CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 50 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a50V50InonsynGttAtt31523152125540-25542

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a50V50IGttAtt31523152All0.000603
ORF3a50V50IGttAtt10751075AY.40.001673
ORF3a50V50IGttAtt334334B.1.1.70.000299
ORF3a50V50IGttAtt262262P.40.996198
ORF3a50V50IGttAtt220220AY.440.001339
ORF3a50V50IGttAtt188188B.1.177.430.277696
ORF3a50V50IGttAtt111111B.1.617.20.000418
ORF3a50V50IGttAtt9595AY.240.040948
ORF3a50V50IGttAtt9393AY.1030.000577
ORF3a50V50IGttAtt5555B.1.258.170.005718
ORF3a50V50IGttAtt4646B.1.20.000405
ORF3a50V50IGttAtt4040AY.250.000241
ORF3a50V50IGttAtt3434AY.430.000151
ORF3a50V50IGttAtt3030B.10.000275
ORF3a50V50IGttAtt2727B.1.10.00049
ORF3a50V50IGttAtt2727P.10.000425
ORF3a50V50IGttAtt2626AY.450.003164
ORF3a50V50IGttAtt2121AY.30.000209
ORF3a50V50IGttAtt2121AY.90.001419
ORF3a50V50IGttAtt2121B.1.1.5190.000834
ORF3a50V50IGttAtt1818AY.1130.002563
ORF3a50V50IGttAtt1818AY.39.10.000713
ORF3a50V50IGttAtt1818AY.470.00056
ORF3a50V50IGttAtt1616B.1.1770.000211
ORF3a50V50IGttAtt1515AY.1200.000558
ORF3a50V50IGttAtt1414AY.610.001467
ORF3a50V50IGttAtt1313AY.1020.000345
ORF3a50V50IGttAtt1313AY.50.000268
ORF3a50V50IGttAtt1313AY.530.003738
ORF3a50V50IGttAtt1313B.1.160.290.054852
ORF3a50V50IGttAtt1010AY.390.000247
ORF3a50V50IGttAtt1010B.1.177.860.001835
ORF3a50V50IGttAtt99AY.1180.000564
ORF3a50V50IGttAtt99AY.39.1.10.006522
ORF3a50V50IGttAtt88B.1.3510.000238
ORF3a50V50IGttAtt88P.20.001493
ORF3a50V50IGttAtt88R.10.00072
ORF3a50V50IGttAtt77AY.750.000392
ORF3a50V50IGttAtt77AY.9.10.000586
ORF3a50V50IGttAtt66AU.10.007595
ORF3a50V50IGttAtt66AY.290.000095
ORF3a50V50IGttAtt66B.1.5260.000141
ORF3a50V50IGttAtt55AY.1000.00023
ORF3a50V50IGttAtt55AY.200.000194
ORF3a50V50IGttAtt55AY.29.10.001103
ORF3a50V50IGttAtt55AY.99.20.000461
ORF3a50V50IGttAtt55B.1.1600.000156
ORF3a50V50IGttAtt55B.1.416.10.007812
ORF3a50V50IGttAtt55P.1.160.001871
ORF3a50V50IGttAtt44AY.330.000267
ORF3a50V50IGttAtt44B.1.4290.000094
ORF3a50V50IGttAtt33AY.130.000483
ORF3a50V50IGttAtt33AY.260.000085
ORF3a50V50IGttAtt33AY.4.20.000065
ORF3a50V50IGttAtt33AY.460.000312
ORF3a50V50IGttAtt33AY.620.001307
ORF3a50V50IGttAtt33AY.75.10.000541
ORF3a50V50IGttAtt33AY.840.001312
ORF3a50V50IGttAtt33AY.98.10.000145
ORF3a50V50IGttAtt33B.1.1.250.001706
ORF3a50V50IGttAtt33B.1.1.280.000934
ORF3a50V50IGttAtt33B.1.1.330.001263
ORF3a50V50IGttAtt33B.1.177.580.003995
ORF3a50V50IGttAtt33B.1.3110.000824
ORF3a50V50IGttAtt22AY.1190.000071
ORF3a50V50IGttAtt22AY.230.000139
ORF3a50V50IGttAtt22AY.46.50.000397
ORF3a50V50IGttAtt22AY.540.000191
ORF3a50V50IGttAtt22AY.740.000231
ORF3a50V50IGttAtt22B0.000256
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.1.2690.002706
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.1.4850.033333
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.160.100.016129
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.2580.000133
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.438.10.000215
ORF3a50V50IGttAtt22B.1.5950.000522
ORF3a50V50IGttAtt22C.140.008658
ORF3a50V50IGttAtt22C.370.000232
ORF3a50V50IGttAtt22P.1.150.000465
ORF3a50V50IGttAtt11A.2.40.003367
ORF3a50V50IGttAtt11AD.20.000219
ORF3a50V50IGttAtt11AY.10.000396
ORF3a50V50IGttAtt11AY.100.00053
ORF3a50V50IGttAtt11AY.1060.000335
ORF3a50V50IGttAtt11AY.110.001339
ORF3a50V50IGttAtt11AY.120.000316
ORF3a50V50IGttAtt11AY.160.00038
ORF3a50V50IGttAtt11AY.16.10.00047
ORF3a50V50IGttAtt11AY.300.000396
ORF3a50V50IGttAtt11AY.340.000097
ORF3a50V50IGttAtt11AY.34.10.00051
ORF3a50V50IGttAtt11AY.380.000499
ORF3a50V50IGttAtt11AY.4.50.000107
ORF3a50V50IGttAtt11AY.46.30.000934
ORF3a50V50IGttAtt11AY.46.60.000072
ORF3a50V50IGttAtt11AY.5.40.000277
ORF3a50V50IGttAtt11AY.550.000917
ORF3a50V50IGttAtt11AY.590.00053
ORF3a50V50IGttAtt11AY.60.000041
ORF3a50V50IGttAtt11AY.600.000938
ORF3a50V50IGttAtt11AY.680.000274
ORF3a50V50IGttAtt11AY.7.10.000113
ORF3a50V50IGttAtt11AY.710.000475
ORF3a50V50IGttAtt11AY.730.000665
ORF3a50V50IGttAtt11AY.9.20.000037
ORF3a50V50IGttAtt11AY.920.000287
ORF3a50V50IGttAtt11AY.930.000273
ORF3a50V50IGttAtt11AY.980.000079
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.10.000327
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.1210.002427
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.2740.005051
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.2840.000107
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.3060.000438
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.3170.000412
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.3480.000796
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.390.00051
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.460.004367
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.4640.001473
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.700.000341
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1.890.006061
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1050.009615
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.110.30.000718
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1390.000733
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.1430.021277
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.160.300.002976
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.177.150.000631
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.177.350.000691
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.177.40.000211
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.177.440.000519
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.2210.000071
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.258.30.001675
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.2600.003344
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.360.000146
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.36.180.00042
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.4000.000429
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.4110.003704
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.4270.00005
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.4680.005714
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.4800.002488
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.5240.001406
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.6090.000479
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.6210.000089
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.6230.000536
ORF3a50V50IGttAtt11B.1.780.008547
ORF3a50V50IGttAtt11B.60.00091
ORF3a50V50IGttAtt11B.6.50.076923
ORF3a50V50IGttAtt11P.1.170.000162
ORF3a50V50IGttAtt11Q.10.000126