CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF3a | 155 | D155Y | nonsyn | Gac | Tac | 28718 | 28717 | 0.999965 | 25855-25857 | |
ORF3a | 155 | D155Y | nonsyn | GaC | TaT | 28718 | 1 | 0.0000348214 | 25855-25857 |
Details of the mutation D155Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 28717 | 28718 | All | 0.005492 |
ORF3a | 155 | D155Y | GaC | TaT | 1 | 28718 | All | 0 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4048 | 4048 | AY.4 | 0.0063 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3027 | 3027 | B.1.1.7 | 0.00271 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2186 | 2186 | B.1.617.2 | 0.008231 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1268 | 1268 | B.1.409 | 0.990625 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1131 | 1131 | AY.103 | 0.007022 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1083 | 1083 | B.1.588 | 0.985441 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1078 | 1078 | AY.61 | 0.112951 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 859 | 859 | AY.4.2 | 0.018631 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 851 | 851 | P.1.2 | 0.983815 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 818 | 818 | B.1.177.62 | 0.97497 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 755 | 755 | AY.43 | 0.003345 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 722 | 722 | AY.29 | 0.011389 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 709 | 709 | B.1 | 0.006494 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 554 | 554 | B.1.2 | 0.004878 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 544 | 544 | AY.25 | 0.003272 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 520 | 520 | B.1.587 | 0.986717 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 491 | 491 | B.1.126 | 0.626276 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 486 | 486 | AY.28 | 0.918715 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 484 | 484 | AY.44 | 0.002946 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 461 | 461 | AY.102 | 0.012223 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 375 | 375 | P.1 | 0.005908 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 285 | 285 | AY.3 | 0.002835 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 250 | 250 | AY.20 | 0.009716 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 214 | 214 | B.1.36 | 0.031223 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 183 | 183 | B.1.1 | 0.00332 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 175 | 175 | B.1.177 | 0.002304 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 161 | 161 | AY.98 | 0.012718 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 155 | 155 | AY.39 | 0.00383 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 146 | 146 | B.1.177.86 | 0.026784 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 145 | 145 | B.1.596 | 0.012635 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 140 | 140 | B.1.160 | 0.004366 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 137 | 137 | AY.120.1 | 0.043981 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 137 | 137 | P.1.14 | 0.006549 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 134 | 134 | B.1.595 | 0.034969 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 125 | 125 | AY.75.1 | 0.022539 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 122 | 122 | B.1.429 | 0.002871 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 108 | 108 | C.37 | 0.012535 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 106 | 106 | B.1.577 | 0.072852 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 91 | 91 | AY.90 | 0.062286 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 79 | 79 | B.1.609 | 0.037872 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 78 | 78 | B.1.526 | 0.001833 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 76 | 76 | AY.13 | 0.012234 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 76 | 76 | AY.42 | 0.003057 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 75 | 75 | AL.1 | 0.974026 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 71 | 71 | AY.26 | 0.00201 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 69 | 69 | AY.23 | 0.004813 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 65 | 65 | AY.98.1 | 0.003148 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 60 | 60 | R.1 | 0.005401 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 58 | 58 | B.1.243 | 0.004036 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 58 | 58 | P.2 | 0.010825 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 57 | 57 | B.1.351 | 0.001694 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 54 | 54 | AY.101 | 0.026484 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 54 | 54 | AY.33 | 0.003606 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 51 | 51 | AY.117 | 0.00431 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 50 | 50 | B.1.1.519 | 0.001986 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 49 | 49 | B.1.258 | 0.003261 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 47 | 47 | AY.107 | 0.021901 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 45 | 45 | XA | 1 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 44 | 44 | AY.119 | 0.001554 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 43 | 43 | B.1.427 | 0.002171 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 43 | 43 | B.1.617.1 | 0.005546 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 41 | 41 | AY.118 | 0.002569 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 38 | 38 | B.1.234 | 0.005014 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 37 | 37 | AY.100 | 0.001702 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 37 | 37 | AY.80 | 0.041761 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 37 | 37 | B.1.1.33 | 0.015572 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 36 | 36 | AY.9.2 | 0.001322 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 36 | 36 | B.1.438.1 | 0.003861 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 35 | 35 | AY.47 | 0.001089 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 34 | 34 | AY.39.1 | 0.001347 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 34 | 34 | AY.5 | 0.000702 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 32 | 32 | B.1.177.57 | 0.008991 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 31 | 31 | B.1.1.214 | 0.001719 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 30 | 30 | B.1.118 | 0.201342 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 29 | 29 | B.1.525 | 0.003282 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 27 | 27 | AY.121 | 0.003654 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 27 | 27 | AY.16.1 | 0.012688 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 27 | 27 | AY.50 | 0.021583 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 27 | 27 | AY.75 | 0.001513 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 27 | 27 | B.1.621 | 0.00239 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 26 | 26 | AY.120 | 0.000967 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 26 | 26 | AY.7.1 | 0.00293 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 26 | 26 | B.1.588.1 | 1 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 25 | 25 | B.1.1.153 | 0.027382 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 25 | 25 | B.1.346 | 0.032765 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 23 | 23 | AY.4.4 | 0.009411 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 23 | 23 | Q.3 | 0.003336 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 22 | 22 | AY.45 | 0.002677 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 22 | 22 | AY.6 | 0.000905 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 22 | 22 | B.1.36.17 | 0.01087 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 21 | 21 | AY.9 | 0.001419 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 20 | 20 | AY.46 | 0.002082 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 19 | 19 | AY.46.6 | 0.001372 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 18 | 18 | B.1.1.231 | 0.055728 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 17 | 17 | B.1.1.189 | 0.025719 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 17 | 17 | B.1.1.416 | 0.015385 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 17 | 17 | B.1.177.21 | 0.0013 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 17 | 17 | B.1.349 | 0.012152 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 17 | 17 | B.1.36.29 | 0.008795 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 16 | 16 | AY.3.1 | 0.001364 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 16 | 16 | AY.4.2.1 | 0.002384 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 16 | 16 | B.1.1.222 | 0.003264 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 16 | 16 | B.1.637 | 0.001169 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 15 | 15 | P.1.12 | 0.00726 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 14 | 14 | AY.10 | 0.007419 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 14 | 14 | AY.24 | 0.006034 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 14 | 14 | AY.70 | 0.002919 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 13 | 13 | AY.46.4 | 0.002139 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 13 | 13 | AY.62 | 0.005664 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 13 | 13 | AY.88 | 0.011494 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 13 | 13 | B.1.367 | 0.010301 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 13 | 13 | P.1.15 | 0.00302 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | AY.116.1 | 0.003737 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | AY.19 | 0.013683 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | AY.4.5 | 0.00129 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | AY.92 | 0.003447 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | B.1.36.8 | 0.012 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 12 | 12 | B.1.466.2 | 0.004695 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | A.2.5 | 0.005489 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | AY.109 | 0.008136 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | AY.113 | 0.001566 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | AY.34 | 0.001067 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | AY.36 | 0.00163 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | AY.99.2 | 0.001014 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | B.1.1.25 | 0.006254 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | B.1.1.28 | 0.003424 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | B.1.582 | 0.005397 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | B.1.623 | 0.005901 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 11 | 11 | P.1.7 | 0.003512 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | AY.104 | 0.019841 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | AY.114 | 0.002311 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | AY.79 | 0.012107 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | B.1.1.306 | 0.004384 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | B.1.214.2 | 0.005995 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 10 | 10 | B.1.567 | 0.033333 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 9 | 9 | AY.1 | 0.003562 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 9 | 9 | AY.5.4 | 0.00249 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 9 | 9 | B.1.415.1 | 0.068182 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 8 | 8 | AY.111 | 0.001465 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 8 | 8 | AY.29.1 | 0.001764 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 8 | 8 | AY.55 | 0.007339 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 8 | 8 | B.1.1.318 | 0.002414 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 8 | 8 | P.1.1 | 0.002541 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AY.38 | 0.003495 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AY.5.3 | 0.002362 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AY.65 | 0.003731 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AY.74 | 0.00081 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AY.95 | 0.005327 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | AZ.2 | 0.005747 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | B | 0.000895 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | B.1.1.50 | 0.004752 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | B.1.210 | 0.014925 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | B.1.340 | 0.030043 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 7 | 7 | B.1.470 | 0.009831 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.46.5 | 0.00119 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.54 | 0.000572 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.59 | 0.003178 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.68 | 0.001642 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.71 | 0.00285 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | AY.77 | 0.006764 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | B.1.1.70 | 0.002046 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | B.1.160.16 | 0.005576 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | B.1.218 | 0.030928 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | B.1.221 | 0.000426 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | Q.1 | 0.000758 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 6 | 6 | Q.8 | 0.000989 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | AN.1 | 0.1 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | AY.106 | 0.001674 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | AY.30 | 0.001979 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | AY.4.1 | 0.003687 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | AY.84 | 0.002187 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.1.317 | 0.002058 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.1.326 | 0.008803 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.1.39 | 0.002548 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.1.432 | 0.006329 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.1.521 | 0.026738 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.160.22 | 0.033784 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.237 | 0.024876 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.240 | 0.001078 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.258.17 | 0.00052 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | B.1.452 | 0.068493 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | D.2 | 0.000375 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 5 | 5 | P.1.17 | 0.000809 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 4 | 0.166667 | |
ORF3a | 155 | D155Y | GaC | TaT | 1 | 4 | 0.055556 | |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | A.23.1 | 0.002817 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.110 | 0.000451 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.116 | 0.001147 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.27 | 0.000259 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.34.1 | 0.00204 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.46.2 | 0.002541 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.64 | 0.002381 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.85 | 0.001709 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.9.1 | 0.000335 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | AY.99 | 0.004197 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.1.434 | 0.001394 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.1.63 | 0.001543 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.177.16 | 0.002658 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.177.44 | 0.002076 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.236 | 0.008214 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.369 | 0.001141 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | B.1.456 | 0.013072 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | C.36.3 | 0.002269 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 4 | 4 | N.9 | 0.02381 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.105 | 0.001929 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.120.2.1 | 0.001495 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.14 | 0.000264 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.32 | 0.001597 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.40 | 0.002893 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.52 | 0.002443 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.56 | 0.004815 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.86 | 0.00249 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.91 | 0.002191 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | AY.93 | 0.000819 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.1.285 | 0.019608 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.1.311 | 0.001074 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.1.352 | 0.09375 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.170 | 0.012931 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.177.12 | 0.000455 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.177.7 | 0.000495 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.177.73 | 0.001699 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.311 | 0.000824 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.36.10 | 0.014354 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.36.19 | 0.027778 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.366 | 0.014634 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.397 | 0.014563 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.413 | 0.012766 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.620 | 0.002838 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.628 | 0.001057 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.1.631 | 0.010101 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | B.6 | 0.00273 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | C.1.2 | 0.012766 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 3 | 3 | Q.4 | 0.001364 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | A.2.4 | 0.006734 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.12 | 0.000632 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.16 | 0.000759 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.46.1 | 0.002053 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.53 | 0.000575 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.67 | 0.000929 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.73 | 0.001331 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.78 | 0.003082 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.82 | 0.002714 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | AY.89 | 0.009804 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.176 | 0.000879 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.207 | 0.002364 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.216 | 0.001781 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.291 | 0.001485 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.304 | 0.005618 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.351 | 0.005587 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.442 | 0.037037 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.46 | 0.008734 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.48 | 0.005747 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.1.517 | 0.013605 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.147 | 0.001512 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.177.11 | 0.003396 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.177.15 | 0.001262 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.177.42 | 0.001789 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.177.58 | 0.002663 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.229 | 0.019417 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.232 | 0.001075 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.247 | 0.029851 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.36.16 | 0.002849 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.36.31 | 0.003503 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.36.38 | 0.003284 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.399 | 0.003868 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.400 | 0.000858 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.420 | 0.020833 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.497 | 0.00063 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.506 | 0.047619 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.527 | 0.007407 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.561 | 0.000794 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.569 | 0.028986 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.576 | 0.001813 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.617.3 | 0.00597 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.621.1 | 0.001012 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.1.93 | 0.001867 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | B.4.1 | 0.037736 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | C.36 | 0.001821 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | N.6 | 0.014184 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | P.1.10 | 0.000539 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 2 | 2 | P.1.17.1 | 0.00175 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | A.2.5.1 | 0.004808 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | A.2.5.3 | 0.010309 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | A.27 | 0.001656 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AD.2 | 0.000219 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AT.1 | 0.005128 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.11 | 0.001339 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.120.2 | 0.001285 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.15 | 0.002222 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.49 | 0.003195 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.51 | 0.000909 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.60 | 0.000938 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.76 | 0.004831 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.87 | 0.000833 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | AY.99.1 | 0.001553 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.135 | 0.004695 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.201 | 0.02439 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.237 | 0.005405 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.269 | 0.001353 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.284 | 0.000107 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.286 | 0.002899 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.305 | 0.003861 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.312 | 0.001912 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.325 | 0.025641 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.333 | 0.001076 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.355 | 0.015385 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.368 | 0.003086 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.375 | 0.011905 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.397 | 0.002252 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.412 | 0.007634 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.417 | 0.002703 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.419 | 0.007407 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.431 | 0.016129 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.466 | 0.008696 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.485 | 0.016667 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.526 | 0.003546 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.62 | 0.027027 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.1.75 | 0.010638 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.111 | 0.001175 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.112 | 0.005181 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.12 | 0.008 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.139 | 0.000733 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.14 | 0.017544 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.146 | 0.004237 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.160.28 | 0.002924 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.160.8 | 0.001289 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.164 | 0.014925 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.32 | 0.00135 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.35 | 0.000691 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.5 | 0.001242 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.52 | 0.001757 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.56 | 0.000668 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.77 | 0.000726 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.84 | 0.006667 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.177.87 | 0.000728 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.195 | 0.005025 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.233 | 0.014085 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.241 | 0.000812 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.289 | 0.00266 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.291 | 0.019231 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.301 | 0.005917 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.351.2 | 0.000303 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.351.3 | 0.000876 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.36.18 | 0.00042 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.36.35 | 0.002604 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.36.36 | 0.000602 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.371 | 0.001122 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.389 | 0.001002 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.393 | 0.028571 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.395 | 0.007042 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.408 | 0.00369 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.426 | 0.001009 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.428 | 0.00102 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.453 | 0.003236 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.459 | 0.004082 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.462 | 0.007246 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.469 | 0.00361 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.523 | 0.002451 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.568 | 0.001111 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.575.1 | 0.002439 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.580 | 0.004065 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.581 | 0.009434 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.591 | 0.010638 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.605 | 0.005952 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.612 | 0.002653 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.618 | 0.004032 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.625 | 0.002353 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.1.84 | 0.020833 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.26 | 0.014706 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | C.18 | 0.002591 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | C.36.3.1 | 0.002717 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | N.10 | 0.029412 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | N.5 | 0.001767 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | P.3 | 0.001595 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | P.4 | 0.003802 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
ORF3a | 155 | D155Y | Gac | Tac | 1 | 1 | Q.7 | 0.001111 |
![]() |
![]() |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|