAT---11AY.190.00114
ORF3a27D27delGAT---11AY.200.000039
ORF3a27D27delGAT---11AY.340.000097
ORF3a27D27delGAT---11AY.370.000316
ORF3a27D27delGAT---11AY.4.2.10.000149
ORF3a27D27delGAT---11AY.460.000104
ORF3a27D27delGAT---11AY.590.00053
ORF3a27D27delGAT---11AY.650.000533
ORF3a27D27delGAT---11AY.680.000274
ORF3a27D27delGAT---11AY.750.000056
ORF3a27D27delGAT---11AY.990.001049
ORF3a27D27delGAT---11B0.000128
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.1890.001513
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.2160.00089
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.3110.000358
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.4090.002833
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.4340.000349
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1.5280.004808
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1600.000031
ORF3a27D27delGAT---11B.1.160.330.004425
ORF3a27D27delGAT---11B.1.177.190.001431
ORF3a27D27delGAT---11B.1.177.210.000076
ORF3a27D27delGAT---11B.1.177.60.000977
ORF3a27D27delGAT---11B.1.1790.003759
ORF3a27D27delGAT---11B.1.2430.00007
ORF3a27D27delGAT---11B.1.2580.000067
ORF3a27D27delGAT---11B.1.3510.00003
ORF3a27D27delGAT---11B.1.36.180.00042
ORF3a27D27delGAT---11B.1.3890.001002
ORF3a27D27delGAT---11B.1.4270.00005
ORF3a27D27delGAT---11B.1.4590.004082
ORF3a27D27delGAT---11B.1.6190.000871
ORF3a27D27delGAT---11B.1.6380.052632
ORF3a27D27delGAT---11B.550.00295
ORF3a27D27delGAT---11C.160.00106
ORF3a27D27delGAT---11D.20.000075
ORF3a27D27delGAT---11P.10.000016
ORF3a27D27delGAT---11P.1.150.000232