CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 69 & Codon = tTg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a69W69LnonsyntGgtTg374437370.9981325597-25599

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a69W69LtGgtTg37373744All0.000715
ORF3a69W69LtGgtTg702702B.1.1.5190.027877
ORF3a69W69LtGgtTg404404B.1.1260.515306
ORF3a69W69LtGgtTg387387B.1.177.300.972362
ORF3a69W69LtGgtTg308308R.10.027723
ORF3a69W69LtGgtTg222222B.1.617.20.000836
ORF3a69W69LtGgtTg210210AY.50.004336
ORF3a69W69LtGgtTg207208B.1.1.70.000185
ORF3a69W69LtGgtTg103103AY.1020.002731
ORF3a69W69LtGgtTg8989AY.1030.000553
ORF3a69W69LtGgtTg8282B.1.10.001488
ORF3a69W69LtGgtTg7070B.10.000641
ORF3a69W69LtGgtTg6464AY.40.0001
ORF3a69W69LtGgtTg6363AY.430.000279
ORF3a69W69LtGgtTg5656AY.30.000557
ORF3a69W69LtGgtTg5555B.1.20.000484
ORF3a69W69LtGgtTg5252P.10.000819
ORF3a69W69LtGgtTg5050AY.440.000304
ORF3a69W69LtGgtTg3737AY.930.010104
ORF3a69W69LtGgtTg3434AY.9.20.001249
ORF3a69W69LtGgtTg3232B.1.1.3601
ORF3a69W69LtGgtTg3131AY.1200.001153
ORF3a69W69LtGgtTg2929B.1.1770.000382
ORF3a69W69LtGgtTg2626B.1.177.870.018923
ORF3a69W69LtGgtTg1717B.1.1.280.005291
ORF3a69W69LtGgtTg1616AY.1000.000736
ORF3a69W69LtGgtTg1515B.1.1.2650.047319
ORF3a69W69LtGgtTg1414AY.250.000084
ORF3a69W69LtGgtTg1313B.290.045614
ORF3a69W69LtGgtTg6120.333333
ORF3a69W69LtGgtTg1212AY.330.000801
ORF3a69W69LtGgtTg1111AY.390.000272
ORF3a69W69LtGgtTg1111B.1.3510.000327
ORF3a69W69LtGgtTg1111B.1.4290.000259
ORF3a69W69LtGgtTg1010AY.1190.000353
ORF3a69W69LtGgtTg1010B.1.4740.019011
ORF3a69W69LtGgtTg99B.1.1.510.015464
ORF3a69W69LtGgtTg88B.1.438.10.000858
ORF3a69W69LtGgtTg88B.1.5260.000188
ORF3a69W69LtGgtTg77AY.7.10.000789
ORF3a69W69LtGgtTg77B.1.1.2320.012704
ORF3a69W69LtGgtTg77P.1.40.006836
ORF3a69W69LtGgtTg66B.1.6210.000531
ORF3a69W69LtGgtTg55AY.1060.001674
ORF3a69W69LtGgtTg55AY.610.000524
ORF3a69W69LtGgtTg55B.1.1.1570.004566
ORF3a69W69LtGgtTg55B.1.177.690.007418
ORF3a69W69LtGgtTg55B.1.5750.001517
ORF3a69W69LtGgtTg55B.1.5960.000436
ORF3a69W69LtGgtTg55C.370.00058
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.350.000932
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.460.000416
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.60.000165
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.9.10.000335
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.980.000316
ORF3a69W69LtGgtTg44AY.98.10.000194
ORF3a69W69LtGgtTg44B.1.1.2630.006231
ORF3a69W69LtGgtTg44B.1.1600.000125
ORF3a69W69LtGgtTg44B.1.2220.006768
ORF3a69W69LtGgtTg44P.1.140.000191
ORF3a69W69LtGgtTg33AY.1180.000188
ORF3a69W69LtGgtTg33AY.4.20.000065
ORF3a69W69LtGgtTg33AY.470.000093
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.1.2840.000322
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.1.3480.002389
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.1.370.000579
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.1.3910.025641
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.36.380.004926
ORF3a69W69LtGgtTg33B.1.617.10.000387
ORF3a69W69LtGgtTg33Q.10.000379
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.1130.000285
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.1210.000271
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.230.000139
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.3.10.000171
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.450.000243
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.46.60.000144
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.480.00093
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.5.30.000675
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.540.000191
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.560.00321
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.580.001815
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.590.001059
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.740.000231
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.75.10.000361
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.910.001461
ORF3a69W69LtGgtTg22AY.99.20.000184
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.1.1350.00939
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.1.3060.000877
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.177.210.000153
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.177.430.002954
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.177.560.001335
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.2210.000142
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.2430.000139
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.36.260.005714
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.36.360.001204
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.4270.000101
ORF3a69W69LtGgtTg22B.1.6330.083333
ORF3a69W69LtGgtTg22C.37.10.005236
ORF3a69W69LtGgtTg22Q.80.00033
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.100.00053
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.1140.000231
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.1160.000287
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.16.10.00047
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.20.000356
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.260.000028
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.270.000065
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.320.000532
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.34.10.00051
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.39.10.00004
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.4.2.10.000149
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.420.00004
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.46.20.000635
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.46.40.000165
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.570.000656
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.70.000196
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.730.000665
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.750.000056
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.790.001211
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.810.001992
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.820.001357
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.840.000437
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.880.000884
ORF3a69W69LtGgtTg11AY.90.000068
ORF3a69W69LtGgtTg11B0.000128
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.100.001115
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.1740.003378
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2040.00304
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2140.000055
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2220.000204
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2280.003049
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.250.000569
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2790.001121
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.2880.001916
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.3020.002075
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.3740.002375
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.4090.002833
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.5280.004808
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1.630.000386
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.1040.00369
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.160.120.00641
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.160.160.000929
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.177.230.003236
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.177.730.000566
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.2200.01087
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.2340.000132
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.2390.001221
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.258.30.001675
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.350.008475
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.36.180.00042
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.3690.000285
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.3970.004854
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.4000.000429
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.4620.007246
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.5250.000113
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.5580.004566
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.6060.006024
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.617.30.002985
ORF3a69W69LtGgtTg11B.1.6250.002353
ORF3a69W69LtGgtTg11B.3.10.001658
ORF3a69W69LtGgtTg11C.360.000911
ORF3a69W69LtGgtTg11P.1.120.000484
ORF3a69W69LtGgtTg11P.1.70.000319