CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 69 & Codon = tCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a69W69SnonsyntGgtCg2162110.97685225597-25599

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a69W69StGgtCg211216All0.00004
ORF3a69W69StGgtCg4244B.1.20.00037
ORF3a69W69StGgtCg1819B.10.000165
ORF3a69W69StGgtCg1818B.1.1.70.000016
ORF3a69W69StGgtCg1717C.370.001973
ORF3a69W69StGgtCg1616B.1.5300.114286
ORF3a69W69StGgtCg1515B.1.1600.000468
ORF3a69W69StGgtCg1313AY.420.000523
ORF3a69W69StGgtCg1313B.1.617.20.000049
ORF3a69W69StGgtCg77AY.40.000011
ORF3a69W69StGgtCg55P.1.40.004883
ORF3a69W69StGgtCg44AY.30.00004
ORF3a69W69StGgtCg44B.1.2580.000266
ORF3a69W69StGgtCg33B.1.1.3060.001315
ORF3a69W69StGgtCg33B.1.2210.000213
ORF3a69W69StGgtCg22AY.200.000078
ORF3a69W69StGgtCg22AY.250.000012
ORF3a69W69StGgtCg22AY.430.000009
ORF3a69W69StGgtCg22AY.480.00093
ORF3a69W69StGgtCg22B.1.10.000036
ORF3a69W69StGgtCg22C.360.001821
ORF3a69W69StGgtCg22C.36.30.001134
ORF3a69W69StGgtCg11AY.1030.000006
ORF3a69W69StGgtCg11AY.1100.000113
ORF3a69W69StGgtCg11AY.1170.000085
ORF3a69W69StGgtCg11AY.230.00007
ORF3a69W69StGgtCg11AY.290.000016
ORF3a69W69StGgtCg11AY.3.10.000085
ORF3a69W69StGgtCg11AY.440.000006
ORF3a69W69StGgtCg11AY.46.20.000635
ORF3a69W69StGgtCg11AY.610.000105
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.1.2140.000055
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.1.4480.002033
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.1.5190.00004
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.177.440.000519
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.177.70.000165
ORF3a69W69StGgtCg11B.1.617.10.000129
ORF3a69W69StGgtCg11P.10.000016
ORF3a69W69StGgtCg11P.1.150.000232
ORF3a69W69StGgtCg11P.1.20.001156
ORF3a69W69StGgtCg11Q.40.000455