CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : Mut = D22Y

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a22D22YnonsynGatTat271227100.99926325456-25458
ORF3a22D22YnonsynGaTTaC271220.00073746325456-25458

Details of the mutation D22Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a22D22YGatTat27102712All0.000518
ORF3a22D22YGaTTaC22712All0
ORF3a22D22YGatTat682682B.1.1.70.000611
ORF3a22D22YGatTat234234AY.40.000364
ORF3a22D22YGatTat222222B.1.617.20.000836
ORF3a22D22YGatTat165165B.1.258.110.065398
ORF3a22D22YGatTat146146B.1.5260.003432
ORF3a22D22YGatTat9191B.1.20.000801
ORF3a22D22YGatTat8080B.1.4430.373832
ORF3a22D22YGatTat7373B.1.1770.000961
ORF3a22D22YGatTat7373B.1.3510.00217
ORF3a22D22YGatTat7070AY.1020.001856
ORF3a22D22YGatTat5252AY.1030.000323
ORF3a22D22YGatTat5151AY.430.000226
ORF3a22D22YGatTat4646AY.30.000458
ORF3a22D22YGatTat4444B.10.000403
ORF3a22D22YGatTat3838B.1.4290.000894
ORF3a22D22YGatTat3232B.1.10.000581
ORF3a22D22YGatTat2828AY.46.60.002022
ORF3a22D22YGatTat2727AY.4.20.000586
ORF3a22D22YGatTat2323AY.250.000138
ORF3a22D22YGatTat2222AY.440.000134
ORF3a22D22YGatTat1919P.10.000299
ORF3a22D22YGatTat1818AY.370.005689
ORF3a22D22YGatTat1818B.1.360.002626
ORF3a22D22YGatTat1717B.1.5900.077273
ORF3a22D22YGatTat1616AY.390.000395
ORF3a22D22YGatTat1515AY.130.002415
ORF3a22D22YGatTat1414AY.620.0061
ORF3a22D22YGatTat1414B.1.1600.000437
ORF3a22D22YGatTat1414B.1.1620.070352
ORF3a22D22YGatTat1313AY.460.001353
ORF3a22D22YGatTat1212B.1.4080.04428
ORF3a22D22YGatTat1111AY.1170.00093
ORF3a22D22YGatTat1111AY.260.000311
ORF3a22D22YGatTat1111AY.420.000443
ORF3a22D22YGatTat1010AY.50.000206
ORF3a22D22YGatTat88AY.160.003037
ORF3a22D22YGatTat88B.1.5250.000905
ORF3a22D22YGatTat77AD.10.028807
ORF3a22D22YGatTat77B.1.1.2770.005311
ORF3a22D22YGatTat57B.1.2430.000348
ORF3a22D22YGaTTaC27B.1.2430.000139
ORF3a22D22YGatTat66AY.1160.001721
ORF3a22D22YGatTat66B.1.177.860.001101
ORF3a22D22YGatTat55AY.1190.000177
ORF3a22D22YGatTat55AY.4.50.000537
ORF3a22D22YGatTat55AY.60.000206
ORF3a22D22YGatTat55P.1.100.001347
ORF3a22D22YGatTat44AY.1200.000149
ORF3a22D22YGatTat44AY.200.000155
ORF3a22D22YGatTat44B.1.1.10.001307
ORF3a22D22YGatTat44B.1.2670.074074
ORF3a22D22YGatTat44B.1.3110.001098
ORF3a22D22YGatTat44B.1.4270.000202
ORF3a22D22YGatTat44B.1.6210.000354
ORF3a22D22YGatTat44P.1.70.001277
ORF3a22D22YGatTat44R.10.00036
ORF3a22D22YGatTat33AY.330.0002
ORF3a22D22YGatTat33AY.340.000291
ORF3a22D22YGatTat33AY.360.000445
ORF3a22D22YGatTat33AY.46.40.000494
ORF3a22D22YGatTat33AY.90.000203
ORF3a22D22YGatTat33AY.9.20.00011
ORF3a22D22YGatTat33B.1.1.1010.03
ORF3a22D22YGatTat33B.1.1.250.001706
ORF3a22D22YGatTat33B.1.1.330.001263
ORF3a22D22YGatTat33B.1.177.600.000655
ORF3a22D22YGatTat33B.1.177.790.007026
ORF3a22D22YGatTat33B.1.3400.012876
ORF3a22D22YGatTat33L.10.005714
ORF3a22D22YGatTat22A0.000774
ORF3a22D22YGatTat22A.20.001324
ORF3a22D22YGatTat22AY.1000.000092
ORF3a22D22YGatTat22AY.1130.000285
ORF3a22D22YGatTat22AY.120.2.10.000997
ORF3a22D22YGatTat22AY.1210.000271
ORF3a22D22YGatTat22AY.140.000176
ORF3a22D22YGatTat22AY.270.000129
ORF3a22D22YGatTat22AY.290.000032
ORF3a22D22YGatTat22AY.34.10.00102
ORF3a22D22YGatTat22AY.46.50.000397
ORF3a22D22YGatTat22AY.680.000547
ORF3a22D22YGatTat22AY.750.000112
ORF3a22D22YGatTat22AY.790.002421
ORF3a22D22YGatTat22AY.9.10.000167
ORF3a22D22YGatTat22AY.910.001461
ORF3a22D22YGatTat22B0.000256
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.2140.000111
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.2220.000408
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.3160.00185
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.3360.033333
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.3480.001592
ORF3a22D22YGatTat22B.1.1.5190.000079
ORF3a22D22YGatTat22B.1.160.160.001859
ORF3a22D22YGatTat22B.1.177.20.009091
ORF3a22D22YGatTat22B.1.177.240.002591
ORF3a22D22YGatTat22B.1.177.330.003289
ORF3a22D22YGatTat22B.1.177.70.00033
ORF3a22D22YGatTat22B.1.177.800.003824
ORF3a22D22YGatTat22B.1.2210.000142
ORF3a22D22YGatTat22B.1.2340.000264
ORF3a22D22YGatTat22B.1.3200.002491
ORF3a22D22YGatTat22B.1.36.290.001035
ORF3a22D22YGatTat22B.1.3960.001411
ORF3a22D22YGatTat22B.1.4970.00063
ORF3a22D22YGatTat22B.1.4990.002101
ORF3a22D22YGatTat22B.1.5820.000981
ORF3a22D22YGatTat22C.370.000232
ORF3a22D22YGatTat22P.1.140.000096
ORF3a22D22YGatTat22P.1.20.002312
ORF3a22D22YGatTat22P.20.000373
ORF3a22D22YGatTat22Q.10.000253
ORF3a22D22YGatTat22Q.80.00033
ORF3a22D22YGatTat11AY.1110.000183
ORF3a22D22YGatTat11AY.230.00007
ORF3a22D22YGatTat11AY.39.10.00004
ORF3a22D22YGatTat11AY.4.2.10.000149
ORF3a22D22YGatTat11AY.5.40.000277
ORF3a22D22YGatTat11AY.540.000095
ORF3a22D22YGatTat11AY.550.000917
ORF3a22D22YGatTat11AY.610.000105
ORF3a22D22YGatTat11AY.740.000116
ORF3a22D22YGatTat11AY.770.001127
ORF3a22D22YGatTat11AY.840.000437
ORF3a22D22YGatTat11AY.900.000684
ORF3a22D22YGatTat11AY.98.10.000048
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.100.001115
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.1170.009709
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.2530.002506
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.2840.000107
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.3100.015152
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.3470.018182
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.3680.003086
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.370.000193
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.3800.009804
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.40.002976
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.4200.001006
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.4340.000349
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.4480.002033
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.500.000679
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.5210.005348
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.540.003021
ORF3a22D22YGatTat11B.1.1.770.041667
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.140.006098
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.210.000076
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.230.003236
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.540.000606
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.570.000281
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.730.000566
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.80.000752
ORF3a22D22YGatTat11B.1.177.820.000477
ORF3a22D22YGatTat11B.1.220.001318
ORF3a22D22YGatTat11B.1.221.30.000833
ORF3a22D22YGatTat11B.1.2290.009709
ORF3a22D22YGatTat11B.1.2580.000067
ORF3a22D22YGatTat11B.1.258.170.000104
ORF3a22D22YGatTat11B.1.3130.006579
ORF3a22D22YGatTat11B.1.36.370.002778
ORF3a22D22YGatTat11B.1.36.380.001642
ORF3a22D22YGatTat11B.1.36.390.002217
ORF3a22D22YGatTat11B.1.3950.007042
ORF3a22D22YGatTat11B.1.4000.000429
ORF3a22D22YGatTat11B.1.4090.000781
ORF3a22D22YGatTat11B.1.5460.003704
ORF3a22D22YGatTat11B.1.5770.000687
ORF3a22D22YGatTat11B.1.5950.000261
ORF3a22D22YGatTat11B.1.5960.000087
ORF3a22D22YGatTat11B.1.6090.000479
ORF3a22D22YGatTat11B.1.6230.000536
ORF3a22D22YGatTat11B.1.6330.041667
ORF3a22D22YGatTat11B.1.6370.000073
ORF3a22D22YGatTat11B.1.90.006173
ORF3a22D22YGatTat11B.1.930.000934
ORF3a22D22YGatTat11B.350.007812
ORF3a22D22YGatTat11B.400.000364
ORF3a22D22YGatTat11D.20.000075
ORF3a22D22YGatTat11L.30.003546
ORF3a22D22YGatTat11P.1.10.000318
ORF3a22D22YGatTat11P.1.150.000232
ORF3a22D22YGatTat11P.1.170.000162
ORF3a22D22YGatTat11P.1.40.000977
ORF3a22D22YGatTat11Q.30.000145
ORF3a22D22YGatTat11W.10.008696