CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 86 & Codon = tCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a86L86SnonsyntTgtCg78740.94871825648-25650

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a86L86StTgtCg7478All0.000014
ORF3a86L86StTgtCg1313AY.5.30.004386
ORF3a86L86StTgtCg99AY.1030.000056
ORF3a86L86StTgtCg88B.1.1770.000105
ORF3a86L86StTgtCg66AY.430.000027
ORF3a86L86StTgtCg56B.1.1.70.000004
ORF3a86L86StTgtCg33AY.40.000005
ORF3a86L86StTgtCg33AY.440.000018
ORF3a86L86StTgtCg13B.1.5250.000113
ORF3a86L86StTgtCg33B.1.617.20.000011
ORF3a86L86StTgtCg33B.1.6210.000266
ORF3a86L86StTgtCg22AY.260.000057
ORF3a86L86StTgtCg22B.10.000018
ORF3a86L86StTgtCg22B.1.6350.035088
ORF3a86L86StTgtCg11A.10.000282
ORF3a86L86StTgtCg11AY.1020.000027
ORF3a86L86StTgtCg11AY.1190.000035
ORF3a86L86StTgtCg11AY.250.000006
ORF3a86L86StTgtCg11AY.290.000016
ORF3a86L86StTgtCg11AY.4.20.000022
ORF3a86L86StTgtCg11B0.000128
ORF3a86L86StTgtCg11B.1.10.000018
ORF3a86L86StTgtCg11B.1.1600.000031
ORF3a86L86StTgtCg11B.1.20.000009
ORF3a86L86StTgtCg11B.1.5820.000491
ORF3a86L86StTgtCg11B.1.5960.000087
ORF3a86L86StTgtCg11C.370.000116
ORF3a86L86StTgtCg11P.10.000016